MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 1312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014910	AGGG	2	8	1690	1697	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014910	CTAC	2	8	8157	8164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014910	GTCT	2	8	10051	10058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014910	ATGA	2	8	16882	16889	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014910	CGCA	2	8	17612	17619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014910	CGAA	2	8	17766	17773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014910	GATG	2	8	23903	23910	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014910	CCGG	2	8	24445	24452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014910	AATT	2	8	28977	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014910	TCCC	2	8	32377	32384	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_014910	GTCT	2	8	33370	33377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014910	AACA	2	8	36377	36384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014910	GGCC	2	8	37398	37405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014910	ATCC	2	8	38041	38048	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014910	GGAG	2	8	38143	38150	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014910	GTTC	2	8	41273	41280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014910	CCGT	2	8	41629	41636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014910	GTAA	2	8	46898	46905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014910	CACG	2	8	46959	46966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014910	GGGC	2	8	48757	48764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014910	CCCG	2	8	48800	48807	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014910	GCGG	2	8	57907	57914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014910	CCGC	2	8	72086	72093	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_014910	CGGG	2	8	72209	72216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014910	GGCC	2	8	72227	72234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014910	CAAA	2	8	77748	77755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014910	CGGC	2	8	87074	87081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014910	AGCA	2	8	88828	88835	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014910	TGCC	2	8	89959	89966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014910	TGGG	2	8	93427	93434	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014910	GCCG	2	8	97929	97936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014910	ACCG	2	8	98963	98970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014910	GGGC	2	8	103103	103110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014910	GCGG	2	8	113355	113362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014910	GCGT	2	8	117895	117902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014910	GCCT	2	8	123396	123403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014910	GTTG	2	8	130899	130906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014910	GCAC	2	8	131025	131032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014910	CTTT	2	8	139458	139465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014910	TGGC	2	8	145163	145170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014910	TCCC	2	8	150281	150288	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_014910	TGAA	2	8	154014	154021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014910	TTGT	2	8	170101	170108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014910	CCCT	2	8	170287	170294	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_014910	AGAA	2	8	170303	170310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014910	GCCG	2	8	172383	172390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014910	GGCG	2	8	172396	172403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014910	TTTG	2	8	179563	179570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014910	TTCG	2	8	186998	187005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014910	AAGA	2	8	196305	196312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014910	AGAA	2	8	197310	197317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014910	GATG	2	8	199704	199711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014910	CATC	2	8	203910	203917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014910	CTTT	2	8	216672	216679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014910	GGCC	2	8	223855	223862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014910	GGGC	2	8	224392	224399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014910	GGGC	2	8	224796	224803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014910	GGCG	2	8	225337	225344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014910	CTTG	2	8	232944	232951	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014910	CTGC	2	8	232958	232965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014910	GCCT	2	8	233481	233488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014910	GTTT	2	8	253478	253485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014910	CCTG	2	8	254875	254882	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014910	TCCA	2	8	264883	264890	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014910	TGCT	2	8	268363	268370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014910	CCAT	2	8	268388	268395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014910	CGTG	2	8	268452	268459	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014910	TCCG	2	8	268889	268896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014910	CAGC	2	8	269710	269717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014910	TTGG	2	8	276089	276096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014910	CCAG	2	8	280076	280083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014910	TTGA	2	8	283258	283265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014910	GGCA	2	8	283936	283943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014910	AGGA	2	8	287280	287287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014910	AGGT	2	8	295606	295613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014910	GCGG	2	8	296105	296112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014910	TGGG	2	8	296348	296355	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014910	GCTC	2	8	296711	296718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014910	AGGC	2	8	296765	296772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014910	GCCG	2	8	296905	296912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014910	CCGA	2	8	312511	312518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014910	GCGG	2	8	320837	320844	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014910	GCAG	2	8	321767	321774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014910	CCGG	2	8	325586	325593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014910	TATT	2	8	336521	336528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014910	GACG	2	8	341632	341639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014910	AGCC	2	8	343207	343214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014910	GCGG	2	8	351585	351592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014910	GGAC	2	8	351691	351698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014910	GTCG	2	8	354627	354634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014910	ACCG	2	8	361683	361690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014910	CTTT	2	8	364084	364091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014910	AGTG	2	8	364108	364115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014910	GCCA	2	8	365715	365722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014910	TGCA	2	8	378619	378626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014910	CCCT	2	8	378711	378718	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_014910	GATG	2	8	386035	386042	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014910	CAAC	2	8	387598	387605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014910	CTGG	2	8	393942	393949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014910	GGCA	2	8	403880	403887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014910	GGGC	2	8	416220	416227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014910	CCCG	2	8	429189	429196	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_014910	CCGG	2	8	431936	431943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014910	TTCA	2	8	433220	433227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014910	CTGG	2	8	434282	434289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014910	AATA	2	8	436564	436571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014910	TGCT	2	8	445349	445356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014910	TTCT	2	8	451307	451314	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014910	CCTT	2	8	452885	452892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014910	AAGA	2	8	454260	454267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014910	GGCT	2	8	458179	458186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014910	GCAA	2	8	458187	458194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014910	CTCC	2	8	458206	458213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_014910	GCCG	2	8	459662	459669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014910	GGGT	2	8	460181	460188	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014910	TGGG	2	8	460796	460803	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014910	CACC	2	8	465923	465930	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_014910	GGGT	2	8	465944	465951	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014910	GCCA	2	8	465963	465970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014910	TGGC	2	8	471915	471922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014910	TGCG	2	8	472719	472726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014910	TTTC	2	8	472889	472896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014910	GTCC	2	8	473313	473320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014910	TGGT	2	8	478326	478333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014910	CAGG	2	8	486848	486855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014910	ACTG	2	8	495293	495300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014910	GGGT	2	8	499083	499090	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014910	ATCA	2	8	500652	500659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014910	GCAA	2	8	500668	500675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014910	AAGC	2	8	502612	502619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014910	CTTT	2	8	502682	502689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014910	TTTG	2	8	502815	502822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014910	TCGC	2	8	503286	503293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014910	CGTG	2	8	503852	503859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014910	GATG	2	8	509899	509906	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014910	GCCC	2	8	513676	513683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_014910	GGCG	2	8	513693	513700	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014910	GGCG	3	12	519177	519188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014910	GAAG	2	8	527591	527598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014910	CCGG	2	8	527659	527666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014910	ATGG	2	8	530287	530294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014910	AAAG	2	8	546162	546169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014910	CGTT	2	8	553508	553515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014910	ATGC	2	8	560565	560572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014910	AATG	2	8	566042	566049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014910	GCCT	2	8	569113	569120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014910	GCCT	2	8	570167	570174	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014910	CACC	2	8	572542	572549	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_014910	AAAT	2	8	581386	581393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014910	CCGG	2	8	581440	581447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014910	CCGC	2	8	585284	585291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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454	NC_014910	GCCA	2	8	1625536	1625543	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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463	NC_014910	TCAA	2	8	1653023	1653030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_014910	CTTG	2	8	1724870	1724877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
483	NC_014910	CAGG	2	8	1725090	1725097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
484	NC_014910	GCCT	2	8	1726573	1726580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_014910	GGGA	2	8	1744100	1744107	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
486	NC_014910	GCCG	2	8	1770424	1770431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
487	NC_014910	GATG	2	8	1771166	1771173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
488	NC_014910	CTTT	2	8	1771839	1771846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
489	NC_014910	GGCG	2	8	1771951	1771958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
490	NC_014910	CGCC	2	8	1771975	1771982	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
491	NC_014910	GCTG	2	8	1772077	1772084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
492	NC_014910	GGCC	2	8	1772100	1772107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
493	NC_014910	CAGC	3	12	1772520	1772531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
494	NC_014910	CCGG	2	8	1773074	1773081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_014910	CCGC	2	8	1773168	1773175	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
496	NC_014910	ACGG	2	8	1775500	1775507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_014910	ATGA	2	8	1775556	1775563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014910	AAGC	2	8	1775581	1775588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014910	ACTG	2	8	1776937	1776944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_014910	TTCA	2	8	1777632	1777639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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