MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 1520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014836	CTCAC	2	10	1101	1110	20 %	20 %	0 %	60 %	317050200
2	NC_014836	AGAAA	2	10	1693	1702	80 %	0 %	20 %	0 %	317050201
3	NC_014836	AAGAT	2	10	2532	2541	60 %	20 %	20 %	0 %	317050201
4	NC_014836	TGGGG	2	10	4591	4600	0 %	20 %	80 %	0 %	317050204
5	NC_014836	CCGCT	2	10	4652	4661	0 %	20 %	20 %	60 %	317050204
6	NC_014836	TGCCG	2	10	6561	6570	0 %	20 %	40 %	40 %	317050206
7	NC_014836	ATCAC	2	10	8156	8165	40 %	20 %	0 %	40 %	317050207
8	NC_014836	ATCCC	2	10	9637	9646	20 %	20 %	0 %	60 %	317050210
9	NC_014836	CGCTG	2	10	9780	9789	0 %	20 %	40 %	40 %	317050210
10	NC_014836	GCCGC	2	10	10630	10639	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014836	TGCCG	2	10	13685	13694	0 %	20 %	40 %	40 %	317050215
12	NC_014836	CACAA	2	10	16502	16511	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014836	CGGGA	2	10	17858	17867	20 %	0 %	60 %	20 %	317050219
14	NC_014836	GAGAA	2	10	18223	18232	60 %	0 %	40 %	0 %	317050219
15	NC_014836	GGCGG	2	10	20357	20366	0 %	0 %	80 %	20 %	317050220
16	NC_014836	GCAGC	2	10	23558	23567	20 %	0 %	40 %	40 %	317050222
17	NC_014836	TGGCG	2	10	24052	24061	0 %	20 %	60 %	20 %	317050222
18	NC_014836	GAGAG	2	10	24355	24364	40 %	0 %	60 %	0 %	317050222
19	NC_014836	GCTCC	2	10	25855	25864	0 %	20 %	20 %	60 %	317050224
20	NC_014836	GGGGA	2	10	28753	28762	20 %	0 %	80 %	0 %	317050226
21	NC_014836	GGCCA	2	10	30732	30741	20 %	0 %	40 %	40 %	317050228
22	NC_014836	GATCG	2	10	34202	34211	20 %	20 %	40 %	20 %	317050232
23	NC_014836	CCGCC	2	10	38131	38140	0 %	0 %	20 %	80 %	317050234
24	NC_014836	TCCAG	2	10	39452	39461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014836	CAAAC	2	10	39570	39579	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014836	AGGTA	2	10	39952	39961	40 %	20 %	40 %	0 %	317050235
27	NC_014836	ATCTT	2	10	41107	41116	20 %	60 %	0 %	20 %	317050238
28	NC_014836	CCCTG	2	10	41424	41433	0 %	20 %	20 %	60 %	317050238
29	NC_014836	ACCGC	2	10	42296	42305	20 %	0 %	20 %	60 %	317050240
30	NC_014836	TCCAC	2	10	45677	45686	20 %	20 %	0 %	60 %	317050243
31	NC_014836	GCAGT	2	10	52255	52264	20 %	20 %	40 %	20 %	317050250
32	NC_014836	AGCTG	2	10	58501	58510	20 %	20 %	40 %	20 %	317050258
33	NC_014836	TGTCC	2	10	58895	58904	0 %	40 %	20 %	40 %	317050259
34	NC_014836	CAGGC	2	10	59718	59727	20 %	0 %	40 %	40 %	317050259
35	NC_014836	GCATC	2	10	60517	60526	20 %	20 %	20 %	40 %	317050260
36	NC_014836	TGGTC	2	10	62307	62316	0 %	40 %	40 %	20 %	317050262
37	NC_014836	GCGTA	2	10	63359	63368	20 %	20 %	40 %	20 %	317050262
38	NC_014836	GCGGT	2	10	66825	66834	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014836	TGCGG	2	10	68375	68384	0 %	20 %	60 %	20 %	317050264
40	NC_014836	CAGAA	2	10	69586	69595	60 %	0 %	20 %	20 %	317050265
41	NC_014836	AGTAT	2	10	71683	71692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014836	AGCGA	2	10	72886	72895	40 %	0 %	40 %	20 %	317050269
43	NC_014836	CCATC	2	10	73719	73728	20 %	20 %	0 %	60 %	317050269
44	NC_014836	ATGAA	2	10	76062	76071	60 %	20 %	20 %	0 %	317050271
45	NC_014836	AATAC	2	10	78090	78099	60 %	20 %	0 %	20 %	317050273
46	NC_014836	GCGAG	2	10	78652	78661	20 %	0 %	60 %	20 %	317050274
47	NC_014836	GGCCA	2	10	80693	80702	20 %	0 %	40 %	40 %	317050277
48	NC_014836	CAGCA	2	10	82257	82266	40 %	0 %	20 %	40 %	317050278
49	NC_014836	GTCCA	2	10	82944	82953	20 %	20 %	20 %	40 %	317050278
50	NC_014836	CTTTT	2	10	90016	90025	0 %	80 %	0 %	20 %	317050285
51	NC_014836	CGCCT	2	10	91939	91948	0 %	20 %	20 %	60 %	317050286
52	NC_014836	CTGTG	2	10	94130	94139	0 %	40 %	40 %	20 %	317050288
53	NC_014836	GGACT	2	10	94145	94154	20 %	20 %	40 %	20 %	317050288
54	NC_014836	GGGAA	2	10	104485	104494	40 %	0 %	60 %	0 %	317050297
55	NC_014836	CGCTG	2	10	108099	108108	0 %	20 %	40 %	40 %	317050301
56	NC_014836	GATGT	2	10	110125	110134	20 %	40 %	40 %	0 %	317050303
57	NC_014836	CAGGC	2	10	110671	110680	20 %	0 %	40 %	40 %	317050303
58	NC_014836	GTTCA	2	10	111445	111454	20 %	40 %	20 %	20 %	317050303
59	NC_014836	GCTCA	2	10	113174	113183	20 %	20 %	20 %	40 %	317050305
60	NC_014836	CATTT	2	10	115547	115556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014836	TTCCA	2	10	119491	119500	20 %	40 %	0 %	40 %	317050311
62	NC_014836	GTAGA	2	10	121925	121934	40 %	20 %	40 %	0 %	317050315
63	NC_014836	GTGGC	2	10	122040	122049	0 %	20 %	60 %	20 %	317050315
64	NC_014836	TGACT	2	10	123367	123376	20 %	40 %	20 %	20 %	317050316
65	NC_014836	GGCCA	2	10	129437	129446	20 %	0 %	40 %	40 %	317050320
66	NC_014836	GCCCG	2	10	132930	132939	0 %	0 %	40 %	60 %	317050321
67	NC_014836	AGCAC	2	10	133891	133900	40 %	0 %	20 %	40 %	317050322
68	NC_014836	TGCCT	2	10	134022	134031	0 %	40 %	20 %	40 %	317050323
69	NC_014836	GGGTG	2	10	134504	134513	0 %	20 %	80 %	0 %	317050323
70	NC_014836	CTGGC	2	10	135679	135688	0 %	20 %	40 %	40 %	317050323
71	NC_014836	CCCGG	2	10	137642	137651	0 %	0 %	40 %	60 %	317050325
72	NC_014836	TTGAT	2	10	143250	143259	20 %	60 %	20 %	0 %	317050332
73	NC_014836	GAGTG	2	10	143489	143498	20 %	20 %	60 %	0 %	317050332
74	NC_014836	GAGTG	2	10	146457	146466	20 %	20 %	60 %	0 %	317050336
75	NC_014836	GGGTC	2	10	147727	147736	0 %	20 %	60 %	20 %	317050337
76	NC_014836	CGAAC	2	10	152310	152319	40 %	0 %	20 %	40 %	317050344
77	NC_014836	TTGCT	2	10	152479	152488	0 %	60 %	20 %	20 %	317050344
78	NC_014836	CTCTG	2	10	159396	159405	0 %	40 %	20 %	40 %	317050350
79	NC_014836	AGGTC	2	10	159436	159445	20 %	20 %	40 %	20 %	317050350
80	NC_014836	GGCGA	2	10	159928	159937	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014836	TGCGC	2	10	162221	162230	0 %	20 %	40 %	40 %	317050353
82	NC_014836	TCGTG	2	10	164124	164133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014836	AGAGG	2	10	166711	166720	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014836	AAGAT	2	10	167632	167641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014836	ATAAA	2	10	175570	175579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014836	ATTTG	2	10	175603	175612	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014836	GATTT	2	10	177145	177154	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014836	ATGCA	2	10	178098	178107	40 %	20 %	20 %	20 %	317050359
89	NC_014836	CCGTG	2	10	178972	178981	0 %	20 %	40 %	40 %	317050361
90	NC_014836	CGCTG	2	10	181997	182006	0 %	20 %	40 %	40 %	317050363
91	NC_014836	GTTGT	2	10	182385	182394	0 %	60 %	40 %	0 %	317050364
92	NC_014836	CGAAA	2	10	182952	182961	60 %	0 %	20 %	20 %	317050364
93	NC_014836	TTCGG	2	10	185176	185185	0 %	40 %	40 %	20 %	317050366
94	NC_014836	GCCAG	2	10	185735	185744	20 %	0 %	40 %	40 %	317050367
95	NC_014836	ATTTT	2	10	190888	190897	20 %	80 %	0 %	0 %	317050371
96	NC_014836	ACACC	2	10	192200	192209	40 %	0 %	0 %	60 %	317050372
97	NC_014836	GGTCA	2	10	193404	193413	20 %	20 %	40 %	20 %	317050373
98	NC_014836	TTTTC	2	10	196875	196884	0 %	80 %	0 %	20 %	317050376
99	NC_014836	GCTTC	2	10	197031	197040	0 %	40 %	20 %	40 %	317050376
100	NC_014836	GTATT	2	10	197226	197235	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014836	TGCCA	2	10	198276	198285	20 %	20 %	20 %	40 %	317050378
102	NC_014836	ATGTC	2	10	198765	198774	20 %	40 %	20 %	20 %	317050378
103	NC_014836	GGCCA	2	10	199142	199151	20 %	0 %	40 %	40 %	317050379
104	NC_014836	TACTG	2	10	199882	199891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014836	CAGGG	2	10	201672	201681	20 %	0 %	60 %	20 %	317050381
106	NC_014836	CGCTG	2	10	206241	206250	0 %	20 %	40 %	40 %	317050385
107	NC_014836	GTGCT	2	10	206392	206401	0 %	40 %	40 %	20 %	317050385
108	NC_014836	AGCTC	2	10	209804	209813	20 %	20 %	20 %	40 %	317050387
109	NC_014836	GGCCA	2	10	211486	211495	20 %	0 %	40 %	40 %	317050389
110	NC_014836	TGGGC	2	10	213251	213260	0 %	20 %	60 %	20 %	317050391
111	NC_014836	ACGGA	2	10	215857	215866	40 %	0 %	40 %	20 %	317050393
112	NC_014836	GACGG	2	10	217191	217200	20 %	0 %	60 %	20 %	317050393
113	NC_014836	CTTGT	2	10	217521	217530	0 %	60 %	20 %	20 %	317050394
114	NC_014836	TCTGC	2	10	218798	218807	0 %	40 %	20 %	40 %	317050396
115	NC_014836	CCTGC	2	10	219758	219767	0 %	20 %	20 %	60 %	317050397
116	NC_014836	CCCGC	2	10	221752	221761	0 %	0 %	20 %	80 %	317050398
117	NC_014836	CACAT	2	10	222195	222204	40 %	20 %	0 %	40 %	317050399
118	NC_014836	GCAGG	2	10	223342	223351	20 %	0 %	60 %	20 %	317050400
119	NC_014836	CGTTG	2	10	225904	225913	0 %	40 %	40 %	20 %	317050401
120	NC_014836	ATGGG	2	10	227020	227029	20 %	20 %	60 %	0 %	317050402
121	NC_014836	TGCGC	2	10	229781	229790	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014836	AAGAT	2	10	229900	229909	60 %	20 %	20 %	0 %	317050405
123	NC_014836	TGTGG	2	10	230157	230166	0 %	40 %	60 %	0 %	317050405
124	NC_014836	TGATA	2	10	231231	231240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014836	TCCCT	2	10	232549	232558	0 %	40 %	0 %	60 %	317050406
126	NC_014836	CAAAG	2	10	233890	233899	60 %	0 %	20 %	20 %	317050407
127	NC_014836	AGCTC	2	10	235188	235197	20 %	20 %	20 %	40 %	317050409
128	NC_014836	AAATA	2	10	236269	236278	80 %	20 %	0 %	0 %	317050409
129	NC_014836	AAGGA	2	10	245989	245998	60 %	0 %	40 %	0 %	317050415
130	NC_014836	GAGCC	2	10	246458	246467	20 %	0 %	40 %	40 %	317050415
131	NC_014836	ACATC	2	10	249190	249199	40 %	20 %	0 %	40 %	317050417
132	NC_014836	TCAGC	2	10	249964	249973	20 %	20 %	20 %	40 %	317050417
133	NC_014836	GATTT	2	10	250569	250578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014836	GTTTC	2	10	252325	252334	0 %	60 %	20 %	20 %	317050419
135	NC_014836	CAGGC	2	10	254848	254857	20 %	0 %	40 %	40 %	317050421
136	NC_014836	CTTCC	2	10	256232	256241	0 %	40 %	0 %	60 %	317050422
137	NC_014836	TGGCA	2	10	260313	260322	20 %	20 %	40 %	20 %	317050424
138	NC_014836	TGCCC	2	10	261797	261806	0 %	20 %	20 %	60 %	317050425
139	NC_014836	GCTCC	2	10	263558	263567	0 %	20 %	20 %	60 %	317050426
140	NC_014836	CAGGC	2	10	263991	264000	20 %	0 %	40 %	40 %	317050427
141	NC_014836	CTGAT	2	10	264965	264974	20 %	40 %	20 %	20 %	317050428
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143	NC_014836	TGGCT	2	10	266784	266793	0 %	40 %	40 %	20 %	317050428
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146	NC_014836	CAGCT	2	10	270600	270609	20 %	20 %	20 %	40 %	317050431
147	NC_014836	CGCTG	2	10	270626	270635	0 %	20 %	40 %	40 %	317050431
148	NC_014836	TGCGC	2	10	271580	271589	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014836	GTAAA	2	10	276031	276040	60 %	20 %	20 %	0 %	317050437
150	NC_014836	CTGAT	2	10	280974	280983	20 %	40 %	20 %	20 %	317050442
151	NC_014836	GCTGA	2	10	284985	284994	20 %	20 %	40 %	20 %	317050443
152	NC_014836	GCTCT	2	10	285285	285294	0 %	40 %	20 %	40 %	317050444
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155	NC_014836	TGCCT	2	10	298026	298035	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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157	NC_014836	GGCAG	2	10	307731	307740	20 %	0 %	60 %	20 %	317050467
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159	NC_014836	GCAAA	2	10	318489	318498	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_014836	CTTTG	2	10	319240	319249	0 %	60 %	20 %	20 %	317050477
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165	NC_014836	TGGTG	2	10	322769	322778	0 %	40 %	60 %	0 %	317050480
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170	NC_014836	TCTGC	2	10	327168	327177	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
171	NC_014836	CGGGG	2	10	327313	327322	0 %	0 %	80 %	20 %	317050486
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175	NC_014836	GCTCC	2	10	343974	343983	0 %	20 %	20 %	60 %	317050501
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196	NC_014836	TGGCG	2	10	383625	383634	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
197	NC_014836	GATTG	2	10	384129	384138	20 %	40 %	40 %	0 %	317050552
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216	NC_014836	CAATG	2	10	422312	422321	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
217	NC_014836	ATTTA	2	10	430022	430031	40 %	60 %	0 %	0 %	317050597
218	NC_014836	GAAAG	2	10	430588	430597	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
219	NC_014836	GTTCC	2	10	434315	434324	0 %	40 %	20 %	40 %	317050601
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222	NC_014836	ATTTT	2	10	438097	438106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_014836	TGGCC	2	10	476397	476406	0 %	20 %	40 %	40 %	317050642
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247	NC_014836	CCTGG	2	10	480257	480266	0 %	20 %	40 %	40 %	317050645
248	NC_014836	TGCAG	2	10	481085	481094	20 %	20 %	40 %	20 %	317050646
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251	NC_014836	GGGAG	2	10	482318	482327	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
252	NC_014836	CGCAG	2	10	483400	483409	20 %	0 %	40 %	40 %	317050648
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254	NC_014836	GCACA	2	10	486827	486836	40 %	0 %	20 %	40 %	317050652
255	NC_014836	GGTCT	2	10	489523	489532	0 %	40 %	40 %	20 %	317050655
256	NC_014836	TGTGC	2	10	496592	496601	0 %	40 %	40 %	20 %	317050661
257	NC_014836	CACGC	2	10	497177	497186	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
258	NC_014836	CTGCG	2	10	497932	497941	0 %	20 %	40 %	40 %	317050662
259	NC_014836	CCTGC	2	10	499757	499766	0 %	20 %	20 %	60 %	317050664
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263	NC_014836	CTTCG	2	10	502130	502139	0 %	40 %	20 %	40 %	317050666
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267	NC_014836	GACAT	2	10	508294	508303	40 %	20 %	20 %	20 %	317050669
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