MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Intrasporangium calvum DSM 43043 chromosome

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014830	CCCGGG	2	12	99832	99843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014830	CCTGAC	2	12	132514	132525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014830	CCCACC	2	12	140288	140299	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
4	NC_014830	CGCCAC	3	18	185696	185713	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014830	CGCCGA	2	12	204227	204238	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014830	CGAACA	2	12	204641	204652	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014830	GATCCG	2	12	212174	212185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014830	ACCATG	2	12	231047	231058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014830	GTCGCG	2	12	302109	302120	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014830	GTTGCA	2	12	330694	330705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014830	TCGACG	2	12	330760	330771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014830	CGGGAG	2	12	334711	334722	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014830	CGTCCA	2	12	350752	350763	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014830	GTTGAT	2	12	351006	351017	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014830	GCTTCG	2	12	356008	356019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014830	GCACCG	2	12	356149	356160	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014830	GATCCA	2	12	356324	356335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014830	CGAGGC	2	12	370495	370506	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014830	CACCGC	2	12	433145	433156	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014830	CACCGC	2	12	433268	433279	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014830	CGCGAG	2	12	465866	465877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014830	GCCGTA	2	12	550323	550334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014830	GTCGCT	2	12	550650	550661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014830	CCCGCC	2	12	581929	581940	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_014830	CCGGTG	2	12	605784	605795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014830	CCTCGC	2	12	623064	623075	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014830	GACGGC	2	12	730904	730915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014830	TCGGCG	2	12	744660	744671	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014830	ACCCGA	2	12	825834	825845	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014830	CGATGA	2	12	830438	830449	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014830	CGGGGG	2	12	830815	830826	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014830	TGACGG	2	12	830941	830952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014830	GGAGGT	2	12	849795	849806	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014830	GACGAG	2	12	856161	856172	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014830	GGTTGC	2	12	861152	861163	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014830	TGGTCG	2	12	866063	866074	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014830	GTGACC	2	12	935076	935087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014830	GTCGCG	2	12	942567	942578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014830	GCCGGT	2	12	942749	942760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014830	CACCCC	2	12	952197	952208	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_014830	CGACCA	2	12	952835	952846	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014830	CGACAG	2	12	1011431	1011442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014830	GGACGA	2	12	1014600	1014611	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014830	GGACGG	2	12	1019729	1019740	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014830	CTGCCC	2	12	1071777	1071788	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014830	GCGCCC	2	12	1108483	1108494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014830	TCGCCG	2	12	1151520	1151531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014830	CGGACC	2	12	1154163	1154174	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014830	TCACCC	2	12	1155764	1155775	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014830	GACGCG	2	12	1166341	1166352	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014830	AAGGGG	2	12	1201168	1201179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014830	GCACGG	2	12	1219063	1219074	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014830	CGAGCG	2	12	1225809	1225820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014830	GCCGCT	2	12	1259794	1259805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014830	AGGCCA	2	12	1269538	1269549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014830	TGCGCG	2	12	1286551	1286562	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014830	CTCGTG	2	12	1350069	1350080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014830	TGCGCC	2	12	1365906	1365917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014830	ACCCGA	2	12	1375250	1375261	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014830	TTTACG	2	12	1381065	1381076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014830	GCGCTC	2	12	1583575	1583586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014830	CGTGGG	2	12	1583672	1583683	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014830	TCGTGG	2	12	1583843	1583854	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014830	CGTCCT	3	18	1583961	1583978	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014830	GCTACC	2	12	1599275	1599286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014830	CGGGGA	2	12	1599291	1599302	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014830	GCCGGC	2	12	1611266	1611277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014830	CCAGCC	2	12	1614140	1614151	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014830	CCGGTG	2	12	1646107	1646118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014830	GTCAAG	2	12	1700527	1700538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014830	GGCTCG	2	12	1700591	1700602	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014830	CGGCAG	2	12	1716261	1716272	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014830	CTCCAC	2	12	1717963	1717974	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014830	CTCGTC	2	12	1737006	1737017	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014830	CACGTG	2	12	1808630	1808641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014830	GGGACC	2	12	1927111	1927122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014830	CCGGGC	2	12	1965515	1965526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014830	GTCGGC	2	12	2048123	2048134	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014830	ACAGGG	2	12	2066001	2066012	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014830	ACGGCG	2	12	2088880	2088891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014830	GTCGCT	2	12	2093444	2093455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014830	GCCCCG	2	12	2132453	2132464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014830	CGGCTC	2	12	2166675	2166686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014830	CCCGCG	2	12	2189125	2189136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014830	GCGCGA	2	12	2275056	2275067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014830	ACGTGC	2	12	2391514	2391525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014830	GGGGAA	2	12	2400555	2400566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014830	ACGGCG	2	12	2434971	2434982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014830	CGCGGG	2	12	2453557	2453568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014830	GCCCAC	2	12	2478295	2478306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014830	TCCTCG	3	18	2533614	2533631	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014830	CCCGCG	2	12	2579294	2579305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014830	GAGCAC	2	12	2591377	2591388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014830	CCCCCG	2	12	2613678	2613689	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_014830	CGTGTA	2	12	2613955	2613966	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014830	TCGGTG	2	12	2614268	2614279	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014830	CGGCGA	2	12	2614314	2614325	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014830	CCGGTC	2	12	2614610	2614621	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014830	GCCACC	2	12	2649997	2650008	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014830	GTCGGG	2	12	2659546	2659557	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014830	GAGCGA	2	12	2663407	2663418	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014830	AGACGG	2	12	2782056	2782067	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014830	CCGGGC	2	12	2787632	2787643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014830	GAGATC	2	12	2845819	2845830	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014830	GGCTCG	2	12	2889875	2889886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014830	TCCCCG	2	12	2896960	2896971	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014830	ACCTGC	5	30	2904307	2904336	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014830	AGGGCC	2	12	3024146	3024157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014830	ACGTCC	2	12	3053642	3053653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014830	GGGTCG	2	12	3053663	3053674	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014830	TTCGTC	2	12	3086140	3086151	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014830	AGCGGG	2	12	3113934	3113945	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014830	CGGGCC	2	12	3145659	3145670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014830	GGTCGA	2	12	3192814	3192825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014830	CGGCCG	2	12	3207805	3207816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014830	GGTCAA	2	12	3208024	3208035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014830	GATCCA	2	12	3219413	3219424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014830	TGCCCT	2	12	3221603	3221614	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014830	CGCCGT	2	12	3250853	3250864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014830	AAGGAA	2	12	3283628	3283639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014830	GAGCCA	2	12	3293443	3293454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014830	GTCCCC	2	12	3294433	3294444	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014830	CGCAGC	2	12	3299047	3299058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014830	GCCCAG	2	12	3319753	3319764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014830	CCAGCC	2	12	3324478	3324489	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014830	AAGACG	2	12	3337975	3337986	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014830	GACGAG	2	12	3344203	3344214	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014830	GGTGTT	2	12	3380699	3380710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014830	CGTCCG	2	12	3394721	3394732	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014830	GTACGA	2	12	3443901	3443912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014830	GCGCCT	2	12	3463625	3463636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014830	GTCGAC	2	12	3484243	3484254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014830	GTGCCG	2	12	3484324	3484335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014830	GCTGCG	2	12	3484406	3484417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014830	AAGGTG	2	12	3488756	3488767	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014830	GGGTGG	3	18	3494336	3494353	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_014830	ACGGGA	2	12	3687068	3687079	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_014830	CGGCGA	2	12	3710880	3710891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014830	CCGGCT	2	12	3711747	3711758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014830	GGGCCG	2	12	3728988	3728999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014830	CGGCCG	2	12	3763448	3763459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014830	CCGACC	2	12	3776699	3776710	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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146	NC_014830	GACGCG	3	18	3838060	3838077	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_014830	CGTCCT	2	12	3848744	3848755	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014830	GACGAG	2	12	3870230	3870241	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014830	GGCCCC	2	12	3880794	3880805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_014830	GGGCCC	2	12	3886148	3886159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014830	GGGCGA	2	12	3886753	3886764	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_014830	CGCGGC	2	12	3927437	3927448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014830	CTTGAC	2	12	3965517	3965528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014830	TCGACC	2	12	4013240	4013251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014830	CGTCAG	2	12	4019827	4019838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.