MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ethanoligenens harbinense YUAN-3 chromosome

Total Repeats: 1642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014828	ACTCC	2	10	435	444	20 %	20 %	0 %	60 %	317131009
2	NC_014828	ACCCG	2	10	3354	3363	20 %	0 %	20 %	60 %	317131012
3	NC_014828	TGCTC	2	10	3777	3786	0 %	40 %	20 %	40 %	317131012
4	NC_014828	AAGGC	2	10	6269	6278	40 %	0 %	40 %	20 %	317131014
5	NC_014828	GCCGC	2	10	6748	6757	0 %	0 %	40 %	60 %	317131014
6	NC_014828	AAGGC	2	10	8270	8279	40 %	0 %	40 %	20 %	317131015
7	NC_014828	GCCGC	2	10	9098	9107	0 %	0 %	40 %	60 %	317131015
8	NC_014828	AAAAT	2	10	10230	10239	80 %	20 %	0 %	0 %	317131018
9	NC_014828	CCGCT	2	10	10646	10655	0 %	20 %	20 %	60 %	317131018
10	NC_014828	AAACG	2	10	10712	10721	60 %	0 %	20 %	20 %	317131018
11	NC_014828	TGCTC	2	10	11614	11623	0 %	40 %	20 %	40 %	317131019
12	NC_014828	CACGG	2	10	13487	13496	20 %	0 %	40 %	40 %	317131021
13	NC_014828	AAACG	2	10	13873	13882	60 %	0 %	20 %	20 %	317131021
14	NC_014828	GGACG	2	10	16425	16434	20 %	0 %	60 %	20 %	317131024
15	NC_014828	CTCGC	2	10	17020	17029	0 %	20 %	20 %	60 %	317131024
16	NC_014828	AGGAA	2	10	17462	17471	60 %	0 %	40 %	0 %	317131024
17	NC_014828	GGGCA	2	10	19166	19175	20 %	0 %	60 %	20 %	317131025
18	NC_014828	CCCCG	2	10	19511	19520	0 %	0 %	20 %	80 %	317131025
19	NC_014828	TGCGA	2	10	20845	20854	20 %	20 %	40 %	20 %	317131026
20	NC_014828	GTCCG	2	10	22162	22171	0 %	20 %	40 %	40 %	317131027
21	NC_014828	GCGCT	2	10	22187	22196	0 %	20 %	40 %	40 %	317131027
22	NC_014828	GGTCA	2	10	23351	23360	20 %	20 %	40 %	20 %	317131028
23	NC_014828	AGGCC	2	10	23880	23889	20 %	0 %	40 %	40 %	317131029
24	NC_014828	GCGCC	2	10	24234	24243	0 %	0 %	40 %	60 %	317131030
25	NC_014828	CGGCG	2	10	24808	24817	0 %	0 %	60 %	40 %	317131030
26	NC_014828	CGGCC	2	10	25840	25849	0 %	0 %	40 %	60 %	317131031
27	NC_014828	TGCCG	2	10	29648	29657	0 %	20 %	40 %	40 %	317131035
28	NC_014828	CAATC	2	10	31082	31091	40 %	20 %	0 %	40 %	317131036
29	NC_014828	GCGCG	2	10	32463	32472	0 %	0 %	60 %	40 %	317131038
30	NC_014828	CTATG	2	10	33199	33208	20 %	40 %	20 %	20 %	317131039
31	NC_014828	GTGCG	2	10	34808	34817	0 %	20 %	60 %	20 %	317131040
32	NC_014828	ATCAA	2	10	35774	35783	60 %	20 %	0 %	20 %	317131041
33	NC_014828	GCGCC	2	10	40082	40091	0 %	0 %	40 %	60 %	317131045
34	NC_014828	GGGCA	2	10	41008	41017	20 %	0 %	60 %	20 %	317131046
35	NC_014828	GAGCG	2	10	41084	41093	20 %	0 %	60 %	20 %	317131046
36	NC_014828	GGACG	2	10	42476	42485	20 %	0 %	60 %	20 %	317131047
37	NC_014828	CCCCG	2	10	46842	46851	0 %	0 %	20 %	80 %	317131049
38	NC_014828	GATCA	2	10	49094	49103	40 %	20 %	20 %	20 %	317131051
39	NC_014828	GTTGA	2	10	50578	50587	20 %	40 %	40 %	0 %	317131052
40	NC_014828	GGCGT	2	10	55864	55873	0 %	20 %	60 %	20 %	317131057
41	NC_014828	GCGCG	2	10	56154	56163	0 %	0 %	60 %	40 %	317131057
42	NC_014828	GATGC	2	10	56956	56965	20 %	20 %	40 %	20 %	317131058
43	NC_014828	TGCTC	2	10	57338	57347	0 %	40 %	20 %	40 %	317131058
44	NC_014828	GTTCG	2	10	62017	62026	0 %	40 %	40 %	20 %	317131061
45	NC_014828	CCGTG	2	10	62494	62503	0 %	20 %	40 %	40 %	317131061
46	NC_014828	GCCAT	2	10	66338	66347	20 %	20 %	20 %	40 %	317131064
47	NC_014828	TTCTG	2	10	71582	71591	0 %	60 %	20 %	20 %	317131069
48	NC_014828	ATGGA	2	10	72086	72095	40 %	20 %	40 %	0 %	317131070
49	NC_014828	GCGCT	2	10	73269	73278	0 %	20 %	40 %	40 %	317131071
50	NC_014828	GCTGC	2	10	73468	73477	0 %	20 %	40 %	40 %	317131071
51	NC_014828	TGGGG	2	10	76306	76315	0 %	20 %	80 %	0 %	317131071
52	NC_014828	TCTAT	2	10	76766	76775	20 %	60 %	0 %	20 %	317131072
53	NC_014828	TGCGG	2	10	78306	78315	0 %	20 %	60 %	20 %	317131072
54	NC_014828	TGCGG	2	10	81820	81829	0 %	20 %	60 %	20 %	317131075
55	NC_014828	TGAGA	2	10	83370	83379	40 %	20 %	40 %	0 %	317131077
56	NC_014828	ACGGC	2	10	85155	85164	20 %	0 %	40 %	40 %	317131081
57	NC_014828	AAAAG	2	10	86575	86584	80 %	0 %	20 %	0 %	317131082
58	NC_014828	AGCCA	2	10	87585	87594	40 %	0 %	20 %	40 %	317131083
59	NC_014828	GGCTT	2	10	89161	89170	0 %	40 %	40 %	20 %	317131086
60	NC_014828	CGTGG	2	10	90428	90437	0 %	20 %	60 %	20 %	317131089
61	NC_014828	AGAAA	2	10	93148	93157	80 %	0 %	20 %	0 %	317131094
62	NC_014828	CGGCG	2	10	96828	96837	0 %	0 %	60 %	40 %	317131098
63	NC_014828	CAGCA	2	10	97017	97026	40 %	0 %	20 %	40 %	317131098
64	NC_014828	GGCTG	2	10	100267	100276	0 %	20 %	60 %	20 %	317131101
65	NC_014828	ACGGC	2	10	100459	100468	20 %	0 %	40 %	40 %	317131101
66	NC_014828	CAAAA	2	10	101416	101425	80 %	0 %	0 %	20 %	317131104
67	NC_014828	GCCCA	2	10	102274	102283	20 %	0 %	20 %	60 %	317131106
68	NC_014828	CGCAT	2	10	106787	106796	20 %	20 %	20 %	40 %	317131110
69	NC_014828	CGCTT	2	10	107990	107999	0 %	40 %	20 %	40 %	317131112
70	NC_014828	CGGCG	2	10	109613	109622	0 %	0 %	60 %	40 %	317131113
71	NC_014828	GCCGT	2	10	110715	110724	0 %	20 %	40 %	40 %	317131114
72	NC_014828	ACCGC	2	10	111193	111202	20 %	0 %	20 %	60 %	317131115
73	NC_014828	GGCAT	2	10	111216	111225	20 %	20 %	40 %	20 %	317131115
74	NC_014828	GCCAT	2	10	112382	112391	20 %	20 %	20 %	40 %	317131117
75	NC_014828	TTGCC	2	10	119773	119782	0 %	40 %	20 %	40 %	317131123
76	NC_014828	AAAAG	2	10	120281	120290	80 %	0 %	20 %	0 %	317131123
77	NC_014828	CTTGA	2	10	120585	120594	20 %	40 %	20 %	20 %	317131123
78	NC_014828	AACGA	2	10	123931	123940	60 %	0 %	20 %	20 %	317131125
79	NC_014828	TTCGT	2	10	125857	125866	0 %	60 %	20 %	20 %	317131126
80	NC_014828	AAACA	2	10	126065	126074	80 %	0 %	0 %	20 %	317131126
81	NC_014828	GCCTT	2	10	137388	137397	0 %	40 %	20 %	40 %	317131134
82	NC_014828	TGGTG	2	10	138049	138058	0 %	40 %	60 %	0 %	317131134
83	NC_014828	TGCAC	2	10	140295	140304	20 %	20 %	20 %	40 %	317131136
84	NC_014828	TGAAC	2	10	141991	142000	40 %	20 %	20 %	20 %	317131138
85	NC_014828	CGCTG	2	10	142630	142639	0 %	20 %	40 %	40 %	317131138
86	NC_014828	GCGAC	2	10	148316	148325	20 %	0 %	40 %	40 %	317131144
87	NC_014828	AGCAG	2	10	153219	153228	40 %	0 %	40 %	20 %	317131148
88	NC_014828	GAATG	2	10	154528	154537	40 %	20 %	40 %	0 %	317131150
89	NC_014828	TCCGC	2	10	154936	154945	0 %	20 %	20 %	60 %	317131150
90	NC_014828	TATTG	2	10	155272	155281	20 %	60 %	20 %	0 %	317131150
91	NC_014828	TGCAC	2	10	156828	156837	20 %	20 %	20 %	40 %	317131152
92	NC_014828	GTGGC	2	10	157379	157388	0 %	20 %	60 %	20 %	317131152
93	NC_014828	CGGTG	2	10	157476	157485	0 %	20 %	60 %	20 %	317131152
94	NC_014828	CCGCG	2	10	162753	162762	0 %	0 %	40 %	60 %	317131157
95	NC_014828	GCGAT	2	10	163352	163361	20 %	20 %	40 %	20 %	317131157
96	NC_014828	AATCA	2	10	164383	164392	60 %	20 %	0 %	20 %	317131157
97	NC_014828	CTGCG	2	10	165080	165089	0 %	20 %	40 %	40 %	317131158
98	NC_014828	GGCCG	2	10	165324	165333	0 %	0 %	60 %	40 %	317131158
99	NC_014828	CGATC	2	10	170018	170027	20 %	20 %	20 %	40 %	317131163
100	NC_014828	GCGCC	2	10	171422	171431	0 %	0 %	40 %	60 %	317131164
101	NC_014828	CCGCC	2	10	172377	172386	0 %	0 %	20 %	80 %	317131166
102	NC_014828	CTGCG	2	10	172938	172947	0 %	20 %	40 %	40 %	317131167
103	NC_014828	GCGCG	3	15	173250	173264	0 %	0 %	60 %	40 %	317131167
104	NC_014828	TGCCT	2	10	174290	174299	0 %	40 %	20 %	40 %	317131168
105	NC_014828	TCTGA	2	10	176591	176600	20 %	40 %	20 %	20 %	317131170
106	NC_014828	ATGGA	2	10	176606	176615	40 %	20 %	40 %	0 %	317131171
107	NC_014828	CCGCT	2	10	177177	177186	0 %	20 %	20 %	60 %	317131172
108	NC_014828	ACCAC	2	10	177399	177408	40 %	0 %	0 %	60 %	317131172
109	NC_014828	CAGCC	2	10	179739	179748	20 %	0 %	20 %	60 %	317131175
110	NC_014828	GCGCC	2	10	181936	181945	0 %	0 %	40 %	60 %	317131177
111	NC_014828	GGGGC	2	10	182511	182520	0 %	0 %	80 %	20 %	317131177
112	NC_014828	GCCCG	2	10	185898	185907	0 %	0 %	40 %	60 %	317131179
113	NC_014828	CTTGC	2	10	186139	186148	0 %	40 %	20 %	40 %	317131179
114	NC_014828	TTGCC	2	10	186152	186161	0 %	40 %	20 %	40 %	317131179
115	NC_014828	GCGCC	2	10	188963	188972	0 %	0 %	40 %	60 %	317131184
116	NC_014828	GTTTC	2	10	189665	189674	0 %	60 %	20 %	20 %	317131184
117	NC_014828	CGCGC	2	10	192265	192274	0 %	0 %	40 %	60 %	317131186
118	NC_014828	TCGAT	2	10	193977	193986	20 %	40 %	20 %	20 %	317131188
119	NC_014828	GCCCG	2	10	194340	194349	0 %	0 %	40 %	60 %	317131188
120	NC_014828	ATTTC	2	10	195211	195220	20 %	60 %	0 %	20 %	317131189
121	NC_014828	GCCGT	2	10	196062	196071	0 %	20 %	40 %	40 %	317131189
122	NC_014828	CGCCA	2	10	196102	196111	20 %	0 %	20 %	60 %	317131189
123	NC_014828	GCACC	2	10	199366	199375	20 %	0 %	20 %	60 %	317131192
124	NC_014828	TGGGC	2	10	201508	201517	0 %	20 %	60 %	20 %	317131194
125	NC_014828	GTGCG	2	10	201579	201588	0 %	20 %	60 %	20 %	317131194
126	NC_014828	GAAAA	2	10	201989	201998	80 %	0 %	20 %	0 %	317131194
127	NC_014828	CGACA	2	10	202307	202316	40 %	0 %	20 %	40 %	317131195
128	NC_014828	CGGGC	2	10	203451	203460	0 %	0 %	60 %	40 %	317131196
129	NC_014828	TACCG	2	10	204705	204714	20 %	20 %	20 %	40 %	317131197
130	NC_014828	TTTCA	2	10	205434	205443	20 %	60 %	0 %	20 %	317131198
131	NC_014828	GCCTG	2	10	206782	206791	0 %	20 %	40 %	40 %	317131200
132	NC_014828	CGCGG	2	10	207850	207859	0 %	0 %	60 %	40 %	317131201
133	NC_014828	GAAAA	2	10	208489	208498	80 %	0 %	20 %	0 %	317131201
134	NC_014828	CGCGC	2	10	210620	210629	0 %	0 %	40 %	60 %	317131203
135	NC_014828	AAAGC	2	10	211057	211066	60 %	0 %	20 %	20 %	317131203
136	NC_014828	CTGGA	2	10	212210	212219	20 %	20 %	40 %	20 %	317131205
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264	NC_014828	TGCGC	2	10	469898	469907	0 %	20 %	40 %	40 %	317131433
265	NC_014828	TCGGT	2	10	469991	470000	0 %	40 %	40 %	20 %	317131433
266	NC_014828	GACAT	2	10	472460	472469	40 %	20 %	20 %	20 %	317131435
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