MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL03

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014826	TGC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
2	NC_014826	GAT	2	6	515	520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630410
3	NC_014826	GAC	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630410
4	NC_014826	AAG	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630410
5	NC_014826	GCT	2	6	726	731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
6	NC_014826	AGA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630410
7	NC_014826	GCT	3	9	795	803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630410
8	NC_014826	TAC	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630410
9	NC_014826	TTA	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630411
10	NC_014826	GAT	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630411
11	NC_014826	TGC	2	6	1287	1292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630412
12	NC_014826	TGC	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630412
13	NC_014826	CAT	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630412
14	NC_014826	CGG	2	6	1349	1354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630412
15	NC_014826	ATA	2	6	1366	1371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630412
16	NC_014826	TAT	3	9	1374	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630412
17	NC_014826	TAC	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
18	NC_014826	ATC	2	6	1547	1552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
19	NC_014826	CTA	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
20	NC_014826	TAA	2	6	1680	1685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630413
21	NC_014826	TCA	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630413
22	NC_014826	TGC	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630414
23	NC_014826	TGT	2	6	2596	2601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630414
24	NC_014826	CTT	3	9	2659	2667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630414
25	NC_014826	GCG	2	6	2668	2673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630414
26	NC_014826	GTG	2	6	2720	2725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315630414
27	NC_014826	GTT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630414
28	NC_014826	TAT	2	6	2881	2886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630414
29	NC_014826	ATG	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630414
30	NC_014826	GAT	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630414
31	NC_014826	TTA	2	6	3216	3221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630414
32	NC_014826	TTC	2	6	3328	3333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630414
33	NC_014826	TGA	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630415
34	NC_014826	TGA	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630415
35	NC_014826	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
36	NC_014826	AAG	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
37	NC_014826	CAG	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630415
38	NC_014826	AAC	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630415
39	NC_014826	CGG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315630415
40	NC_014826	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630415
41	NC_014826	TTC	2	6	4594	4599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630415
42	NC_014826	CAG	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630416
43	NC_014826	GAT	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630416
44	NC_014826	GAC	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
45	NC_014826	CAG	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
46	NC_014826	ATT	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630417
47	NC_014826	TAC	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630417
48	NC_014826	ATA	2	6	6296	6301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630417
49	NC_014826	GAT	2	6	6377	6382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630417
50	NC_014826	ATG	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630417
51	NC_014826	TTC	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630417
52	NC_014826	ATA	2	6	6675	6680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630417
53	NC_014826	CAG	2	6	6697	6702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630417
54	NC_014826	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315630417
55	NC_014826	ACC	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315630418
56	NC_014826	ATC	2	6	6867	6872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630418
57	NC_014826	TAT	2	6	7019	7024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630418
58	NC_014826	CTG	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630418
59	NC_014826	GCC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315630418
60	NC_014826	TCA	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630418
61	NC_014826	ATC	2	6	7222	7227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630418
62	NC_014826	ATT	2	6	7322	7327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630418
63	NC_014826	ATG	2	6	7351	7356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630418
64	NC_014826	CTG	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630418
65	NC_014826	ACA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630418
66	NC_014826	AGC	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630418
67	NC_014826	TAA	2	6	7757	7762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630418
68	NC_014826	CAA	2	6	7911	7916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630418
69	NC_014826	ACG	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630418
70	NC_014826	GAT	2	6	8020	8025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630418
71	NC_014826	ATT	2	6	8275	8280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630419
72	NC_014826	AAT	2	6	8362	8367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630419
73	NC_014826	AGA	2	6	8437	8442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630419
74	NC_014826	TGA	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630419
75	NC_014826	AAG	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630419
76	NC_014826	TCA	2	6	8541	8546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630419
77	NC_014826	GCA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630419
78	NC_014826	AAT	2	6	8627	8632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630419
79	NC_014826	TTA	2	6	8653	8658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630419
80	NC_014826	TTC	2	6	8854	8859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630420
81	NC_014826	ATC	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630420
82	NC_014826	ATT	2	6	9658	9663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630421
83	NC_014826	AGA	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630421
84	NC_014826	AGC	2	6	9697	9702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
85	NC_014826	GGA	2	6	9710	9715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315630421
86	NC_014826	AGC	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
87	NC_014826	GCA	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
88	NC_014826	CAG	3	9	9813	9821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
89	NC_014826	GCA	2	6	9839	9844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630421
90	NC_014826	CAT	2	6	9852	9857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630421
91	NC_014826	ATT	2	6	9903	9908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630422
92	NC_014826	AGA	2	6	9921	9926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630422
93	NC_014826	AGC	2	6	9942	9947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
94	NC_014826	GGA	2	6	9955	9960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315630422
95	NC_014826	AGC	2	6	9978	9983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
96	NC_014826	GCA	2	6	9991	9996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
97	NC_014826	CAG	3	9	10058	10066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
98	NC_014826	GCA	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630422
99	NC_014826	CAT	2	6	10097	10102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630422
100	NC_014826	AAT	3	9	10401	10409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630423
101	NC_014826	TAA	2	6	10436	10441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630423
102	NC_014826	GAA	2	6	10572	10577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630423
103	NC_014826	TGG	2	6	10802	10807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315630423
104	NC_014826	CTG	2	6	10908	10913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630423
105	NC_014826	GGT	2	6	11013	11018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315630423
106	NC_014826	GAA	2	6	11121	11126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630423
107	NC_014826	ATT	2	6	11200	11205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630423
108	NC_014826	TGA	2	6	11216	11221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630423
109	NC_014826	TGG	2	6	11281	11286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315630423
110	NC_014826	TCT	2	6	11361	11366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630423
111	NC_014826	AAG	2	6	11399	11404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630423
112	NC_014826	ATT	2	6	11530	11535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630423
113	NC_014826	AAT	2	6	11676	11681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630423
114	NC_014826	AGA	2	6	11729	11734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630423
115	NC_014826	TAC	2	6	11759	11764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630423
116	NC_014826	TGA	2	6	11959	11964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630424
117	NC_014826	TAC	2	6	11986	11991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630424
118	NC_014826	GAA	2	6	12002	12007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630424
119	NC_014826	AAG	2	6	12015	12020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315630424
120	NC_014826	AGG	2	6	12037	12042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315630424
121	NC_014826	CCT	2	6	12056	12061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315630424
122	NC_014826	TCC	2	6	12118	12123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315630424
123	NC_014826	AAC	2	6	12167	12172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630424
124	NC_014826	TAA	2	6	12244	12249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630424
125	NC_014826	AGG	2	6	12328	12333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315630424
126	NC_014826	TAT	2	6	12372	12377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630424
127	NC_014826	TAT	2	6	12478	12483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630424
128	NC_014826	AAC	2	6	12510	12515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315630424
129	NC_014826	TGA	2	6	12526	12531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630424
130	NC_014826	TAA	2	6	12598	12603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630424
131	NC_014826	TGC	2	6	12622	12627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630424
132	NC_014826	GAT	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630424
133	NC_014826	TAT	2	6	12814	12819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630424
134	NC_014826	ATA	2	6	12891	12896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630424
135	NC_014826	TAA	2	6	12940	12945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630424
136	NC_014826	TGG	2	6	13038	13043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315630424
137	NC_014826	ATG	2	6	13153	13158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630425
138	NC_014826	ACT	2	6	13194	13199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630425
139	NC_014826	ATG	2	6	13312	13317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630425
140	NC_014826	CTT	2	6	13410	13415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630425
141	NC_014826	TGA	2	6	13532	13537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630425
142	NC_014826	TAA	2	6	13589	13594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630425
143	NC_014826	ATG	2	6	13639	13644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630425
144	NC_014826	GGA	2	6	13646	13651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315630425
145	NC_014826	CTT	2	6	13701	13706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630425
146	NC_014826	GAT	2	6	13722	13727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630425
147	NC_014826	TGT	2	6	13733	13738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630425
148	NC_014826	CTT	2	6	13785	13790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315630425
149	NC_014826	AGT	2	6	13926	13931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630425
150	NC_014826	ATC	2	6	14047	14052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630426
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152	NC_014826	TTG	2	6	14279	14284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315630426
153	NC_014826	ATT	2	6	14347	14352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630426
154	NC_014826	AGC	2	6	14394	14399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315630426
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159	NC_014826	TGC	2	6	14598	14603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315630426
160	NC_014826	ATA	2	6	14662	14667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630426
161	NC_014826	ATT	2	6	14708	14713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630427
162	NC_014826	TAG	2	6	14721	14726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315630427
163	NC_014826	AAT	2	6	14812	14817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315630427
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167	NC_014826	TTA	2	6	15246	15251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630427
168	NC_014826	CAT	2	6	15331	15336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315630427
169	NC_014826	ATT	2	6	15406	15411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315630427

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.