MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL03

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014826	ACA	2	6	13	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014826	AGT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014826	TAG	3	9	75	83	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014826	AGT	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014826	TGC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
6	NC_014826	GAT	2	6	515	520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630410
7	NC_014826	GAC	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630410
8	NC_014826	AAG	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630410
9	NC_014826	GCT	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
10	NC_014826	AGA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630410
11	NC_014826	GCT	3	9	795	803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
12	NC_014826	TAC	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630410
13	NC_014826	TTA	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630411
14	NC_014826	GAT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630411
15	NC_014826	TGT	2	6	1205	1210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014826	TGC	2	6	1287	1292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630412
17	NC_014826	TGC	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630412
18	NC_014826	CAT	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630412
19	NC_014826	CGG	2	6	1349	1354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630412
20	NC_014826	ATA	2	6	1366	1371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630412
21	NC_014826	TAT	3	9	1374	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630412
22	NC_014826	TAC	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
23	NC_014826	ATC	2	6	1547	1552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
24	NC_014826	CTA	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
25	NC_014826	TAA	2	6	1680	1685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630413
26	NC_014826	TCA	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
27	NC_014826	AAT	2	6	2100	2105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014826	TAT	2	6	2327	2332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014826	TGA	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014826	TGC	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630414
31	NC_014826	TGT	2	6	2596	2601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630414
32	NC_014826	CTT	3	9	2659	2667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630414
33	NC_014826	GCG	2	6	2668	2673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630414
34	NC_014826	GTG	2	6	2720	2725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315630414
35	NC_014826	GTT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630414
36	NC_014826	TAT	2	6	2881	2886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630414
37	NC_014826	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630414
38	NC_014826	GAT	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630414
39	NC_014826	TTA	2	6	3216	3221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630414
40	NC_014826	TTC	2	6	3328	3333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630414
41	NC_014826	CCT	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014826	CAT	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014826	GTT	2	6	3608	3613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014826	TAT	2	6	3683	3688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014826	TAT	2	6	3708	3713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014826	TTA	2	6	3718	3723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014826	TTA	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014826	TGA	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630415
49	NC_014826	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630415
50	NC_014826	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
51	NC_014826	AAG	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
52	NC_014826	CAG	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630415
53	NC_014826	AAC	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630415
54	NC_014826	CGG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630415
55	NC_014826	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
56	NC_014826	TTC	2	6	4594	4599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630415
57	NC_014826	CAG	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630416
58	NC_014826	GAT	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630416
59	NC_014826	TCA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014826	ATA	2	6	5242	5247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014826	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014826	TTC	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014826	TGT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014826	CAC	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014826	ATA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014826	TAA	2	6	5665	5670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014826	CCA	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014826	CCT	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014826	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014826	TTA	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014826	GAC	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
72	NC_014826	CAG	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
73	NC_014826	ATT	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630417
74	NC_014826	TAC	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630417
75	NC_014826	ATA	2	6	6296	6301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630417
76	NC_014826	GAT	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630417
77	NC_014826	ATG	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630417
78	NC_014826	TTC	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630417
79	NC_014826	ATA	2	6	6675	6680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630417
80	NC_014826	CAG	2	6	6697	6702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
81	NC_014826	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315630417
82	NC_014826	ACC	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315630418
83	NC_014826	ATC	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630418
84	NC_014826	TAT	2	6	7019	7024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630418
85	NC_014826	CTG	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630418
86	NC_014826	GCC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315630418
87	NC_014826	TCA	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630418
88	NC_014826	ATC	2	6	7222	7227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630418
89	NC_014826	ATT	2	6	7322	7327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630418
90	NC_014826	ATG	2	6	7351	7356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630418
91	NC_014826	CTG	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630418
92	NC_014826	ACA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630418
93	NC_014826	AGC	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630418
94	NC_014826	TAA	2	6	7757	7762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630418
95	NC_014826	CAA	2	6	7911	7916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630418
96	NC_014826	ACG	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630418
97	NC_014826	GAT	2	6	8020	8025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630418
98	NC_014826	TAC	2	6	8120	8125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014826	CAT	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014826	TAG	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014826	TGG	2	6	8264	8269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014826	ATT	2	6	8275	8280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630419
103	NC_014826	AAT	2	6	8362	8367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630419
104	NC_014826	AGA	2	6	8437	8442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630419
105	NC_014826	TGA	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630419
106	NC_014826	AAG	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630419
107	NC_014826	TCA	2	6	8541	8546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630419
108	NC_014826	GCA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630419
109	NC_014826	AAT	2	6	8627	8632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630419
110	NC_014826	TTA	2	6	8653	8658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630419
111	NC_014826	TTC	2	6	8854	8859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630420
112	NC_014826	ATC	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630420
113	NC_014826	GAA	2	6	8996	9001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014826	CAT	2	6	9107	9112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014826	AGA	2	6	9114	9119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014826	ATA	2	6	9168	9173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014826	TAA	2	6	9305	9310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014826	TAC	2	6	9464	9469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014826	AGC	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014826	ATT	2	6	9658	9663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630421
121	NC_014826	AGA	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630421
122	NC_014826	AGC	2	6	9697	9702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
123	NC_014826	GGA	2	6	9710	9715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315630421
124	NC_014826	AGC	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
125	NC_014826	GCA	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
126	NC_014826	CAG	3	9	9813	9821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
127	NC_014826	GCA	2	6	9839	9844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
128	NC_014826	CAT	2	6	9852	9857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630421
129	NC_014826	ATT	2	6	9903	9908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630422
130	NC_014826	AGA	2	6	9921	9926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630422
131	NC_014826	AGC	2	6	9942	9947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
132	NC_014826	GGA	2	6	9955	9960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315630422
133	NC_014826	AGC	2	6	9978	9983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
134	NC_014826	GCA	2	6	9991	9996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
135	NC_014826	CAG	3	9	10058	10066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
136	NC_014826	GCA	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
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139	NC_014826	TAG	2	6	10295	10300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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217	NC_014826	CTT	2	6	15854	15859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.