MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014910	TTGTAA	2	12	139496	139507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014910	GCAAAA	2	12	139566	139577	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014910	TTGTGG	2	12	152816	152827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014910	TGGAAA	2	12	175681	175692	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014910	GGCACG	2	12	224668	224679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014910	GCTGGC	2	12	225238	225249	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014910	AAAGGC	2	12	275891	275902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014910	ACTATG	2	12	282530	282541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014910	ACTATG	2	12	282927	282938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014910	CTGGCG	2	12	283998	284009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014910	GCCGGG	2	12	285640	285651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014910	CCTCGG	2	12	296881	296892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014910	CTCCCT	2	12	378647	378658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014910	TGTTTT	2	12	378922	378933	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014910	CTTTCC	2	12	452865	452876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014910	CCTCGT	2	12	458905	458916	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014910	CGGGCT	2	12	459419	459430	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014910	GGCGAT	2	12	460721	460732	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014910	CGGCCG	2	12	460813	460824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014910	CTAACC	2	12	496701	496712	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014910	CCGTGC	2	12	509968	509979	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014910	GCGCTG	2	12	509996	510007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014910	CGCGGG	2	12	533057	533068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014910	ATGGCC	2	12	621133	621144	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014910	CGAGCG	2	12	635236	635247	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014910	GCTTGT	2	12	643322	643333	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014910	GGAGGG	2	12	710029	710040	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014910	TGAGCC	2	12	722515	722526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014910	CAGGCC	2	12	729003	729014	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014910	CTTTTT	2	12	733424	733435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014910	GGCGGG	2	12	750225	750236	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014910	CGGCTC	2	12	759139	759150	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014910	CGGCTG	2	12	761213	761224	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014910	GCCCCT	2	12	762445	762456	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014910	TCCGCT	2	12	762511	762522	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014910	GCAATT	2	12	963826	963837	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014910	GTGCCA	2	12	1026298	1026309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014910	TCGTAT	2	12	1043369	1043380	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014910	CGCGGG	2	12	1076015	1076026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014910	ACGCTG	2	12	1093093	1093104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014910	AATTTG	2	12	1103288	1103299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014910	GGCGTT	2	12	1108435	1108446	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014910	CGCTGC	2	12	1168094	1168105	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014910	GCTCCC	2	12	1168149	1168160	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014910	GCCGGG	2	12	1197068	1197079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014910	CTCACC	2	12	1205215	1205226	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014910	TGTTTT	2	12	1211358	1211369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014910	CAAAAA	2	12	1211745	1211756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014910	CTCGCC	2	12	1214414	1214425	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014910	CCATCA	2	12	1215177	1215188	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014910	ATGCGC	2	12	1249050	1249061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014910	AGCCAG	2	12	1296861	1296872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014910	CGAATA	2	12	1301566	1301577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014910	CCGCAT	2	12	1314805	1314816	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014910	GCGGTG	2	12	1349117	1349128	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014910	GCGGGG	2	12	1402149	1402160	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014910	GGGCAG	2	12	1501272	1501283	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014910	CCTTGG	2	12	1510597	1510608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014910	GCCGAT	2	12	1516121	1516132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014910	GCTTGC	2	12	1526358	1526369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014910	TGACGT	2	12	1593973	1593984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014910	GCCACG	2	12	1597091	1597102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014910	TGTTTT	2	12	1603677	1603688	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014910	TGTCGG	2	12	1615476	1615487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014910	GGGCCT	2	12	1625168	1625179	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014910	CATCGA	2	12	1630339	1630350	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014910	GCCCGG	2	12	1635921	1635932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014910	TGCGCG	2	12	1644881	1644892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014910	CCCTCC	2	12	1644900	1644911	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_014910	TTTTTC	2	12	1646143	1646154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014910	CCCCTT	2	12	1660173	1660184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014910	CCGCTG	2	12	1718654	1718665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014910	GAGAGT	2	12	1744130	1744141	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014910	GCAGCC	2	12	1773490	1773501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014910	GTTTTT	2	12	1827126	1827137	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014910	GGCAGC	2	12	1878540	1878551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014910	CGGACG	2	12	1918019	1918030	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014910	CCTTCT	2	12	1924276	1924287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014910	CGTGGC	2	12	1928721	1928732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014910	GCACCG	2	12	1946096	1946107	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014910	CCTGCA	2	12	1956453	1956464	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014910	CGGCGC	2	12	1990796	1990807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014910	TGGCGC	2	12	1996252	1996263	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014910	CCGCGC	2	12	2014357	2014368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014910	CAGGCC	2	12	2032028	2032039	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014910	GCAAAA	2	12	2172599	2172610	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014910	CATGAC	2	12	2172849	2172860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014910	AGCACC	2	12	2187886	2187897	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014910	AAGCCG	3	18	2192054	2192071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014910	CCAGGC	2	12	2216027	2216038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014910	CGATGG	4	24	2232253	2232276	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014910	CGGTGC	2	12	2287986	2287997	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014910	GCATGC	2	12	2299535	2299546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014910	GGTCAT	2	12	2318626	2318637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014910	GTCGTT	2	12	2329073	2329084	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014910	AGGCGC	2	12	2409728	2409739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014910	GTTTTT	2	12	2497201	2497212	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014910	TGGCGA	2	12	2538773	2538784	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014910	GCCAAA	2	12	2569363	2569374	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014910	AGCCCT	2	12	2591805	2591816	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014910	GAAAAA	2	12	2633969	2633980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014910	GCCGCG	2	12	2705188	2705199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014910	CTGGGC	2	12	2740572	2740583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014910	TGCGCG	2	12	2788097	2788108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014910	CAGCGC	2	12	2805837	2805848	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014910	GCATCG	2	12	2810725	2810736	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014910	CGCTGC	2	12	2815819	2815830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014910	ACTGCA	2	12	2815838	2815849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014910	CGGTTG	2	12	2905398	2905409	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014910	CGCGCC	3	18	2914351	2914368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014910	GCCACC	2	12	2959070	2959081	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014910	CACTGC	2	12	3013925	3013936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014910	GGTGCG	2	12	3019559	3019570	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014910	GCTGCG	2	12	3027486	3027497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014910	GAAAAA	2	12	3038831	3038842	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014910	GCAGCG	2	12	3039239	3039250	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014910	CCGGGC	2	12	3095464	3095475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014910	GCGGCC	2	12	3131539	3131550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014910	GAACCA	2	12	3144103	3144114	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014910	GCCCGC	2	12	3166817	3166828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014910	ACCTGC	2	12	3176969	3176980	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014910	GGCTGC	2	12	3241438	3241449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014910	CAGGAC	2	12	3243378	3243389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014910	GAATAT	2	12	3249550	3249561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014910	TCGCCC	2	12	3249586	3249597	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014910	ATCAAT	2	12	3297222	3297233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014910	GGGCCG	2	12	3321067	3321078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014910	CCGCGG	2	12	3574706	3574717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014910	TATCCA	2	12	3630096	3630107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014910	CCCAGC	2	12	3661659	3661670	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014910	GATGCG	2	12	3661715	3661726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014910	TGGTTG	2	12	3669574	3669585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014910	GGAGGC	2	12	3721967	3721978	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014910	GCAACA	2	12	3729736	3729747	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014910	AAATCA	2	12	3742021	3742032	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014910	TGGCCG	2	12	3781084	3781095	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_014910	CTGCGC	2	12	3873751	3873762	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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141	NC_014910	GGCGCA	2	12	3878988	3878999	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014910	CTGCGC	2	12	3901066	3901077	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014910	GCCACG	2	12	3928871	3928882	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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146	NC_014910	GCTGGC	2	12	3990923	3990934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_014910	TTGACG	2	12	3998452	3998463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_014910	GAACCA	2	12	4003978	4003989	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014910	CCCCCA	2	12	4026172	4026183	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
151	NC_014910	CCTGAC	2	12	4042095	4042106	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_014910	CAGGCG	2	12	4092829	4092840	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_014910	GGAGAA	2	12	4124927	4124938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014910	GGTTGC	2	12	4618120	4618131	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
180	NC_014910	GCCCGC	2	12	4618160	4618171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_014910	CGTCCA	2	12	4631133	4631144	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
182	NC_014910	AACGGC	2	12	4634273	4634284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.