MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL02

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014825	GCTGG	2	10	934	943	0 %	20 %	60 %	20 %	319788692
2	NC_014825	CGCTG	2	10	1366	1375	0 %	20 %	40 %	40 %	319788692
3	NC_014825	AACAA	2	10	1797	1806	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014825	GTCAG	2	10	1906	1915	20 %	20 %	40 %	20 %	319788693
5	NC_014825	CAGTA	2	10	6338	6347	40 %	20 %	20 %	20 %	319788697
6	NC_014825	TGTTT	2	10	9504	9513	0 %	80 %	20 %	0 %	319788700
7	NC_014825	GTCGG	2	10	10162	10171	0 %	20 %	60 %	20 %	319788701
8	NC_014825	ACTAT	2	10	14724	14733	40 %	40 %	0 %	20 %	319788704
9	NC_014825	TTTTC	2	10	19801	19810	0 %	80 %	0 %	20 %	319788710
10	NC_014825	ACAGC	2	10	20760	20769	40 %	0 %	20 %	40 %	319788711
11	NC_014825	ACAAA	2	10	21722	21731	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014825	CAGCC	2	10	22037	22046	20 %	0 %	20 %	60 %	319788712
13	NC_014825	TATCA	2	10	22516	22525	40 %	40 %	0 %	20 %	319788712
14	NC_014825	GTTCA	2	10	23137	23146	20 %	40 %	20 %	20 %	319788712
15	NC_014825	TATTG	2	10	23938	23947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014825	TCATA	2	10	24326	24335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014825	TATAT	2	10	24344	24353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014825	TGATA	2	10	28020	28029	40 %	40 %	20 %	0 %	319788718
19	NC_014825	CGAGC	2	10	29369	29378	20 %	0 %	40 %	40 %	319788719
20	NC_014825	TAATT	2	10	32830	32839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014825	CTGAT	2	10	35990	35999	20 %	40 %	20 %	20 %	319788726
22	NC_014825	TGTTC	2	10	36041	36050	0 %	60 %	20 %	20 %	319788726
23	NC_014825	TTCAT	2	10	37612	37621	20 %	60 %	0 %	20 %	319788726
24	NC_014825	TTCTT	2	10	39662	39671	0 %	80 %	0 %	20 %	319788729
25	NC_014825	TGCCT	2	10	40348	40357	0 %	40 %	20 %	40 %	319788729
26	NC_014825	TCTGC	2	10	41234	41243	0 %	40 %	20 %	40 %	319788729
27	NC_014825	CCTGC	2	10	41632	41641	0 %	20 %	20 %	60 %	319788729
28	NC_014825	TATAT	2	10	42565	42574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014825	TACAA	2	10	42798	42807	60 %	20 %	0 %	20 %	319788731
30	NC_014825	TCATC	2	10	42919	42928	20 %	40 %	0 %	40 %	319788731
31	NC_014825	AGTTC	2	10	45306	45315	20 %	40 %	20 %	20 %	319788731
32	NC_014825	ATATC	2	10	46087	46096	40 %	40 %	0 %	20 %	319788731
33	NC_014825	GTCCT	2	10	47429	47438	0 %	40 %	20 %	40 %	319788732
34	NC_014825	TATAT	2	10	53483	53492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014825	CCATA	2	10	53837	53846	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014825	AATAG	2	10	54194	54203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014825	GAACT	2	10	54320	54329	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014825	ACAGG	2	10	54582	54591	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014825	CTGCC	2	10	57843	57852	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014825	TCCGC	2	10	58676	58685	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014825	ATACC	2	10	59778	59787	40 %	20 %	0 %	40 %	319788740
42	NC_014825	CAGCT	2	10	61137	61146	20 %	20 %	20 %	40 %	319788742
43	NC_014825	TATGA	2	10	62380	62389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014825	TATCA	2	10	65291	65300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014825	AATGA	2	10	65491	65500	60 %	20 %	20 %	0 %	319788746
46	NC_014825	CTGTG	2	10	67323	67332	0 %	40 %	40 %	20 %	319788746
47	NC_014825	ACCTA	2	10	69053	69062	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014825	ACATC	2	10	70772	70781	40 %	20 %	0 %	40 %	319788749
49	NC_014825	TGCCT	2	10	71152	71161	0 %	40 %	20 %	40 %	319788750
50	NC_014825	CAGCT	2	10	71437	71446	20 %	20 %	20 %	40 %	319788750
51	NC_014825	TACAT	2	10	71471	71480	40 %	40 %	0 %	20 %	319788750
52	NC_014825	AGCTT	2	10	71570	71579	20 %	40 %	20 %	20 %	319788750
53	NC_014825	CAGCC	2	10	72709	72718	20 %	0 %	20 %	60 %	319788751
54	NC_014825	TACTT	2	10	75258	75267	20 %	60 %	0 %	20 %	319788755
55	NC_014825	TATCT	2	10	78057	78066	20 %	60 %	0 %	20 %	319788759
56	NC_014825	TACCG	2	10	81191	81200	20 %	20 %	20 %	40 %	319788762
57	NC_014825	CAAGT	2	10	82625	82634	40 %	20 %	20 %	20 %	319788763
58	NC_014825	TTACC	2	10	82747	82756	20 %	40 %	0 %	40 %	319788763
59	NC_014825	TTATT	2	10	84955	84964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014825	TAAAC	2	10	85513	85522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014825	ATATC	2	10	85777	85786	40 %	40 %	0 %	20 %	319788764
62	NC_014825	CTTTT	2	10	86057	86066	0 %	80 %	0 %	20 %	319788765
63	NC_014825	GCTGT	2	10	86277	86286	0 %	40 %	40 %	20 %	319788765
64	NC_014825	TATCA	2	10	88033	88042	40 %	40 %	0 %	20 %	319788766
65	NC_014825	AAAAG	2	10	92694	92703	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014825	CTTTT	2	10	92720	92729	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014825	TATAA	2	10	94657	94666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014825	CTGCA	2	10	95427	95436	20 %	20 %	20 %	40 %	319788774
69	NC_014825	TCCTG	2	10	97930	97939	0 %	40 %	20 %	40 %	319788776
70	NC_014825	CTATC	2	10	99044	99053	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014825	TCTTT	2	10	101067	101076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014825	TAAGA	2	10	101084	101093	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014825	AAGCA	2	10	101112	101121	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014825	CTCAC	2	10	101964	101973	20 %	20 %	0 %	60 %	319788779
75	NC_014825	CGTCT	2	10	103387	103396	0 %	40 %	20 %	40 %	319788781
76	NC_014825	TGTTT	2	10	105537	105546	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014825	AAGAC	2	10	109544	109553	60 %	0 %	20 %	20 %	319788787
78	NC_014825	AAAGC	2	10	111787	111796	60 %	0 %	20 %	20 %	319788790
79	NC_014825	GGAAA	2	10	114210	114219	60 %	0 %	40 %	0 %	319788793
80	NC_014825	CGATC	2	10	115670	115679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014825	AAATC	2	10	115990	115999	60 %	20 %	0 %	20 %	319788794
82	NC_014825	TGCCT	2	10	116284	116293	0 %	40 %	20 %	40 %	319788794
83	NC_014825	GGGAA	2	10	118298	118307	40 %	0 %	60 %	0 %	319788796
84	NC_014825	TCAGA	2	10	119742	119751	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014825	TTCGG	2	10	120174	120183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014825	GTCAT	2	10	122668	122677	20 %	40 %	20 %	20 %	319788799
87	NC_014825	CAGAG	2	10	123363	123372	40 %	0 %	40 %	20 %	319788800
88	NC_014825	GGCAA	2	10	125651	125660	40 %	0 %	40 %	20 %	319788804
89	NC_014825	CAAGC	2	10	125717	125726	40 %	0 %	20 %	40 %	319788804
90	NC_014825	TCGGT	2	10	126239	126248	0 %	40 %	40 %	20 %	319788805
91	NC_014825	ATCAA	2	10	126626	126635	60 %	20 %	0 %	20 %	319788805
92	NC_014825	TTGCT	2	10	130128	130137	0 %	60 %	20 %	20 %	319788809
93	NC_014825	AGCCC	2	10	130639	130648	20 %	0 %	20 %	60 %	319788809
94	NC_014825	AAGTG	2	10	130791	130800	40 %	20 %	40 %	0 %	319788809
95	NC_014825	TATGA	2	10	130910	130919	40 %	40 %	20 %	0 %	319788809
96	NC_014825	AGGAT	2	10	132146	132155	40 %	20 %	40 %	0 %	319788811
97	NC_014825	GTGCG	2	10	132282	132291	0 %	20 %	60 %	20 %	319788811
98	NC_014825	TGTTC	2	10	133609	133618	0 %	60 %	20 %	20 %	319788815
99	NC_014825	GGCGC	2	10	136754	136763	0 %	0 %	60 %	40 %	319788820
100	NC_014825	ACAGC	2	10	140115	140124	40 %	0 %	20 %	40 %	319788822
101	NC_014825	TATAT	2	10	140606	140615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014825	GGTCA	2	10	142816	142825	20 %	20 %	40 %	20 %	319788825
103	NC_014825	TTCTT	2	10	143166	143175	0 %	80 %	0 %	20 %	319788825
104	NC_014825	TACGT	2	10	153765	153774	20 %	40 %	20 %	20 %	319788829
105	NC_014825	ATTAC	2	10	155564	155573	40 %	40 %	0 %	20 %	319788829
106	NC_014825	CAGAT	2	10	157752	157761	40 %	20 %	20 %	20 %	319788830
107	NC_014825	GTGAG	2	10	157805	157814	20 %	20 %	60 %	0 %	319788830
108	NC_014825	ACTGC	2	10	158655	158664	20 %	20 %	20 %	40 %	319788831
109	NC_014825	AAACA	2	10	158981	158990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014825	TATAA	2	10	160203	160212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014825	AAGGA	2	10	160236	160245	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014825	TTGTT	2	10	160851	160860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014825	ATATC	2	10	161574	161583	40 %	40 %	0 %	20 %	319788835
114	NC_014825	TATCT	2	10	162085	162094	20 %	60 %	0 %	20 %	319788835
115	NC_014825	TTTTC	2	10	164644	164653	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014825	GCAAA	2	10	164898	164907	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014825	TTCCC	2	10	168377	168386	0 %	40 %	0 %	60 %	319788838
118	NC_014825	CAAGG	2	10	170389	170398	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014825	CAAGA	2	10	173062	173071	60 %	0 %	20 %	20 %	319788843
120	NC_014825	TTTCA	2	10	173564	173573	20 %	60 %	0 %	20 %	319788843
121	NC_014825	ATGAG	2	10	174805	174814	40 %	20 %	40 %	0 %	319788844
122	NC_014825	AAACA	2	10	176277	176286	80 %	0 %	0 %	20 %	319788846
123	NC_014825	ATGAA	2	10	177543	177552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014825	ATATA	2	10	177744	177753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014825	TCTTT	2	10	179129	179138	0 %	80 %	0 %	20 %	319788847
126	NC_014825	CATAT	2	10	179226	179235	40 %	40 %	0 %	20 %	319788847
127	NC_014825	TATCA	2	10	181535	181544	40 %	40 %	0 %	20 %	319788850
128	NC_014825	ATTTC	2	10	183843	183852	20 %	60 %	0 %	20 %	319788852
129	NC_014825	AAACA	2	10	184036	184045	80 %	0 %	0 %	20 %	319788852
130	NC_014825	TATTC	2	10	184214	184223	20 %	60 %	0 %	20 %	319788852
131	NC_014825	ATTCC	2	10	184441	184450	20 %	40 %	0 %	40 %	319788852
132	NC_014825	ATATC	2	10	185083	185092	40 %	40 %	0 %	20 %	319788853
133	NC_014825	TAATA	2	10	185231	185240	60 %	40 %	0 %	0 %	319788853
134	NC_014825	ATATT	2	10	185284	185293	40 %	60 %	0 %	0 %	319788853
135	NC_014825	CCACA	2	10	187228	187237	40 %	0 %	0 %	60 %	319788855
136	NC_014825	CCTTA	2	10	189211	189220	20 %	40 %	0 %	40 %	319788857
137	NC_014825	GAACA	2	10	190776	190785	60 %	0 %	20 %	20 %	319788858
138	NC_014825	CGTTG	2	10	192808	192817	0 %	40 %	40 %	20 %	319788861
139	NC_014825	CTTGT	2	10	194312	194321	0 %	60 %	20 %	20 %	319788863
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141	NC_014825	TTTCA	2	10	195238	195247	20 %	60 %	0 %	20 %	319788863
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177	NC_014825	TCTAT	2	10	263556	263565	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
178	NC_014825	GCACA	2	10	264975	264984	40 %	0 %	20 %	40 %	319788909
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.