MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 281

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014908	CG	3	6	432	437	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
2	NC_014908	GC	5	10	766	775	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
3	NC_014908	GC	3	6	940	945	0 %	0 %	50 %	50 %	319760025
4	NC_014908	GC	3	6	1557	1562	0 %	0 %	50 %	50 %	319760026
5	NC_014908	AG	3	6	1768	1773	50 %	0 %	50 %	0 %	319760026
6	NC_014908	TG	3	6	2292	2297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014908	GC	3	6	2741	2746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014908	AC	3	6	3359	3364	50 %	0 %	0 %	50 %	319760028
9	NC_014908	CG	3	6	3487	3492	0 %	0 %	50 %	50 %	319760028
10	NC_014908	GA	3	6	3768	3773	50 %	0 %	50 %	0 %	319760028
11	NC_014908	GC	3	6	4366	4371	0 %	0 %	50 %	50 %	319760029
12	NC_014908	CG	3	6	4561	4566	0 %	0 %	50 %	50 %	319760029
13	NC_014908	AG	3	6	5709	5714	50 %	0 %	50 %	0 %	319760032
14	NC_014908	GC	4	8	6343	6350	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
15	NC_014908	GC	3	6	6659	6664	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
16	NC_014908	GC	3	6	6935	6940	0 %	0 %	50 %	50 %	319760032
17	NC_014908	CT	3	6	8520	8525	0 %	50 %	0 %	50 %	319760034
18	NC_014908	CG	3	6	10460	10465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014908	AT	3	6	11060	11065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014908	CT	3	6	11230	11235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014908	CT	3	6	11630	11635	0 %	50 %	0 %	50 %	319760037
22	NC_014908	CG	3	6	11656	11661	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
23	NC_014908	GC	3	6	11731	11736	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
24	NC_014908	GC	4	8	11873	11880	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
25	NC_014908	CG	3	6	12468	12473	0 %	0 %	50 %	50 %	319760037
26	NC_014908	AT	3	6	13406	13411	50 %	50 %	0 %	0 %	319760037
27	NC_014908	AG	3	6	13532	13537	50 %	0 %	50 %	0 %	319760037
28	NC_014908	CT	3	6	13634	13639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014908	AC	3	6	13696	13701	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014908	GT	3	6	14017	14022	0 %	50 %	50 %	0 %	319760038
31	NC_014908	AG	3	6	14138	14143	50 %	0 %	50 %	0 %	319760038
32	NC_014908	GC	3	6	15218	15223	0 %	0 %	50 %	50 %	319760040
33	NC_014908	CG	3	6	16180	16185	0 %	0 %	50 %	50 %	319760041
34	NC_014908	CT	3	6	16499	16504	0 %	50 %	0 %	50 %	319760042
35	NC_014908	CG	3	6	17457	17462	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
36	NC_014908	CG	3	6	17748	17753	0 %	0 %	50 %	50 %	319760042
37	NC_014908	AG	3	6	18882	18887	50 %	0 %	50 %	0 %	319760045
38	NC_014908	CG	3	6	19150	19155	0 %	0 %	50 %	50 %	319760045
39	NC_014908	GA	3	6	21261	21266	50 %	0 %	50 %	0 %	319760046
40	NC_014908	GC	3	6	21515	21520	0 %	0 %	50 %	50 %	319760046
41	NC_014908	CG	3	6	21895	21900	0 %	0 %	50 %	50 %	319760047
42	NC_014908	GA	3	6	21914	21919	50 %	0 %	50 %	0 %	319760047
43	NC_014908	CG	3	6	22095	22100	0 %	0 %	50 %	50 %	319760047
44	NC_014908	AC	3	6	22221	22226	50 %	0 %	0 %	50 %	319760047
45	NC_014908	CT	3	6	22523	22528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014908	GC	3	6	22971	22976	0 %	0 %	50 %	50 %	319760048
47	NC_014908	GC	5	10	23063	23072	0 %	0 %	50 %	50 %	319760048
48	NC_014908	TG	3	6	24419	24424	0 %	50 %	50 %	0 %	319760049
49	NC_014908	AG	3	6	24489	24494	50 %	0 %	50 %	0 %	319760049
50	NC_014908	GA	3	6	24707	24712	50 %	0 %	50 %	0 %	319760049
51	NC_014908	GC	3	6	24935	24940	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
52	NC_014908	CG	3	6	24941	24946	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
53	NC_014908	CG	4	8	25018	25025	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
54	NC_014908	GC	3	6	25120	25125	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
55	NC_014908	CT	3	6	25332	25337	0 %	50 %	0 %	50 %	319760050
56	NC_014908	GA	3	6	25921	25926	50 %	0 %	50 %	0 %	319760050
57	NC_014908	CG	3	6	26092	26097	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
58	NC_014908	CG	3	6	26316	26321	0 %	0 %	50 %	50 %	319760050
59	NC_014908	GT	3	6	26813	26818	0 %	50 %	50 %	0 %	319760050
60	NC_014908	TA	3	6	27625	27630	50 %	50 %	0 %	0 %	319760050
61	NC_014908	CT	3	6	28269	28274	0 %	50 %	0 %	50 %	319760050
62	NC_014908	GC	3	6	28782	28787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014908	CT	4	8	29446	29453	0 %	50 %	0 %	50 %	319760051
64	NC_014908	TA	3	6	29727	29732	50 %	50 %	0 %	0 %	319760051
65	NC_014908	CG	3	6	29774	29779	0 %	0 %	50 %	50 %	319760051
66	NC_014908	CG	3	6	30553	30558	0 %	0 %	50 %	50 %	319760052
67	NC_014908	AT	3	6	31356	31361	50 %	50 %	0 %	0 %	319760053
68	NC_014908	GA	3	6	31513	31518	50 %	0 %	50 %	0 %	319760053
69	NC_014908	CG	3	6	32233	32238	0 %	0 %	50 %	50 %	319760053
70	NC_014908	CT	3	6	32433	32438	0 %	50 %	0 %	50 %	319760053
71	NC_014908	GC	3	6	32462	32467	0 %	0 %	50 %	50 %	319760053
72	NC_014908	GC	3	6	35505	35510	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
73	NC_014908	GC	3	6	36359	36364	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
74	NC_014908	GC	3	6	36428	36433	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
75	NC_014908	GC	3	6	36497	36502	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
76	NC_014908	GC	3	6	36842	36847	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
77	NC_014908	GC	3	6	36911	36916	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
78	NC_014908	GC	3	6	36980	36985	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
79	NC_014908	GC	3	6	37049	37054	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
80	NC_014908	GC	3	6	37256	37261	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
81	NC_014908	GC	3	6	37325	37330	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
82	NC_014908	GC	3	6	37463	37468	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
83	NC_014908	GC	3	6	37601	37606	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
84	NC_014908	GC	3	6	37670	37675	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
85	NC_014908	GC	3	6	37877	37882	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
86	NC_014908	GC	3	6	37946	37951	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
87	NC_014908	GC	3	6	38015	38020	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
88	NC_014908	TC	3	6	38194	38199	0 %	50 %	0 %	50 %	319760054
89	NC_014908	GC	3	6	38557	38562	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
90	NC_014908	GC	3	6	38956	38961	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
91	NC_014908	GC	3	6	38984	38989	0 %	0 %	50 %	50 %	319760055
92	NC_014908	TG	3	6	39404	39409	0 %	50 %	50 %	0 %	319760056
93	NC_014908	CT	3	6	39486	39491	0 %	50 %	0 %	50 %	319760056
94	NC_014908	TA	4	8	39524	39531	50 %	50 %	0 %	0 %	319760056
95	NC_014908	GT	3	6	40553	40558	0 %	50 %	50 %	0 %	319760057
96	NC_014908	CG	4	8	41678	41685	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
97	NC_014908	GC	3	6	41991	41996	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
98	NC_014908	CG	3	6	42156	42161	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
99	NC_014908	CG	3	6	42488	42493	0 %	0 %	50 %	50 %	319760058
100	NC_014908	GA	3	6	43703	43708	50 %	0 %	50 %	0 %	319760059
101	NC_014908	GC	3	6	43755	43760	0 %	0 %	50 %	50 %	319760059
102	NC_014908	GA	4	8	44278	44285	50 %	0 %	50 %	0 %	319760059
103	NC_014908	TG	3	6	44470	44475	0 %	50 %	50 %	0 %	319760059
104	NC_014908	AG	3	6	44917	44922	50 %	0 %	50 %	0 %	319760059
105	NC_014908	GT	3	6	45789	45794	0 %	50 %	50 %	0 %	319760060
106	NC_014908	AC	3	6	46029	46034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014908	GC	3	6	46547	46552	0 %	0 %	50 %	50 %	319760061
108	NC_014908	TG	3	6	47380	47385	0 %	50 %	50 %	0 %	319760062
109	NC_014908	CA	3	6	47622	47627	50 %	0 %	0 %	50 %	319760063
110	NC_014908	GC	4	8	47909	47916	0 %	0 %	50 %	50 %	319760064
111	NC_014908	GA	3	6	48065	48070	50 %	0 %	50 %	0 %	319760064
112	NC_014908	AC	3	6	48480	48485	50 %	0 %	0 %	50 %	319760065
113	NC_014908	AC	3	6	50283	50288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014908	GC	3	6	50708	50713	0 %	0 %	50 %	50 %	319760067
115	NC_014908	GC	3	6	51894	51899	0 %	0 %	50 %	50 %	319760070
116	NC_014908	CT	3	6	52192	52197	0 %	50 %	0 %	50 %	319760071
117	NC_014908	GC	3	6	52923	52928	0 %	0 %	50 %	50 %	319760072
118	NC_014908	AC	3	6	54246	54251	50 %	0 %	0 %	50 %	319760075
119	NC_014908	GC	3	6	54511	54516	0 %	0 %	50 %	50 %	319760075
120	NC_014908	CA	3	6	55756	55761	50 %	0 %	0 %	50 %	319760077
121	NC_014908	CG	3	6	56848	56853	0 %	0 %	50 %	50 %	319760080
122	NC_014908	GC	3	6	57296	57301	0 %	0 %	50 %	50 %	319760080
123	NC_014908	TG	3	6	57453	57458	0 %	50 %	50 %	0 %	319760080
124	NC_014908	CG	3	6	57593	57598	0 %	0 %	50 %	50 %	319760081
125	NC_014908	GA	3	6	57772	57777	50 %	0 %	50 %	0 %	319760082
126	NC_014908	CG	3	6	57876	57881	0 %	0 %	50 %	50 %	319760082
127	NC_014908	GT	3	6	58682	58687	0 %	50 %	50 %	0 %	319760083
128	NC_014908	CT	3	6	59412	59417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014908	CA	3	6	59680	59685	50 %	0 %	0 %	50 %	319760085
130	NC_014908	CG	3	6	59984	59989	0 %	0 %	50 %	50 %	319760086
131	NC_014908	CA	3	6	60885	60890	50 %	0 %	0 %	50 %	319760087
132	NC_014908	GC	3	6	61155	61160	0 %	0 %	50 %	50 %	319760088
133	NC_014908	AC	3	6	61258	61263	50 %	0 %	0 %	50 %	319760088
134	NC_014908	AG	3	6	61771	61776	50 %	0 %	50 %	0 %	319760090
135	NC_014908	GC	3	6	61787	61792	0 %	0 %	50 %	50 %	319760090
136	NC_014908	TG	3	6	62597	62602	0 %	50 %	50 %	0 %	319760092
137	NC_014908	GC	3	6	62925	62930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014908	GC	3	6	63296	63301	0 %	0 %	50 %	50 %	319760094
139	NC_014908	AC	3	6	63648	63653	50 %	0 %	0 %	50 %	319760095
140	NC_014908	GC	3	6	63835	63840	0 %	0 %	50 %	50 %	319760095
141	NC_014908	TC	3	6	64072	64077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014908	AG	3	6	65547	65552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014908	TC	3	6	65664	65669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014908	GC	3	6	66270	66275	0 %	0 %	50 %	50 %	319760100
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.