MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cellulosilyticus DSM 2522 chromosome

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014829	TATTAC	2	12	1607	1618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014829	TAATCA	2	12	18956	18967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014829	CAAAAA	2	12	19189	19200	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014829	TTTTTC	2	12	33646	33657	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014829	GCCATT	2	12	60987	60998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014829	TAATTT	2	12	61261	61272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014829	TTAAAG	2	12	79391	79402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014829	TTGATT	2	12	98968	98979	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014829	CAAAAC	2	12	113330	113341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014829	AGTCAA	2	12	114983	114994	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014829	TCTTTT	2	12	149419	149430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014829	TAGTTG	2	12	149873	149884	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014829	TTATTT	2	12	171680	171691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014829	GGAGAA	2	12	176853	176864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014829	GGTATA	2	12	176877	176888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014829	TCTTTT	2	12	193614	193625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014829	TCTTTT	2	12	198218	198229	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014829	TTCTTT	2	12	203330	203341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014829	TAATAC	2	12	214592	214603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014829	CTATTT	2	12	217303	217314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014829	CTATTT	2	12	232513	232524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014829	TCTTTT	2	12	248317	248328	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014829	TAGTGA	2	12	261787	261798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014829	AATGGC	2	12	263829	263840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014829	TAGTGG	2	12	269963	269974	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014829	AATACT	2	12	279548	279559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014829	CTATTT	2	12	285804	285815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014829	TATCTT	2	12	384546	384557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014829	TAGTAA	2	12	394696	394707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014829	CTTTCC	2	12	396425	396436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014829	TATTAA	2	12	396450	396461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014829	AAAAGT	2	12	417973	417984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014829	ATTTGT	2	12	418193	418204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014829	ATCATT	2	12	423204	423215	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014829	TCAACT	2	12	428319	428330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014829	AATATA	2	12	429398	429409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014829	AAAGAT	2	12	465483	465494	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014829	CGTGAT	2	12	482114	482125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014829	AAAGTA	2	12	490403	490414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014829	AATTTT	2	12	496083	496094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014829	TGATAA	2	12	514265	514276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014829	CAATGG	2	12	571148	571159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014829	TTTTAT	2	12	586799	586810	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014829	ATTTTT	2	12	587214	587225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014829	TATTGC	2	12	601977	601988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014829	AAAATA	2	12	603447	603458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014829	AACAAA	2	12	605910	605921	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014829	AAAGAA	2	12	667125	667136	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014829	ATGTGA	2	12	674373	674384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014829	ATGTGA	2	12	679292	679303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014829	TCTTCC	2	12	687913	687924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014829	ATTAGT	2	12	723590	723601	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014829	CCCACA	2	12	729404	729415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014829	AGATTT	2	12	752609	752620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014829	AATTAT	2	12	768621	768632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014829	TCAAAG	2	12	797855	797866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014829	TTTTAC	2	12	812252	812263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014829	AAATAG	2	12	813598	813609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014829	AAATAC	2	12	827125	827136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014829	AGAAAG	2	12	872250	872261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014829	AATGGC	2	12	874466	874477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014829	ATATAA	2	12	898984	898995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014829	GAATAT	2	12	943344	943355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014829	ATTCTT	2	12	946863	946874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014829	GAAAAA	2	12	997076	997087	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014829	ATCAAA	2	12	1007445	1007456	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014829	ATATAA	2	12	1021419	1021430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014829	GAAATA	2	12	1031311	1031322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014829	ATCTTG	2	12	1037229	1037240	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014829	ATTGAT	2	12	1050472	1050483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014829	CTCTTT	2	12	1054395	1054406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014829	TTTTTA	2	12	1060244	1060255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014829	AGTGTT	2	12	1079329	1079340	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014829	GATTGT	2	12	1080189	1080200	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014829	CTTTTT	2	12	1104661	1104672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014829	AGCTAT	2	12	1113521	1113532	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014829	TACATA	2	12	1119087	1119098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014829	TACAAT	2	12	1129903	1129914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014829	AATAAA	2	12	1142307	1142318	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014829	TAAAGA	2	12	1142411	1142422	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014829	TGCTTC	2	12	1181368	1181379	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014829	GAGGAC	2	12	1187173	1187184	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014829	TAAAAA	2	12	1189649	1189660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014829	AATATA	2	12	1243586	1243597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014829	TGAATA	2	12	1271429	1271440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014829	TAAGAA	2	12	1312987	1312998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014829	AACTAC	2	12	1356816	1356827	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014829	GAATTC	2	12	1375395	1375406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014829	AATAAA	2	12	1432641	1432652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014829	TATATC	2	12	1448550	1448561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014829	TCATTC	2	12	1481333	1481344	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014829	AAGGAA	2	12	1501471	1501482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014829	TTGGCT	2	12	1501522	1501533	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014829	AAATTG	2	12	1503933	1503944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014829	AAGCAA	2	12	1529199	1529210	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014829	AGATTA	2	12	1567343	1567354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014829	ATTAAT	2	12	1573037	1573048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014829	ATAGTG	2	12	1573063	1573074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014829	TCGAAC	2	12	1573381	1573392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014829	GCAATT	2	12	1591707	1591718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014829	TTTTAT	2	12	1602222	1602233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014829	AATGGC	2	12	1603121	1603132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014829	CCGACA	2	12	1603140	1603151	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014829	AAAGAG	2	12	1611268	1611279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014829	ATATCA	2	12	1666247	1666258	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014829	CGTTTA	2	12	1710854	1710865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014829	AGATAA	2	12	1713578	1713589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014829	AAATGT	2	12	1742600	1742611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014829	TGTAAT	2	12	1742620	1742631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014829	ATTTTT	2	12	1745003	1745014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014829	TAAAAA	2	12	1773022	1773033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014829	AAAGTC	2	12	1783342	1783353	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014829	GACTTT	2	12	1783363	1783374	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014829	TCTTAT	2	12	1790646	1790657	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014829	GAAGGA	2	12	1820052	1820063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014829	TATTTA	2	12	1822922	1822933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014829	GAGGGG	2	12	1862080	1862091	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014829	AAATGT	2	12	1870699	1870710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014829	AAATAG	2	12	1895077	1895088	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014829	CGATTG	2	12	1897586	1897597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014829	TATAAA	2	12	1908358	1908369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014829	TGAAGT	2	12	1960004	1960015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014829	CATATA	2	12	1990520	1990531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014829	CAGATT	2	12	2005507	2005518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014829	GATGGC	2	12	2032099	2032110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014829	AAAAGA	2	12	2054629	2054640	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014829	ATTAAA	2	12	2073024	2073035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014829	AACATG	2	12	2075079	2075090	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014829	TTTTCA	2	12	2075104	2075115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014829	CAAAAA	2	12	2080796	2080807	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014829	ATTTTT	2	12	2112876	2112887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014829	ATAAGT	2	12	4218571	4218582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_014829	CAATGT	2	12	4264928	4264939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_014829	ACCTAT	2	12	4317929	4317940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_014829	CAATAA	2	12	4328208	4328219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_014829	AAATCT	2	12	4354110	4354121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.