MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 1575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	GTT	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014908	GAG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014908	CGC	2	6	267	272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
4	NC_014908	TGC	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760025
5	NC_014908	ACG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
6	NC_014908	TTC	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760025
7	NC_014908	CGA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
8	NC_014908	GGC	2	6	487	492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760025
9	NC_014908	GCG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760025
10	NC_014908	AGT	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760025
11	NC_014908	GCC	2	6	640	645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
12	NC_014908	TCT	2	6	657	662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760025
13	NC_014908	GCT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760025
14	NC_014908	GCC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760025
15	NC_014908	ACC	2	6	881	886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760025
16	NC_014908	ACG	2	6	1025	1030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760025
17	NC_014908	AGG	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760025
18	NC_014908	CTT	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760026
19	NC_014908	TCG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760026
20	NC_014908	GTG	2	6	1419	1424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760026
21	NC_014908	AGC	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760026
22	NC_014908	TCG	2	6	1615	1620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760026
23	NC_014908	GAT	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760026
24	NC_014908	AGA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760026
25	NC_014908	CCA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760026
26	NC_014908	CCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760026
27	NC_014908	AAT	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014908	AGG	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014908	AAC	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014908	GCC	2	6	2249	2254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014908	CGC	2	6	2324	2329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014908	GGC	2	6	2347	2352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014908	AGA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014908	GAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014908	GCA	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014908	AGT	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014908	GCT	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014908	GTT	2	6	2892	2897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014908	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014908	CTA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014908	CGA	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760028
42	NC_014908	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760028
43	NC_014908	GCC	2	6	3690	3695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760028
44	NC_014908	GCA	2	6	3780	3785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760028
45	NC_014908	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014908	CGA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014908	CAA	2	6	4184	4189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014908	GAA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760029
49	NC_014908	ATT	2	6	4411	4416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760029
50	NC_014908	TGG	2	6	4449	4454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760029
51	NC_014908	TTC	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760029
52	NC_014908	GCG	2	6	4668	4673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760030
53	NC_014908	GAA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760030
54	NC_014908	GAG	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760030
55	NC_014908	TGG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760030
56	NC_014908	ACC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014908	CAA	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014908	AGA	2	6	5036	5041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760031
59	NC_014908	ACA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760031
60	NC_014908	CCT	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760031
61	NC_014908	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760031
62	NC_014908	GTG	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760031
63	NC_014908	TCG	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760031
64	NC_014908	GTC	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760031
65	NC_014908	ATT	2	6	5449	5454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760032
66	NC_014908	GGC	2	6	5472	5477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
67	NC_014908	GGT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760032
68	NC_014908	GCG	3	9	5540	5548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
69	NC_014908	AAG	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760032
70	NC_014908	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760032
71	NC_014908	AGC	2	6	6175	6180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
72	NC_014908	GTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760032
73	NC_014908	TCA	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
74	NC_014908	ACG	2	6	6432	6437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
75	NC_014908	CTA	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
76	NC_014908	GAT	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760032
77	NC_014908	TGT	2	6	6609	6614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760032
78	NC_014908	CGT	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760032
79	NC_014908	ATC	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
80	NC_014908	CGA	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
81	NC_014908	CGG	2	6	6762	6767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760032
82	NC_014908	GCC	2	6	6833	6838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760032
83	NC_014908	GGT	2	6	6841	6846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760032
84	NC_014908	CAA	2	6	6847	6852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760032
85	NC_014908	CGA	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760032
86	NC_014908	GAA	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760032
87	NC_014908	ACC	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760032
88	NC_014908	CAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760032
89	NC_014908	CCA	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760033
90	NC_014908	TCG	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760033
91	NC_014908	TGC	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760033
92	NC_014908	TGG	2	6	7764	7769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760033
93	NC_014908	TTC	2	6	7820	7825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760033
94	NC_014908	AGC	3	9	7834	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760033
95	NC_014908	GCT	2	6	8007	8012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760034
96	NC_014908	GCC	3	9	8062	8070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760034
97	NC_014908	TTG	2	6	8192	8197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760034
98	NC_014908	ATG	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760034
99	NC_014908	ATT	2	6	8407	8412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760034
100	NC_014908	AAG	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760034
101	NC_014908	AGC	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760034
102	NC_014908	CTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760034
103	NC_014908	AAT	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760035
104	NC_014908	TTC	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760035
105	NC_014908	CTC	2	6	8757	8762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319760035
106	NC_014908	GGC	2	6	8769	8774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760035
107	NC_014908	ATC	2	6	8823	8828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760035
108	NC_014908	AGC	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
109	NC_014908	ATT	2	6	8877	8882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760035
110	NC_014908	CGC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760035
111	NC_014908	TAA	2	6	8954	8959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760035
112	NC_014908	CAG	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
113	NC_014908	CGT	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760035
114	NC_014908	AGA	2	6	9034	9039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760035
115	NC_014908	CAG	2	6	9041	9046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760035
116	NC_014908	AGA	2	6	9047	9052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760035
117	NC_014908	CAA	2	6	9202	9207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014908	ATG	2	6	9315	9320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760036
119	NC_014908	CGC	2	6	9359	9364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760036
120	NC_014908	CAA	2	6	9470	9475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760036
121	NC_014908	CAG	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760036
122	NC_014908	ACA	2	6	9541	9546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760036
123	NC_014908	GCG	2	6	9702	9707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760036
124	NC_014908	AAG	2	6	9729	9734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760036
125	NC_014908	TGC	2	6	9899	9904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014908	CTT	2	6	10213	10218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014908	GCC	2	6	10220	10225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014908	GCA	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014908	AGC	2	6	10475	10480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014908	ATA	2	6	10606	10611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014908	GTT	3	9	10863	10871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014908	CAG	2	6	10942	10947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014908	ATT	2	6	10986	10991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014908	TGA	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014908	ACG	2	6	11269	11274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014908	TGG	2	6	11344	11349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014908	CGA	2	6	11462	11467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760037
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157	NC_014908	TTG	2	6	13722	13727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_014908	CGG	2	6	21781	21786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_014908	ACG	2	6	22324	22329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760047
260	NC_014908	CGA	2	6	22471	22476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_014908	GCA	2	6	22540	22545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_014908	GCA	4	12	22549	22560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_014908	GAC	2	6	22571	22576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760048
264	NC_014908	ATG	2	6	22577	22582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760048
265	NC_014908	GGC	2	6	22597	22602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760048
266	NC_014908	CGG	2	6	22659	22664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760048
267	NC_014908	TGT	2	6	22735	22740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760048
268	NC_014908	GCA	2	6	22937	22942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760048
269	NC_014908	GGC	2	6	23080	23085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760048
270	NC_014908	CAG	2	6	23327	23332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760048
271	NC_014908	GCA	2	6	23500	23505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760048
272	NC_014908	GGA	2	6	23542	23547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760048
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274	NC_014908	CTG	2	6	23806	23811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760049
275	NC_014908	ATC	2	6	23866	23871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760049
276	NC_014908	CGG	2	6	23881	23886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760049
277	NC_014908	ATC	2	6	24019	24024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760049
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279	NC_014908	ATG	2	6	24119	24124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760049
280	NC_014908	TCA	2	6	24146	24151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760049
281	NC_014908	TGT	2	6	24164	24169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760049
282	NC_014908	GCC	2	6	24208	24213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760049
283	NC_014908	TGG	2	6	24300	24305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760049
284	NC_014908	CAG	2	6	24503	24508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760049
285	NC_014908	GCC	2	6	24516	24521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760049
286	NC_014908	CCA	2	6	24533	24538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760049
287	NC_014908	CTG	2	6	24661	24666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760049
288	NC_014908	TGC	2	6	24682	24687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760049
289	NC_014908	GTC	2	6	24750	24755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760050
290	NC_014908	CGG	2	6	24898	24903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760050
291	NC_014908	TCA	2	6	24925	24930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760050
292	NC_014908	CTG	2	6	24948	24953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760050
293	NC_014908	CGC	2	6	24973	24978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760050
294	NC_014908	CGA	2	6	25049	25054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760050
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302	NC_014908	TGG	2	6	25697	25702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760050
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325	NC_014908	AAG	2	6	27559	27564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760050
326	NC_014908	ACA	2	6	27682	27687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760050
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333	NC_014908	CAA	3	9	28649	28657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760050
334	NC_014908	ATC	2	6	28856	28861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
335	NC_014908	GCA	2	6	28868	28873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
336	NC_014908	ACC	2	6	28949	28954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
337	NC_014908	ATC	2	6	29030	29035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
338	NC_014908	TCC	2	6	29053	29058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
339	NC_014908	GCA	2	6	29194	29199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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382	NC_014908	GGC	2	6	32808	32813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
383	NC_014908	GTC	2	6	32833	32838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
384	NC_014908	GTG	2	6	32872	32877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760054
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386	NC_014908	TGA	2	6	33134	33139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760054
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498	NC_014908	TGG	2	6	40395	40400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760057
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500	NC_014908	ATC	2	6	40541	40546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760057

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