MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 94080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014834	ACT	2	6	330	335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931397
2	NC_014834	CTG	2	6	352	357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931397
3	NC_014834	GCC	2	6	456	461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931397
4	NC_014834	CGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931397
5	NC_014834	GCA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931397
6	NC_014834	ACG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931397
7	NC_014834	CGG	2	6	532	537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931397
8	NC_014834	CGC	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931397
9	NC_014834	CGC	3	9	604	612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931397
10	NC_014834	GCC	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931397
11	NC_014834	GCG	2	6	636	641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931397
12	NC_014834	CTG	2	6	701	706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931397
13	NC_014834	CCG	2	6	762	767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931397
14	NC_014834	TCG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931397
15	NC_014834	CGA	2	6	859	864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931397
16	NC_014834	GGT	3	9	943	951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931397
17	NC_014834	GGC	2	6	952	957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931397
18	NC_014834	GCC	2	6	964	969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931397
19	NC_014834	CGA	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931397
20	NC_014834	CGG	2	6	1015	1020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931397
21	NC_014834	CTG	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931397
22	NC_014834	TCG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931397
23	NC_014834	TGT	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931397
24	NC_014834	GCC	2	6	1449	1454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931397
25	NC_014834	CGG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931397
26	NC_014834	TGC	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931397
27	NC_014834	CGA	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931397
28	NC_014834	CCG	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931398
29	NC_014834	AGA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931398
30	NC_014834	AAC	2	6	2589	2594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931398
31	NC_014834	AAG	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931398
32	NC_014834	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931398
33	NC_014834	CCG	2	6	2695	2700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931398
34	NC_014834	GAA	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931398
35	NC_014834	CGC	2	6	2819	2824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931398
36	NC_014834	CGC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931399
37	NC_014834	CCG	2	6	3199	3204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931399
38	NC_014834	GGT	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931399
39	NC_014834	GGA	2	6	3305	3310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931399
40	NC_014834	GCC	2	6	3401	3406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931399
41	NC_014834	GCG	2	6	3409	3414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931399
42	NC_014834	GGC	3	9	3464	3472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931399
43	NC_014834	ATC	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931399
44	NC_014834	CTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931399
45	NC_014834	CTG	2	6	3642	3647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931399
46	NC_014834	GCC	2	6	3756	3761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931399
47	NC_014834	CGT	2	6	3857	3862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931399
48	NC_014834	TGC	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931399
49	NC_014834	CGC	3	9	3908	3916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931399
50	NC_014834	CCT	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931399
51	NC_014834	TCG	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931399
52	NC_014834	ACC	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931399
53	NC_014834	CGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931399
54	NC_014834	TGC	3	9	4081	4089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931399
55	NC_014834	CGA	2	6	4091	4096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931399
56	NC_014834	GGT	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931399
57	NC_014834	GCC	2	6	4120	4125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931399
58	NC_014834	CGG	2	6	4213	4218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931399
59	NC_014834	CGA	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
60	NC_014834	CAC	2	6	4635	4640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931400
61	NC_014834	GTC	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
62	NC_014834	CGA	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
63	NC_014834	CGA	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
64	NC_014834	CGG	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
65	NC_014834	TCA	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931400
66	NC_014834	CGG	2	6	4826	4831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
67	NC_014834	GGT	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931400
68	NC_014834	GGT	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931400
69	NC_014834	GTG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931400
70	NC_014834	CTG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
71	NC_014834	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
72	NC_014834	CAA	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931400
73	NC_014834	TCG	3	9	5254	5262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
74	NC_014834	TGG	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931400
75	NC_014834	CAA	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931400
76	NC_014834	CGG	2	6	5363	5368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
77	NC_014834	ACA	2	6	5425	5430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931400
78	NC_014834	AAG	2	6	5436	5441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931400
79	NC_014834	CGA	2	6	5462	5467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
80	NC_014834	TCG	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
81	NC_014834	GGT	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931400
82	NC_014834	CGC	2	6	5597	5602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931400
83	NC_014834	GAG	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931400
84	NC_014834	TCG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
85	NC_014834	TCG	2	6	5791	5796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
86	NC_014834	TGC	2	6	5854	5859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
87	NC_014834	CGA	2	6	5966	5971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
88	NC_014834	ATC	2	6	6003	6008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931400
89	NC_014834	TGA	2	6	6010	6015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931400
90	NC_014834	CTG	3	9	6051	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
91	NC_014834	TTC	3	9	6063	6071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931400
92	NC_014834	GGC	2	6	6096	6101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
93	NC_014834	GCC	2	6	6119	6124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931400
94	NC_014834	GAC	2	6	6210	6215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
95	NC_014834	GAG	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931400
96	NC_014834	CGC	2	6	6252	6257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931400
97	NC_014834	CTG	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
98	NC_014834	GCA	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
99	NC_014834	CAA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931400
100	NC_014834	CCG	2	6	6382	6387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931400
101	NC_014834	GGC	2	6	6407	6412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
102	NC_014834	GCG	2	6	6517	6522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
103	NC_014834	CGA	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
104	NC_014834	GCT	2	6	6551	6556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
105	NC_014834	CCG	2	6	6562	6567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931400
106	NC_014834	CGA	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
107	NC_014834	GCG	2	6	6591	6596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931400
108	NC_014834	TGC	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
109	NC_014834	TCG	2	6	6632	6637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
110	NC_014834	CGA	2	6	6821	6826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
111	NC_014834	CGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931400
112	NC_014834	CGT	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931400
113	NC_014834	CAT	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931401
114	NC_014834	TGC	3	9	7680	7688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931401
115	NC_014834	CGC	2	6	7732	7737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931401
116	NC_014834	ACA	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931401
117	NC_014834	ACG	2	6	7860	7865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931401
118	NC_014834	TGG	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931401
119	NC_014834	TGA	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931401
120	NC_014834	AAG	2	6	8138	8143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931401
121	NC_014834	GCG	2	6	8156	8161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931401
122	NC_014834	GCG	2	6	8189	8194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931401
123	NC_014834	GGT	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931401
124	NC_014834	CGA	2	6	8280	8285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931401
125	NC_014834	CGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931401
126	NC_014834	CGC	2	6	8322	8327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931401
127	NC_014834	GAT	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931401
128	NC_014834	TCG	2	6	8508	8513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931401
129	NC_014834	GTC	3	9	8521	8529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931401
130	NC_014834	CCG	2	6	8550	8555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931401
131	NC_014834	GAA	2	6	8618	8623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931401
132	NC_014834	GAG	2	6	8660	8665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931401
133	NC_014834	TCC	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931401
134	NC_014834	AGG	2	6	8724	8729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931401
135	NC_014834	CGT	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931401
136	NC_014834	CTG	2	6	8840	8845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931401
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138	NC_014834	GTC	2	6	8903	8908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931401
139	NC_014834	CAG	2	6	8966	8971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931401
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152	NC_014834	CGG	2	6	9838	9843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931402
153	NC_014834	CAG	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931402
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249	NC_014834	ATG	2	6	15969	15974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931409
250	NC_014834	CGA	2	6	16027	16032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931410
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252	NC_014834	CGG	2	6	16212	16217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931410
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254	NC_014834	CGT	2	6	16284	16289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931410
255	NC_014834	CAT	2	6	16306	16311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931410
256	NC_014834	CTC	2	6	16336	16341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931410
257	NC_014834	TCT	2	6	16353	16358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931410
258	NC_014834	CTG	2	6	16371	16376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931410
259	NC_014834	CCG	2	6	16419	16424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931410
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377	NC_014834	CCG	3	9	22203	22211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
378	NC_014834	GCG	2	6	22212	22217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
379	NC_014834	GCT	2	6	22405	22410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931416
380	NC_014834	CAT	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
381	NC_014834	ACC	2	6	22593	22598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931416
382	NC_014834	GCA	2	6	22606	22611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
383	NC_014834	TCA	2	6	22651	22656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
384	NC_014834	GCC	2	6	22670	22675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
385	NC_014834	GGT	2	6	22753	22758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931416
386	NC_014834	GAT	2	6	22802	22807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
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402	NC_014834	CGG	2	6	23437	23442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
403	NC_014834	GCG	2	6	23530	23535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
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410	NC_014834	GAT	2	6	24228	24233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931417
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497	NC_014834	GAC	2	6	28477	28482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931421
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499	NC_014834	GCA	2	6	28538	28543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931421
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