MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 chromosome

Total Repeats: 43325

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014833	ATG	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
2	NC_014833	TGA	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
3	NC_014833	AAT	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054732
4	NC_014833	CTG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054732
5	NC_014833	CAG	2	6	193	198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054732
6	NC_014833	GAA	2	6	238	243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054732
7	NC_014833	GAT	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
8	NC_014833	AGG	2	6	296	301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054732
9	NC_014833	AAG	2	6	304	309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054732
10	NC_014833	ATG	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
11	NC_014833	ATC	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054732
12	NC_014833	CTT	2	6	670	675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054732
13	NC_014833	GAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
14	NC_014833	ATC	2	6	694	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054732
15	NC_014833	TTC	2	6	727	732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054732
16	NC_014833	CAA	2	6	827	832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054732
17	NC_014833	TAA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054732
18	NC_014833	CTG	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054732
19	NC_014833	GTA	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
20	NC_014833	GAT	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054732
21	NC_014833	CCA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317054732
22	NC_014833	ATA	2	6	1383	1388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054732
23	NC_014833	ATA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054733
24	NC_014833	ATG	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054733
25	NC_014833	AAG	2	6	2048	2053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054733
26	NC_014833	CGA	2	6	2054	2059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054733
27	NC_014833	GAT	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054733
28	NC_014833	AAG	2	6	2106	2111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054733
29	NC_014833	TGA	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054733
30	NC_014833	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054733
31	NC_014833	ACT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054733
32	NC_014833	CGG	2	6	2549	2554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054733
33	NC_014833	TGC	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054733
34	NC_014833	TCA	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054733
35	NC_014833	TAC	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054733
36	NC_014833	CCT	2	6	2837	2842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317054733
37	NC_014833	GGC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054733
38	NC_014833	CTG	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054733
39	NC_014833	TTC	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054733
40	NC_014833	TAA	2	6	2976	2981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054733
41	NC_014833	TAG	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054734
42	NC_014833	GAA	2	6	3114	3119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054734
43	NC_014833	TCT	2	6	3303	3308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054735
44	NC_014833	GCG	2	6	3363	3368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054735
45	NC_014833	GCA	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054735
46	NC_014833	CGA	3	9	3409	3417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054735
47	NC_014833	CGG	2	6	3556	3561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054735
48	NC_014833	AGA	2	6	3623	3628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054735
49	NC_014833	CTG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054735
50	NC_014833	AGA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054735
51	NC_014833	CTG	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054735
52	NC_014833	GGC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054735
53	NC_014833	ATT	3	9	3900	3908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317054735
54	NC_014833	ATA	2	6	3993	3998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054735
55	NC_014833	CGA	2	6	4000	4005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054735
56	NC_014833	TCC	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317054735
57	NC_014833	GAG	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054735
58	NC_014833	ATC	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054735
59	NC_014833	TCC	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317054735
60	NC_014833	CTG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054735
61	NC_014833	TGA	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054735
62	NC_014833	AAG	2	6	4397	4402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054736
63	NC_014833	TGT	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054736
64	NC_014833	AGA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054736
65	NC_014833	AGA	2	6	4584	4589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054736
66	NC_014833	TGA	2	6	4662	4667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054736
67	NC_014833	GTA	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054737
68	NC_014833	GAA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054737
69	NC_014833	GAT	2	6	4946	4951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054737
70	NC_014833	ATA	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054737
71	NC_014833	CTT	2	6	5067	5072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054737
72	NC_014833	TGA	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054738
73	NC_014833	CTG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054738
74	NC_014833	ATA	2	6	5403	5408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
75	NC_014833	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054739
76	NC_014833	ACG	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054739
77	NC_014833	CGA	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054739
78	NC_014833	ATA	2	6	5627	5632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
79	NC_014833	GTT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054739
80	NC_014833	CGG	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054739
81	NC_014833	GGA	2	6	5774	5779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
82	NC_014833	GTT	2	6	5819	5824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054739
83	NC_014833	ACT	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054739
84	NC_014833	CTG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054739
85	NC_014833	TTC	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054739
86	NC_014833	GAT	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054739
87	NC_014833	ATA	2	6	6263	6268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
88	NC_014833	AAT	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054739
89	NC_014833	CGG	2	6	6301	6306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054739
90	NC_014833	TCA	2	6	6375	6380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054739
91	NC_014833	GAC	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054739
92	NC_014833	TCG	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054739
93	NC_014833	GGA	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
94	NC_014833	AAG	2	6	6646	6651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054739
95	NC_014833	TGA	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054739
96	NC_014833	CTG	2	6	6995	7000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054739
97	NC_014833	TCT	2	6	7005	7010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054739
98	NC_014833	GAG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
99	NC_014833	GAA	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054739
100	NC_014833	CGG	2	6	7150	7155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054739
101	NC_014833	GAT	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054739
102	NC_014833	GGA	2	6	7267	7272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054739
103	NC_014833	GAA	2	6	7345	7350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054739
104	NC_014833	CGG	2	6	7429	7434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054740
105	NC_014833	GAA	2	6	7442	7447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054740
106	NC_014833	GAA	2	6	7586	7591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054740
107	NC_014833	GAA	2	6	7595	7600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054740
108	NC_014833	GTG	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317054740
109	NC_014833	TGA	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054740
110	NC_014833	CAC	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317054740
111	NC_014833	TGA	2	6	7797	7802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054740
112	NC_014833	ATG	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054740
113	NC_014833	ATC	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054740
114	NC_014833	AAG	2	6	8070	8075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054740
115	NC_014833	ATT	2	6	8313	8318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317054741
116	NC_014833	ATG	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054741
117	NC_014833	TGT	2	6	8491	8496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054741
118	NC_014833	ATG	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054741
119	NC_014833	GCA	2	6	8553	8558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054741
120	NC_014833	ATA	2	6	8692	8697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054741
121	NC_014833	AGA	2	6	8944	8949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054742
122	NC_014833	CTG	2	6	9158	9163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054742
123	NC_014833	AAG	2	6	9223	9228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054742
124	NC_014833	CTA	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054742
125	NC_014833	CGG	2	6	9465	9470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054742
126	NC_014833	GAG	2	6	9553	9558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054742
127	NC_014833	GTT	2	6	9580	9585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054742
128	NC_014833	TTG	2	6	9620	9625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317054742
129	NC_014833	GGT	2	6	9744	9749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317054742
130	NC_014833	CTG	2	6	9802	9807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054742
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132	NC_014833	GAA	2	6	9993	9998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054742
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253	NC_014833	GAG	2	6	20766	20771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054748
254	NC_014833	ATG	2	6	21074	21079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054749
255	NC_014833	GAT	2	6	21140	21145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054749
256	NC_014833	AAG	2	6	21194	21199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317054749
257	NC_014833	TGA	2	6	21271	21276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054749
258	NC_014833	CTT	2	6	21278	21283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054749
259	NC_014833	AAC	2	6	21317	21322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054749
260	NC_014833	GAT	2	6	21355	21360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054749
261	NC_014833	TGA	2	6	21514	21519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054749
262	NC_014833	ATA	2	6	21900	21905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317054749
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268	NC_014833	TGA	2	6	22451	22456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054750
269	NC_014833	GCG	2	6	22675	22680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054750
270	NC_014833	CTG	2	6	22825	22830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054750
271	NC_014833	ATG	2	6	22856	22861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054750
272	NC_014833	GCT	2	6	22926	22931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054750
273	NC_014833	CTG	2	6	22943	22948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054750
274	NC_014833	TTC	3	9	23059	23067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054750
275	NC_014833	TGG	2	6	23068	23073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317054750
276	NC_014833	TGA	2	6	23084	23089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054750
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278	NC_014833	GCT	2	6	23554	23559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054751
279	NC_014833	ATG	2	6	23601	23606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054751
280	NC_014833	CTG	2	6	23624	23629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054751
281	NC_014833	ACA	2	6	23712	23717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054751
282	NC_014833	AGC	3	9	24095	24103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054752
283	NC_014833	CAA	2	6	24137	24142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054752
284	NC_014833	CAG	2	6	24178	24183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054752
285	NC_014833	TGC	2	6	24194	24199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054752
286	NC_014833	TGA	2	6	24200	24205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054752
287	NC_014833	TGC	2	6	24403	24408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054752
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291	NC_014833	CGG	2	6	24797	24802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054752
292	NC_014833	TGA	2	6	24823	24828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054752
293	NC_014833	TGC	2	6	24839	24844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054752
294	NC_014833	ACA	2	6	24856	24861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317054752
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328	NC_014833	CGG	2	6	28021	28026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317054754
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331	NC_014833	TAC	2	6	28175	28180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317054754
332	NC_014833	CTG	2	6	28258	28263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317054754
333	NC_014833	GGA	2	6	28328	28333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317054754
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335	NC_014833	GAT	2	6	28445	28450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054754
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345	NC_014833	TTC	2	6	28937	28942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317054754
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361	NC_014833	ACC	2	6	30292	30297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317054755
362	NC_014833	CAG	2	6	30328	30333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054755
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377	NC_014833	GTA	2	6	31305	31310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317054756
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499	NC_014833	ACG	2	6	41231	41236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054762
500	NC_014833	CAG	2	6	41254	41259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317054762

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