MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014911	CGAG	2	8	359	366	25 %	0 %	50 %	25 %	319765070
2	NC_014911	GCTC	2	8	651	658	0 %	25 %	25 %	50 %	319765071
3	NC_014911	CGGC	2	8	873	880	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
4	NC_014911	TCCT	2	8	1186	1193	0 %	50 %	0 %	50 %	319765071
5	NC_014911	TTGC	2	8	1252	1259	0 %	50 %	25 %	25 %	319765071
6	NC_014911	CGGT	2	8	1301	1308	0 %	25 %	50 %	25 %	319765071
7	NC_014911	CCGA	2	8	1390	1397	25 %	0 %	25 %	50 %	319765071
8	NC_014911	CCGG	2	8	1559	1566	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
9	NC_014911	CCAT	2	8	1646	1653	25 %	25 %	0 %	50 %	319765071
10	NC_014911	GTCG	2	8	3646	3653	0 %	25 %	50 %	25 %	319765071
11	NC_014911	GCCG	2	8	3879	3886	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
12	NC_014911	GGGT	2	8	4497	4504	0 %	25 %	75 %	0 %	319765071
13	NC_014911	GCGG	2	8	4510	4517	0 %	0 %	75 %	25 %	319765071
14	NC_014911	CGGC	2	8	4667	4674	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
15	NC_014911	CGGC	2	8	4713	4720	0 %	0 %	50 %	50 %	319765071
16	NC_014911	CGGC	2	8	5159	5166	0 %	0 %	50 %	50 %	319765072
17	NC_014911	CGGC	2	8	5389	5396	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
18	NC_014911	GGCC	2	8	6249	6256	0 %	0 %	50 %	50 %	319765073
19	NC_014911	GACG	2	8	7297	7304	25 %	0 %	50 %	25 %	319765073
20	NC_014911	CGGA	2	8	7356	7363	25 %	0 %	50 %	25 %	319765074
21	NC_014911	TTGC	2	8	7994	8001	0 %	50 %	25 %	25 %	319765075
22	NC_014911	CCGG	2	8	8476	8483	0 %	0 %	50 %	50 %	319765075
23	NC_014911	TCCA	2	8	8808	8815	25 %	25 %	0 %	50 %	319765075
24	NC_014911	GACG	2	8	8858	8865	25 %	0 %	50 %	25 %	319765075
25	NC_014911	CACC	2	8	9013	9020	25 %	0 %	0 %	75 %	319765075
26	NC_014911	GGCC	2	8	9391	9398	0 %	0 %	50 %	50 %	319765075
27	NC_014911	TCCT	2	8	9792	9799	0 %	50 %	0 %	50 %	319765076
28	NC_014911	CGGC	2	8	10337	10344	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
29	NC_014911	GGCC	2	8	10349	10356	0 %	0 %	50 %	50 %	319765076
30	NC_014911	TGGA	2	8	11885	11892	25 %	25 %	50 %	0 %	319765076
31	NC_014911	AGCG	2	8	11993	12000	25 %	0 %	50 %	25 %	319765076
32	NC_014911	CGCC	2	8	12325	12332	0 %	0 %	25 %	75 %	319765077
33	NC_014911	GCTG	2	8	12830	12837	0 %	25 %	50 %	25 %	319765078
34	NC_014911	CCGG	2	8	12976	12983	0 %	0 %	50 %	50 %	319765078
35	NC_014911	CAGC	2	8	13079	13086	25 %	0 %	25 %	50 %	319765078
36	NC_014911	AAAG	2	8	13184	13191	75 %	0 %	25 %	0 %	319765078
37	NC_014911	TCGT	2	8	13478	13485	0 %	50 %	25 %	25 %	319765079
38	NC_014911	GCCA	2	8	13619	13626	25 %	0 %	25 %	50 %	319765079
39	NC_014911	CGGC	2	8	14318	14325	0 %	0 %	50 %	50 %	319765080
40	NC_014911	TTGC	2	8	14636	14643	0 %	50 %	25 %	25 %	319765081
41	NC_014911	CCTT	2	8	14787	14794	0 %	50 %	0 %	50 %	319765081
42	NC_014911	CGCC	2	8	15509	15516	0 %	0 %	25 %	75 %	319765082
43	NC_014911	GCCG	2	8	15847	15854	0 %	0 %	50 %	50 %	319765083
44	NC_014911	GGTC	2	8	16105	16112	0 %	25 %	50 %	25 %	319765083
45	NC_014911	CTGG	2	8	16646	16653	0 %	25 %	50 %	25 %	319765083
46	NC_014911	TGCG	2	8	16657	16664	0 %	25 %	50 %	25 %	319765083
47	NC_014911	GGCC	2	8	16747	16754	0 %	0 %	50 %	50 %	319765083
48	NC_014911	GCCG	2	8	17107	17114	0 %	0 %	50 %	50 %	319765084
49	NC_014911	GCCA	2	8	17362	17369	25 %	0 %	25 %	50 %	319765084
50	NC_014911	GCAC	2	8	18072	18079	25 %	0 %	25 %	50 %	319765085
51	NC_014911	AGGG	2	8	18417	18424	25 %	0 %	75 %	0 %	319765085
52	NC_014911	TGGC	2	8	18618	18625	0 %	25 %	50 %	25 %	319765085
53	NC_014911	CTCG	2	8	18876	18883	0 %	25 %	25 %	50 %	319765086
54	NC_014911	GGCC	2	8	18986	18993	0 %	0 %	50 %	50 %	319765086
55	NC_014911	CGGC	3	12	19328	19339	0 %	0 %	50 %	50 %	319765087
56	NC_014911	GGCA	2	8	19371	19378	25 %	0 %	50 %	25 %	319765087
57	NC_014911	GGCC	2	8	19944	19951	0 %	0 %	50 %	50 %	319765088
58	NC_014911	CCCA	2	8	20964	20971	25 %	0 %	0 %	75 %	319765091
59	NC_014911	CGGC	2	8	21094	21101	0 %	0 %	50 %	50 %	319765091
60	NC_014911	CCGG	2	8	21257	21264	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
61	NC_014911	TCGC	2	8	21561	21568	0 %	25 %	25 %	50 %	319765092
62	NC_014911	GGCC	2	8	21749	21756	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
63	NC_014911	GCGA	2	8	21902	21909	25 %	0 %	50 %	25 %	319765092
64	NC_014911	CGCC	2	8	22019	22026	0 %	0 %	25 %	75 %	319765092
65	NC_014911	CGGC	2	8	22102	22109	0 %	0 %	50 %	50 %	319765092
66	NC_014911	CAGC	2	8	22256	22263	25 %	0 %	25 %	50 %	319765092
67	NC_014911	GGCC	2	8	22451	22458	0 %	0 %	50 %	50 %	319765093
68	NC_014911	GCCG	2	8	22497	22504	0 %	0 %	50 %	50 %	319765093
69	NC_014911	GTAG	2	8	22767	22774	25 %	25 %	50 %	0 %	319765093
70	NC_014911	ATGG	2	8	24205	24212	25 %	25 %	50 %	0 %	319765094
71	NC_014911	GGCC	2	8	28052	28059	0 %	0 %	50 %	50 %	319765096
72	NC_014911	CGCC	2	8	28223	28230	0 %	0 %	25 %	75 %	319765096
73	NC_014911	CCGC	2	8	28232	28239	0 %	0 %	25 %	75 %	319765096
74	NC_014911	ATCT	2	8	28386	28393	25 %	50 %	0 %	25 %	319765096
75	NC_014911	CCGA	2	8	28827	28834	25 %	0 %	25 %	50 %	319765096
76	NC_014911	ACCG	2	8	29085	29092	25 %	0 %	25 %	50 %	319765096
77	NC_014911	GACC	2	8	30164	30171	25 %	0 %	25 %	50 %	319765098
78	NC_014911	GCGG	2	8	30739	30746	0 %	0 %	75 %	25 %	319765099
79	NC_014911	CATC	2	8	30765	30772	25 %	25 %	0 %	50 %	319765099
80	NC_014911	CGGC	2	8	30949	30956	0 %	0 %	50 %	50 %	319765100
81	NC_014911	GAAC	2	8	31010	31017	50 %	0 %	25 %	25 %	319765100
82	NC_014911	TTCG	2	8	31537	31544	0 %	50 %	25 %	25 %	319765101
83	NC_014911	CGTT	2	8	31588	31595	0 %	50 %	25 %	25 %	319765101
84	NC_014911	CGCT	2	8	31648	31655	0 %	25 %	25 %	50 %	319765101
85	NC_014911	GTTG	2	8	31930	31937	0 %	50 %	50 %	0 %	319765101
86	NC_014911	CTGG	2	8	32505	32512	0 %	25 %	50 %	25 %	319765102
87	NC_014911	TGGC	2	8	32624	32631	0 %	25 %	50 %	25 %	319765102
88	NC_014911	ACCT	2	8	32799	32806	25 %	25 %	0 %	50 %	319765102
89	NC_014911	GCAC	2	8	33897	33904	25 %	0 %	25 %	50 %	319765102
90	NC_014911	CCGG	3	12	34421	34432	0 %	0 %	50 %	50 %	319765102
91	NC_014911	CCAC	2	8	37412	37419	25 %	0 %	0 %	75 %	319765103
92	NC_014911	CGGA	2	8	37602	37609	25 %	0 %	50 %	25 %	319765103
93	NC_014911	ACAG	2	8	38022	38029	50 %	0 %	25 %	25 %	319765104
94	NC_014911	CGGT	2	8	38600	38607	0 %	25 %	50 %	25 %	319765104
95	NC_014911	GCGG	2	8	38722	38729	0 %	0 %	75 %	25 %	319765104
96	NC_014911	GTCG	2	8	39408	39415	0 %	25 %	50 %	25 %	319765105
97	NC_014911	GGTC	2	8	39576	39583	0 %	25 %	50 %	25 %	319765105
98	NC_014911	GGCC	2	8	40031	40038	0 %	0 %	50 %	50 %	319765106
99	NC_014911	CTCG	2	8	40262	40269	0 %	25 %	25 %	50 %	319765106
100	NC_014911	GCGT	2	8	40298	40305	0 %	25 %	50 %	25 %	319765106
101	NC_014911	GCGA	2	8	41425	41432	25 %	0 %	50 %	25 %	319765108
102	NC_014911	AGCC	2	8	41531	41538	25 %	0 %	25 %	50 %	319765108
103	NC_014911	AGAT	2	8	41801	41808	50 %	25 %	25 %	0 %	319765108
104	NC_014911	GGCG	2	8	41908	41915	0 %	0 %	75 %	25 %	319765108
105	NC_014911	CTTG	2	8	41929	41936	0 %	50 %	25 %	25 %	319765108
106	NC_014911	GCCG	2	8	42666	42673	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
107	NC_014911	AGGC	2	8	42724	42731	25 %	0 %	50 %	25 %	319765109
108	NC_014911	CTTG	2	8	43459	43466	0 %	50 %	25 %	25 %	319765110
109	NC_014911	CGGC	2	8	43605	43612	0 %	0 %	50 %	50 %	319765110
110	NC_014911	GCCG	2	8	45452	45459	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
111	NC_014911	TTGA	2	8	45538	45545	25 %	50 %	25 %	0 %	319765113
112	NC_014911	GCCG	2	8	46134	46141	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
113	NC_014911	GCCC	2	8	46256	46263	0 %	0 %	25 %	75 %	319765113
114	NC_014911	TCCT	2	8	46908	46915	0 %	50 %	0 %	50 %	319765115
115	NC_014911	CCCT	2	8	46944	46951	0 %	25 %	0 %	75 %	319765115
116	NC_014911	CGAC	2	8	47011	47018	25 %	0 %	25 %	50 %	319765115
117	NC_014911	GACC	2	8	47486	47493	25 %	0 %	25 %	50 %	319765116
118	NC_014911	CACC	2	8	47812	47819	25 %	0 %	0 %	75 %	319765116
119	NC_014911	ATTG	2	8	47906	47913	25 %	50 %	25 %	0 %	319765116
120	NC_014911	CCGA	2	8	48015	48022	25 %	0 %	25 %	50 %	319765116
121	NC_014911	CCGA	2	8	48145	48152	25 %	0 %	25 %	50 %	319765116
122	NC_014911	GCAA	2	8	48465	48472	50 %	0 %	25 %	25 %	319765117
123	NC_014911	GCTG	2	8	48605	48612	0 %	25 %	50 %	25 %	319765117
124	NC_014911	CACG	2	8	49913	49920	25 %	0 %	25 %	50 %	319765119
125	NC_014911	CGGC	2	8	50350	50357	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
126	NC_014911	GCCG	2	8	50530	50537	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
127	NC_014911	CGGC	2	8	50836	50843	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
128	NC_014911	TGGC	2	8	51747	51754	0 %	25 %	50 %	25 %	319765119
129	NC_014911	GTGG	2	8	52031	52038	0 %	25 %	75 %	0 %	319765120
130	NC_014911	GTGG	2	8	52402	52409	0 %	25 %	75 %	0 %	319765120
131	NC_014911	CTAC	2	8	52473	52480	25 %	25 %	0 %	50 %	319765120
132	NC_014911	CGTG	2	8	52543	52550	0 %	25 %	50 %	25 %	319765120
133	NC_014911	CCCT	2	8	52642	52649	0 %	25 %	0 %	75 %	319765121
134	NC_014911	CGGC	2	8	53758	53765	0 %	0 %	50 %	50 %	319765122
135	NC_014911	CAAT	2	8	53906	53913	50 %	25 %	0 %	25 %	319765122
136	NC_014911	GCCG	2	8	53954	53961	0 %	0 %	50 %	50 %	319765122
137	NC_014911	CGTC	2	8	54054	54061	0 %	25 %	25 %	50 %	319765123
138	NC_014911	TCGT	2	8	54106	54113	0 %	50 %	25 %	25 %	319765123
139	NC_014911	GCGG	2	8	54688	54695	0 %	0 %	75 %	25 %	319765123
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.