MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ruminococcus albus 7 chromosome

Total Repeats: 2669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014833	CAGGA	2	10	814	823	40 %	0 %	40 %	20 %	317054732
2	NC_014833	AAAGA	2	10	4734	4743	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014833	GAAAA	2	10	4850	4859	80 %	0 %	20 %	0 %	317054737
4	NC_014833	AGCTG	2	10	5337	5346	20 %	20 %	40 %	20 %	317054738
5	NC_014833	GTGCT	2	10	7727	7736	0 %	40 %	40 %	20 %	317054740
6	NC_014833	AAAAG	2	10	8032	8041	80 %	0 %	20 %	0 %	317054740
7	NC_014833	CTATC	2	10	10980	10989	20 %	40 %	0 %	40 %	317054742
8	NC_014833	CAGAA	2	10	11199	11208	60 %	0 %	20 %	20 %	317054742
9	NC_014833	GCCCA	2	10	13130	13139	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_014833	GCAAG	2	10	14344	14353	40 %	0 %	40 %	20 %	317054744
11	NC_014833	AGAAA	2	10	14964	14973	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014833	TATAA	2	10	17147	17156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014833	CATCA	2	10	18126	18135	40 %	20 %	0 %	40 %	317054747
14	NC_014833	AGGAT	2	10	23471	23480	40 %	20 %	40 %	0 %	317054751
15	NC_014833	GTGAG	2	10	23847	23856	20 %	20 %	60 %	0 %	317054751
16	NC_014833	ACGAT	2	10	24247	24256	40 %	20 %	20 %	20 %	317054752
17	NC_014833	TCGGA	2	10	24343	24352	20 %	20 %	40 %	20 %	317054752
18	NC_014833	CTGAT	2	10	25228	25237	20 %	40 %	20 %	20 %	317054752
19	NC_014833	GTTCA	2	10	26612	26621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014833	AGTGA	2	10	29441	29450	40 %	20 %	40 %	0 %	317054754
21	NC_014833	GAACA	2	10	29630	29639	60 %	0 %	20 %	20 %	317054755
22	NC_014833	TACGG	2	10	31808	31817	20 %	20 %	40 %	20 %	317054756
23	NC_014833	GAAAG	2	10	36010	36019	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014833	CGGTA	2	10	37642	37651	20 %	20 %	40 %	20 %	317054760
25	NC_014833	ATGCT	2	10	38459	38468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014833	AATGA	2	10	38895	38904	60 %	20 %	20 %	0 %	317054761
27	NC_014833	TTCCT	2	10	39914	39923	0 %	60 %	0 %	40 %	317054762
28	NC_014833	ATCCT	2	10	40055	40064	20 %	40 %	0 %	40 %	317054762
29	NC_014833	GCTGA	2	10	42253	42262	20 %	20 %	40 %	20 %	317054762
30	NC_014833	AAAGA	2	10	45039	45048	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014833	GAGAA	2	10	47724	47733	60 %	0 %	40 %	0 %	317054768
32	NC_014833	TCGCT	2	10	54596	54605	0 %	40 %	20 %	40 %	317054783
33	NC_014833	GGGCT	2	10	55757	55766	0 %	20 %	60 %	20 %	317054786
34	NC_014833	AAAGA	2	10	61193	61202	80 %	0 %	20 %	0 %	317054795
35	NC_014833	TATAA	2	10	63336	63345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014833	ATGGT	2	10	64279	64288	20 %	40 %	40 %	0 %	317054798
37	NC_014833	AGATA	2	10	65281	65290	60 %	20 %	20 %	0 %	317054799
38	NC_014833	TATAG	2	10	68839	68848	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014833	ATGGT	2	10	70420	70429	20 %	40 %	40 %	0 %	317054805
40	NC_014833	ATTAT	2	10	76041	76050	40 %	60 %	0 %	0 %	317054809
41	NC_014833	CTATA	2	10	77207	77216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014833	CTTTG	2	10	77972	77981	0 %	60 %	20 %	20 %	317054812
43	NC_014833	TTCTA	2	10	78308	78317	20 %	60 %	0 %	20 %	317054812
44	NC_014833	ACTGC	2	10	79441	79450	20 %	20 %	20 %	40 %	317054813
45	NC_014833	AGCAG	2	10	80077	80086	40 %	0 %	40 %	20 %	317054813
46	NC_014833	CTTCT	2	10	83700	83709	0 %	60 %	0 %	40 %	317054815
47	NC_014833	CAGTA	2	10	84370	84379	40 %	20 %	20 %	20 %	317054816
48	NC_014833	TCAGC	2	10	85368	85377	20 %	20 %	20 %	40 %	317054816
49	NC_014833	TGAAG	2	10	85551	85560	40 %	20 %	40 %	0 %	317054816
50	NC_014833	ACTGC	2	10	85739	85748	20 %	20 %	20 %	40 %	317054816
51	NC_014833	CTTTG	2	10	85999	86008	0 %	60 %	20 %	20 %	317054817
52	NC_014833	GCTCA	2	10	86656	86665	20 %	20 %	20 %	40 %	317054817
53	NC_014833	AAGTA	2	10	87167	87176	60 %	20 %	20 %	0 %	317054818
54	NC_014833	CTGCC	2	10	91544	91553	0 %	20 %	20 %	60 %	317054821
55	NC_014833	CTGTA	2	10	91906	91915	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014833	AGCTT	2	10	92462	92471	20 %	40 %	20 %	20 %	317054822
57	NC_014833	TGCTT	2	10	93951	93960	0 %	60 %	20 %	20 %	317054823
58	NC_014833	AACAT	2	10	96997	97006	60 %	20 %	0 %	20 %	317054828
59	NC_014833	CTTTC	2	10	97347	97356	0 %	60 %	0 %	40 %	317054828
60	NC_014833	TTATT	2	10	99428	99437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014833	CTTGC	2	10	100828	100837	0 %	40 %	20 %	40 %	317054832
62	NC_014833	CAGTA	2	10	101846	101855	40 %	20 %	20 %	20 %	317054833
63	NC_014833	GGTGT	2	10	102893	102902	0 %	40 %	60 %	0 %	317054834
64	NC_014833	TTTCC	2	10	103208	103217	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014833	CGATA	2	10	103960	103969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014833	CTTTT	2	10	106659	106668	0 %	80 %	0 %	20 %	317054838
67	NC_014833	TTTTC	2	10	106978	106987	0 %	80 %	0 %	20 %	317054838
68	NC_014833	ATTAT	2	10	113138	113147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014833	TATCA	2	10	113989	113998	40 %	40 %	0 %	20 %	317054845
70	NC_014833	CATGA	2	10	116010	116019	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014833	ATTTA	2	10	116236	116245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014833	GCTGT	2	10	117550	117559	0 %	40 %	40 %	20 %	317054848
73	NC_014833	GGTCA	2	10	119412	119421	20 %	20 %	40 %	20 %	317054849
74	NC_014833	AAGGC	2	10	119536	119545	40 %	0 %	40 %	20 %	317054849
75	NC_014833	TATCT	2	10	121861	121870	20 %	60 %	0 %	20 %	317054851
76	NC_014833	CTGTT	2	10	122853	122862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014833	ACTTC	2	10	123164	123173	20 %	40 %	0 %	40 %	317054853
78	NC_014833	ATATG	2	10	123247	123256	40 %	40 %	20 %	0 %	317054853
79	NC_014833	GGCAA	2	10	124808	124817	40 %	0 %	40 %	20 %	317054853
80	NC_014833	TGAAC	2	10	124968	124977	40 %	20 %	20 %	20 %	317054854
81	NC_014833	GCGAT	2	10	125938	125947	20 %	20 %	40 %	20 %	317054855
82	NC_014833	AAGGC	2	10	127048	127057	40 %	0 %	40 %	20 %	317054855
83	NC_014833	CAGTA	2	10	129106	129115	40 %	20 %	20 %	20 %	317054857
84	NC_014833	TCTGG	2	10	129137	129146	0 %	40 %	40 %	20 %	317054857
85	NC_014833	AAATT	2	10	130210	130219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014833	ACCGC	2	10	130243	130252	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_014833	TGTGA	2	10	130353	130362	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014833	GGGCA	2	10	131375	131384	20 %	0 %	60 %	20 %	317054860
89	NC_014833	AGCGC	2	10	133205	133214	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014833	CAGCA	2	10	134442	134451	40 %	0 %	20 %	40 %	317054863
91	NC_014833	GCTGT	2	10	135910	135919	0 %	40 %	40 %	20 %	317054864
92	NC_014833	CATCG	2	10	135973	135982	20 %	20 %	20 %	40 %	317054864
93	NC_014833	GTGAG	2	10	138898	138907	20 %	20 %	60 %	0 %	317054867
94	NC_014833	GCTTT	2	10	139242	139251	0 %	60 %	20 %	20 %	317054868
95	NC_014833	TATAA	2	10	140250	140259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014833	AAGGA	2	10	143946	143955	60 %	0 %	40 %	0 %	317054871
97	NC_014833	GCAAG	2	10	144202	144211	40 %	0 %	40 %	20 %	317054871
98	NC_014833	CCTGC	2	10	145514	145523	0 %	20 %	20 %	60 %	317054872
99	NC_014833	CCCTG	2	10	146105	146114	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_014833	TATCT	2	10	147153	147162	20 %	60 %	0 %	20 %	317054874
101	NC_014833	TATAA	2	10	150610	150619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014833	ATCAG	2	10	151781	151790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014833	ATTTC	2	10	152365	152374	20 %	60 %	0 %	20 %	317054879
104	NC_014833	TTACT	2	10	153547	153556	20 %	60 %	0 %	20 %	317054879
105	NC_014833	AGATA	2	10	155248	155257	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014833	GATAT	2	10	155758	155767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014833	TGATA	2	10	161568	161577	40 %	40 %	20 %	0 %	317054885
108	NC_014833	GATGA	2	10	162932	162941	40 %	20 %	40 %	0 %	317054886
109	NC_014833	TATAA	2	10	163403	163412	60 %	40 %	0 %	0 %	317054887
110	NC_014833	CTGCA	2	10	164077	164086	20 %	20 %	20 %	40 %	317054888
111	NC_014833	CCTTT	2	10	164466	164475	0 %	60 %	0 %	40 %	317054888
112	NC_014833	GAAAA	2	10	164863	164872	80 %	0 %	20 %	0 %	317054888
113	NC_014833	ATAAA	2	10	165352	165361	80 %	20 %	0 %	0 %	317054889
114	NC_014833	CTACA	2	10	167146	167155	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014833	GATTT	2	10	167891	167900	20 %	60 %	20 %	0 %	317054896
116	NC_014833	GATAT	2	10	169650	169659	40 %	40 %	20 %	0 %	317054898
117	NC_014833	ATTTG	2	10	169996	170005	20 %	60 %	20 %	0 %	317054898
118	NC_014833	GATAA	2	10	170457	170466	60 %	20 %	20 %	0 %	317054898
119	NC_014833	CATGA	2	10	170610	170619	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014833	ATACT	2	10	171015	171024	40 %	40 %	0 %	20 %	317054899
121	NC_014833	GAACG	2	10	171922	171931	40 %	0 %	40 %	20 %	317054900
122	NC_014833	ATATC	2	10	172023	172032	40 %	40 %	0 %	20 %	317054900
123	NC_014833	TTATC	2	10	172126	172135	20 %	60 %	0 %	20 %	317054900
124	NC_014833	ATCGA	2	10	172478	172487	40 %	20 %	20 %	20 %	317054900
125	NC_014833	AAGTG	2	10	176142	176151	40 %	20 %	40 %	0 %	317054904
126	NC_014833	GCTGC	2	10	182357	182366	0 %	20 %	40 %	40 %	317054907
127	NC_014833	TCTGC	2	10	182538	182547	0 %	40 %	20 %	40 %	317054908
128	NC_014833	GAAGG	2	10	182730	182739	40 %	0 %	60 %	0 %	317054908
129	NC_014833	CGCTC	2	10	184891	184900	0 %	20 %	20 %	60 %	317054909
130	NC_014833	TCTGC	2	10	189275	189284	0 %	40 %	20 %	40 %	317054912
131	NC_014833	CATGC	2	10	190746	190755	20 %	20 %	20 %	40 %	317054912
132	NC_014833	ACTAT	2	10	190936	190945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014833	GTCGG	2	10	195303	195312	0 %	20 %	60 %	20 %	317054916
134	NC_014833	TACTG	2	10	197241	197250	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014833	CAAAA	2	10	199738	199747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014833	AGTCC	2	10	201712	201721	20 %	20 %	20 %	40 %	317054922
137	NC_014833	AAAGC	2	10	202418	202427	60 %	0 %	20 %	20 %	317054923
138	NC_014833	ACGCA	2	10	203280	203289	40 %	0 %	20 %	40 %	317054924
139	NC_014833	CTATA	2	10	203604	203613	40 %	40 %	0 %	20 %	317054924
140	NC_014833	ATAAG	2	10	204859	204868	60 %	20 %	20 %	0 %	317054925
141	NC_014833	TGATA	2	10	205658	205667	40 %	40 %	20 %	0 %	317054925
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147	NC_014833	TCTGT	2	10	214133	214142	0 %	60 %	20 %	20 %	317054932
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149	NC_014833	GCCGT	2	10	215932	215941	0 %	20 %	40 %	40 %	317054933
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151	NC_014833	AAAAC	2	10	218359	218368	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014833	TATGA	2	10	219833	219842	40 %	40 %	20 %	0 %	317054936
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172	NC_014833	GACTT	2	10	247034	247043	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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235	NC_014833	TCATT	2	10	330655	330664	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
236	NC_014833	ATGAA	2	10	331347	331356	60 %	20 %	20 %	0 %	317055041
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245	NC_014833	ATGCC	2	10	342013	342022	20 %	20 %	20 %	40 %	317055048
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249	NC_014833	GATAT	2	10	344338	344347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_014833	TAATA	2	10	344458	344467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014833	TAAAA	2	10	348443	348452	80 %	20 %	0 %	0 %	317055052
252	NC_014833	CCTCT	2	10	351226	351235	0 %	40 %	0 %	60 %	317055054
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255	NC_014833	GTTTC	2	10	356413	356422	0 %	60 %	20 %	20 %	317055058
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263	NC_014833	TTCTT	2	10	361203	361212	0 %	80 %	0 %	20 %	317055063
264	NC_014833	AAAAC	2	10	363701	363710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_014833	AGTGT	2	10	367894	367903	20 %	40 %	40 %	0 %	317055072
266	NC_014833	GGTCA	2	10	367956	367965	20 %	20 %	40 %	20 %	317055072
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268	NC_014833	AAATC	2	10	375112	375121	60 %	20 %	0 %	20 %	317055078
269	NC_014833	GTTGT	2	10	379400	379409	0 %	60 %	40 %	0 %	317055078
270	NC_014833	CAACT	2	10	382836	382845	40 %	20 %	0 %	40 %	317055078
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381	NC_014833	CTTTT	2	10	541066	541075	0 %	80 %	0 %	20 %	317055203
382	NC_014833	TATAA	2	10	546201	546210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_014833	TCAGC	2	10	551516	551525	20 %	20 %	20 %	40 %	317055207
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396	NC_014833	CGGCA	2	10	574765	574774	20 %	0 %	40 %	40 %	317055225
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399	NC_014833	CCACA	2	10	577038	577047	40 %	0 %	0 %	60 %	317055225
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