MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cenarchaeum symbiosum A

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014820	CATGC	2	10	13488	13497	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014820	GAAAT	2	10	44326	44335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014820	TAGCC	2	10	49015	49024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014820	CTATT	2	10	60712	60721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014820	AATAT	2	10	83408	83417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014820	GATAA	2	10	95683	95692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014820	TTTTA	2	10	99044	99053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014820	ATTCT	2	10	99149	99158	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014820	GCCGT	2	10	105561	105570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014820	CCCCG	2	10	124423	124432	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_014820	TCCTC	2	10	129096	129105	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_014820	TCCAT	2	10	129417	129426	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014820	CTGTC	2	10	130803	130812	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014820	CTTGT	2	10	131057	131066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014820	GAAAA	2	10	160664	160673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014820	GCCTA	2	10	160842	160851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014820	TGGCA	2	10	210940	210949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014820	GCTAA	2	10	218353	218362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014820	GTATC	2	10	241041	241050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014820	TCGTT	2	10	241961	241970	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014820	GCCGC	2	10	245633	245642	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_014820	GTCCC	2	10	259341	259350	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014820	GCCGG	2	10	260192	260201	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014820	AAACA	2	10	284972	284981	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014820	ATAAG	2	10	287360	287369	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014820	TTATC	2	10	287489	287498	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014820	TAGGC	2	10	299706	299715	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014820	TTATC	2	10	302668	302677	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014820	AGGGC	2	10	307477	307486	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014820	GGGCA	2	10	335312	335321	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014820	CCCTG	2	10	337226	337235	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014820	GGTAA	2	10	348414	348423	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014820	TATCC	2	10	352959	352968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014820	TAGTC	2	10	372569	372578	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014820	GGCCC	2	10	374199	374208	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_014820	ATACT	2	10	384283	384292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014820	GTTTG	2	10	395179	395188	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014820	CGGCC	2	10	418332	418341	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_014820	AGGGG	2	10	447106	447115	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014820	TCTCC	2	10	449130	449139	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014820	TACAA	2	10	466216	466225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014820	AGCTG	2	10	470238	470247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014820	TGCGT	2	10	507129	507138	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014820	AAAAT	2	10	555305	555314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014820	ATGAA	2	10	575267	575276	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014820	CCTGC	2	10	584539	584548	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_014820	CCTGC	2	10	607911	607920	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014820	CATCT	2	10	612641	612650	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014820	TCTTT	2	10	618172	618181	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014820	CCGCA	2	10	618744	618753	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_014820	TAGGC	2	10	628876	628885	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014820	TGGTA	2	10	635149	635158	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014820	ATAAA	2	10	639792	639801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014820	TGCCT	2	10	669572	669581	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014820	GGGAT	2	10	715958	715967	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014820	TGGCA	2	10	716048	716057	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014820	TTTAT	2	10	742574	742583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014820	CTTTC	2	10	753638	753647	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014820	GGCAT	2	10	810865	810874	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014820	AATGG	2	10	818117	818126	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014820	TAGGC	2	10	818266	818275	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014820	TCTAT	2	10	891670	891679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014820	ACCAT	2	10	891706	891715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014820	CCGGG	2	10	905924	905933	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014820	ACACT	2	10	909275	909284	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014820	GCAGG	2	10	947419	947428	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014820	ACAGC	2	10	948404	948413	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014820	GCCGC	2	10	954409	954418	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_014820	GGATC	2	10	954503	954512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014820	CCGGC	2	10	1033663	1033672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_014820	ACAAT	2	10	1041016	1041025	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014820	CGTCC	2	10	1065143	1065152	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_014820	TCTAG	2	10	1065506	1065515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014820	ATTAT	2	10	1094475	1094484	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014820	ACTCG	2	10	1097723	1097732	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014820	GTGAT	2	10	1115153	1115162	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014820	CTTGT	2	10	1125025	1125034	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014820	TGCAC	2	10	1126735	1126744	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014820	GCCTA	2	10	1127673	1127682	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014820	CCATC	2	10	1127788	1127797	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_014820	TAGGC	2	10	1130028	1130037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014820	ACAGG	2	10	1136362	1136371	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014820	ACTAT	2	10	1160637	1160646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014820	GATCC	2	10	1173419	1173428	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014820	CATGC	2	10	1200240	1200249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014820	AGGGG	2	10	1200847	1200856	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014820	GCACT	2	10	1201616	1201625	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014820	CCTCT	2	10	1202128	1202137	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_014820	GATCG	2	10	1202603	1202612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014820	GCAAG	2	10	1205636	1205645	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014820	CGGCA	2	10	1217741	1217750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014820	CCGCA	2	10	1217990	1217999	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_014820	CGGGG	2	10	1218066	1218075	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014820	CGGCA	2	10	1218317	1218326	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014820	CCGCA	2	10	1218566	1218575	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014820	CGGGG	2	10	1218642	1218651	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014820	CGGGG	2	10	1219218	1219227	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014820	GCAAG	2	10	1223195	1223204	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014820	CCCTG	2	10	1226686	1226695	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_014820	GGGGC	2	10	1229097	1229106	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014820	AATCC	2	10	1235314	1235323	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014820	TACAG	2	10	1236890	1236899	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014820	TCTCA	2	10	1236926	1236935	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014820	CCGGG	2	10	1241033	1241042	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014820	TGATA	2	10	1268900	1268909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014820	GATCC	2	10	1299658	1299667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014820	CGGAT	2	10	1304647	1304656	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014820	AATCA	2	10	1310942	1310951	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014820	GCCAG	2	10	1318653	1318662	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014820	CCGGC	2	10	1374044	1374053	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_014820	ACTGC	2	10	1428107	1428116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014820	CAGTG	2	10	1428795	1428804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014820	GAGGG	2	10	1428853	1428862	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014820	TCAGG	2	10	1437672	1437681	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014820	CGCAC	2	10	1448779	1448788	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_014820	CGGCA	2	10	1454118	1454127	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_014820	GGCCG	2	10	1472338	1472347	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014820	TAGGC	2	10	1473466	1473475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014820	CCCGG	2	10	1491320	1491329	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_014820	GCGCG	2	10	1507560	1507569	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014820	CGGCA	2	10	1508922	1508931	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014820	CCCGT	2	10	1512124	1512133	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_014820	CATTC	2	10	1539896	1539905	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014820	ACTGG	2	10	1541410	1541419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014820	TAGAC	2	10	1564655	1564664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014820	CACCC	2	10	1568833	1568842	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_014820	TTTCT	2	10	1578828	1578837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014820	AACAG	2	10	1592355	1592364	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014820	ACCCG	2	10	1652196	1652205	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014820	TTTTA	2	10	1662657	1662666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014820	ATGTG	2	10	1685754	1685763	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014820	GGCAG	2	10	1691352	1691361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014820	AATAG	2	10	1727209	1727218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014820	TGCCC	2	10	1751273	1751282	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_014820	ATAAA	2	10	1767190	1767199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014820	GGGGC	2	10	1809111	1809120	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014820	CAGTA	2	10	1811475	1811484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014820	TGATA	2	10	1813014	1813023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014820	TATAT	2	10	1813026	1813035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014820	TACGA	2	10	1813390	1813399	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014820	GTGGA	2	10	1814478	1814487	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014820	AGGGG	2	10	1817624	1817633	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014820	CGGGG	2	10	1819519	1819528	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014820	TTCTT	2	10	1822428	1822437	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014820	ACATT	2	10	1823232	1823241	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014820	GCCCG	2	10	1841038	1841047	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_014820	GCAGC	2	10	1842958	1842967	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014820	CGGGC	2	10	1844410	1844419	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014820	AAAAT	2	10	1882292	1882301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014820	TGCAT	2	10	1915605	1915614	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_014820	TCTGG	2	10	1932279	1932288	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014820	TGATT	2	10	1947660	1947669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014820	ACGCG	2	10	1980201	1980210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_014820	GTCCG	2	10	1981346	1981355	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_014820	GCCTA	2	10	1981994	1982003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_014820	CGGGG	2	10	2018828	2018837	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
157	NC_014820	TATTC	2	10	2035603	2035612	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.