MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL01

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014824	GGATTC	2	12	2850	2861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	317133721
2	NC_014824	TTTGAG	2	12	3264	3275	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	317133721
3	NC_014824	GCAGAA	2	12	9029	9040	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	317133724
4	NC_014824	AAAAGA	2	12	9529	9540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317133724
5	NC_014824	GCTTAT	2	12	9677	9688	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	317133724
6	NC_014824	GAATTC	2	12	11655	11666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317133726
7	NC_014824	ACAAAA	2	12	14079	14090	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	317133728
8	NC_014824	AATGAT	2	12	20821	20832	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	317133732
9	NC_014824	GATGCT	2	12	21494	21505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	317133733
10	NC_014824	GAAAAA	2	12	22508	22519	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317133734
11	NC_014824	TTTGAT	2	12	24000	24011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317133735
12	NC_014824	AATAAA	2	12	25161	25172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	317133736
13	NC_014824	TGATAC	2	12	25466	25477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317133736
14	NC_014824	CGATTC	2	12	39239	39250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	317133753
15	NC_014824	TATTGA	2	12	40523	40534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	317133754
16	NC_014824	TGAAAA	2	12	41354	41365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	317133754
17	NC_014824	GATAAA	2	12	41401	41412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	317133755
18	NC_014824	ATTTGT	2	12	44754	44765	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317133758
19	NC_014824	AATTAT	2	12	45251	45262	50 %	50 %	0 %	0 %	317133758
20	NC_014824	AAACTC	2	12	46792	46803	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	317133759
21	NC_014824	ATCGAT	2	12	50365	50376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317133759
22	NC_014824	ATTTGA	2	12	50616	50627	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	317133759
23	NC_014824	TGAGAA	2	12	51298	51309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317133760
24	NC_014824	TCAGGA	2	12	52441	52452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317133760
25	NC_014824	GTTATA	2	12	56317	56328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	317133764
26	NC_014824	AAAGAA	2	12	56395	56406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317133764
27	NC_014824	TTTACA	2	12	61234	61245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	317133767
28	NC_014824	TTTGTA	2	12	61802	61813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317133767
29	NC_014824	ATTACC	2	12	62895	62906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133767
30	NC_014824	GTTTTC	2	12	63704	63715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	317133768
31	NC_014824	AATATC	2	12	68033	68044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	317133774
32	NC_014824	AAGGTA	2	12	71622	71633	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317133776
33	NC_014824	GCTAAA	2	12	72740	72751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	317133776
34	NC_014824	CCGAGA	2	12	76967	76978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133782
35	NC_014824	ATTCAT	2	12	79398	79409	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	317133783
36	NC_014824	CTATCA	2	12	95759	95770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133796
37	NC_014824	AATGAA	2	12	100229	100240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	317133799
38	NC_014824	TCATAT	2	12	102388	102399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	317133802
39	NC_014824	ACAGGA	2	12	104206	104217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	317133803
40	NC_014824	TGACCG	2	12	111222	111233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317133812
41	NC_014824	CGCAGC	2	12	111733	111744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	317133812
42	NC_014824	CACTTA	2	12	123827	123838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133821
43	NC_014824	TATATG	2	12	123866	123877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	317133821
44	NC_014824	TATAAA	2	12	127741	127752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133822
45	NC_014824	ACAATC	2	12	131682	131693	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	317133826
46	NC_014824	ATCTTT	2	12	132871	132882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	317133827
47	NC_014824	ACCATC	2	12	133995	134006	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	317133828
48	NC_014824	GGGTAT	2	12	139806	139817	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	317133832
49	NC_014824	ACTGAG	2	12	142228	142239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317133832
50	NC_014824	AGCGAT	2	12	144749	144760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317133836
51	NC_014824	ATATCG	2	12	145364	145375	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317133837
52	NC_014824	AGGTAT	2	12	145773	145784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133837
53	NC_014824	GAAAAA	2	12	152358	152369	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317133840
54	NC_014824	TATCAT	2	12	153916	153927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	317133841
55	NC_014824	ATCGAT	2	12	154565	154576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317133841
56	NC_014824	TTGATT	2	12	155633	155644	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317133843
57	NC_014824	GCCGTA	2	12	157036	157047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317133844
58	NC_014824	ATATCT	2	12	159506	159517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	317133847
59	NC_014824	GAAGGA	2	12	176336	176347	50 %	0 %	50 %	0 %	317133861
60	NC_014824	TTTGTG	2	12	187520	187531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133871
61	NC_014824	AAGAAA	2	12	192247	192258	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317133875
62	NC_014824	ATCAAA	2	12	195487	195498	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	317133878
63	NC_014824	TAGATG	2	12	197127	197138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133879
64	NC_014824	AATGGA	2	12	197597	197608	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317133880
65	NC_014824	TGATTT	2	12	207529	207540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317133889
66	NC_014824	GCCTGA	2	12	207706	207717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317133889
67	NC_014824	ATCTAT	2	12	208245	208256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	317133890
68	NC_014824	ATATGT	2	12	211386	211397	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	317133891
69	NC_014824	AAAAAT	2	12	212570	212581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	317133891
70	NC_014824	GCCGGT	2	12	216271	216282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317133894
71	NC_014824	ATATCA	2	12	219223	219234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	317133895
72	NC_014824	CATAAA	2	12	220969	220980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	317133898
73	NC_014824	GTATGA	2	12	232017	232028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133908
74	NC_014824	GTAAGA	2	12	234547	234558	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317133910
75	NC_014824	GACAAG	2	12	236778	236789	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	317133910
76	NC_014824	GAAAAA	2	12	238747	238758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317133911
77	NC_014824	AAATCA	2	12	249902	249913	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	317133917
78	NC_014824	GAAAAA	2	12	251138	251149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317133917
79	NC_014824	CTCATT	2	12	259001	259012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	317133924
80	NC_014824	GTTCCT	2	12	262406	262417	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	317133927
81	NC_014824	TATGAA	2	12	270051	270062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	317133938
82	NC_014824	CGAAGC	2	12	274367	274378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133941
83	NC_014824	TAAAAT	2	12	277670	277681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133944
84	NC_014824	GTTCCT	2	12	283726	283737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	317133951
85	NC_014824	TTGATT	2	12	285849	285860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317133953
86	NC_014824	CGACAA	2	12	286210	286221	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	317133954
87	NC_014824	TAAACA	2	12	289602	289613	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	317133956
88	NC_014824	AATATC	2	12	291471	291482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	317133958
89	NC_014824	TTTTCA	2	12	294459	294470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	317133960
90	NC_014824	ACTTGC	2	12	294806	294817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	317133960
91	NC_014824	TATGGC	2	12	313193	313204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	317133982
92	NC_014824	GCGAGG	2	12	314525	314536	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	317133983
93	NC_014824	AATGGC	2	12	320014	320025	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317133991
94	NC_014824	GCAGAA	2	12	320471	320482	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	317133992
95	NC_014824	ACTTTG	2	12	321378	321389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	317133994
96	NC_014824	GACAAC	2	12	321454	321465	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	317133994
97	NC_014824	TTACAC	2	12	329022	329033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317134002
98	NC_014824	GCTATT	2	12	335309	335320	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	317134009
99	NC_014824	AATGAA	2	12	336735	336746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	317134010
100	NC_014824	ATTTGA	2	12	339766	339777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	317134013
101	NC_014824	CATTTG	2	12	347560	347571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	317134020
102	NC_014824	GTTATT	2	12	352352	352363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	317134025
103	NC_014824	TTTTGC	2	12	361455	361466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	317134031
104	NC_014824	CAAAAG	2	12	361771	361782	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	317134031
105	NC_014824	AAAAGA	2	12	366018	366029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	317134033
106	NC_014824	TAAAGG	2	12	369111	369122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317134036
107	NC_014824	TTCAAT	2	12	377333	377344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	317134040
108	NC_014824	AAGAGA	2	12	379970	379981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317134044
109	NC_014824	CTATCA	2	12	383265	383276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317134048
110	NC_014824	CATGAT	2	12	383666	383677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	317134049
111	NC_014824	ATCGGG	2	12	388171	388182	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	317134055
112	NC_014824	AGTAGC	2	12	392147	392158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317134060
113	NC_014824	GAAGAT	2	12	394738	394749	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317134065
114	NC_014824	ACAGGA	2	12	402076	402087	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	317134074
115	NC_014824	TCTGCA	2	12	403310	403321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	317134076
116	NC_014824	TAAGGA	2	12	404004	404015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	317134077
117	NC_014824	CAAGGT	2	12	406503	406514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	317134079
118	NC_014824	AAATAC	2	12	406685	406696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	317134079
119	NC_014824	ATGTTC	2	12	408982	408993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	317134081
120	NC_014824	ATCTTT	2	12	414938	414949	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	317134088

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.