MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC chromosome

Total Repeats: 84927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014910	AGC	2	6	285	290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
2	NC_014910	AGC	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
3	NC_014910	CTG	2	6	377	382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
4	NC_014910	CTG	2	6	443	448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
5	NC_014910	GAG	2	6	584	589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760739
6	NC_014910	GCC	2	6	680	685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760739
7	NC_014910	CGG	2	6	736	741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760739
8	NC_014910	CAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760739
9	NC_014910	GCT	2	6	787	792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
10	NC_014910	CGA	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
11	NC_014910	CTG	3	9	914	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
12	NC_014910	CGA	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
13	NC_014910	TTC	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760739
14	NC_014910	GGA	2	6	964	969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760739
15	NC_014910	TTC	2	6	971	976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760739
16	NC_014910	GCT	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
17	NC_014910	AAG	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
18	NC_014910	TGA	2	6	1017	1022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760739
19	NC_014910	GCC	2	6	1108	1113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760739
20	NC_014910	CAA	2	6	1144	1149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760739
21	NC_014910	GAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760739
22	NC_014910	CTT	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760739
23	NC_014910	CTG	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
24	NC_014910	AGA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
25	NC_014910	ACT	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760739
26	NC_014910	AAG	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
27	NC_014910	AGA	2	6	1479	1484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760739
28	NC_014910	TGC	2	6	1533	1538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760739
29	NC_014910	CAG	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
30	NC_014910	CAG	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760739
31	NC_014910	GAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760739
32	NC_014910	TCG	2	6	1815	1820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
33	NC_014910	CAC	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760740
34	NC_014910	CAC	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760740
35	NC_014910	CCG	2	6	2004	2009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760740
36	NC_014910	GGC	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760740
37	NC_014910	AGG	2	6	2115	2120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760740
38	NC_014910	CTG	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
39	NC_014910	CTA	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760740
40	NC_014910	TGG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760740
41	NC_014910	AGC	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760740
42	NC_014910	AGG	2	6	2331	2336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760740
43	NC_014910	CTG	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
44	NC_014910	CAA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760740
45	NC_014910	ACC	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760740
46	NC_014910	TCA	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760740
47	NC_014910	CAT	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760740
48	NC_014910	AGG	3	9	2655	2663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760740
49	NC_014910	CGG	2	6	2689	2694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760740
50	NC_014910	GTC	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
51	NC_014910	ACA	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760740
52	NC_014910	CGT	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760740
53	NC_014910	CGA	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
54	NC_014910	CGG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
55	NC_014910	CAC	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
56	NC_014910	GGT	2	6	3155	3160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760741
57	NC_014910	CGA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
58	NC_014910	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
59	NC_014910	TCG	2	6	3205	3210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
60	NC_014910	GAC	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
61	NC_014910	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
62	NC_014910	GGC	2	6	3342	3347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
63	NC_014910	GGC	2	6	3378	3383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
64	NC_014910	GAA	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
65	NC_014910	GTG	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760741
66	NC_014910	GGT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760741
67	NC_014910	CAA	2	6	3668	3673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760741
68	NC_014910	CGA	2	6	3695	3700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
69	NC_014910	AGG	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
70	NC_014910	TCA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760741
71	NC_014910	GAA	2	6	3773	3778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
72	NC_014910	TGC	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
73	NC_014910	CGG	2	6	3833	3838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
74	NC_014910	ACG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
75	NC_014910	CAA	2	6	3917	3922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760741
76	NC_014910	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
77	NC_014910	AAG	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
78	NC_014910	GCG	2	6	4039	4044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
79	NC_014910	TGC	2	6	4065	4070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
80	NC_014910	CAG	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
81	NC_014910	CAG	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
82	NC_014910	GGA	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
83	NC_014910	TCG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
84	NC_014910	GGA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
85	NC_014910	TCG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
86	NC_014910	TCG	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
87	NC_014910	CCG	2	6	4387	4392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
88	NC_014910	ATC	2	6	4506	4511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760741
89	NC_014910	GCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
90	NC_014910	CGA	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
91	NC_014910	CGC	2	6	4592	4597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
92	NC_014910	ACC	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
93	NC_014910	CAT	4	12	4616	4627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760741
94	NC_014910	CTG	3	9	4665	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
95	NC_014910	CTT	2	6	4676	4681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760741
96	NC_014910	TCG	2	6	4702	4707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
97	NC_014910	GCC	2	6	4733	4738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
98	NC_014910	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760741
99	NC_014910	CGC	3	9	4784	4792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
100	NC_014910	CTG	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
101	NC_014910	CGG	2	6	4844	4849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
102	NC_014910	CGA	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
103	NC_014910	GGA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
104	NC_014910	GCG	2	6	5062	5067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
105	NC_014910	CCG	2	6	5071	5076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
106	NC_014910	GCC	2	6	5128	5133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
107	NC_014910	ACC	2	6	5134	5139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
108	NC_014910	AGC	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
109	NC_014910	TCA	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760741
110	NC_014910	CGA	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
111	NC_014910	CGC	2	6	5195	5200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
112	NC_014910	GCC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
113	NC_014910	AGG	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
114	NC_014910	GCG	2	6	5260	5265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760741
115	NC_014910	AGG	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760741
116	NC_014910	CAC	2	6	5342	5347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
117	NC_014910	AGC	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
118	NC_014910	ACC	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760741
119	NC_014910	GCC	2	6	5425	5430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760741
120	NC_014910	TGC	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760741
121	NC_014910	CGA	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
122	NC_014910	CGA	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760741
123	NC_014910	TCG	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760742
124	NC_014910	CTG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760742
125	NC_014910	GGC	2	6	5826	5831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760742
126	NC_014910	GCG	2	6	5953	5958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760742
127	NC_014910	GCC	2	6	5970	5975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760742
128	NC_014910	CGC	2	6	6069	6074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760743
129	NC_014910	CAG	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760743
130	NC_014910	CCA	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760743
131	NC_014910	CGC	2	6	6325	6330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760743
132	NC_014910	CCA	2	6	6346	6351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760743
133	NC_014910	GCT	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760743
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135	NC_014910	GTT	2	6	6512	6517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760743
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152	NC_014910	GCG	2	6	7489	7494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760744
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162	NC_014910	GGC	2	6	7895	7900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760744
163	NC_014910	CAG	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760744
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249	NC_014910	CGG	2	6	12779	12784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760748
250	NC_014910	CTG	2	6	12888	12893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760748
251	NC_014910	CTG	2	6	12930	12935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760748
252	NC_014910	CCA	2	6	12938	12943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760748
253	NC_014910	GTC	2	6	13026	13031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760748
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255	NC_014910	CCT	2	6	13142	13147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760748
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382	NC_014910	GGA	2	6	19525	19530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760754
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500	NC_014910	GCC	2	6	25317	25322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760758

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