MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF chromosome

Total Repeats: 902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014909	CGTAT	2	10	1280	1289	20 %	40 %	20 %	20 %	319760151
2	NC_014909	GTAAT	2	10	2242	2251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014909	ATTTG	2	10	2466	2475	20 %	60 %	20 %	0 %	319760152
4	NC_014909	TAAAA	2	10	3251	3260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014909	TATGT	2	10	3536	3545	20 %	60 %	20 %	0 %	319760153
6	NC_014909	AATAT	2	10	4770	4779	60 %	40 %	0 %	0 %	319760156
7	NC_014909	TAAAT	2	10	6238	6247	60 %	40 %	0 %	0 %	319760156
8	NC_014909	GATTT	2	10	10057	10066	20 %	60 %	20 %	0 %	319760160
9	NC_014909	ATATA	2	10	12336	12345	60 %	40 %	0 %	0 %	319760162
10	NC_014909	ATATA	2	10	12573	12582	60 %	40 %	0 %	0 %	319760162
11	NC_014909	TATTT	2	10	13253	13262	20 %	80 %	0 %	0 %	319760162
12	NC_014909	AAATG	2	10	13886	13895	60 %	20 %	20 %	0 %	319760162
13	NC_014909	TAATC	2	10	14593	14602	40 %	40 %	0 %	20 %	319760164
14	NC_014909	TATGA	2	10	14854	14863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014909	TAAAA	2	10	15588	15597	80 %	20 %	0 %	0 %	319760165
16	NC_014909	TTTAA	2	10	15793	15802	40 %	60 %	0 %	0 %	319760165
17	NC_014909	AAGGA	2	10	17601	17610	60 %	0 %	40 %	0 %	319760166
18	NC_014909	AAGAA	2	10	17654	17663	80 %	0 %	20 %	0 %	319760166
19	NC_014909	GTTTA	2	10	18284	18293	20 %	60 %	20 %	0 %	319760166
20	NC_014909	AAATT	2	10	19981	19990	60 %	40 %	0 %	0 %	319760168
21	NC_014909	AGTAT	2	10	20866	20875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014909	ATGGA	2	10	21610	21619	40 %	20 %	40 %	0 %	319760169
23	NC_014909	ATTGT	2	10	22371	22380	20 %	60 %	20 %	0 %	319760170
24	NC_014909	CGATG	2	10	22575	22584	20 %	20 %	40 %	20 %	319760170
25	NC_014909	TATTT	2	10	23039	23048	20 %	80 %	0 %	0 %	319760170
26	NC_014909	AATTA	2	10	23995	24004	60 %	40 %	0 %	0 %	319760170
27	NC_014909	TTACA	2	10	25777	25786	40 %	40 %	0 %	20 %	319760172
28	NC_014909	TAATA	2	10	27483	27492	60 %	40 %	0 %	0 %	319760173
29	NC_014909	ATAAA	2	10	29108	29117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014909	ACATA	2	10	30574	30583	60 %	20 %	0 %	20 %	319760175
31	NC_014909	TTTAG	2	10	31917	31926	20 %	60 %	20 %	0 %	319760176
32	NC_014909	TTATT	2	10	32383	32392	20 %	80 %	0 %	0 %	319760176
33	NC_014909	GTTTA	2	10	32790	32799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014909	ATTTA	2	10	34134	34143	40 %	60 %	0 %	0 %	319760178
35	NC_014909	TATAT	2	10	34857	34866	40 %	60 %	0 %	0 %	319760178
36	NC_014909	CTTTG	2	10	35052	35061	0 %	60 %	20 %	20 %	319760178
37	NC_014909	GATTG	2	10	36023	36032	20 %	40 %	40 %	0 %	319760179
38	NC_014909	AATTT	2	10	36698	36707	40 %	60 %	0 %	0 %	319760179
39	NC_014909	TGTAT	2	10	37635	37644	20 %	60 %	20 %	0 %	319760180
40	NC_014909	AATAA	2	10	37950	37959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014909	TCCAT	2	10	38606	38615	20 %	40 %	0 %	40 %	319760181
42	NC_014909	GAGTT	2	10	38818	38827	20 %	40 %	40 %	0 %	319760181
43	NC_014909	AATTT	2	10	39797	39806	40 %	60 %	0 %	0 %	319760182
44	NC_014909	TACAA	2	10	39921	39930	60 %	20 %	0 %	20 %	319760182
45	NC_014909	ATTTT	2	10	41855	41864	20 %	80 %	0 %	0 %	319760182
46	NC_014909	AAATC	2	10	42187	42196	60 %	20 %	0 %	20 %	319760183
47	NC_014909	ATTTC	2	10	43362	43371	20 %	60 %	0 %	20 %	319760184
48	NC_014909	TATAT	2	10	44361	44370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014909	ATGTG	2	10	44766	44775	20 %	40 %	40 %	0 %	319760185
50	NC_014909	CTATT	2	10	45678	45687	20 %	60 %	0 %	20 %	319760186
51	NC_014909	TTTTA	2	10	45873	45882	20 %	80 %	0 %	0 %	319760186
52	NC_014909	ATTGA	2	10	46165	46174	40 %	40 %	20 %	0 %	319760186
53	NC_014909	TGTTT	2	10	47342	47351	0 %	80 %	20 %	0 %	319760187
54	NC_014909	TATTT	2	10	47427	47436	20 %	80 %	0 %	0 %	319760187
55	NC_014909	ATATA	2	10	47777	47786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014909	TGAAA	2	10	48256	48265	60 %	20 %	20 %	0 %	319760188
57	NC_014909	GTTTT	2	10	49973	49982	0 %	80 %	20 %	0 %	319760190
58	NC_014909	TTTGT	2	10	51865	51874	0 %	80 %	20 %	0 %	319760193
59	NC_014909	TAATT	2	10	52068	52077	40 %	60 %	0 %	0 %	319760193
60	NC_014909	TTTAA	2	10	52453	52462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014909	AAATA	2	10	52770	52779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014909	GTATA	2	10	53121	53130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014909	TATTT	2	10	53261	53270	20 %	80 %	0 %	0 %	319760195
64	NC_014909	GGATT	2	10	54017	54026	20 %	40 %	40 %	0 %	319760195
65	NC_014909	CTATA	2	10	54531	54540	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014909	AAAAT	2	10	56044	56053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014909	ATGAT	2	10	56816	56825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014909	ATTAT	2	10	57211	57220	40 %	60 %	0 %	0 %	319760198
69	NC_014909	AAAAT	2	10	57265	57274	80 %	20 %	0 %	0 %	319760198
70	NC_014909	AATAT	2	10	57515	57524	60 %	40 %	0 %	0 %	319760199
71	NC_014909	AAATA	2	10	58266	58275	80 %	20 %	0 %	0 %	319760200
72	NC_014909	TAAAT	2	10	58717	58726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014909	GTTTT	2	10	59545	59554	0 %	80 %	20 %	0 %	319760201
74	NC_014909	ACGTT	2	10	59698	59707	20 %	40 %	20 %	20 %	319760201
75	NC_014909	TATTT	2	10	60204	60213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014909	ATAGA	2	10	60542	60551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014909	GATTA	2	10	67089	67098	40 %	40 %	20 %	0 %	319760206
78	NC_014909	ATATA	2	10	68812	68821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014909	AGATT	2	10	69253	69262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014909	TTTAA	2	10	70352	70361	40 %	60 %	0 %	0 %	319760209
81	NC_014909	CATAT	2	10	70402	70411	40 %	40 %	0 %	20 %	319760209
82	NC_014909	TGAAG	2	10	71316	71325	40 %	20 %	40 %	0 %	319760210
83	NC_014909	TGAAA	2	10	71835	71844	60 %	20 %	20 %	0 %	319760210
84	NC_014909	GAAAG	2	10	72072	72081	60 %	0 %	40 %	0 %	319760210
85	NC_014909	TAAAT	2	10	72351	72360	60 %	40 %	0 %	0 %	319760210
86	NC_014909	AATTA	2	10	72884	72893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014909	TGAAT	2	10	72926	72935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014909	TTATT	2	10	73161	73170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014909	GATAT	2	10	73303	73312	40 %	40 %	20 %	0 %	319760212
90	NC_014909	GTTTA	2	10	73902	73911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014909	AGTGC	2	10	74398	74407	20 %	20 %	40 %	20 %	319760213
92	NC_014909	AATTT	2	10	74911	74920	40 %	60 %	0 %	0 %	319760214
93	NC_014909	ATTTG	2	10	75050	75059	20 %	60 %	20 %	0 %	319760214
94	NC_014909	ATACA	2	10	75856	75865	60 %	20 %	0 %	20 %	319760214
95	NC_014909	TAAAA	2	10	76268	76277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014909	ATATT	2	10	76373	76382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014909	TTATA	2	10	76609	76618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014909	AATTA	2	10	76733	76742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014909	TTAAC	2	10	76807	76816	40 %	40 %	0 %	20 %	319760215
100	NC_014909	GTATA	2	10	76881	76890	40 %	40 %	20 %	0 %	319760215
101	NC_014909	AGGTA	2	10	77092	77101	40 %	20 %	40 %	0 %	319760215
102	NC_014909	AATTT	2	10	77165	77174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014909	AAAAT	2	10	77242	77251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014909	TAATA	3	15	77474	77488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014909	AAATG	2	10	77840	77849	60 %	20 %	20 %	0 %	319760217
106	NC_014909	ATTAT	2	10	81634	81643	40 %	60 %	0 %	0 %	319760219
107	NC_014909	CATAA	2	10	81937	81946	60 %	20 %	0 %	20 %	319760219
108	NC_014909	ATTAG	2	10	82738	82747	40 %	40 %	20 %	0 %	319760219
109	NC_014909	TAATT	2	10	83034	83043	40 %	60 %	0 %	0 %	319760219
110	NC_014909	TGAAA	2	10	83122	83131	60 %	20 %	20 %	0 %	319760219
111	NC_014909	ATTAT	2	10	85122	85131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014909	TTGAA	2	10	85136	85145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014909	ATTTG	2	10	85424	85433	20 %	60 %	20 %	0 %	319760221
114	NC_014909	TAAAT	2	10	85638	85647	60 %	40 %	0 %	0 %	319760221
115	NC_014909	GCATT	2	10	87192	87201	20 %	40 %	20 %	20 %	319760223
116	NC_014909	TAATT	2	10	87374	87383	40 %	60 %	0 %	0 %	319760223
117	NC_014909	ATATA	2	10	88624	88633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014909	ATGAT	2	10	89520	89529	40 %	40 %	20 %	0 %	319760224
119	NC_014909	TTTAT	2	10	89724	89733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014909	TTATA	2	10	89779	89788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014909	TACTT	2	10	90374	90383	20 %	60 %	0 %	20 %	319760225
122	NC_014909	AGTTA	2	10	90524	90533	40 %	40 %	20 %	0 %	319760225
123	NC_014909	TTGAT	2	10	91207	91216	20 %	60 %	20 %	0 %	319760225
124	NC_014909	ATTTT	2	10	94016	94025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014909	AAAGT	2	10	96442	96451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014909	AGTTT	2	10	97005	97014	20 %	60 %	20 %	0 %	319760230
127	NC_014909	TTATT	2	10	97372	97381	20 %	80 %	0 %	0 %	319760232
128	NC_014909	ATAAG	2	10	97777	97786	60 %	20 %	20 %	0 %	319760232
129	NC_014909	AATAT	2	10	99102	99111	60 %	40 %	0 %	0 %	319760234
130	NC_014909	AATAT	2	10	100529	100538	60 %	40 %	0 %	0 %	319760234
131	NC_014909	AGATG	2	10	101195	101204	40 %	20 %	40 %	0 %	319760235
132	NC_014909	TTTGT	2	10	101289	101298	0 %	80 %	20 %	0 %	319760235
133	NC_014909	TAATT	2	10	101399	101408	40 %	60 %	0 %	0 %	319760235
134	NC_014909	ATTAA	2	10	101730	101739	60 %	40 %	0 %	0 %	319760235
135	NC_014909	TGATA	2	10	102485	102494	40 %	40 %	20 %	0 %	319760235
136	NC_014909	TTTTA	2	10	102572	102581	20 %	80 %	0 %	0 %	319760235
137	NC_014909	ATTTG	2	10	103774	103783	20 %	60 %	20 %	0 %	319760235
138	NC_014909	AATTT	2	10	104695	104704	40 %	60 %	0 %	0 %	319760235
139	NC_014909	TTGAT	2	10	104975	104984	20 %	60 %	20 %	0 %	319760236
140	NC_014909	GTCAT	2	10	105321	105330	20 %	40 %	20 %	20 %	319760236
141	NC_014909	TATGT	2	10	105513	105522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_014909	TAGTT	2	10	226126	226135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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