MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	TCAA	2	8	2015	2022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014908	GGTG	2	8	2545	2552	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014908	GTGA	2	8	3866	3873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014908	GGAC	2	8	4195	4202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014908	AAAT	2	8	4227	4234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014908	CAAT	2	8	4242	4249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014908	ATTG	2	8	4266	4273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014908	GAGG	2	8	9233	9240	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014908	GCGG	2	8	9870	9877	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014908	GTTG	2	8	10550	10557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014908	ACTG	2	8	11007	11014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014908	CCTT	2	8	28842	28849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014908	GCCA	2	8	28988	28995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014908	ACCG	2	8	29110	29117	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014908	AACG	2	8	38469	38476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014908	TTCA	2	8	40266	40273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014908	CCAC	2	8	43404	43411	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_014908	GGGC	2	8	43505	43512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014908	GGGT	2	8	45978	45985	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014908	CTAA	2	8	46038	46045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014908	GCTA	2	8	50185	50192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014908	GGGT	2	8	51083	51090	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014908	GACA	2	8	60144	60151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014908	GAGC	2	8	60175	60182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014908	AGGA	2	8	61686	61693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014908	AGCG	2	8	61938	61945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014908	CCAA	2	8	61977	61984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014908	TGAT	2	8	62755	62762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014908	AAAC	2	8	63897	63904	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014908	AGCC	2	8	65537	65544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014908	ATTG	3	12	69170	69181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014908	CCAA	2	8	76040	76047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014908	CGGC	2	8	76172	76179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014908	GCGG	2	8	76199	76206	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014908	AGCG	2	8	76323	76330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014908	AACG	2	8	76382	76389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014908	CGAA	2	8	76433	76440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014908	CGCC	2	8	76755	76762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_014908	TCCG	2	8	77614	77621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014908	CATC	2	8	78893	78900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014908	AATC	2	8	80391	80398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014908	CGAA	2	8	87940	87947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014908	CCGT	2	8	88330	88337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014908	CTGG	2	8	88371	88378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014908	TGAG	2	8	89100	89107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014908	CATG	2	8	94319	94326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014908	ATGA	2	8	94590	94597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014908	TGCT	2	8	94636	94643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014908	GATG	2	8	107632	107639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014908	CCGC	2	8	108827	108834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014908	CGGA	2	8	108912	108919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014908	GGCG	2	8	109771	109778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014908	CTGG	2	8	111061	111068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014908	TGGC	2	8	111180	111187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014908	ACCT	2	8	111355	111362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014908	TGGC	2	8	112151	112158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014908	GCAC	2	8	112454	112461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014908	CCGG	3	12	112978	112989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014908	GCGA	2	8	113746	113753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014908	AAGC	2	8	114006	114013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014908	ACGA	2	8	115710	115717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014908	ATTC	2	8	115988	115995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014908	GGCC	2	8	115999	116006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014908	CGGT	2	8	116030	116037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014908	GGCA	2	8	119058	119065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014908	TCCA	2	8	119195	119202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014908	TGCC	2	8	119226	119233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014908	CTGT	2	8	119632	119639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.