MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 chromosome

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014833	GCTGCA	2	12	12671	12682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014833	CTTGCC	2	12	61989	62000	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014833	ATCTTG	2	12	62666	62677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014833	TTCTAT	2	12	63094	63105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014833	TAATTA	2	12	69860	69871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014833	TCAATG	2	12	88328	88339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014833	ATCCTG	2	12	103389	103400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014833	TGCTAT	2	12	108575	108586	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014833	AACTAA	2	12	122971	122982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014833	TTTTTA	2	12	135496	135507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014833	TTCAAG	2	12	159498	159509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014833	TAAATA	2	12	167252	167263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014833	AACGGC	2	12	175492	175503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014833	AGACAC	2	12	179714	179725	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014833	ACGTTT	2	12	184172	184183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014833	GTTTGC	2	12	221378	221389	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014833	GCTAAA	2	12	244521	244532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014833	ATTTTT	2	12	323192	323203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014833	TCAATG	2	12	351500	351511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014833	AGGTAA	2	12	384843	384854	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014833	ATCTTT	2	12	395508	395519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014833	AAACGA	2	12	395634	395645	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014833	TAGTCA	2	12	406275	406286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014833	AGCGAG	2	12	419991	420002	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014833	TTAGTT	2	12	422649	422660	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014833	GGTGAT	2	12	473509	473520	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014833	AATTTT	2	12	506338	506349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014833	TGATAT	2	12	541631	541642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014833	AACAAA	2	12	552779	552790	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014833	TAAATA	2	12	586094	586105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014833	TAAATT	2	12	597900	597911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014833	TTCATC	2	12	601593	601604	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014833	AATCAT	2	12	602708	602719	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014833	TTCAAA	2	12	604287	604298	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014833	GCAGAA	2	12	612202	612213	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014833	GCTGAC	2	12	633815	633826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014833	CCTGCC	2	12	696056	696067	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014833	TTTGTA	2	12	703532	703543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014833	GCTGAC	2	12	712555	712566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014833	AAATAG	2	12	719632	719643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014833	ATGATA	2	12	748086	748097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014833	AATTGT	2	12	753708	753719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014833	CATAAT	2	12	753739	753750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014833	CAAATG	2	12	766587	766598	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014833	ATGGTA	2	12	766680	766691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014833	ATAATT	2	12	878520	878531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014833	AAGGCA	2	12	919414	919425	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014833	GCCTAA	2	12	921355	921366	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014833	CTTATT	2	12	931700	931711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014833	CGGCAG	2	12	934105	934116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014833	TGTAGT	2	12	938281	938292	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014833	GCAGCC	2	12	956646	956657	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014833	GTCTTT	2	12	1072122	1072133	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014833	ATACTA	2	12	1085388	1085399	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014833	AATAAG	2	12	1117338	1117349	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014833	GCTTTT	2	12	1210531	1210542	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014833	AGTAAA	2	12	1250550	1250561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014833	CGGCAG	2	12	1259494	1259505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014833	CTGTGC	2	12	1313527	1313538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014833	CTGTGC	2	12	1313728	1313739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014833	CCGCCT	2	12	1316810	1316821	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014833	AGAATA	2	12	1364351	1364362	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014833	ATTAAG	2	12	1394972	1394983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014833	TGAAGT	2	12	1395644	1395655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014833	CAAACA	2	12	1408579	1408590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014833	TTGCTA	2	12	1442535	1442546	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014833	TTCTAT	2	12	1480361	1480372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014833	GCAAAG	2	12	1503318	1503329	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014833	GGTTCG	2	12	1506445	1506456	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014833	ATAGCA	2	12	1535689	1535700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014833	TAGTCA	2	12	1544942	1544953	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014833	GCTGCA	2	12	1545394	1545405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014833	TGCAAA	2	12	1554204	1554215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014833	TTTTTA	2	12	1617825	1617836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014833	CGTAAA	2	12	1627104	1627115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014833	GTATGA	2	12	1633834	1633845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014833	ATCGAG	2	12	1640345	1640356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014833	CATATC	2	12	1640663	1640674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014833	AGCGAC	2	12	1692026	1692037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014833	ATCAGT	2	12	1696163	1696174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014833	CTGCCT	2	12	1708268	1708279	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014833	ATAACG	2	12	1709130	1709141	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014833	CCATAT	2	12	1724838	1724849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014833	GTATAA	2	12	1730630	1730641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014833	AATATA	2	12	1886127	1886138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014833	GATACG	2	12	1932833	1932844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014833	ATTTTT	2	12	1952725	1952736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014833	GGAAAA	2	12	1966315	1966326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014833	TTTTTG	2	12	1984592	1984603	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014833	TGTTTT	2	12	2143960	2143971	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014833	AAAGAT	2	12	2158415	2158426	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014833	GCCGCA	2	12	2162327	2162338	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014833	CAATAA	2	12	2163455	2163466	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014833	ATTATA	2	12	2260379	2260390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014833	TATAAT	2	12	2282380	2282391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014833	TTATAT	2	12	2296532	2296543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014833	ATTTTT	2	12	2327121	2327132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014833	AAAAAT	2	12	2355544	2355555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014833	AGATAA	2	12	2430522	2430533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014833	TTTACA	2	12	2505500	2505511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014833	AAGAAA	2	12	2581021	2581032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014833	GAAATA	2	12	2582698	2582709	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014833	ACGGAT	2	12	2627987	2627998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014833	ATTATA	2	12	2644108	2644119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014833	AAGCCT	2	12	2663443	2663454	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014833	TTTGCT	2	12	2668682	2668693	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014833	AGATAA	2	12	2687504	2687515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014833	TGATAG	2	12	2767785	2767796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014833	TGTCAA	2	12	2791618	2791629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014833	TAGTCA	2	12	2800131	2800142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014833	GAATAC	2	12	2826621	2826632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014833	TCAAAA	2	12	2838608	2838619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014833	TATAAG	2	12	2846823	2846834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014833	CTTTAT	2	12	2863560	2863571	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014833	CTCGCT	2	12	2866136	2866147	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014833	TAGTCA	2	12	2885418	2885429	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014833	CATATA	2	12	2893050	2893061	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014833	CTTGTT	2	12	2927952	2927963	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014833	TACTTA	2	12	2928361	2928372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014833	TGCATT	2	12	2968089	2968100	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014833	CCGCTG	2	12	2969493	2969504	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014833	AAATAG	2	12	2972486	2972497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014833	GATATA	2	12	2982293	2982304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014833	AATTAT	2	12	3077472	3077483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014833	TTATAA	2	12	3102122	3102133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014833	TAGTCA	2	12	3102380	3102391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014833	GTTTTT	2	12	3109765	3109776	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014833	TTCCAG	2	12	3132176	3132187	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014833	AAACAA	2	12	3145276	3145287	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014833	ATTTAC	2	12	3163815	3163826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014833	ATGATT	2	12	3199957	3199968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014833	CCGAAG	2	12	3279271	3279282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014833	TTTTTG	2	12	3338040	3338051	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014833	AATATT	2	12	3352494	3352505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014833	GCTGAC	2	12	3443330	3443341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014833	TTTCCT	2	12	3497927	3497938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014833	ACCTGT	2	12	3512509	3512520	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014833	TTGTAT	2	12	3536899	3536910	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014833	AATATG	2	12	3557888	3557899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014833	TAAAAT	2	12	3560920	3560931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014833	TCAGCT	2	12	3574802	3574813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014833	TTCGCT	2	12	3582055	3582066	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014833	TTCTAT	2	12	3600236	3600247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_014833	TCCCCC	2	12	3624720	3624731	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
145	NC_014833	TTTGCA	2	12	3671070	3671081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014833	CTCGCT	2	12	3674283	3674294	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.