MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL02

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014825	CCTG	2	8	1833	1840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014825	ACTG	2	8	1855	1862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014825	ATGA	2	8	2449	2456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014825	CATT	2	8	4536	4543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014825	ATCT	2	8	6410	6417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014825	AAAC	2	8	8888	8895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014825	TATG	2	8	12474	12481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014825	TATT	2	8	12600	12607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014825	TAAG	2	8	12681	12688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014825	CAAA	2	8	15513	15520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014825	TTCA	2	8	24047	24054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014825	TGCT	2	8	24136	24143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014825	AATT	2	8	24156	24163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014825	ATAA	2	8	27853	27860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014825	TTAA	2	8	27909	27916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014825	TAAA	2	8	28296	28303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014825	AGGA	2	8	28423	28430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014825	TATC	2	8	38037	38044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014825	TTAC	2	8	42625	42632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014825	GGCA	2	8	42707	42714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014825	TTTC	2	8	53350	53357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014825	TTCT	2	8	53451	53458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014825	TCTT	2	8	53532	53539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014825	ACAG	2	8	53684	53691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014825	ACAG	2	8	54145	54152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014825	TCTG	2	8	56393	56400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014825	TTAA	2	8	57297	57304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014825	AAAG	2	8	57317	57324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014825	TGGG	2	8	57754	57761	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014825	ATAC	2	8	58654	58661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014825	TTCT	2	8	59362	59369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014825	ATTT	2	8	65107	65114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014825	ATAA	2	8	67440	67447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014825	TCGT	2	8	67535	67542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014825	GATA	2	8	69074	69081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014825	TACT	2	8	78718	78725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014825	CAGC	2	8	79177	79184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014825	AGCA	2	8	81939	81946	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014825	ATTT	2	8	93189	93196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014825	CATT	2	8	93348	93355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014825	GATT	2	8	93373	93380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014825	TAAT	2	8	94462	94469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014825	AAGA	2	8	94731	94738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014825	TTTA	2	8	94853	94860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014825	GTTA	2	8	96847	96854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014825	CCTT	2	8	98838	98845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014825	TCAA	2	8	100670	100677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014825	CATA	2	8	100929	100936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014825	TGAT	2	8	105397	105404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014825	ACCG	2	8	105747	105754	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014825	GCAG	2	8	105986	105993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014825	TTGA	2	8	108150	108157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014825	ATAA	2	8	108201	108208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014825	CAGG	2	8	112614	112621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014825	GCAG	2	8	112738	112745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014825	CCTC	2	8	113399	113406	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_014825	GGGC	2	8	115645	115652	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014825	TTTG	2	8	115703	115710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014825	TGAT	2	8	119195	119202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014825	TCGA	2	8	121957	121964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014825	AGGT	2	8	124037	124044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014825	TTCG	2	8	126710	126717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014825	CAGG	2	8	126869	126876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014825	TCAT	2	8	127238	127245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014825	ATTA	2	8	127259	127266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014825	AAAC	2	8	129808	129815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014825	GCTG	2	8	131732	131739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014825	AAAG	2	8	134233	134240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014825	GAAT	2	8	135072	135079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014825	AAGG	2	8	146686	146693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014825	CAAA	2	8	157216	157223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014825	GAAA	2	8	157309	157316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014825	CCAA	2	8	159302	159309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014825	CCCA	2	8	159328	159335	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_014825	AACG	2	8	161150	161157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014825	ATCG	2	8	162970	162977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014825	AAAG	2	8	163535	163542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014825	ACTG	2	8	164554	164561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014825	GCCT	2	8	164829	164836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014825	GTCA	2	8	164968	164975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014825	TTGG	2	8	165014	165021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014825	AGAT	2	8	167086	167093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014825	CCGA	2	8	167237	167244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014825	ATCA	2	8	167482	167489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014825	ATCG	2	8	170114	170121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014825	AAAT	2	8	170267	170274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014825	ATTC	2	8	171181	171188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014825	GTCT	2	8	171411	171418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014825	GATT	2	8	172579	172586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014825	TAAT	2	8	177376	177383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014825	TAAT	2	8	177445	177452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014825	ATCA	2	8	177621	177628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014825	AATA	2	8	177736	177743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014825	AGAA	2	8	178175	178182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014825	AAGG	2	8	178202	178209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014825	TTGT	2	8	178473	178480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014825	AATT	2	8	183333	183340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014825	CTAC	2	8	192207	192214	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014825	CCAC	2	8	192737	192744	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_014825	ATTT	2	8	193486	193493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014825	ATTT	2	8	195956	195963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014825	TGAT	2	8	238947	238954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014825	AGGG	2	8	241495	241502	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014825	AGGA	2	8	243100	243107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014825	ATAC	2	8	247360	247367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014825	AAAC	2	8	247406	247413	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014825	TGAA	2	8	247488	247495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014825	AAAT	2	8	247510	247517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014825	TGAT	2	8	253992	253999	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014825	ATCA	2	8	261706	261713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014825	CAAA	2	8	263578	263585	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014825	CATA	2	8	268391	268398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014825	CAGA	2	8	268642	268649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014825	CCTG	2	8	268670	268677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014825	TAAA	2	8	270734	270741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014825	ATCA	2	8	273432	273439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014825	TTCT	2	8	299963	299970	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014825	ATTT	2	8	300015	300022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014825	GTTT	2	8	301230	301237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014825	TACA	2	8	305324	305331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014825	ATGT	2	8	305366	305373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014825	AAAC	2	8	305399	305406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014825	GCCT	2	8	309168	309175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014825	CTTG	2	8	310204	310211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014825	ATTT	2	8	310321	310328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014825	GTTT	2	8	311378	311385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014825	GTTT	2	8	312875	312882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014825	CAAA	2	8	312904	312911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014825	CAAA	2	8	312996	313003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014825	GTTT	2	8	313059	313066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014825	ACGG	2	8	313360	313367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014825	TATT	2	8	313402	313409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014825	CTGA	2	8	320109	320116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014825	TATT	2	8	320123	320130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014825	GGGA	2	8	320238	320245	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014825	TTTA	2	8	326554	326561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014825	TAAT	2	8	327430	327437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014825	TGAA	2	8	328116	328123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014825	AAAT	2	8	329543	329550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014825	TAAT	2	8	329692	329699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014825	TTTC	2	8	336952	336959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014825	AATT	2	8	338739	338746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014825	CTTG	2	8	342370	342377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014825	ATTA	2	8	345020	345027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014825	ATAA	2	8	352621	352628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.