MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pantoea sp. At-9b plasmid pPAT9B03

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014840	AGTT	2	8	6276	6283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014840	TTAT	2	8	12415	12422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014840	CTGA	2	8	12554	12561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014840	TTAT	2	8	21183	21190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014840	TCAC	2	8	21275	21282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014840	TATT	2	8	21318	21325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014840	AAAC	2	8	21483	21490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014840	TTAT	2	8	23489	23496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014840	CTTA	2	8	30955	30962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014840	ATTT	2	8	31287	31294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014840	AACA	2	8	35355	35362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014840	ATGA	2	8	36788	36795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014840	TCGA	2	8	36801	36808	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014840	TGTT	2	8	36907	36914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014840	GGCA	2	8	37395	37402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014840	CATC	2	8	37426	37433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014840	AGGT	2	8	39089	39096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014840	CTCA	2	8	39964	39971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014840	GTAC	2	8	42561	42568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014840	TCGG	2	8	45420	45427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014840	ATAA	2	8	45678	45685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014840	TAAT	2	8	45715	45722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014840	TAAA	2	8	59605	59612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014840	AGGC	2	8	59992	59999	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014840	AGCC	2	8	60159	60166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014840	TTAT	2	8	60202	60209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014840	TGTC	2	8	60220	60227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014840	TCAT	2	8	69418	69425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014840	ATCG	2	8	73789	73796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014840	CAGA	2	8	74684	74691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014840	CAGC	2	8	81691	81698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014840	TTTG	2	8	81858	81865	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014840	GTTT	2	8	82070	82077	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014840	ATAA	2	8	83090	83097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014840	TTAT	2	8	83113	83120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014840	TAAA	2	8	84647	84654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014840	CAAC	2	8	84876	84883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014840	AGGC	2	8	90235	90242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014840	TGGC	2	8	92516	92523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014840	CGGA	2	8	98600	98607	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014840	CCAG	2	8	98644	98651	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014840	TATG	2	8	99820	99827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014840	AACT	2	8	105465	105472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014840	CGTT	2	8	106181	106188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014840	TCTT	2	8	106334	106341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014840	TGAT	2	8	109230	109237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014840	ATGT	2	8	110705	110712	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014840	ATGT	2	8	116433	116440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014840	GCGG	2	8	118294	118301	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014840	CGCC	2	8	122309	122316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014840	CAGA	2	8	122434	122441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014840	AGAA	2	8	126382	126389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014840	CCAT	2	8	127433	127440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014840	ACCA	2	8	133394	133401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014840	GAGT	2	8	133428	133435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014840	GAAC	2	8	147530	147537	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014840	AAAT	2	8	153865	153872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014840	TTTC	2	8	163449	163456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014840	AGCC	2	8	166697	166704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014840	ATAA	2	8	172520	172527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014840	AGAA	2	8	182471	182478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014840	TTGA	2	8	187910	187917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014840	TGAA	2	8	188054	188061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014840	GATT	2	8	188077	188084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014840	ATAA	2	8	192987	192994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014840	ATCT	2	8	199710	199717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014840	ATAA	2	8	202877	202884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014840	CTCA	2	8	205689	205696	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014840	TGAA	2	8	207205	207212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014840	ATGA	2	8	210437	210444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014840	TTTA	2	8	210901	210908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014840	AGTA	2	8	211158	211165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014840	TTCC	2	8	211266	211273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014840	CTGG	2	8	211426	211433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014840	CACT	2	8	212577	212584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014840	ATCG	2	8	213225	213232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014840	AGTG	2	8	213336	213343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014840	TGAT	2	8	213574	213581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014840	ATGA	2	8	213977	213984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014840	AGTA	2	8	214137	214144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014840	GTAT	2	8	214798	214805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014840	CCGA	2	8	217088	217095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014840	ATTT	2	8	224521	224528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014840	GAAC	2	8	225427	225434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014840	GTCA	2	8	225928	225935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014840	CCAT	2	8	225996	226003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014840	TCAA	2	8	226035	226042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014840	AATG	2	8	226425	226432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014840	TGAT	2	8	226706	226713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014840	TGTT	2	8	229256	229263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014840	AGTG	2	8	230047	230054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014840	GAAC	2	8	232875	232882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014840	TTGC	2	8	233929	233936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014840	ACAG	2	8	235592	235599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014840	TGCT	2	8	236253	236260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014840	AACG	2	8	236636	236643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014840	GAAT	2	8	239207	239214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014840	TGCT	2	8	241058	241065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014840	CCGG	2	8	242521	242528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014840	AAAT	2	8	245653	245660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014840	ATTT	2	8	245667	245674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014840	CGAT	2	8	246795	246802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014840	TTTG	2	8	246804	246811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014840	ATTA	2	8	250127	250134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014840	ACCA	2	8	250172	250179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014840	TCAT	2	8	250254	250261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014840	GGCA	2	8	252477	252484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014840	TTTA	2	8	253058	253065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014840	TAAT	2	8	253112	253119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014840	TGAT	2	8	253135	253142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014840	CAGG	2	8	253684	253691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014840	CAGC	2	8	254165	254172	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014840	TAAG	2	8	254235	254242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014840	ATGA	2	8	256325	256332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014840	GATT	2	8	260409	260416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014840	TCAC	2	8	264635	264642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014840	AAAC	2	8	265203	265210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014840	TCGC	2	8	266715	266722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014840	ATTC	2	8	266838	266845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014840	GGAA	2	8	267862	267869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014840	GTTG	2	8	270570	270577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014840	GAAT	2	8	274361	274368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014840	ATTT	2	8	274400	274407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014840	TATT	2	8	275332	275339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014840	TTCA	2	8	276046	276053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014840	AAAC	2	8	276148	276155	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014840	CCTG	2	8	276901	276908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014840	AAAC	2	8	285497	285504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014840	AACG	2	8	286715	286722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014840	CTTT	2	8	288108	288115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014840	GGCA	2	8	291541	291548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014840	CAAT	2	8	293345	293352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014840	TCCC	2	8	294705	294712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_014840	ATCA	2	8	294785	294792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014840	CCCT	2	8	295285	295292	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_014840	AAGA	2	8	297771	297778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014840	TTAA	2	8	298343	298350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014840	CAGT	2	8	299254	299261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014840	CTGT	2	8	299537	299544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014840	CTGC	2	8	303492	303499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014840	AGCA	2	8	312392	312399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014840	CGGG	2	8	316806	316813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014840	CAGA	2	8	320903	320910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.