MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014836	GCCGC	2	10	10630	10639	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014836	CACAA	2	10	16502	16511	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014836	TCCAG	2	10	39452	39461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014836	CAAAC	2	10	39570	39579	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014836	GCGGT	2	10	66825	66834	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014836	AGTAT	2	10	71683	71692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014836	CATTT	2	10	115547	115556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014836	GGCGA	2	10	159928	159937	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014836	TCGTG	2	10	164124	164133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014836	AGAGG	2	10	166711	166720	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014836	AAGAT	2	10	167632	167641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014836	ATAAA	2	10	175570	175579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014836	ATTTG	2	10	175603	175612	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014836	GATTT	2	10	177145	177154	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014836	GTATT	2	10	197226	197235	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014836	TACTG	2	10	199882	199891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014836	TGCGC	2	10	229781	229790	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014836	TGATA	2	10	231231	231240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014836	GATTT	2	10	250569	250578	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014836	TGCGC	2	10	271580	271589	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014836	TGCCT	2	10	298026	298035	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014836	AAGCA	2	10	300684	300693	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014836	GCAAA	2	10	318489	318498	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014836	TCTGC	2	10	327168	327177	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014836	TGGCG	2	10	383625	383634	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014836	CAATG	2	10	422312	422321	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014836	GAAAG	2	10	430588	430597	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014836	ATTTT	2	10	438097	438106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014836	CCTCG	2	10	465655	465664	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014836	GGGAA	2	10	478902	478911	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014836	GGGAG	2	10	482318	482327	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014836	CACGC	2	10	497177	497186	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014836	AAAAG	2	10	515118	515127	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014836	ATATT	2	10	536711	536720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014836	GCCAG	2	10	540295	540304	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014836	AAGAG	2	10	555964	555973	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014836	GGTTT	2	10	560199	560208	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014836	TAAAA	2	10	656674	656683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014836	GGTAA	2	10	661400	661409	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014836	TCACC	2	10	692052	692061	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014836	ACGGC	2	10	693473	693482	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014836	GCCAG	2	10	696481	696490	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014836	TAACT	2	10	699044	699053	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014836	AGGCG	2	10	701091	701100	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014836	TTTTG	2	10	704135	704144	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014836	GGGGA	2	10	704478	704487	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014836	GAAAA	2	10	709274	709283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014836	TCCGC	2	10	712211	712220	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_014836	GGGGA	2	10	714683	714692	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014836	CAGGA	2	10	731801	731810	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014836	AAGCG	2	10	732105	732114	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014836	GCATG	2	10	741658	741667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014836	TTGTC	2	10	748433	748442	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014836	CTGGA	2	10	755208	755217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014836	TTTTC	2	10	758948	758957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014836	CAACG	2	10	823681	823690	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014836	TTATT	2	10	823752	823761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014836	TCCAG	2	10	840306	840315	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014836	CTGTC	2	10	845003	845012	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014836	GCAGC	2	10	849836	849845	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014836	TTTTG	2	10	850813	850822	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014836	GCCAG	2	10	894669	894678	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014836	ATTCC	2	10	973552	973561	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014836	GTCGT	2	10	994108	994117	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014836	TCAAT	2	10	996031	996040	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014836	GCGCC	2	10	996191	996200	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014836	AGGGT	2	10	996551	996560	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014836	TCCAA	2	10	1005272	1005281	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014836	AGGGG	2	10	1009639	1009648	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014836	AGGGG	2	10	1010841	1010850	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014836	TTTAC	2	10	1024743	1024752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014836	AGCAT	2	10	1028902	1028911	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014836	CTGGA	2	10	1037190	1037199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014836	CACCG	2	10	1047248	1047257	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014836	GGTCG	2	10	1052070	1052079	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014836	CCCAA	2	10	1057177	1057186	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_014836	GGGGA	2	10	1058461	1058470	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014836	CGCAA	2	10	1059995	1060004	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014836	AACCG	2	10	1063928	1063937	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014836	TGCTG	2	10	1070744	1070753	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014836	TGCTG	2	10	1124072	1124081	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014836	AATGA	2	10	1125440	1125449	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014836	TTGAT	2	10	1127398	1127407	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014836	GAAAG	2	10	1135093	1135102	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014836	AGCCA	2	10	1146739	1146748	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014836	TTCCT	2	10	1156894	1156903	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014836	CTTTC	2	10	1167352	1167361	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014836	AGAAA	2	10	1174318	1174327	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014836	TCGTG	2	10	1186514	1186523	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014836	AGAGG	2	10	1189270	1189279	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014836	AAGAT	2	10	1190191	1190200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014836	GCATG	2	10	1194045	1194054	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014836	CAATT	2	10	1225137	1225146	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014836	TGTGG	2	10	1276253	1276262	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014836	ACTCA	2	10	1284773	1284782	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014836	AGGCG	2	10	1290472	1290481	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014836	GAACA	2	10	1305700	1305709	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014836	GCAAA	2	10	1311730	1311739	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014836	AAAAG	2	10	1325055	1325064	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014836	AAAGG	2	10	1332648	1332657	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014836	ATTCA	2	10	1363320	1363329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014836	CTTCT	2	10	1371651	1371660	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014836	CCATG	2	10	1379673	1379682	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014836	TGAAG	2	10	1402542	1402551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014836	AGCAA	2	10	1411212	1411221	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014836	GGCGG	2	10	1435404	1435413	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014836	CATTT	2	10	1464543	1464552	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014836	CGTGC	2	10	1534318	1534327	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014836	GAACC	2	10	1534333	1534342	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014836	ATTTG	2	10	1559738	1559747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014836	AAAGA	2	10	1569698	1569707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014836	CCCCT	2	10	1590034	1590043	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_014836	GTATT	2	10	1619218	1619227	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014836	ATTTG	2	10	1628591	1628600	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014836	CGCAA	2	10	1698518	1698527	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014836	TTTTG	2	10	1699291	1699300	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014836	AAGGA	2	10	1705125	1705134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014836	GTATC	2	10	1742494	1742503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014836	CTTCT	2	10	1745335	1745344	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014836	CACTA	2	10	1753359	1753368	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014836	CGGGG	2	10	1821128	1821137	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014836	GATCA	2	10	1826344	1826353	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014836	AAAGG	2	10	1840449	1840458	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014836	TGCGC	2	10	1840569	1840578	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014836	AGGCG	2	10	1841365	1841374	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014836	CAAAT	2	10	1841817	1841826	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014836	CCTTT	2	10	1841936	1841945	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014836	CCTTT	2	10	1842134	1842143	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014836	TGCGC	2	10	1850780	1850789	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014836	GCGGG	2	10	1852008	1852017	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014836	TCGTT	2	10	1854292	1854301	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014836	GTACA	2	10	1909442	1909451	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014836	ATCAG	2	10	1910729	1910738	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014836	TTCTC	2	10	1914920	1914929	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014836	CTTTC	2	10	1921569	1921578	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014836	CTATG	2	10	1927316	1927325	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014836	CATCA	2	10	1931691	1931700	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014836	TCCTC	2	10	1935255	1935264	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_014836	GCATG	2	10	1948243	1948252	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014836	GTACA	2	10	1949461	1949470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014836	TTGAG	2	10	1953446	1953455	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014836	GGAAA	2	10	1966973	1966982	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014836	TCGAA	2	10	1971705	1971714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014836	CATGC	2	10	1976006	1976015	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_014836	GCCGC	2	10	2403428	2403437	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
183	NC_014836	GAAAA	2	10	2415871	2415880	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014836	GTTTT	2	10	2450978	2450987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_014836	GCATC	2	10	2488176	2488185	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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223	NC_014836	ATGAC	2	10	2906716	2906725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.