MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL01

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014824	TATAA	2	10	20100	20109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014824	TTTTG	2	10	31244	31253	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014824	ATTAT	2	10	37923	37932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014824	TTATA	2	10	65401	65410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014824	TCTTT	2	10	68924	68933	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014824	TATAA	2	10	73767	73776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014824	CCCTT	2	10	84451	84460	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014824	TTCCT	2	10	85688	85697	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014824	GCAGC	2	10	86103	86112	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014824	GCTCT	2	10	87763	87772	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014824	ACTTG	2	10	87954	87963	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014824	AAAAG	2	10	90662	90671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014824	AAATT	2	10	92764	92773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014824	GTAAG	2	10	92801	92810	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014824	TTTTC	2	10	93417	93426	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014824	GATAT	2	10	99655	99664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014824	GTTCA	2	10	101318	101327	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014824	GTTAT	2	10	102319	102328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014824	TACCA	2	10	108824	108833	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014824	TAATT	2	10	115445	115454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014824	TAAAA	2	10	126537	126546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014824	TAATT	2	10	126550	126559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014824	AAAAT	2	10	126654	126663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014824	GAAAA	2	10	132369	132378	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014824	CACTT	2	10	136455	136464	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014824	CTTGT	2	10	137076	137085	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014824	CTGTA	2	10	137597	137606	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014824	AAATC	2	10	151226	151235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014824	CTTTG	2	10	151588	151597	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014824	GAAAA	2	10	151842	151851	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014824	CCCTA	2	10	152881	152890	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014824	TCGAT	2	10	153303	153312	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014824	AATAA	2	10	154897	154906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014824	ATTTA	2	10	159600	159609	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014824	AATAA	2	10	160489	160498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014824	TCTTT	2	10	166590	166599	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014824	TGTGA	2	10	167770	167779	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014824	CATTC	2	10	169346	169355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014824	TTCCC	2	10	170935	170944	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014824	ACCTT	2	10	173551	173560	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014824	TATAT	2	10	174438	174447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014824	GATAT	2	10	185436	185445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014824	AGTAA	2	10	186618	186627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014824	AAGAA	2	10	186648	186657	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014824	AACAG	2	10	193735	193744	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014824	GCAGG	2	10	200881	200890	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014824	TGATA	2	10	201823	201832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014824	ATATA	2	10	212909	212918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014824	GATCA	2	10	219800	219809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014824	ATTAT	2	10	221493	221502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014824	TCTTT	2	10	223869	223878	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014824	ACAAA	2	10	229272	229281	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014824	TAGTT	2	10	229316	229325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014824	ATATA	2	10	230938	230947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014824	TATAA	2	10	232462	232471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014824	TCAGA	2	10	244505	244514	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014824	TCAGA	2	10	245653	245662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014824	ATTAT	2	10	247363	247372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014824	AGATC	2	10	251855	251864	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014824	AGATC	2	10	254001	254010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014824	TGGAT	2	10	254164	254173	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014824	AGATA	2	10	255361	255370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014824	GATAT	2	10	255872	255881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014824	AGCTT	2	10	258351	258360	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014824	AGATC	2	10	260668	260677	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014824	ATATA	2	10	266153	266162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014824	GTATG	2	10	269823	269832	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014824	TCCTG	2	10	271187	271196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014824	GAACT	2	10	271623	271632	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014824	TGCTT	2	10	274432	274441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014824	GAAAA	2	10	275692	275701	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014824	AATTA	2	10	279455	279464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014824	TTATG	2	10	279554	279563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014824	GTAGG	2	10	280719	280728	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014824	TATAA	2	10	284199	284208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014824	ATACA	2	10	293239	293248	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014824	GTTTG	2	10	297308	297317	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014824	TAATT	2	10	298910	298919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014824	TTAAA	2	10	309552	309561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014824	TAAAA	2	10	315059	315068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014824	TATAA	2	10	324471	324480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014824	TATAA	2	10	327737	327746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014824	ACTGT	2	10	330870	330879	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014824	ATTAT	2	10	332268	332277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014824	TTTCA	2	10	332302	332311	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014824	TGATA	2	10	332406	332415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014824	GAAGA	2	10	342142	342151	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014824	GAATT	2	10	366237	366246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014824	TTAAA	2	10	367729	367738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014824	AACGA	2	10	373485	373494	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014824	AACAG	2	10	376035	376044	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014824	AAAAT	2	10	379857	379866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014824	AAAAC	2	10	382913	382922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014824	AGTAT	2	10	393110	393119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014824	GGAAG	2	10	402892	402901	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014824	CAACA	2	10	404202	404211	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014824	TAGAG	2	10	407093	407102	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014824	CCCAT	2	10	410269	410278	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_014824	ATTAT	2	10	412385	412394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.