MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014911	AGAT	2	8	12526	12533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014911	CCTC	2	8	14512	14519	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_014911	AACC	2	8	15759	15766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014911	TGGG	2	8	16941	16948	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014911	CCGG	2	8	22387	22394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014911	CCCT	2	8	23066	23073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014911	AGCC	2	8	23681	23688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014911	GCCG	2	8	23734	23741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014911	GGCC	2	8	23749	23756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014911	CTTA	2	8	23948	23955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014911	CCGG	2	8	25209	25216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014911	GCTG	2	8	25649	25656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014911	CGCC	2	8	25697	25704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_014911	GGCG	2	8	27284	27291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014911	GGGA	2	8	27308	27315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014911	GGCG	2	8	31215	31222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014911	CTGC	2	8	35303	35310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014911	ATCA	2	8	35640	35647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014911	GCTC	2	8	36398	36405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014911	ATTG	2	8	36642	36649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014911	TGAT	2	8	36968	36975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014911	GAGC	2	8	37777	37784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014911	AGCC	2	8	47224	47231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014911	CGGC	2	8	60935	60942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014911	CAAG	2	8	73458	73465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014911	TTTG	2	8	74626	74633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.