MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ethanoligenens harbinense YUAN-3 chromosome

Total Repeats: 2055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014828	CGGAG	2	10	309	318	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014828	ACTCC	2	10	435	444	20 %	20 %	0 %	60 %	317131009
3	NC_014828	CTATT	2	10	1948	1957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014828	ACCCG	2	10	3354	3363	20 %	0 %	20 %	60 %	317131012
5	NC_014828	TGCTC	2	10	3777	3786	0 %	40 %	20 %	40 %	317131012
6	NC_014828	AAGGC	2	10	6269	6278	40 %	0 %	40 %	20 %	317131014
7	NC_014828	GCCGC	2	10	6748	6757	0 %	0 %	40 %	60 %	317131014
8	NC_014828	AAGGC	2	10	8270	8279	40 %	0 %	40 %	20 %	317131015
9	NC_014828	GCCGC	2	10	9098	9107	0 %	0 %	40 %	60 %	317131015
10	NC_014828	AAAAT	2	10	10230	10239	80 %	20 %	0 %	0 %	317131018
11	NC_014828	CCGCT	2	10	10646	10655	0 %	20 %	20 %	60 %	317131018
12	NC_014828	AAACG	2	10	10712	10721	60 %	0 %	20 %	20 %	317131018
13	NC_014828	TGCTC	2	10	11614	11623	0 %	40 %	20 %	40 %	317131019
14	NC_014828	CACGG	2	10	13487	13496	20 %	0 %	40 %	40 %	317131021
15	NC_014828	AAACG	2	10	13873	13882	60 %	0 %	20 %	20 %	317131021
16	NC_014828	GCGCC	2	10	16354	16363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014828	AAAAG	2	10	16380	16389	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014828	GGACG	2	10	16425	16434	20 %	0 %	60 %	20 %	317131024
19	NC_014828	CTCGC	2	10	17020	17029	0 %	20 %	20 %	60 %	317131024
20	NC_014828	AGGAA	2	10	17462	17471	60 %	0 %	40 %	0 %	317131024
21	NC_014828	GGGCA	2	10	19166	19175	20 %	0 %	60 %	20 %	317131025
22	NC_014828	CCCCG	2	10	19511	19520	0 %	0 %	20 %	80 %	317131025
23	NC_014828	TGCGA	2	10	20845	20854	20 %	20 %	40 %	20 %	317131026
24	NC_014828	GTCCG	2	10	22162	22171	0 %	20 %	40 %	40 %	317131027
25	NC_014828	GCGCT	2	10	22187	22196	0 %	20 %	40 %	40 %	317131027
26	NC_014828	GGTCA	2	10	23351	23360	20 %	20 %	40 %	20 %	317131028
27	NC_014828	AGGCC	2	10	23880	23889	20 %	0 %	40 %	40 %	317131029
28	NC_014828	GCGCC	2	10	24234	24243	0 %	0 %	40 %	60 %	317131030
29	NC_014828	CGGCG	2	10	24808	24817	0 %	0 %	60 %	40 %	317131030
30	NC_014828	CGGCC	2	10	25840	25849	0 %	0 %	40 %	60 %	317131031
31	NC_014828	TAAAA	2	10	26643	26652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014828	GGGTA	2	10	29445	29454	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014828	TGCCG	2	10	29648	29657	0 %	20 %	40 %	40 %	317131035
34	NC_014828	CAATC	2	10	31082	31091	40 %	20 %	0 %	40 %	317131036
35	NC_014828	GCGCG	2	10	32463	32472	0 %	0 %	60 %	40 %	317131038
36	NC_014828	CTATG	2	10	33199	33208	20 %	40 %	20 %	20 %	317131039
37	NC_014828	AAACA	2	10	34396	34405	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014828	GTGCG	2	10	34808	34817	0 %	20 %	60 %	20 %	317131040
39	NC_014828	ATCAA	2	10	35774	35783	60 %	20 %	0 %	20 %	317131041
40	NC_014828	TCCCT	2	10	37233	37242	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014828	CCTGT	2	10	38728	38737	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014828	GCGCC	2	10	40082	40091	0 %	0 %	40 %	60 %	317131045
43	NC_014828	GGGCA	2	10	41008	41017	20 %	0 %	60 %	20 %	317131046
44	NC_014828	GAGCG	2	10	41084	41093	20 %	0 %	60 %	20 %	317131046
45	NC_014828	TACAA	2	10	42047	42056	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014828	GGACG	2	10	42476	42485	20 %	0 %	60 %	20 %	317131047
47	NC_014828	CCCCG	2	10	46842	46851	0 %	0 %	20 %	80 %	317131049
48	NC_014828	GATCA	2	10	49094	49103	40 %	20 %	20 %	20 %	317131051
49	NC_014828	GTTGA	2	10	50578	50587	20 %	40 %	40 %	0 %	317131052
50	NC_014828	GGCGT	2	10	55864	55873	0 %	20 %	60 %	20 %	317131057
51	NC_014828	GCGCG	2	10	56154	56163	0 %	0 %	60 %	40 %	317131057
52	NC_014828	GATGC	2	10	56956	56965	20 %	20 %	40 %	20 %	317131058
53	NC_014828	TGCTC	2	10	57338	57347	0 %	40 %	20 %	40 %	317131058
54	NC_014828	GTTCG	2	10	62017	62026	0 %	40 %	40 %	20 %	317131061
55	NC_014828	CCGTG	2	10	62494	62503	0 %	20 %	40 %	40 %	317131061
56	NC_014828	CCGGC	2	10	65166	65175	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_014828	GCCAT	2	10	66338	66347	20 %	20 %	20 %	40 %	317131064
58	NC_014828	TTCTG	2	10	71582	71591	0 %	60 %	20 %	20 %	317131069
59	NC_014828	ATGGA	2	10	72086	72095	40 %	20 %	40 %	0 %	317131070
60	NC_014828	CCGGC	2	10	72862	72871	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_014828	GCGCT	2	10	73269	73278	0 %	20 %	40 %	40 %	317131071
62	NC_014828	GCTGC	2	10	73468	73477	0 %	20 %	40 %	40 %	317131071
63	NC_014828	TGGGG	2	10	76306	76315	0 %	20 %	80 %	0 %	317131071
64	NC_014828	TCTAT	2	10	76766	76775	20 %	60 %	0 %	20 %	317131072
65	NC_014828	TGCGG	2	10	78306	78315	0 %	20 %	60 %	20 %	317131072
66	NC_014828	TGCGG	2	10	81820	81829	0 %	20 %	60 %	20 %	317131075
67	NC_014828	TGAGA	2	10	83370	83379	40 %	20 %	40 %	0 %	317131077
68	NC_014828	ACGGC	2	10	85155	85164	20 %	0 %	40 %	40 %	317131081
69	NC_014828	AAAAG	2	10	86575	86584	80 %	0 %	20 %	0 %	317131082
70	NC_014828	AGCCA	2	10	87585	87594	40 %	0 %	20 %	40 %	317131083
71	NC_014828	GGCTT	2	10	89161	89170	0 %	40 %	40 %	20 %	317131086
72	NC_014828	CGTGG	2	10	90428	90437	0 %	20 %	60 %	20 %	317131089
73	NC_014828	AGAAA	2	10	93148	93157	80 %	0 %	20 %	0 %	317131094
74	NC_014828	CGGCG	2	10	96828	96837	0 %	0 %	60 %	40 %	317131098
75	NC_014828	CAGCA	2	10	97017	97026	40 %	0 %	20 %	40 %	317131098
76	NC_014828	GGCTG	2	10	100267	100276	0 %	20 %	60 %	20 %	317131101
77	NC_014828	ACGGC	2	10	100459	100468	20 %	0 %	40 %	40 %	317131101
78	NC_014828	CAAAA	2	10	101416	101425	80 %	0 %	0 %	20 %	317131104
79	NC_014828	GCCCA	2	10	102274	102283	20 %	0 %	20 %	60 %	317131106
80	NC_014828	CATGT	2	10	103928	103937	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014828	CGCAT	2	10	106787	106796	20 %	20 %	20 %	40 %	317131110
82	NC_014828	CGCTT	2	10	107990	107999	0 %	40 %	20 %	40 %	317131112
83	NC_014828	CGGCG	2	10	109613	109622	0 %	0 %	60 %	40 %	317131113
84	NC_014828	GCCGT	2	10	110715	110724	0 %	20 %	40 %	40 %	317131114
85	NC_014828	ACCGC	2	10	111193	111202	20 %	0 %	20 %	60 %	317131115
86	NC_014828	GGCAT	2	10	111216	111225	20 %	20 %	40 %	20 %	317131115
87	NC_014828	GCCAT	2	10	112382	112391	20 %	20 %	20 %	40 %	317131117
88	NC_014828	ATGCA	2	10	113047	113056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014828	AAAAG	2	10	114541	114550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014828	AAAGC	2	10	116301	116310	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014828	TTGCC	2	10	119773	119782	0 %	40 %	20 %	40 %	317131123
92	NC_014828	AAAAG	2	10	120281	120290	80 %	0 %	20 %	0 %	317131123
93	NC_014828	CTTGA	2	10	120585	120594	20 %	40 %	20 %	20 %	317131123
94	NC_014828	AACGA	2	10	123931	123940	60 %	0 %	20 %	20 %	317131125
95	NC_014828	TTCGT	2	10	125857	125866	0 %	60 %	20 %	20 %	317131126
96	NC_014828	AAACA	2	10	126065	126074	80 %	0 %	0 %	20 %	317131126
97	NC_014828	GGCAG	2	10	130471	130480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014828	GCCTT	2	10	137388	137397	0 %	40 %	20 %	40 %	317131134
99	NC_014828	TGGTG	2	10	138049	138058	0 %	40 %	60 %	0 %	317131134
100	NC_014828	TGCAC	2	10	140295	140304	20 %	20 %	20 %	40 %	317131136
101	NC_014828	TGAAC	2	10	141991	142000	40 %	20 %	20 %	20 %	317131138
102	NC_014828	CGCTG	2	10	142630	142639	0 %	20 %	40 %	40 %	317131138
103	NC_014828	GTATA	2	10	143983	143992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014828	GCGAC	2	10	148316	148325	20 %	0 %	40 %	40 %	317131144
105	NC_014828	AGCAG	2	10	153219	153228	40 %	0 %	40 %	20 %	317131148
106	NC_014828	GAATG	2	10	154528	154537	40 %	20 %	40 %	0 %	317131150
107	NC_014828	TCCGC	2	10	154936	154945	0 %	20 %	20 %	60 %	317131150
108	NC_014828	TATTG	2	10	155272	155281	20 %	60 %	20 %	0 %	317131150
109	NC_014828	TGCAC	2	10	156828	156837	20 %	20 %	20 %	40 %	317131152
110	NC_014828	GTGGC	2	10	157379	157388	0 %	20 %	60 %	20 %	317131152
111	NC_014828	CGGTG	2	10	157476	157485	0 %	20 %	60 %	20 %	317131152
112	NC_014828	CCGCG	2	10	162753	162762	0 %	0 %	40 %	60 %	317131157
113	NC_014828	GCGAT	2	10	163352	163361	20 %	20 %	40 %	20 %	317131157
114	NC_014828	AATCA	2	10	164383	164392	60 %	20 %	0 %	20 %	317131157
115	NC_014828	CTGCG	2	10	165080	165089	0 %	20 %	40 %	40 %	317131158
116	NC_014828	GGCCG	2	10	165324	165333	0 %	0 %	60 %	40 %	317131158
117	NC_014828	CGATC	2	10	170018	170027	20 %	20 %	20 %	40 %	317131163
118	NC_014828	GCGCC	2	10	171422	171431	0 %	0 %	40 %	60 %	317131164
119	NC_014828	CCGCC	2	10	172377	172386	0 %	0 %	20 %	80 %	317131166
120	NC_014828	CTGCG	2	10	172938	172947	0 %	20 %	40 %	40 %	317131167
121	NC_014828	GCGCG	3	15	173250	173264	0 %	0 %	60 %	40 %	317131167
122	NC_014828	GTTCT	2	10	173935	173944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014828	TGCCT	2	10	174290	174299	0 %	40 %	20 %	40 %	317131168
124	NC_014828	TCTGA	2	10	176591	176600	20 %	40 %	20 %	20 %	317131170
125	NC_014828	ATGGA	2	10	176606	176615	40 %	20 %	40 %	0 %	317131171
126	NC_014828	CCGCT	2	10	177177	177186	0 %	20 %	20 %	60 %	317131172
127	NC_014828	ACCAC	2	10	177399	177408	40 %	0 %	0 %	60 %	317131172
128	NC_014828	TTGCA	2	10	178556	178565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014828	CAGCC	2	10	179739	179748	20 %	0 %	20 %	60 %	317131175
130	NC_014828	GCGCC	2	10	181936	181945	0 %	0 %	40 %	60 %	317131177
131	NC_014828	GGGGC	2	10	182511	182520	0 %	0 %	80 %	20 %	317131177
132	NC_014828	GCCCG	2	10	185898	185907	0 %	0 %	40 %	60 %	317131179
133	NC_014828	CTTGC	2	10	186139	186148	0 %	40 %	20 %	40 %	317131179
134	NC_014828	TTGCC	2	10	186152	186161	0 %	40 %	20 %	40 %	317131179
135	NC_014828	GCGCC	2	10	188963	188972	0 %	0 %	40 %	60 %	317131184
136	NC_014828	GTTTC	2	10	189665	189674	0 %	60 %	20 %	20 %	317131184
137	NC_014828	CGCGC	2	10	192265	192274	0 %	0 %	40 %	60 %	317131186
138	NC_014828	TCGAT	2	10	193977	193986	20 %	40 %	20 %	20 %	317131188
139	NC_014828	GCCCG	2	10	194340	194349	0 %	0 %	40 %	60 %	317131188
140	NC_014828	ATTTC	2	10	195211	195220	20 %	60 %	0 %	20 %	317131189
141	NC_014828	GCCGT	2	10	196062	196071	0 %	20 %	40 %	40 %	317131189
142	NC_014828	CGCCA	2	10	196102	196111	20 %	0 %	20 %	60 %	317131189
143	NC_014828	GGGAA	2	10	197341	197350	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014828	GCACC	2	10	199366	199375	20 %	0 %	20 %	60 %	317131192
145	NC_014828	TGGGC	2	10	201508	201517	0 %	20 %	60 %	20 %	317131194
146	NC_014828	GTGCG	2	10	201579	201588	0 %	20 %	60 %	20 %	317131194
147	NC_014828	GAAAA	2	10	201989	201998	80 %	0 %	20 %	0 %	317131194
148	NC_014828	CGACA	2	10	202307	202316	40 %	0 %	20 %	40 %	317131195
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150	NC_014828	TACCG	2	10	204705	204714	20 %	20 %	20 %	40 %	317131197
151	NC_014828	TTTCA	2	10	205434	205443	20 %	60 %	0 %	20 %	317131198
152	NC_014828	GCCTG	2	10	206782	206791	0 %	20 %	40 %	40 %	317131200
153	NC_014828	CGCGG	2	10	207850	207859	0 %	0 %	60 %	40 %	317131201
154	NC_014828	GAAAA	2	10	208489	208498	80 %	0 %	20 %	0 %	317131201
155	NC_014828	CGCGC	2	10	210620	210629	0 %	0 %	40 %	60 %	317131203
156	NC_014828	AAAGC	2	10	211057	211066	60 %	0 %	20 %	20 %	317131203
157	NC_014828	AAACC	2	10	211217	211226	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
158	NC_014828	CTGGA	2	10	212210	212219	20 %	20 %	40 %	20 %	317131205
159	NC_014828	GCGCC	3	15	212762	212776	0 %	0 %	40 %	60 %	317131206
160	NC_014828	GCGCG	2	10	213786	213795	0 %	0 %	60 %	40 %	317131206
161	NC_014828	CCCGT	2	10	213894	213903	0 %	20 %	20 %	60 %	317131206
162	NC_014828	GGCAA	2	10	218799	218808	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_014828	CGGCG	2	10	220276	220285	0 %	0 %	60 %	40 %	317131212
164	NC_014828	TCATC	2	10	220705	220714	20 %	40 %	0 %	40 %	317131212
165	NC_014828	ACCTC	2	10	225344	225353	20 %	20 %	0 %	60 %	317131215
166	NC_014828	GCCCA	2	10	229691	229700	20 %	0 %	20 %	60 %	317131222
167	NC_014828	ACGCT	2	10	238060	238069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
168	NC_014828	CGTTG	2	10	238480	238489	0 %	40 %	40 %	20 %	317131232
169	NC_014828	TGGGC	2	10	240063	240072	0 %	20 %	60 %	20 %	317131233
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171	NC_014828	TGCCC	2	10	242516	242525	0 %	20 %	20 %	60 %	317131235
172	NC_014828	GCGCG	2	10	242851	242860	0 %	0 %	60 %	40 %	317131236
173	NC_014828	GGCAG	2	10	244176	244185	20 %	0 %	60 %	20 %	317131237
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176	NC_014828	AAAAC	2	10	248325	248334	80 %	0 %	0 %	20 %	317131242
177	NC_014828	AAGAA	2	10	252628	252637	80 %	0 %	20 %	0 %	317131244
178	NC_014828	AATGG	2	10	253253	253262	40 %	20 %	40 %	0 %	317131244
179	NC_014828	GAGAT	2	10	253734	253743	40 %	20 %	40 %	0 %	317131245
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182	NC_014828	CGATT	2	10	258720	258729	20 %	40 %	20 %	20 %	317131249
183	NC_014828	AGAAA	2	10	258735	258744	80 %	0 %	20 %	0 %	317131249
184	NC_014828	AAGTC	2	10	259638	259647	40 %	20 %	20 %	20 %	317131250
185	NC_014828	TGCGG	2	10	263722	263731	0 %	20 %	60 %	20 %	317131254
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187	NC_014828	GCCGG	2	10	264458	264467	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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203	NC_014828	CGCGG	2	10	292059	292068	0 %	0 %	60 %	40 %	317131271
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213	NC_014828	TGCGC	2	10	310766	310775	0 %	20 %	40 %	40 %	317131285
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224	NC_014828	CTCAT	2	10	332835	332844	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
225	NC_014828	TCCGG	2	10	333092	333101	0 %	20 %	40 %	40 %	317131305
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239	NC_014828	GGAAA	2	10	354425	354434	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
240	NC_014828	ATCAT	2	10	354814	354823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
241	NC_014828	CGGCG	2	10	359345	359354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
242	NC_014828	CTGGC	2	10	361062	361071	0 %	20 %	40 %	40 %	317131333
243	NC_014828	CGCGG	2	10	361664	361673	0 %	0 %	60 %	40 %	317131333
244	NC_014828	GCCGC	2	10	362716	362725	0 %	0 %	40 %	60 %	317131334
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249	NC_014828	GGCGT	2	10	370755	370764	0 %	20 %	60 %	20 %	317131340
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252	NC_014828	GCGGA	2	10	371721	371730	20 %	0 %	60 %	20 %	317131340
253	NC_014828	CGATG	2	10	372778	372787	20 %	20 %	40 %	20 %	317131341
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255	NC_014828	CCGCA	2	10	376594	376603	20 %	0 %	20 %	60 %	317131344
256	NC_014828	CCGTG	2	10	380746	380755	0 %	20 %	40 %	40 %	317131348
257	NC_014828	GCAGG	2	10	381290	381299	20 %	0 %	60 %	20 %	317131349
258	NC_014828	CGGGC	2	10	383588	383597	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
259	NC_014828	GTCCT	2	10	384093	384102	0 %	40 %	20 %	40 %	317131354
260	NC_014828	CTGGC	2	10	386338	386347	0 %	20 %	40 %	40 %	317131357
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262	NC_014828	CGACG	2	10	390097	390106	20 %	0 %	40 %	40 %	317131360
263	NC_014828	CGGAG	2	10	391699	391708	20 %	0 %	60 %	20 %	317131361
264	NC_014828	GGATG	2	10	392109	392118	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_014828	TGCGG	2	10	395567	395576	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
266	NC_014828	AACGC	2	10	397746	397755	40 %	0 %	20 %	40 %	317131367
267	NC_014828	CCCGG	2	10	401350	401359	0 %	0 %	40 %	60 %	317131372
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269	NC_014828	TCCGT	2	10	403954	403963	0 %	40 %	20 %	40 %	317131379
270	NC_014828	GTTGT	2	10	405033	405042	0 %	60 %	40 %	0 %	317131382
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369	NC_014828	GTTTT	2	10	553257	553266	0 %	80 %	20 %	0 %	317131527
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375	NC_014828	ATTGC	2	10	558122	558131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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382	NC_014828	GCATA	2	10	565599	565608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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384	NC_014828	GACCA	2	10	567112	567121	40 %	0 %	20 %	40 %	317131542
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386	NC_014828	ACCGT	2	10	568679	568688	20 %	20 %	20 %	40 %	317131542
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391	NC_014828	GCGCA	2	10	572529	572538	20 %	0 %	40 %	40 %	317131542
392	NC_014828	ATGTC	2	10	573210	573219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
393	NC_014828	TCTGT	2	10	576618	576627	0 %	60 %	20 %	20 %	317131545
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396	NC_014828	GCAGA	2	10	579567	579576	40 %	0 %	40 %	20 %	317131546
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398	NC_014828	AGCTC	2	10	582895	582904	20 %	20 %	20 %	40 %	317131546
399	NC_014828	ATTCG	2	10	583211	583220	20 %	40 %	20 %	20 %	317131546
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444	NC_014828	TGAAC	2	10	635244	635253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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