MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	GGGCAA	2	12	6067	6078	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319760032
2	NC_014908	CCAACA	2	12	6975	6986	50 %	0 %	0 %	50 %	319760032
3	NC_014908	TCATGT	2	12	14379	14390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319760039
4	NC_014908	CTCGAA	2	12	20659	20670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319760045
5	NC_014908	CTCGCT	2	12	21937	21948	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319760047
6	NC_014908	AGAGGC	2	12	24860	24871	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319760050
7	NC_014908	CAAAAC	2	12	28575	28586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760050
8	NC_014908	AATGAA	2	12	30010	30021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319760051
9	NC_014908	GCCGTG	2	12	30822	30833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319760052
10	NC_014908	CTCGTT	2	12	31369	31380	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319760053
11	NC_014908	TGGAGG	2	12	34551	34562	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	319760054
12	NC_014908	GTAGCG	3	18	36101	36118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319760054
13	NC_014908	GCACCG	2	12	36475	36486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
14	NC_014908	GCACCG	2	12	36889	36900	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
15	NC_014908	GCACCG	2	12	37027	37038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
16	NC_014908	GCACCG	2	12	37303	37314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
17	NC_014908	GCACCG	2	12	37648	37659	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
18	NC_014908	CGGCTC	2	12	38117	38128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319760054
19	NC_014908	GGCGGG	2	12	38212	38223	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	319760054
20	NC_014908	TGCCCG	2	12	40800	40811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319760057
21	NC_014908	TGTTGG	2	12	46772	46783	0 %	50 %	50 %	0 %	319760061
22	NC_014908	ACCTGC	2	12	50388	50399	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319760067
23	NC_014908	TCGACC	2	12	52382	52393	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319760071
24	NC_014908	CTGGCG	2	12	58760	58771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319760083
25	NC_014908	GCCAAG	2	12	61046	61057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760088
26	NC_014908	GAATTG	2	12	69162	69173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760103
27	NC_014908	TCGAAC	2	12	73390	73401	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319760110
28	NC_014908	GTCGGC	2	12	74136	74147	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319760110
29	NC_014908	ACTGGC	2	12	74195	74206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319760110
30	NC_014908	AGGTAG	2	12	75166	75177	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319760110
31	NC_014908	TTCGCG	2	12	75324	75335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760110
32	NC_014908	ATGGAA	2	12	78501	78512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319760114
33	NC_014908	TGATCG	2	12	79964	79975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319760115
34	NC_014908	GGCGTC	2	12	82902	82913	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319760119
35	NC_014908	GCAGCG	2	12	83242	83253	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319760120
36	NC_014908	GTACTG	2	12	84132	84143	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319760121
37	NC_014908	CAACGC	2	12	91705	91716	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319760127
38	NC_014908	GGCGAC	2	12	97253	97264	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319760130
39	NC_014908	CTGCGT	2	12	99863	99874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760131
40	NC_014908	TTCCAT	2	12	108020	108031	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319760140
41	NC_014908	GGAATG	2	12	116622	116633	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319760147

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.