MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF chromosome

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014909	GTAAT	2	10	2242	2251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014909	TAAAA	2	10	3251	3260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014909	TATGA	2	10	14854	14863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014909	AGTAT	2	10	20866	20875	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014909	ATAAA	2	10	29108	29117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014909	GTTTA	2	10	32790	32799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014909	AATAA	2	10	37950	37959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014909	TATAT	2	10	44361	44370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014909	ATATA	2	10	47777	47786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014909	TTTAA	2	10	52453	52462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014909	AAATA	2	10	52770	52779	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014909	GTATA	2	10	53121	53130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014909	CTATA	2	10	54531	54540	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014909	AAAAT	2	10	56044	56053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014909	ATGAT	2	10	56816	56825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014909	TAAAT	2	10	58717	58726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014909	TATTT	2	10	60204	60213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014909	ATAGA	2	10	60542	60551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014909	ATATA	2	10	68812	68821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014909	AGATT	2	10	69253	69262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014909	AATTA	2	10	72884	72893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014909	TGAAT	2	10	72926	72935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014909	TTATT	2	10	73161	73170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014909	GTTTA	2	10	73902	73911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014909	TAAAA	2	10	76268	76277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014909	ATATT	2	10	76373	76382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014909	TTATA	2	10	76609	76618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014909	AATTA	2	10	76733	76742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014909	AATTT	2	10	77165	77174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014909	AAAAT	2	10	77242	77251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014909	TAATA	3	15	77474	77488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014909	ATTAT	2	10	85122	85131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014909	TTGAA	2	10	85136	85145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014909	ATATA	2	10	88624	88633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014909	TTTAT	2	10	89724	89733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014909	TTATA	2	10	89779	89788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014909	ATTTT	2	10	94016	94025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014909	AAAGT	2	10	96442	96451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014909	TATGT	2	10	105513	105522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014909	ATATA	2	10	117373	117382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014909	TATAT	2	10	120207	120216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014909	TGTTT	2	10	121702	121711	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014909	TATTT	2	10	124462	124471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014909	TAAGG	2	10	124534	124543	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014909	TGATG	2	10	126639	126648	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014909	TAAAT	2	10	134885	134894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014909	AAACA	2	10	136186	136195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014909	TACAA	2	10	155015	155024	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014909	ATTTA	2	10	160035	160044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014909	ATTTT	2	10	181915	181924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014909	AATGA	2	10	181950	181959	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014909	ATTTA	2	10	182122	182131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014909	TTATG	2	10	182443	182452	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014909	TTTTA	2	10	183993	184002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014909	AATAA	2	10	188459	188468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014909	AATTA	2	10	189059	189068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014909	ATTTA	2	10	189331	189340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014909	AGGTG	2	10	192013	192022	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014909	TTTAA	2	10	192512	192521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014909	AATTA	2	10	196205	196214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014909	ATTTT	2	10	207205	207214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014909	TAATA	2	10	211611	211620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014909	TATCG	2	10	211833	211842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014909	TAATA	2	10	212731	212740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014909	GTAAT	2	10	212913	212922	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014909	TATAG	2	10	215436	215445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014909	TTTGT	2	10	215481	215490	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014909	TTTCA	2	10	218619	218628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014909	TAGAA	2	10	225601	225610	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014909	TAGTT	2	10	226126	226135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014909	AAGAG	2	10	231273	231282	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014909	AATTT	2	10	241474	241483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014909	ATAAA	2	10	243748	243757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014909	TGATT	2	10	245412	245421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014909	AGTTA	2	10	246643	246652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014909	TTTTA	2	10	248159	248168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014909	AAATA	2	10	249130	249139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014909	TAAAA	2	10	249157	249166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014909	ATATT	2	10	250018	250027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014909	TATAT	3	15	250707	250721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014909	ATTAT	2	10	250768	250777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014909	AAAAT	2	10	252811	252820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014909	TACAT	2	10	260771	260780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014909	ATTTT	2	10	260879	260888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014909	TAAAA	2	10	261057	261066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014909	TTTAT	2	10	269344	269353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014909	AAATT	2	10	269524	269533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014909	ATTAA	2	10	269846	269855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014909	ATTTT	2	10	270057	270066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014909	TGTAA	2	10	278829	278838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014909	GTTAT	2	10	280104	280113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014909	ATTTA	2	10	280125	280134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014909	TTAGT	2	10	283590	283599	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014909	TATTT	2	10	283706	283715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014909	TATCA	2	10	287504	287513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014909	TAAAA	2	10	287700	287709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014909	ATAAG	2	10	287756	287765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014909	TAATT	2	10	287928	287937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014909	TGTAT	2	10	299129	299138	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014909	ATTAT	2	10	303833	303842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014909	TTATA	2	10	304881	304890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014909	ATTAC	2	10	306716	306725	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014909	GTATC	2	10	309543	309552	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014909	TATAA	2	10	312813	312822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014909	ATTAA	2	10	324728	324737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014909	TATTG	2	10	328455	328464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014909	ATTAG	2	10	334896	334905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014909	ATTGT	2	10	336750	336759	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014909	ATATT	2	10	338260	338269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014909	AAGTA	2	10	338284	338293	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014909	ACCCT	2	10	338310	338319	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_014909	GGGTT	2	10	340896	340905	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014909	TATAA	2	10	344995	345004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014909	TCAAA	2	10	348849	348858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014909	AAATA	2	10	350047	350056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014909	AATTA	2	10	351224	351233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014909	TGATT	2	10	360646	360655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014909	TAAAT	2	10	362317	362326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014909	ATATT	2	10	364276	364285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014909	GAAAT	2	10	366918	366927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014909	TAAAT	2	10	367090	367099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014909	TATAT	2	10	369439	369448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014909	ATTAT	2	10	369943	369952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014909	TAATA	2	10	370147	370156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014909	AGGTA	2	10	370684	370693	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014909	AATTT	2	10	370701	370710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014909	ATTTA	2	10	370796	370805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014909	TTATT	2	10	371299	371308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014909	TAATT	2	10	371380	371389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014909	TAAAG	2	10	381504	381513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014909	TCTAT	2	10	386878	386887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014909	ATATT	2	10	387101	387110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014909	ATTTA	2	10	388329	388338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014909	CTATA	2	10	388353	388362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014909	AAAAT	2	10	388376	388385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014909	ATTTT	2	10	389257	389266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014909	TTAAT	2	10	390004	390013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014909	TAAAA	2	10	391282	391291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014909	ATATT	2	10	394857	394866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014909	AATAA	2	10	394938	394947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014909	TTTTA	2	10	398189	398198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014909	TTAAT	2	10	398671	398680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014909	ATTTT	2	10	404796	404805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014909	AATTT	2	10	414850	414859	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014909	ATTTA	2	10	420233	420242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014909	TAAAA	2	10	430008	430017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014909	AATAC	2	10	432658	432667	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014909	TTAAA	2	10	434334	434343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014909	AATTT	2	10	434545	434554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.