MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfurispirillum indicum S5 chromosome

Total Repeats: 43979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014836	AGC	2	6	6	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014836	ACC	2	6	89	94	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050200
3	NC_014836	TGA	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050200
4	NC_014836	GGA	2	6	244	249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050200
5	NC_014836	AGC	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050200
6	NC_014836	GTC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050200
7	NC_014836	CGC	2	6	514	519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050200
8	NC_014836	GAT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050200
9	NC_014836	GAG	2	6	719	724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050200
10	NC_014836	GAA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050200
11	NC_014836	ACC	2	6	946	951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050200
12	NC_014836	ATA	2	6	1053	1058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050200
13	NC_014836	CTC	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050200
14	NC_014836	CGG	2	6	1348	1353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050200
15	NC_014836	TTA	2	6	1621	1626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014836	TAC	2	6	1631	1636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014836	TAA	2	6	1639	1644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014836	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014836	TAG	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014836	AAG	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050201
21	NC_014836	ATT	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317050201
22	NC_014836	CTG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050201
23	NC_014836	CAC	2	6	2176	2181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050201
24	NC_014836	CAG	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050201
25	NC_014836	TGA	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050201
26	NC_014836	CTG	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050201
27	NC_014836	AAG	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050201
28	NC_014836	CCA	2	6	2451	2456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050201
29	NC_014836	CTA	2	6	2550	2555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050201
30	NC_014836	ATT	2	6	2654	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317050201
31	NC_014836	ATA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050201
32	NC_014836	TGC	2	6	3267	3272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050202
33	NC_014836	CAG	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050202
34	NC_014836	ATT	2	6	3389	3394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317050202
35	NC_014836	GAT	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050202
36	NC_014836	TTC	2	6	3474	3479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050202
37	NC_014836	CAG	2	6	3576	3581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050202
38	NC_014836	AGA	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050202
39	NC_014836	TGG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050202
40	NC_014836	GAT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050202
41	NC_014836	CAG	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050202
42	NC_014836	TGG	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050202
43	NC_014836	TGC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050202
44	NC_014836	GCT	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050202
45	NC_014836	CAG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050202
46	NC_014836	CAC	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050202
47	NC_014836	GGT	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050202
48	NC_014836	CGC	2	6	4021	4026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050203
49	NC_014836	GGC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050203
50	NC_014836	ATA	2	6	4199	4204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050203
51	NC_014836	TCA	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050203
52	NC_014836	TGA	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050204
53	NC_014836	CTG	3	9	4283	4291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050204
54	NC_014836	ATT	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317050204
55	NC_014836	CCG	2	6	4333	4338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050204
56	NC_014836	CAG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050204
57	NC_014836	TGG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050204
58	NC_014836	GCA	2	6	4496	4501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050204
59	NC_014836	TGG	2	6	4558	4563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050204
60	NC_014836	GTA	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050204
61	NC_014836	GAT	2	6	4769	4774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050204
62	NC_014836	CGG	2	6	4783	4788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050204
63	NC_014836	AAC	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050204
64	NC_014836	GAG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050204
65	NC_014836	TCA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050204
66	NC_014836	ACC	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050204
67	NC_014836	CAC	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050204
68	NC_014836	CAG	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050204
69	NC_014836	GGC	2	6	5666	5671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050204
70	NC_014836	CTC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014836	AGG	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014836	CTG	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050205
73	NC_014836	GTT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050205
74	NC_014836	ATC	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050205
75	NC_014836	TGA	2	6	6138	6143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050205
76	NC_014836	GTC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050205
77	NC_014836	CGA	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050205
78	NC_014836	GGC	3	9	6276	6284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050205
79	NC_014836	CCT	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014836	TAG	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014836	ATT	2	6	6435	6440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014836	TGG	2	6	6471	6476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050206
83	NC_014836	CCT	2	6	6524	6529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050206
84	NC_014836	AGA	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050206
85	NC_014836	GAG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050206
86	NC_014836	CCG	2	6	6660	6665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050206
87	NC_014836	GCC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050206
88	NC_014836	GTG	2	6	6859	6864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050206
89	NC_014836	GGT	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050206
90	NC_014836	TGA	2	6	7094	7099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050206
91	NC_014836	TCG	2	6	7112	7117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050206
92	NC_014836	CTG	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050206
93	NC_014836	ACG	2	6	7208	7213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050206
94	NC_014836	TCA	2	6	7232	7237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050206
95	NC_014836	CCG	2	6	7238	7243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050206
96	NC_014836	AAT	2	6	7353	7358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050206
97	NC_014836	ATT	2	6	7363	7368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014836	GGC	2	6	7396	7401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014836	GGC	2	6	7435	7440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050207
100	NC_014836	TGC	2	6	7441	7446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050207
101	NC_014836	TGG	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050207
102	NC_014836	CGC	2	6	7994	7999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050207
103	NC_014836	TCG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050207
104	NC_014836	GTC	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014836	GGC	2	6	8444	8449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050208
106	NC_014836	CCG	2	6	8456	8461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050208
107	NC_014836	CGG	2	6	8544	8549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050208
108	NC_014836	CGG	3	9	8556	8564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050208
109	NC_014836	TGA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050208
110	NC_014836	GGA	2	6	8591	8596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317050208
111	NC_014836	GGC	2	6	8858	8863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050209
112	NC_014836	CGA	2	6	8999	9004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050209
113	NC_014836	CGC	2	6	9117	9122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050209
114	NC_014836	CGT	2	6	9125	9130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050209
115	NC_014836	TCG	2	6	9148	9153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050209
116	NC_014836	CTC	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050209
117	NC_014836	CCG	2	6	9227	9232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050209
118	NC_014836	CCG	2	6	9469	9474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050210
119	NC_014836	AAG	2	6	9525	9530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050210
120	NC_014836	GAA	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050210
121	NC_014836	TCG	2	6	9726	9731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050210
122	NC_014836	ACC	2	6	9798	9803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317050210
123	NC_014836	CGC	2	6	9880	9885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050210
124	NC_014836	GCG	2	6	9967	9972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050210
125	NC_014836	ACG	2	6	10044	10049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050210
126	NC_014836	GCA	2	6	10063	10068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050210
127	NC_014836	CGC	2	6	10076	10081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050210
128	NC_014836	CGG	2	6	10093	10098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050210
129	NC_014836	GCC	2	6	10105	10110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050210
130	NC_014836	GAA	2	6	10121	10126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050210
131	NC_014836	GCA	2	6	10220	10225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050211
132	NC_014836	GAC	2	6	10303	10308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050211
133	NC_014836	CGG	2	6	10407	10412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050211
134	NC_014836	TTA	2	6	10536	10541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014836	ATA	2	6	10555	10560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014836	GCG	2	6	10643	10648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014836	ATT	2	6	10672	10677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317050212
138	NC_014836	TTC	2	6	10721	10726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050212
139	NC_014836	TCT	3	9	10755	10763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050212
140	NC_014836	GCG	2	6	10936	10941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050212
141	NC_014836	TCC	2	6	11010	11015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050212
142	NC_014836	ATG	2	6	11175	11180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050212
143	NC_014836	TCG	2	6	11181	11186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050212
144	NC_014836	CAA	2	6	11191	11196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317050212
145	NC_014836	CGC	2	6	11274	11279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317050212
146	NC_014836	GTT	2	6	11280	11285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050212
147	NC_014836	TCA	2	6	11286	11291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050212
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151	NC_014836	CTG	2	6	11495	11500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050212
152	NC_014836	TGC	2	6	11512	11517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050212
153	NC_014836	TGC	2	6	11556	11561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050212
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157	NC_014836	TTC	2	6	11871	11876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050213
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159	NC_014836	ATC	2	6	12102	12107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050213
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162	NC_014836	GCG	2	6	12232	12237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050213
163	NC_014836	GCA	2	6	12311	12316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050213
164	NC_014836	ACG	2	6	12531	12536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050213
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166	NC_014836	TCC	2	6	12706	12711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_014836	GCA	2	6	12731	12736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_014836	CGT	2	6	12740	12745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_014836	GCT	2	6	12769	12774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_014836	TCT	2	6	12810	12815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_014836	TGC	2	6	12964	12969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014836	CTG	2	6	13081	13086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050214
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181	NC_014836	TAG	2	6	13526	13531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014836	ATT	2	6	13559	13564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014836	TGG	2	6	13595	13600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050215
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202	NC_014836	CAG	2	6	14936	14941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050216
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205	NC_014836	CGA	3	9	15080	15088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050217
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226	NC_014836	GCA	3	9	16577	16585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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242	NC_014836	CAG	2	6	17951	17956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050219
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250	NC_014836	CAG	2	6	18435	18440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050219
251	NC_014836	GTT	2	6	18507	18512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050219
252	NC_014836	TCT	2	6	18530	18535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050219
253	NC_014836	CTC	2	6	18714	18719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050219
254	NC_014836	TGC	2	6	18824	18829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050219
255	NC_014836	TGC	2	6	18887	18892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050219
256	NC_014836	TGG	2	6	18893	18898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050219
257	NC_014836	ATA	2	6	19018	19023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317050219
258	NC_014836	CTT	2	6	19038	19043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050219
259	NC_014836	AGT	2	6	19220	19225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050219
260	NC_014836	CAT	2	6	19287	19292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050219
261	NC_014836	AGA	2	6	19352	19357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050219
262	NC_014836	GAA	2	6	19461	19466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317050219
263	NC_014836	CTC	2	6	19599	19604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317050219
264	NC_014836	CTG	2	6	19633	19638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_014836	GTG	2	6	19654	19659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_014836	AGA	2	6	19701	19706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014836	CCA	2	6	19755	19760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_014836	GGT	2	6	19871	19876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050220
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270	NC_014836	CAG	2	6	19930	19935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317050220
271	NC_014836	CTT	2	6	20005	20010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317050220
272	NC_014836	TGC	2	6	20028	20033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050220
273	NC_014836	TGG	2	6	20269	20274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050220
274	NC_014836	CTG	2	6	20297	20302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050220
275	NC_014836	CGG	2	6	20310	20315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050220
276	NC_014836	TGA	2	6	20521	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050220
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279	NC_014836	CAT	2	6	20656	20661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050220
280	NC_014836	GTG	2	6	20685	20690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317050220
281	NC_014836	GTT	2	6	20735	20740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317050220
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290	NC_014836	GTA	2	6	21104	21109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317050220
291	NC_014836	GCT	2	6	21155	21160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317050220
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295	NC_014836	CAG	3	9	21391	21399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_014836	CAG	2	6	21424	21429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_014836	CCT	2	6	21449	21454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_014836	CTG	2	6	21465	21470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_014836	GTG	2	6	21551	21556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014836	AGA	2	6	21642	21647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_014836	GCG	2	6	21724	21729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317050221
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378	NC_014836	TCA	2	6	26473	26478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317050224
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