MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 3810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014910	CGCCCA	2	12	4290006	4290017	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319764756
3502	NC_014910	CGGCCA	2	12	4290030	4290041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764756
3503	NC_014910	CCTCGC	2	12	4292035	4292046	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	319764758
3504	NC_014910	GCTCCA	2	12	4294761	4294772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319764761
3505	NC_014910	CGGCCT	2	12	4298237	4298248	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319764764
3506	NC_014910	GCGCCG	2	12	4298817	4298828	0 %	0 %	50 %	50 %	319764765
3507	NC_014910	GTAGTC	2	12	4298906	4298917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319764765
3508	NC_014910	CTTGGA	2	12	4299209	4299220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319764765
3509	NC_014910	GCGAAG	2	12	4300083	4300094	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319764765
3510	NC_014910	CATCGT	2	12	4301776	4301787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319764766
3511	NC_014910	ACATCG	2	12	4303945	4303956	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319764767
3512	NC_014910	CCACGT	2	12	4305885	4305896	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319764768
3513	NC_014910	TGCCGG	2	12	4306191	4306202	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764768
3514	NC_014910	CCAGGG	2	12	4306713	4306724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319764768
3515	NC_014910	GTCGAT	2	12	4308883	4308894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319764770
3516	NC_014910	GCAGCG	2	12	4309005	4309016	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319764770
3517	NC_014910	TCGTGC	2	12	4310094	4310105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319764770
3518	NC_014910	CTTGTG	2	12	4312551	4312562	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319764773
3519	NC_014910	GCCCAG	2	12	4314667	4314678	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764776
3520	NC_014910	CCAGCA	2	12	4314846	4314857	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319764776
3521	NC_014910	TTTTCC	2	12	4316232	4316243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319764778
3522	NC_014910	CGCTGC	2	12	4316752	4316763	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319764779
3523	NC_014910	AGTTCG	2	12	4317343	4317354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319764779
3524	NC_014910	CTTGGG	2	12	4317757	4317768	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319764780
3525	NC_014910	GACGGC	2	12	4320195	4320206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319764782
3526	NC_014910	CACCTG	2	12	4320252	4320263	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319764782
3527	NC_014910	CGCGGC	2	12	4321246	4321257	0 %	0 %	50 %	50 %	319764783
3528	NC_014910	GCATAG	2	12	4322244	4322255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319764784
3529	NC_014910	TTCAAC	2	12	4323258	4323269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319764785
3530	NC_014910	CGCTTT	2	12	4327208	4327219	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319764788
3531	NC_014910	GCAAAG	2	12	4327652	4327663	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319764789
3532	NC_014910	GAGCCA	2	12	4333389	4333400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319764794
3533	NC_014910	CCCACG	2	12	4334517	4334528	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319764796
3534	NC_014910	TTGGCC	2	12	4335088	4335099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319764797
3535	NC_014910	TGGCCA	2	12	4335848	4335859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764797
3536	NC_014910	TGGCCA	2	12	4336496	4336507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764797
3537	NC_014910	CACGGC	2	12	4338746	4338757	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764799
3538	NC_014910	GCCCTG	2	12	4339193	4339204	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319764800
3539	NC_014910	TGGCTG	2	12	4339229	4339240	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319764800
3540	NC_014910	CCGCCA	2	12	4341661	4341672	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319764803
3541	NC_014910	GGTGCT	2	12	4342227	4342238	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319764804
3542	NC_014910	GCCACG	2	12	4342819	4342830	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764805
3543	NC_014910	CCGTGG	2	12	4342913	4342924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764805
3544	NC_014910	GTTCAC	2	12	4344515	4344526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319764806
3545	NC_014910	TCCATC	2	12	4345197	4345208	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319764807
3546	NC_014910	CTGGGC	2	12	4345346	4345357	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764807
3547	NC_014910	CATGGC	2	12	4346752	4346763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764808
3548	NC_014910	CGCCGG	2	12	4347421	4347432	0 %	0 %	50 %	50 %	319764808
3549	NC_014910	CGCCCG	2	12	4347832	4347843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319764808
3550	NC_014910	TCCACC	2	12	4348215	4348226	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	319764809
3551	NC_014910	AGCCGA	2	12	4349641	4349652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319764810
3552	NC_014910	TATGCC	2	12	4351699	4351710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319764812
3553	NC_014910	CCTTGT	2	12	4351977	4351988	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319764812
3554	NC_014910	CACGGC	2	12	4352023	4352034	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764812
3555	NC_014910	CGCCGG	2	12	4354844	4354855	0 %	0 %	50 %	50 %	319764814
3556	NC_014910	GGCCAC	2	12	4355589	4355600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764815
3557	NC_014910	GCCACC	2	12	4356893	4356904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319764816
3558	NC_014910	GCAGGC	2	12	4357929	4357940	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319764818
3559	NC_014910	CCGGCG	2	12	4358001	4358012	0 %	0 %	50 %	50 %	319764818
3560	NC_014910	CCTGCA	2	12	4360553	4360564	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319764820
3561	NC_014910	CACCAA	2	12	4361905	4361916	50 %	0 %	0 %	50 %	319764821
3562	NC_014910	CTGGCC	2	12	4362473	4362484	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319764821
3563	NC_014910	TGTTCG	2	12	4363201	4363212	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319764822
3564	NC_014910	CGACGC	2	12	4363694	4363705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764822
3565	NC_014910	CCACGG	3	18	4365162	4365179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764824
3566	NC_014910	CTGCCA	2	12	4366227	4366238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319764825
3567	NC_014910	GTTCGC	2	12	4366506	4366517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319764826
3568	NC_014910	GCCGGC	2	12	4366732	4366743	0 %	0 %	50 %	50 %	319764826
3569	NC_014910	GCAGCT	2	12	4370598	4370609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764831
3570	NC_014910	GCCCAT	2	12	4370698	4370709	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319764831
3571	NC_014910	GATGGC	2	12	4370827	4370838	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319764831
3572	NC_014910	CCCACA	2	12	4371003	4371014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319764831
3573	NC_014910	CACGGT	2	12	4373748	4373759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764832
3574	NC_014910	GCCTGC	2	12	4373785	4373796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319764832
3575	NC_014910	GCCAGC	2	12	4375083	4375094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764834
3576	NC_014910	GGCCAC	2	12	4375280	4375291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764834
3577	NC_014910	AGGGCC	2	12	4375479	4375490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319764834
3578	NC_014910	CACGCG	2	12	4376382	4376393	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764836
3579	NC_014910	GCGCTG	2	12	4379242	4379253	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764839
3580	NC_014910	CCCACG	2	12	4379846	4379857	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319764839
3581	NC_014910	CTGCAG	2	12	4380697	4380708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764840
3582	NC_014910	CGAAGG	2	12	4381458	4381469	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319764841
3583	NC_014910	CGCGGC	2	12	4382016	4382027	0 %	0 %	50 %	50 %	319764842
3584	NC_014910	GCGTGG	2	12	4383912	4383923	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319764844
3585	NC_014910	GCGCGG	2	12	4385782	4385793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319764846
3586	NC_014910	CTGGCG	2	12	4386233	4386244	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764846
3587	NC_014910	CGTGGC	2	12	4386493	4386504	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764846
3588	NC_014910	CGTGGT	2	12	4387024	4387035	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319764846
3589	NC_014910	GCCGTG	2	12	4387202	4387213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764846
3590	NC_014910	GCCAGC	2	12	4388708	4388719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764848
3591	NC_014910	TGCCAT	2	12	4389084	4389095	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319764849
3592	NC_014910	GCGCCA	2	12	4391273	4391284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764850
3593	NC_014910	GGCCTC	2	12	4391427	4391438	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319764850
3594	NC_014910	CGGCCT	2	12	4391525	4391536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319764850
3595	NC_014910	ACTACG	2	12	4392713	4392724	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319764851
3596	NC_014910	GCGCAC	2	12	4394967	4394978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764854
3597	NC_014910	GCACGC	2	12	4395492	4395503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764854
3598	NC_014910	TGCCGA	2	12	4396978	4396989	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764857
3599	NC_014910	TGGCCA	2	12	4397377	4397388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319764857
3600	NC_014910	CCTGGG	2	12	4397635	4397646	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764857
3601	NC_014910	TGCGCG	2	12	4397901	4397912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764858
3602	NC_014910	GCTCGT	2	12	4400768	4400779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319764860
3603	NC_014910	GCGCAG	2	12	4401543	4401554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319764861
3604	NC_014910	GGCATG	2	12	4401950	4401961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319764862
3605	NC_014910	TGACCT	2	12	4402446	4402457	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319764862
3606	NC_014910	CAGGCC	2	12	4404076	4404087	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764864
3607	NC_014910	CCGCGC	2	12	4405924	4405935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319764865
3608	NC_014910	CCAGCG	2	12	4406721	4406732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764866
3609	NC_014910	GCCCAG	2	12	4407908	4407919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319764867
3610	NC_014910	GGCCGC	2	12	4413187	4413198	0 %	0 %	50 %	50 %	319764871
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3720	NC_014910	CTGGGG	2	12	4542362	4542373	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319764985
3721	NC_014910	TCTCGA	2	12	4543119	4543130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319764987
3722	NC_014910	TTCGTG	2	12	4543584	4543595	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319764988
3723	NC_014910	GCGCTG	2	12	4544037	4544048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764988
3724	NC_014910	TGGCCG	2	12	4544308	4544319	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764988
3725	NC_014910	CGACTT	2	12	4544771	4544782	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319764988
3726	NC_014910	CGCTGG	2	12	4545316	4545327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319764988
3727	NC_014910	CCGGCG	2	12	4548861	4548872	0 %	0 %	50 %	50 %	319764990
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3807	NC_014910	GGGCCT	2	12	4627216	4627227	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319765061
3808	NC_014910	GCCCGA	2	12	4628381	4628392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765061
3809	NC_014910	CGGCGC	2	12	4629170	4629181	0 %	0 %	50 %	50 %	319765062
3810	NC_014910	TGGACT	2	12	4635055	4635066	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319765065

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