MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014836	CGGTGT	2	12	33242	33253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014836	GACATC	2	12	78947	78958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014836	TGACAA	2	12	99693	99704	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014836	TGAGCT	2	12	267783	267794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014836	GGTTTT	2	12	271650	271661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014836	CTCCCC	2	12	272057	272068	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7	NC_014836	GTCCCC	2	12	330102	330113	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014836	AGGTAA	2	12	346863	346874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014836	CTGTTT	2	12	440698	440709	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014836	GCTCCA	2	12	502892	502903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014836	CTTCTG	2	12	503142	503153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014836	TGCAGA	2	12	533252	533263	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014836	GATGGA	2	12	557820	557831	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014836	TTTTCT	2	12	691990	692001	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014836	GCCAAG	2	12	696349	696360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014836	CTGGGG	2	12	696541	696552	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014836	TAAAAA	2	12	715283	715294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014836	ACCAAG	2	12	728938	728949	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014836	CCGACC	2	12	729893	729904	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014836	AAGTTT	2	12	730032	730043	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014836	GACCCC	2	12	731633	731644	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014836	AGAAAT	2	12	800997	801008	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014836	CAGGCG	2	12	831850	831861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014836	AAGTTT	2	12	845214	845225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014836	AAACTT	2	12	849563	849574	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014836	CGCTGT	2	12	996018	996029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014836	AAGTTT	2	12	1000072	1000083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014836	AAACTT	2	12	1004106	1004117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014836	AGTCAT	2	12	1004502	1004513	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014836	AAACTT	2	12	1042262	1042273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014836	GAGATG	2	12	1051642	1051653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014836	TCGCCA	2	12	1123117	1123128	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014836	AGTCAT	2	12	1123701	1123712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014836	GGTGAT	2	12	1134875	1134886	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014836	GAGAAG	2	12	1143364	1143375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014836	TTCCCT	2	12	1241035	1241046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014836	TACTGC	2	12	1313374	1313385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014836	TCTGAA	2	12	1357354	1357365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014836	AGTGGA	2	12	1357644	1357655	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014836	AAAGGC	2	12	1363274	1363285	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014836	CGCTCT	2	12	1487571	1487582	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014836	CTTCTC	2	12	1501590	1501601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014836	CTTTTT	2	12	1590008	1590019	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014836	CGGGTG	2	12	1619281	1619292	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014836	AGTGCA	2	12	1778583	1778594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014836	GGAAAT	2	12	1789272	1789283	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014836	GCCCCA	2	12	1859598	1859609	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014836	TGGTGA	2	12	1864421	1864432	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014836	AAAAAC	2	12	1876202	1876213	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014836	CTTGTG	2	12	1897452	1897463	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014836	GAGAAA	2	12	1931817	1931828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014836	CGGTTG	2	12	1980650	1980661	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014836	GGGGGA	2	12	2097128	2097139	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014836	CATTAT	2	12	2149706	2149717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014836	ATTTCA	2	12	2176636	2176647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014836	CAGAAG	2	12	2191083	2191094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014836	TGGAGC	2	12	2191333	2191344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014836	GGCCCT	2	12	2197452	2197463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014836	AGCGAG	2	12	2248078	2248089	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014836	GCTTGG	2	12	2263475	2263486	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014836	ACAAAA	2	12	2331364	2331375	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014836	AAGTTT	2	12	2368774	2368785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014836	TGTTTT	2	12	2424052	2424063	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014836	AAACTT	2	12	2517365	2517376	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014836	CATCCT	2	12	2539399	2539410	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014836	AGGTAA	2	12	2576594	2576605	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014836	CATTGC	2	12	2577802	2577813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014836	AAGGTA	2	12	2673357	2673368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014836	TTTTGG	2	12	2746050	2746061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014836	GGCCTG	2	12	2760279	2760290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014836	GAAACA	2	12	2806104	2806115	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014836	TGTGAA	2	12	2847837	2847848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014836	TGGTGC	2	12	2869607	2869618	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.