MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	CTTC	2	8	258	265	0 %	50 %	0 %	50 %	319760025
2	NC_014908	TGCG	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	319760025
3	NC_014908	CGAG	2	8	1803	1810	25 %	0 %	50 %	25 %	319760026
4	NC_014908	GCCC	2	8	1910	1917	0 %	0 %	25 %	75 %	319760026
5	NC_014908	TCAA	2	8	2015	2022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014908	GGTG	2	8	2545	2552	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014908	GAAT	2	8	3066	3073	50 %	25 %	25 %	0 %	319760027
8	NC_014908	CGCT	2	8	3499	3506	0 %	25 %	25 %	50 %	319760028
9	NC_014908	CGCT	2	8	3560	3567	0 %	25 %	25 %	50 %	319760028
10	NC_014908	AAGC	2	8	3787	3794	50 %	0 %	25 %	25 %	319760028
11	NC_014908	GTGA	2	8	3866	3873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014908	GGAC	2	8	4195	4202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014908	AAAT	2	8	4227	4234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014908	CAAT	2	8	4242	4249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014908	ATTG	2	8	4266	4273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014908	GGAC	2	8	5757	5764	25 %	0 %	50 %	25 %	319760032
17	NC_014908	TGGG	2	8	5793	5800	0 %	25 %	75 %	0 %	319760032
18	NC_014908	GGGC	2	8	6310	6317	0 %	0 %	75 %	25 %	319760032
19	NC_014908	CACG	2	8	6517	6524	25 %	0 %	25 %	50 %	319760032
20	NC_014908	TGAG	2	8	7179	7186	25 %	25 %	50 %	0 %	319760032
21	NC_014908	ACCA	2	8	7478	7485	50 %	0 %	0 %	50 %	319760033
22	NC_014908	GCTG	2	8	7542	7549	0 %	25 %	50 %	25 %	319760033
23	NC_014908	CTGG	2	8	8142	8149	0 %	25 %	50 %	25 %	319760034
24	NC_014908	CATC	2	8	8316	8323	25 %	25 %	0 %	50 %	319760034
25	NC_014908	GAGG	2	8	9233	9240	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014908	GGCG	2	8	9444	9451	0 %	0 %	75 %	25 %	319760036
27	NC_014908	AATG	2	8	9797	9804	50 %	25 %	25 %	0 %	319760036
28	NC_014908	GCGG	2	8	9870	9877	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014908	GTTG	2	8	10550	10557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014908	ACTG	2	8	11007	11014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014908	ACAA	2	8	12144	12151	75 %	0 %	0 %	25 %	319760037
32	NC_014908	AAAC	2	8	13057	13064	75 %	0 %	0 %	25 %	319760037
33	NC_014908	AGGT	2	8	14272	14279	25 %	25 %	50 %	0 %	319760038
34	NC_014908	GCAA	2	8	14876	14883	50 %	0 %	25 %	25 %	319760040
35	NC_014908	TCAT	2	8	14935	14942	25 %	50 %	0 %	25 %	319760040
36	NC_014908	GCCG	2	8	15261	15268	0 %	0 %	50 %	50 %	319760040
37	NC_014908	CCTG	2	8	16813	16820	0 %	25 %	25 %	50 %	319760042
38	NC_014908	CGCC	2	8	17019	17026	0 %	0 %	25 %	75 %	319760042
39	NC_014908	GCCG	2	8	17068	17075	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
40	NC_014908	AGCG	2	8	17252	17259	25 %	0 %	50 %	25 %	319760042
41	NC_014908	GCGG	2	8	17269	17276	0 %	0 %	75 %	25 %	319760042
42	NC_014908	ACGG	2	8	17345	17352	25 %	0 %	50 %	25 %	319760042
43	NC_014908	CGGC	2	8	17783	17790	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
44	NC_014908	ACGC	2	8	18093	18100	25 %	0 %	25 %	50 %	319760043
45	NC_014908	AAGC	2	8	18458	18465	50 %	0 %	25 %	25 %	319760044
46	NC_014908	GCGG	2	8	18555	18562	0 %	0 %	75 %	25 %	319760044
47	NC_014908	CATG	2	8	19161	19168	25 %	25 %	25 %	25 %	319760045
48	NC_014908	GTTT	2	8	19334	19341	0 %	75 %	25 %	0 %	319760045
49	NC_014908	ACCT	2	8	19882	19889	25 %	25 %	0 %	50 %	319760045
50	NC_014908	GGGC	2	8	20189	20196	0 %	0 %	75 %	25 %	319760045
51	NC_014908	AAGC	2	8	20284	20291	50 %	0 %	25 %	25 %	319760045
52	NC_014908	TCAT	2	8	20308	20315	25 %	50 %	0 %	25 %	319760045
53	NC_014908	TCGC	2	8	20448	20455	0 %	25 %	25 %	50 %	319760045
54	NC_014908	ATTC	2	8	20949	20956	25 %	50 %	0 %	25 %	319760045
55	NC_014908	CAAG	2	8	21727	21734	50 %	0 %	25 %	25 %	319760046
56	NC_014908	GGCC	2	8	22164	22171	0 %	0 %	50 %	50 %	319760047
57	NC_014908	GCTC	2	8	23592	23599	0 %	25 %	25 %	50 %	319760049
58	NC_014908	CAGC	2	8	23979	23986	25 %	0 %	25 %	50 %	319760049
59	NC_014908	TGAT	2	8	24038	24045	25 %	50 %	25 %	0 %	319760049
60	NC_014908	CGGC	2	8	24761	24768	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
61	NC_014908	CGGA	2	8	26439	26446	25 %	0 %	50 %	25 %	319760050
62	NC_014908	TGGG	2	8	26458	26465	0 %	25 %	75 %	0 %	319760050
63	NC_014908	CAGG	2	8	26610	26617	25 %	0 %	50 %	25 %	319760050
64	NC_014908	CCCA	2	8	26975	26982	25 %	0 %	0 %	75 %	319760050
65	NC_014908	ACGT	2	8	27695	27702	25 %	25 %	25 %	25 %	319760050
66	NC_014908	CAAG	2	8	27866	27873	50 %	0 %	25 %	25 %	319760050
67	NC_014908	GATT	2	8	28069	28076	25 %	50 %	25 %	0 %	319760050
68	NC_014908	TGCA	2	8	28091	28098	25 %	25 %	25 %	25 %	319760050
69	NC_014908	GAAC	2	8	28124	28131	50 %	0 %	25 %	25 %	319760050
70	NC_014908	CAAA	2	8	28259	28266	75 %	0 %	0 %	25 %	319760050
71	NC_014908	CCTT	2	8	28842	28849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014908	GCCA	2	8	28988	28995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014908	ACCG	2	8	29110	29117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014908	GACC	2	8	29427	29434	25 %	0 %	25 %	50 %	319760051
75	NC_014908	ACCG	2	8	29584	29591	25 %	0 %	25 %	50 %	319760051
76	NC_014908	ATGC	2	8	29869	29876	25 %	25 %	25 %	25 %	319760051
77	NC_014908	GGTT	2	8	29881	29888	0 %	50 %	50 %	0 %	319760051
78	NC_014908	GCCC	2	8	30305	30312	0 %	0 %	25 %	75 %	319760052
79	NC_014908	CGTG	2	8	30770	30777	0 %	25 %	50 %	25 %	319760052
80	NC_014908	GCTT	2	8	30976	30983	0 %	50 %	25 %	25 %	319760052
81	NC_014908	GCTG	2	8	31337	31344	0 %	25 %	50 %	25 %	319760053
82	NC_014908	TGAA	2	8	32514	32521	50 %	25 %	25 %	0 %	319760053
83	NC_014908	AGGG	2	8	32758	32765	25 %	0 %	75 %	0 %	319760054
84	NC_014908	ACAA	2	8	33411	33418	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
85	NC_014908	CAAA	2	8	33522	33529	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
86	NC_014908	TGGT	2	8	33807	33814	0 %	50 %	50 %	0 %	319760054
87	NC_014908	CAAC	2	8	34228	34235	50 %	0 %	0 %	50 %	319760054
88	NC_014908	GGAT	2	8	34482	34489	25 %	25 %	50 %	0 %	319760054
89	NC_014908	AGTC	2	8	34495	34502	25 %	25 %	25 %	25 %	319760054
90	NC_014908	CAAA	2	8	35013	35020	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
91	NC_014908	CAAT	2	8	35551	35558	50 %	25 %	0 %	25 %	319760054
92	NC_014908	GAAA	2	8	35724	35731	75 %	0 %	25 %	0 %	319760054
93	NC_014908	CATC	2	8	35923	35930	25 %	25 %	0 %	50 %	319760054
94	NC_014908	GCAG	2	8	35964	35971	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
95	NC_014908	CGGC	2	8	36029	36036	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
96	NC_014908	CGAG	2	8	36503	36510	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
97	NC_014908	CCGA	2	8	36571	36578	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
98	NC_014908	CGAG	2	8	36779	36786	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
99	NC_014908	CGAG	2	8	36917	36924	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
100	NC_014908	CGAG	2	8	37055	37062	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
101	NC_014908	CCGA	2	8	37123	37130	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
102	NC_014908	CGAG	2	8	37193	37200	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
103	NC_014908	CGAG	2	8	37331	37338	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
104	NC_014908	CGAG	2	8	37400	37407	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
105	NC_014908	CGAG	2	8	37538	37545	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
106	NC_014908	CGAG	2	8	37676	37683	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
107	NC_014908	CCGA	2	8	37744	37751	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
108	NC_014908	CGAG	2	8	37814	37821	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
109	NC_014908	CGAG	2	8	38021	38028	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
110	NC_014908	AAGG	2	8	38327	38334	50 %	0 %	50 %	0 %	319760054
111	NC_014908	AACG	2	8	38469	38476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014908	GACC	2	8	38621	38628	25 %	0 %	25 %	50 %	319760055
113	NC_014908	GGCC	2	8	39125	39132	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
114	NC_014908	CAGG	2	8	39242	39249	25 %	0 %	50 %	25 %	319760055
115	NC_014908	ATCG	2	8	39791	39798	25 %	25 %	25 %	25 %	319760056
116	NC_014908	GACG	2	8	39920	39927	25 %	0 %	50 %	25 %	319760056
117	NC_014908	TTCA	2	8	40266	40273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014908	GGCC	2	8	40674	40681	0 %	0 %	50 %	50 %	319760057
119	NC_014908	GCAC	2	8	41226	41233	25 %	0 %	25 %	50 %	319760058
120	NC_014908	TGGC	2	8	41542	41549	0 %	25 %	50 %	25 %	319760058
121	NC_014908	CCAG	2	8	41822	41829	25 %	0 %	25 %	50 %	319760058
122	NC_014908	CAGC	2	8	42528	42535	25 %	0 %	25 %	50 %	319760058
123	NC_014908	CCAC	2	8	43404	43411	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_014908	GGGC	2	8	43505	43512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014908	CGCC	2	8	43710	43717	0 %	0 %	25 %	75 %	319760059
126	NC_014908	GGCT	2	8	43834	43841	0 %	25 %	50 %	25 %	319760059
127	NC_014908	ACGC	2	8	44291	44298	25 %	0 %	25 %	50 %	319760059
128	NC_014908	CTGG	2	8	44354	44361	0 %	25 %	50 %	25 %	319760059
129	NC_014908	GCTG	2	8	44505	44512	0 %	25 %	50 %	25 %	319760059
130	NC_014908	CACC	2	8	44606	44613	25 %	0 %	0 %	75 %	319760059
131	NC_014908	GAGG	2	8	45141	45148	25 %	0 %	75 %	0 %	319760059
132	NC_014908	GGGT	2	8	45978	45985	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014908	CTAA	2	8	46038	46045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014908	TCGC	2	8	46730	46737	0 %	25 %	25 %	50 %	319760061
135	NC_014908	TCGG	2	8	46996	47003	0 %	25 %	50 %	25 %	319760061
136	NC_014908	AAGA	2	8	47182	47189	75 %	0 %	25 %	0 %	319760061
137	NC_014908	CCCG	2	8	48640	48647	0 %	0 %	25 %	75 %	319760065
138	NC_014908	GCGT	2	8	49085	49092	0 %	25 %	50 %	25 %	319760065
139	NC_014908	ATCG	2	8	49199	49206	25 %	25 %	25 %	25 %	319760066
140	NC_014908	TGAG	2	8	49635	49642	25 %	25 %	50 %	0 %	319760066
141	NC_014908	AAGC	2	8	49818	49825	50 %	0 %	25 %	25 %	319760066
142	NC_014908	CGGC	2	8	49915	49922	0 %	0 %	50 %	50 %	319760066
143	NC_014908	GCTA	2	8	50185	50192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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325	NC_014908	ATTC	2	8	115988	115995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
326	NC_014908	GGCC	2	8	115999	116006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
327	NC_014908	CGGT	2	8	116030	116037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
328	NC_014908	TTGG	2	8	116347	116354	0 %	50 %	50 %	0 %	319760147
329	NC_014908	CCAT	2	8	116366	116373	25 %	25 %	0 %	50 %	319760147
330	NC_014908	TGCG	2	8	116409	116416	0 %	25 %	50 %	25 %	319760147
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337	NC_014908	CGAA	2	8	118542	118549	50 %	0 %	25 %	25 %	319760149
338	NC_014908	GGCA	2	8	119058	119065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
339	NC_014908	TCCA	2	8	119195	119202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
340	NC_014908	TGCC	2	8	119226	119233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
341	NC_014908	CTGT	2	8	119632	119639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.