MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL01

Total Repeats: 5663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014824	AGG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133720
2	NC_014824	GAT	2	6	325	330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
3	NC_014824	TGA	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
4	NC_014824	CAG	2	6	487	492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
5	NC_014824	AAT	2	6	531	536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
6	NC_014824	CTT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133720
7	NC_014824	GAT	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
8	NC_014824	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
9	NC_014824	GAT	3	9	904	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
10	NC_014824	GAA	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
11	NC_014824	ATA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
12	NC_014824	GAA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
13	NC_014824	GGA	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133720
14	NC_014824	ACG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
15	NC_014824	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
16	NC_014824	GAC	2	6	1250	1255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
17	NC_014824	CAA	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133720
18	NC_014824	TGA	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
19	NC_014824	TTC	2	6	1405	1410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133720
20	NC_014824	TCA	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133720
21	NC_014824	ATA	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
22	NC_014824	ATA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133720
23	NC_014824	GAT	2	6	1696	1701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133720
24	NC_014824	CGG	2	6	1743	1748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133720
25	NC_014824	GAA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
26	NC_014824	ATC	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133720
27	NC_014824	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
28	NC_014824	GAA	3	9	2112	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133720
29	NC_014824	CAG	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133720
30	NC_014824	AGA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
31	NC_014824	AGA	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
32	NC_014824	ATC	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
33	NC_014824	TCT	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133721
34	NC_014824	TCG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133721
35	NC_014824	AAT	2	6	2588	2593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
36	NC_014824	ATG	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
37	NC_014824	TGA	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
38	NC_014824	TTC	2	6	2885	2890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133721
39	NC_014824	AAG	2	6	2912	2917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
40	NC_014824	AGC	2	6	2924	2929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133721
41	NC_014824	AAT	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
42	NC_014824	TCA	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
43	NC_014824	TGA	2	6	2987	2992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
44	NC_014824	ATA	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
45	NC_014824	AAG	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
46	NC_014824	GAG	2	6	3075	3080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133721
47	NC_014824	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
48	NC_014824	AGA	2	6	3206	3211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
49	NC_014824	GAT	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
50	NC_014824	CGG	2	6	3332	3337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133721
51	NC_014824	ACT	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
52	NC_014824	AGC	2	6	3380	3385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133721
53	NC_014824	TGA	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
54	NC_014824	GAT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
55	NC_014824	AGA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
56	NC_014824	ATC	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133721
57	NC_014824	GAA	2	6	3873	3878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133721
58	NC_014824	AGG	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133721
59	NC_014824	TAA	2	6	3962	3967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
60	NC_014824	AAT	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
61	NC_014824	AGC	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133721
62	NC_014824	ATG	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133721
63	NC_014824	CTG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133721
64	NC_014824	AAT	2	6	4377	4382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133721
65	NC_014824	ATT	2	6	4392	4397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133721
66	NC_014824	AGG	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014824	AGA	2	6	4561	4566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
68	NC_014824	AAG	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
69	NC_014824	CAT	2	6	4763	4768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133722
70	NC_014824	AGA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
71	NC_014824	TGA	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133722
72	NC_014824	AAG	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
73	NC_014824	GAC	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133722
74	NC_014824	TCA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133722
75	NC_014824	TTA	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
76	NC_014824	TAA	2	6	5274	5279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133722
77	NC_014824	ATA	2	6	5303	5308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133722
78	NC_014824	ATT	2	6	5467	5472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
79	NC_014824	CAG	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133722
80	NC_014824	TCT	2	6	5551	5556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133722
81	NC_014824	GAA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133722
82	NC_014824	ATT	2	6	5690	5695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
83	NC_014824	AAT	2	6	5743	5748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133722
84	NC_014824	ATT	2	6	5855	5860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133722
85	NC_014824	CTT	2	6	5901	5906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014824	TAA	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014824	ATT	2	6	5946	5951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014824	GCA	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133723
89	NC_014824	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133723
90	NC_014824	AAG	2	6	6330	6335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133723
91	NC_014824	AAT	2	6	6336	6341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133723
92	NC_014824	TAT	2	6	6473	6478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133723
93	NC_014824	ATA	2	6	6556	6561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133723
94	NC_014824	GAA	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133723
95	NC_014824	ATG	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133723
96	NC_014824	TTC	2	6	6783	6788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014824	TGA	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014824	ATT	3	9	6889	6897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133724
99	NC_014824	CTG	2	6	6981	6986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133724
100	NC_014824	GAA	3	9	7043	7051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
101	NC_014824	AGA	2	6	7090	7095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
102	NC_014824	CTA	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
103	NC_014824	AAC	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133724
104	NC_014824	AGA	2	6	7353	7358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
105	NC_014824	CTA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
106	NC_014824	GAA	2	6	7489	7494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
107	NC_014824	ACG	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133724
108	NC_014824	AGC	2	6	7573	7578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133724
109	NC_014824	CTT	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133724
110	NC_014824	ATT	2	6	7816	7821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133724
111	NC_014824	AGA	2	6	7973	7978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
112	NC_014824	TCA	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
113	NC_014824	TGA	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133724
114	NC_014824	TGT	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133724
115	NC_014824	CAT	2	6	8171	8176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
116	NC_014824	ATC	2	6	8187	8192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
117	NC_014824	AAT	2	6	8332	8337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133724
118	NC_014824	ATC	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
119	NC_014824	GAA	2	6	8394	8399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
120	NC_014824	AGA	2	6	8599	8604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
121	NC_014824	TAC	2	6	8656	8661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
122	NC_014824	AGC	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133724
123	NC_014824	ATG	2	6	8724	8729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133724
124	NC_014824	AAT	2	6	8875	8880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133724
125	NC_014824	TGC	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133724
126	NC_014824	TCA	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
127	NC_014824	TGA	2	6	8982	8987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133724
128	NC_014824	CGG	2	6	8992	8997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133724
129	NC_014824	AGA	2	6	9022	9027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
130	NC_014824	ATT	2	6	9046	9051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133724
131	NC_014824	ATT	2	6	9086	9091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133724
132	NC_014824	CAT	2	6	9261	9266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
133	NC_014824	CAT	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133724
134	NC_014824	TTG	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133724
135	NC_014824	ATG	2	6	9632	9637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133724
136	NC_014824	GAA	2	6	9932	9937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
137	NC_014824	TGA	2	6	10204	10209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133724
138	NC_014824	TAA	2	6	10395	10400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133724
139	NC_014824	TGA	2	6	10459	10464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133724
140	NC_014824	GAG	2	6	10598	10603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133724
141	NC_014824	GAT	2	6	10604	10609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133724
142	NC_014824	GAA	2	6	10616	10621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
143	NC_014824	AAC	2	6	10643	10648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133724
144	NC_014824	GAA	2	6	10735	10740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
145	NC_014824	TCT	2	6	10795	10800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133724
146	NC_014824	GAA	2	6	10830	10835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133724
147	NC_014824	AAT	2	6	10911	10916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133724
148	NC_014824	GAG	2	6	11016	11021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014824	GAA	2	6	11033	11038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133725
150	NC_014824	GCT	2	6	11067	11072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133725
151	NC_014824	AAG	2	6	11101	11106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133725
152	NC_014824	TTA	2	6	11129	11134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133725
153	NC_014824	TTC	2	6	11285	11290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133725
154	NC_014824	AGA	2	6	11306	11311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133725
155	NC_014824	AGA	2	6	11363	11368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133725
156	NC_014824	ATC	2	6	11465	11470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133725
157	NC_014824	TAA	2	6	11539	11544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014824	CTG	2	6	11549	11554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014824	TGA	2	6	11715	11720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133726
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161	NC_014824	CAA	2	6	11834	11839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133726
162	NC_014824	TCT	2	6	11962	11967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133726
163	NC_014824	ATA	2	6	12037	12042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133726
164	NC_014824	AGC	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133726
165	NC_014824	AGA	2	6	12278	12283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133726
166	NC_014824	CTG	2	6	12383	12388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133726
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168	NC_014824	ATG	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133727
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173	NC_014824	ACG	2	6	12766	12771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133727
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178	NC_014824	TAA	2	6	13301	13306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133728
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196	NC_014824	ATA	2	6	14296	14301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133728
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239	NC_014824	TAC	2	6	18500	18505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133731
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243	NC_014824	TCG	2	6	18877	18882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133731
244	NC_014824	TCT	2	6	19003	19008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133731
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246	NC_014824	AAG	2	6	19155	19160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133731
247	NC_014824	TGA	2	6	19196	19201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133731
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249	NC_014824	GAT	2	6	19338	19343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133731
250	NC_014824	GAT	2	6	19356	19361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133731
251	NC_014824	TAA	2	6	19420	19425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133731
252	NC_014824	AGG	2	6	19507	19512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133731
253	NC_014824	CAG	2	6	19540	19545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133731
254	NC_014824	CGG	2	6	19574	19579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133731
255	NC_014824	GAA	2	6	19593	19598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133731
256	NC_014824	GTA	2	6	19734	19739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133731
257	NC_014824	ATG	2	6	19909	19914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133731
258	NC_014824	CAA	2	6	19961	19966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133731
259	NC_014824	TCG	2	6	20052	20057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_014824	ATG	2	6	20255	20260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133732
261	NC_014824	CTA	2	6	20358	20363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133732
262	NC_014824	TGT	2	6	20421	20426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133732
263	NC_014824	GCT	2	6	20536	20541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133732
264	NC_014824	TGT	2	6	20568	20573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133732
265	NC_014824	AAT	2	6	20628	20633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133732
266	NC_014824	AAT	2	6	20641	20646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133732
267	NC_014824	GAT	2	6	20686	20691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133732
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270	NC_014824	TGA	2	6	20757	20762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133732
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273	NC_014824	ATT	2	6	20812	20817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133732
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275	NC_014824	CAT	2	6	20885	20890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133732
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279	NC_014824	TGA	2	6	20992	20997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133733
280	NC_014824	TGA	2	6	21109	21114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133733
281	NC_014824	TTG	2	6	21198	21203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133733
282	NC_014824	AAC	2	6	21340	21345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133733
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285	NC_014824	GAT	2	6	21545	21550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133733
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331	NC_014824	TAA	2	6	25588	25593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_014824	TAA	2	6	28830	28835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133741
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383	NC_014824	AGA	2	6	28975	28980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133741
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500	NC_014824	GCG	2	6	37235	37240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133751

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