MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ethanoligenens harbinense YUAN-3 chromosome

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014828	CGGAG	2	10	309	318	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014828	CTATT	2	10	1948	1957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014828	GCGCC	2	10	16354	16363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014828	AAAAG	2	10	16380	16389	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014828	TAAAA	2	10	26643	26652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014828	GGGTA	2	10	29445	29454	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014828	AAACA	2	10	34396	34405	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014828	TCCCT	2	10	37233	37242	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014828	CCTGT	2	10	38728	38737	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014828	TACAA	2	10	42047	42056	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014828	CCGGC	2	10	65166	65175	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_014828	CCGGC	2	10	72862	72871	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_014828	CATGT	2	10	103928	103937	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014828	ATGCA	2	10	113047	113056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014828	AAAAG	2	10	114541	114550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014828	AAAGC	2	10	116301	116310	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014828	GGCAG	2	10	130471	130480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014828	GTATA	2	10	143983	143992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014828	GTTCT	2	10	173935	173944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014828	TTGCA	2	10	178556	178565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014828	GGGAA	2	10	197341	197350	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014828	AAACC	2	10	211217	211226	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014828	GGCAA	2	10	218799	218808	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014828	ACGCT	2	10	238060	238069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014828	TGCTT	2	10	247301	247310	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014828	GCCGG	2	10	264458	264467	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014828	TCCGG	2	10	291475	291484	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014828	GTTGC	2	10	304880	304889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014828	TATGA	2	10	305177	305186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014828	TCACA	2	10	326125	326134	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014828	GCGCC	2	10	329551	329560	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014828	CTCAT	2	10	332835	332844	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014828	CGGCG	2	10	338350	338359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014828	GGAAA	2	10	354425	354434	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014828	ATCAT	2	10	354814	354823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014828	CGGCG	2	10	359345	359354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014828	CAGAC	2	10	374552	374561	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014828	CGGGC	2	10	383588	383597	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014828	GGATG	2	10	392109	392118	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014828	TGCGG	2	10	395567	395576	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014828	TTCGG	2	10	420163	420172	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014828	GGGGA	2	10	423021	423030	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014828	CGGTT	2	10	442118	442127	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014828	CGCAG	2	10	442131	442140	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014828	GGGGA	2	10	448731	448740	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014828	TTCCT	2	10	450262	450271	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014828	GGCGG	2	10	452145	452154	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014828	TCGTG	2	10	452633	452642	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014828	CTGAA	2	10	454269	454278	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014828	GGGAG	2	10	454605	454614	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014828	AAGAG	2	10	457813	457822	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014828	CGTTT	2	10	460264	460273	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014828	TTATT	2	10	468060	468069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014828	TTTCC	2	10	487205	487214	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014828	GCACA	2	10	549848	549857	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014828	TGGCA	2	10	550004	550013	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014828	TCCGC	2	10	550292	550301	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_014828	AAGCA	2	10	556893	556902	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014828	TTATA	2	10	558107	558116	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014828	ATTGC	2	10	558122	558131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014828	TAGCG	2	10	559196	559205	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014828	TAAAA	2	10	559206	559215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014828	GCATA	2	10	565599	565608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014828	TTGGT	2	10	566702	566711	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014828	ATGTC	2	10	573210	573219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014828	ATATA	2	10	579001	579010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014828	GAAAA	2	10	597192	597201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014828	ATAGC	2	10	602612	602621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014828	CATGA	2	10	609740	609749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014828	AAGAT	2	10	614653	614662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014828	ATTGC	2	10	627733	627742	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014828	TCATA	2	10	627814	627823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014828	CTGCG	2	10	628755	628764	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014828	CGGAA	2	10	628961	628970	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014828	GACGC	2	10	629090	629099	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014828	TACAA	2	10	635117	635126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014828	TGAAC	2	10	635244	635253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014828	CCGTG	2	10	643718	643727	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014828	TCTCG	2	10	646770	646779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014828	TAATT	2	10	647465	647474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014828	TATAC	2	10	659548	659557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014828	TTACA	2	10	660551	660560	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014828	ACCCT	2	10	660856	660865	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_014828	TAATA	2	10	660883	660892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014828	CCCTG	2	10	664909	664918	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_014828	CAAAA	2	10	665252	665261	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014828	CACAC	2	10	678010	678019	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_014828	TTTTG	2	10	678529	678538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014828	GCGAC	2	10	682962	682971	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014828	TTTCA	2	10	683874	683883	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014828	CGACA	2	10	684714	684723	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014828	CCGTT	2	10	685387	685396	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014828	ATATA	2	10	685473	685482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014828	CTTGC	2	10	703377	703386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014828	CCGCC	2	10	713641	713650	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
96	NC_014828	TTCTG	2	10	738204	738213	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014828	GTTTT	2	10	772033	772042	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014828	CCGGC	2	10	773746	773755	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_014828	CTGCC	2	10	782879	782888	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_014828	CAAAA	2	10	798839	798848	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014828	GTTCC	2	10	804329	804338	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014828	CAAAG	2	10	832215	832224	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014828	TAATA	2	10	832619	832628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014828	GATTT	2	10	832686	832695	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014828	AAAAC	2	10	843319	843328	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014828	ATCAA	2	10	859908	859917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014828	ATGAA	2	10	864488	864497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014828	TGCAT	2	10	896234	896243	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014828	TTTTG	2	10	901345	901354	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014828	GCTTT	2	10	902125	902134	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014828	TGCTA	2	10	905379	905388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014828	GTGCA	2	10	912956	912965	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014828	TTCGG	2	10	912989	912998	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014828	TTTGT	2	10	916572	916581	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014828	AATGT	2	10	923555	923564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014828	TCGCC	2	10	923920	923929	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_014828	GTTGT	2	10	924160	924169	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014828	CATAT	2	10	934598	934607	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014828	GCGGG	2	10	935868	935877	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014828	GTTCC	2	10	937000	937009	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014828	AGAAT	2	10	937185	937194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014828	GCACA	2	10	962110	962119	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014828	TGGCA	2	10	962266	962275	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014828	TCCGC	2	10	962554	962563	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_014828	AAGAT	2	10	975162	975171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014828	TCTGG	2	10	975977	975986	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014828	CAAGG	2	10	976005	976014	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014828	AAATT	2	10	979464	979473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014828	TGCGG	2	10	1000497	1000506	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014828	TTTGC	2	10	1003935	1003944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014828	GCAAA	2	10	1004110	1004119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014828	GATAA	2	10	1010589	1010598	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014828	TCAGA	2	10	1011349	1011358	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014828	TCCGA	2	10	1012239	1012248	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014828	GTTTG	2	10	1017543	1017552	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014828	TACAA	2	10	1017691	1017700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014828	AGCAA	2	10	1019184	1019193	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014828	ACAAA	2	10	1019378	1019387	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014828	TTTGT	2	10	1026521	1026530	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014828	CATAG	2	10	1029886	1029895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014828	TTGAG	2	10	1035097	1035106	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014828	CTTTG	2	10	1037382	1037391	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014828	TGTCA	2	10	1037794	1037803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014828	ATTTT	2	10	1038610	1038619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014828	TGGGT	2	10	1049263	1049272	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014828	AGCGG	2	10	1058220	1058229	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014828	TGCCA	2	10	1058509	1058518	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014828	TGTGC	2	10	1058665	1058674	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_014828	CATAT	2	10	1070658	1070667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_014828	GATGG	2	10	1076854	1076863	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014828	TATAA	2	10	1286772	1286781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_014828	CGGTC	2	10	1314256	1314265	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_014828	AGGGT	2	10	1396587	1396596	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014828	ACCCG	2	10	1402635	1402644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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281	NC_014828	ATAAG	2	10	2007090	2007099	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014828	TTTTC	2	10	2070444	2070453	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_014828	ATAAA	2	10	2077849	2077858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014828	CGCGC	2	10	2097438	2097447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
285	NC_014828	CGCCC	2	10	2110871	2110880	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
286	NC_014828	CCGCT	2	10	2118206	2118215	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
287	NC_014828	GCCGA	2	10	2133535	2133544	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
288	NC_014828	TTGTA	2	10	2133857	2133866	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014828	CTTCT	2	10	2137610	2137619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
290	NC_014828	CCTGA	2	10	2137630	2137639	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
291	NC_014828	TGTCA	2	10	2137955	2137964	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_014828	TTTAT	2	10	2156666	2156675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_014828	ATTTT	2	10	2175652	2175661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_014828	TCAAA	2	10	2177614	2177623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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301	NC_014828	TCCCG	2	10	2195367	2195376	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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389	NC_014828	ACTAT	2	10	2811389	2811398	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_014828	GCACA	2	10	2954597	2954606	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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406	NC_014828	GGACC	2	10	2973784	2973793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
407	NC_014828	CTATC	2	10	2973839	2973848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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410	NC_014828	TTCAG	2	10	2983251	2983260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
411	NC_014828	CACGA	2	10	2984889	2984898	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
412	NC_014828	AAGAA	2	10	3001351	3001360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
413	NC_014828	CCCGC	2	10	3005521	3005530	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.