MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 14278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014834	TC	3	6	8	13	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014834	CG	3	6	186	191	0 %	0 %	50 %	50 %	316931397
3	NC_014834	CG	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	316931397
4	NC_014834	GC	3	6	410	415	0 %	0 %	50 %	50 %	316931397
5	NC_014834	CG	3	6	1077	1082	0 %	0 %	50 %	50 %	316931397
6	NC_014834	GC	3	6	1651	1656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014834	CG	3	6	1839	1844	0 %	0 %	50 %	50 %	316931398
8	NC_014834	GC	3	6	1925	1930	0 %	0 %	50 %	50 %	316931398
9	NC_014834	GC	3	6	2336	2341	0 %	0 %	50 %	50 %	316931398
10	NC_014834	CG	3	6	2673	2678	0 %	0 %	50 %	50 %	316931398
11	NC_014834	GC	3	6	3364	3369	0 %	0 %	50 %	50 %	316931399
12	NC_014834	GC	3	6	3984	3989	0 %	0 %	50 %	50 %	316931399
13	NC_014834	GC	3	6	4159	4164	0 %	0 %	50 %	50 %	316931399
14	NC_014834	CG	3	6	5678	5683	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
15	NC_014834	GC	3	6	5688	5693	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
16	NC_014834	GC	3	6	5713	5718	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
17	NC_014834	CG	4	8	5889	5896	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
18	NC_014834	GC	3	6	6034	6039	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
19	NC_014834	GC	4	8	6173	6180	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
20	NC_014834	CG	5	10	6281	6290	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
21	NC_014834	CG	3	6	6373	6378	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
22	NC_014834	CG	3	6	6422	6427	0 %	0 %	50 %	50 %	316931400
23	NC_014834	GA	3	6	6984	6989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014834	CG	3	6	7395	7400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014834	CG	3	6	8254	8259	0 %	0 %	50 %	50 %	316931401
26	NC_014834	GC	3	6	8266	8271	0 %	0 %	50 %	50 %	316931401
27	NC_014834	CG	3	6	8438	8443	0 %	0 %	50 %	50 %	316931401
28	NC_014834	CT	3	6	8557	8562	0 %	50 %	0 %	50 %	316931401
29	NC_014834	CG	3	6	9331	9336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014834	GC	3	6	9571	9576	0 %	0 %	50 %	50 %	316931402
31	NC_014834	CG	3	6	10274	10279	0 %	0 %	50 %	50 %	316931402
32	NC_014834	GC	3	6	10552	10557	0 %	0 %	50 %	50 %	316931402
33	NC_014834	GC	3	6	11166	11171	0 %	0 %	50 %	50 %	316931404
34	NC_014834	GC	7	14	11250	11263	0 %	0 %	50 %	50 %	316931404
35	NC_014834	GC	3	6	11353	11358	0 %	0 %	50 %	50 %	316931404
36	NC_014834	GC	3	6	11370	11375	0 %	0 %	50 %	50 %	316931404
37	NC_014834	GC	3	6	11571	11576	0 %	0 %	50 %	50 %	316931404
38	NC_014834	GC	3	6	11722	11727	0 %	0 %	50 %	50 %	316931404
39	NC_014834	GC	3	6	12587	12592	0 %	0 %	50 %	50 %	316931404
40	NC_014834	CT	3	6	12992	12997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014834	GC	3	6	14487	14492	0 %	0 %	50 %	50 %	316931406
42	NC_014834	CG	4	8	15125	15132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014834	CG	3	6	15355	15360	0 %	0 %	50 %	50 %	316931407
44	NC_014834	CG	3	6	15590	15595	0 %	0 %	50 %	50 %	316931408
45	NC_014834	CG	3	6	15848	15853	0 %	0 %	50 %	50 %	316931409
46	NC_014834	GC	3	6	15994	15999	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
47	NC_014834	CG	3	6	16719	16724	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
48	NC_014834	GC	3	6	16877	16882	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
49	NC_014834	GC	3	6	16971	16976	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
50	NC_014834	GC	3	6	17384	17389	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
51	NC_014834	CG	4	8	17479	17486	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
52	NC_014834	CG	3	6	17751	17756	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
53	NC_014834	GC	3	6	17955	17960	0 %	0 %	50 %	50 %	316931410
54	NC_014834	AC	3	6	18304	18309	50 %	0 %	0 %	50 %	316931411
55	NC_014834	CG	3	6	18415	18420	0 %	0 %	50 %	50 %	316931411
56	NC_014834	AC	3	6	19326	19331	50 %	0 %	0 %	50 %	316931412
57	NC_014834	GC	3	6	19379	19384	0 %	0 %	50 %	50 %	316931412
58	NC_014834	GC	3	6	19708	19713	0 %	0 %	50 %	50 %	316931412
59	NC_014834	GC	3	6	19982	19987	0 %	0 %	50 %	50 %	316931412
60	NC_014834	GC	3	6	20152	20157	0 %	0 %	50 %	50 %	316931412
61	NC_014834	GC	3	6	20220	20225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014834	CG	3	6	20262	20267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014834	GC	3	6	20451	20456	0 %	0 %	50 %	50 %	316931413
64	NC_014834	CG	3	6	20672	20677	0 %	0 %	50 %	50 %	316931413
65	NC_014834	GC	3	6	20787	20792	0 %	0 %	50 %	50 %	316931413
66	NC_014834	GC	3	6	22183	22188	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
67	NC_014834	GC	3	6	22444	22449	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
68	NC_014834	GC	3	6	22477	22482	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
69	NC_014834	GC	3	6	23270	23275	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
70	NC_014834	CG	3	6	24269	24274	0 %	0 %	50 %	50 %	316931417
71	NC_014834	CG	3	6	24601	24606	0 %	0 %	50 %	50 %	316931417
72	NC_014834	GA	3	6	24880	24885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014834	GC	3	6	25842	25847	0 %	0 %	50 %	50 %	316931419
74	NC_014834	GC	3	6	26117	26122	0 %	0 %	50 %	50 %	316931419
75	NC_014834	CG	3	6	26338	26343	0 %	0 %	50 %	50 %	316931419
76	NC_014834	CG	3	6	26675	26680	0 %	0 %	50 %	50 %	316931420
77	NC_014834	CG	3	6	28211	28216	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
78	NC_014834	CG	3	6	28245	28250	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
79	NC_014834	GC	3	6	28363	28368	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
80	NC_014834	CG	3	6	28601	28606	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
81	NC_014834	TG	3	6	28996	29001	0 %	50 %	50 %	0 %	316931421
82	NC_014834	GC	3	6	29098	29103	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
83	NC_014834	CG	3	6	29252	29257	0 %	0 %	50 %	50 %	316931421
84	NC_014834	CG	3	6	30982	30987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014834	GC	3	6	32871	32876	0 %	0 %	50 %	50 %	316931424
86	NC_014834	GC	3	6	32887	32892	0 %	0 %	50 %	50 %	316931424
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88	NC_014834	GC	3	6	33422	33427	0 %	0 %	50 %	50 %	316931424
89	NC_014834	GC	3	6	34012	34017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014834	CG	3	6	34069	34074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014834	CT	3	6	34363	34368	0 %	50 %	0 %	50 %	316931425
92	NC_014834	GC	3	6	34709	34714	0 %	0 %	50 %	50 %	316931425
93	NC_014834	CG	3	6	35424	35429	0 %	0 %	50 %	50 %	316931425
94	NC_014834	GC	4	8	35875	35882	0 %	0 %	50 %	50 %	316931425
95	NC_014834	CG	3	6	35893	35898	0 %	0 %	50 %	50 %	316931425
96	NC_014834	GC	3	6	36081	36086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014834	CA	3	6	36173	36178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014834	CG	3	6	36266	36271	0 %	0 %	50 %	50 %	316931426
99	NC_014834	GC	3	6	36549	36554	0 %	0 %	50 %	50 %	316931426
100	NC_014834	CG	4	8	36744	36751	0 %	0 %	50 %	50 %	316931426
101	NC_014834	CG	3	6	37070	37075	0 %	0 %	50 %	50 %	316931426
102	NC_014834	GC	3	6	37092	37097	0 %	0 %	50 %	50 %	316931426
103	NC_014834	GC	3	6	37102	37107	0 %	0 %	50 %	50 %	316931426
104	NC_014834	GC	3	6	37325	37330	0 %	0 %	50 %	50 %	316931426
105	NC_014834	CG	3	6	37643	37648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014834	GC	3	6	37829	37834	0 %	0 %	50 %	50 %	316931427
107	NC_014834	GC	4	8	37884	37891	0 %	0 %	50 %	50 %	316931427
108	NC_014834	GC	3	6	38248	38253	0 %	0 %	50 %	50 %	316931428
109	NC_014834	GC	3	6	38556	38561	0 %	0 %	50 %	50 %	316931428
110	NC_014834	CG	3	6	38875	38880	0 %	0 %	50 %	50 %	316931429
111	NC_014834	CG	3	6	39977	39982	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
112	NC_014834	GC	4	8	40142	40149	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
113	NC_014834	CG	3	6	40265	40270	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
114	NC_014834	GC	4	8	40437	40444	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
115	NC_014834	CG	3	6	40461	40466	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
116	NC_014834	GC	5	10	40625	40634	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
117	NC_014834	CG	3	6	40790	40795	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
118	NC_014834	GC	3	6	41178	41183	0 %	0 %	50 %	50 %	316931430
119	NC_014834	CG	3	6	41433	41438	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
120	NC_014834	CG	3	6	41604	41609	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
121	NC_014834	GC	4	8	42246	42253	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
122	NC_014834	GC	3	6	42679	42684	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
123	NC_014834	CG	4	8	43215	43222	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
124	NC_014834	GC	3	6	43506	43511	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
125	NC_014834	GC	3	6	43949	43954	0 %	0 %	50 %	50 %	316931432
126	NC_014834	GC	3	6	43958	43963	0 %	0 %	50 %	50 %	316931432
127	NC_014834	CG	4	8	44316	44323	0 %	0 %	50 %	50 %	316931432
128	NC_014834	GC	3	6	45992	45997	0 %	0 %	50 %	50 %	316931434
129	NC_014834	CG	3	6	46236	46241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014834	CG	3	6	46245	46250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014834	CG	3	6	46479	46484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014834	GC	3	6	47068	47073	0 %	0 %	50 %	50 %	316931436
133	NC_014834	CG	3	6	47448	47453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014834	AG	3	6	47920	47925	50 %	0 %	50 %	0 %	316931437
135	NC_014834	GC	4	8	48008	48015	0 %	0 %	50 %	50 %	316931437
136	NC_014834	GC	3	6	48745	48750	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
137	NC_014834	CG	3	6	48869	48874	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
138	NC_014834	GT	3	6	49087	49092	0 %	50 %	50 %	0 %	316931438
139	NC_014834	CG	3	6	49198	49203	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
140	NC_014834	CG	3	6	49295	49300	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
141	NC_014834	GC	3	6	49438	49443	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
142	NC_014834	GC	4	8	49529	49536	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
143	NC_014834	GC	3	6	49805	49810	0 %	0 %	50 %	50 %	316931439
144	NC_014834	AC	3	6	50328	50333	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014834	GC	3	6	50935	50940	0 %	0 %	50 %	50 %	316931440
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