MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	GACGC	2	10	143	152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014908	TCAAT	2	10	10742	10751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014908	GTTAA	2	10	61287	61296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014908	CGCTG	2	10	65714	65723	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014908	CGAAC	2	10	65828	65837	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014908	TTCGA	2	10	77671	77680	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014908	GCCGC	2	10	78923	78932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014908	CGGGT	2	10	78986	78995	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014908	GACGT	2	10	79156	79165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014908	GCAAG	2	10	80316	80325	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014908	TGAGG	2	10	94077	94086	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014908	TTGAT	2	10	94265	94274	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014908	TGGGT	2	10	104065	104074	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014908	ACGTC	2	10	107367	107376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014908	ACCCG	2	10	107537	107546	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014908	CGGCG	2	10	107596	107605	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014908	TCGAA	2	10	108853	108862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014908	CGATG	2	10	111417	111426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014908	GCGCA	2	10	111638	111647	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.