MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	GTT	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014908	GAG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014908	AAT	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014908	AGG	2	6	2001	2006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014908	AAC	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014908	GCC	2	6	2249	2254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014908	CGC	2	6	2324	2329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014908	GGC	2	6	2347	2352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014908	AGA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014908	GAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014908	GCA	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014908	AGT	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014908	GCT	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014908	GTT	2	6	2892	2897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014908	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014908	CTA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014908	ATG	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014908	CGA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014908	CAA	2	6	4184	4189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014908	ACC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014908	CAA	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014908	CAA	2	6	9202	9207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014908	TGC	2	6	9899	9904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014908	CTT	2	6	10213	10218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014908	GCC	2	6	10220	10225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014908	GCA	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014908	AGC	2	6	10475	10480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014908	ATA	2	6	10606	10611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014908	GTT	3	9	10863	10871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014908	CAG	2	6	10942	10947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014908	ATT	2	6	10986	10991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014908	TGA	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014908	ACG	2	6	11269	11274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014908	TGG	2	6	11344	11349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014908	GCA	2	6	13580	13585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014908	TTG	2	6	13722	13727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014908	CGG	2	6	13864	13869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014908	GCA	2	6	15334	15339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014908	TAC	2	6	18446	18451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014908	TCG	2	6	21768	21773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014908	CGG	2	6	21781	21786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014908	CGA	2	6	22471	22476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014908	GCA	2	6	22540	22545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014908	GCA	4	12	22549	22560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014908	ATC	2	6	28856	28861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014908	GCA	2	6	28868	28873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014908	ACC	2	6	28949	28954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014908	ATC	2	6	29030	29035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014908	TCC	2	6	29053	29058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014908	GCA	2	6	29194	29199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014908	CTT	2	6	38433	38438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014908	TGG	2	6	40290	40295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014908	TGG	3	9	42762	42770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014908	CAT	2	6	42781	42786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014908	GTG	2	6	42806	42811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014908	TGG	2	6	42957	42962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014908	AGG	2	6	43113	43118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014908	ATC	2	6	43142	43147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014908	CGA	2	6	43170	43175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014908	GCT	2	6	43333	43338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014908	GCG	2	6	43412	43417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014908	CAC	2	6	43476	43481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014908	TGC	2	6	43608	43613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014908	AGC	2	6	43621	43626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014908	TGG	2	6	46002	46007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014908	GGT	2	6	46081	46086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014908	AAC	2	6	46183	46188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014908	CAA	2	6	46192	46197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014908	CAA	2	6	46216	46221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014908	TTC	2	6	47253	47258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014908	CAT	2	6	47660	47665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014908	CCA	2	6	48356	48361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_014908	ACC	2	6	49124	49129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014908	TCT	2	6	49162	49167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014908	GAA	2	6	49177	49182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014908	GCC	2	6	50255	50260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014908	CTT	2	6	50312	50317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014908	CGC	2	6	51101	51106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014908	TCT	2	6	51630	51635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014908	ACC	2	6	53150	53155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014908	CCA	2	6	53172	53177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014908	ACC	2	6	53851	53856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014908	CGT	2	6	54733	54738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014908	CTA	2	6	57679	57684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014908	CAA	2	6	57697	57702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014908	GAC	2	6	58154	58159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014908	GGT	2	6	58184	58189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014908	TGG	2	6	58497	58502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014908	TGC	2	6	59439	59444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014908	AGC	2	6	59667	59672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014908	CAT	2	6	60156	60161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014908	ACG	2	6	60305	60310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014908	TAT	2	6	61278	61283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014908	CCG	2	6	61920	61925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014908	CGT	2	6	61969	61974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014908	ACC	2	6	62119	62124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014908	GAA	2	6	62137	62142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014908	AGA	2	6	62885	62890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014908	TCA	2	6	63919	63924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014908	ACT	2	6	63998	64003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014908	GCC	2	6	64079	64084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014908	GAA	2	6	64094	64099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014908	AAG	2	6	64121	64126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014908	GCA	2	6	64232	64237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014908	ACC	2	6	64531	64536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014908	GAA	2	6	64549	64554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014908	TCT	2	6	65363	65368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014908	ATG	2	6	65431	65436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014908	TCA	2	6	65485	65490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014908	TGA	2	6	65503	65508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014908	CTC	2	6	65513	65518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014908	GAT	2	6	65525	65530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014908	GTG	2	6	65581	65586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014908	CAA	2	6	65746	65751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014908	CTG	2	6	65786	65791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014908	CAA	2	6	65902	65907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014908	CGA	2	6	65916	65921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014908	GCG	2	6	65957	65962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014908	TGC	2	6	66061	66066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014908	CAA	3	9	66076	66084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014908	CCG	2	6	66127	66132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014908	GGC	2	6	66135	66140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014908	TGA	2	6	66147	66152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014908	CGA	2	6	67743	67748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014908	ACC	2	6	68552	68557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014908	CTG	2	6	69583	69588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014908	CTG	2	6	70898	70903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014908	GCC	3	9	70907	70915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014908	GCA	2	6	70934	70939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014908	GCC	2	6	71211	71216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014908	GCC	2	6	71233	71238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014908	GGT	2	6	71683	71688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014908	CCG	2	6	72969	72974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014908	CCG	2	6	76102	76107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014908	GCC	2	6	76118	76123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_014908	CGA	2	6	76135	76140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014908	CGA	2	6	76219	76224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014908	CGT	2	6	76298	76303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014908	GTC	2	6	76468	76473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014908	AGC	2	6	76529	76534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_014908	GGT	2	6	115700	115705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014908	TCA	2	6	115722	115727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_014908	GCG	2	6	115799	115804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_014908	CCT	2	6	115952	115957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_014908	CCA	2	6	116019	116024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_014908	CAT	2	6	116089	116094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_014908	CTC	2	6	119149	119154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_014908	CAT	2	6	119565	119570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_014908	AAC	2	6	119657	119662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.