MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX02

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014819	GTGGAC	2	12	2087	2098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315500679
2	NC_014819	AGTTAT	2	12	5171	5182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014819	ACCTCC	2	12	5528	5539	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	315500680
4	NC_014819	CGTCGG	2	12	7425	7436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014819	CCCGAT	2	12	11396	11407	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500684
6	NC_014819	AGGAAA	2	12	11535	11546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315500684
7	NC_014819	CCGTCA	2	12	16470	16481	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500687
8	NC_014819	CGGCCT	2	12	19363	19374	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500689
9	NC_014819	AGGTGT	2	12	19413	19424	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315500690
10	NC_014819	GCCGAA	2	12	19585	19596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315500690
11	NC_014819	CTTGGA	2	12	20582	20593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500691
12	NC_014819	CGACCT	2	12	28338	28349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500698
13	NC_014819	CATTAT	2	12	28524	28535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315500698
14	NC_014819	AATACG	2	12	32560	32571	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014819	TCGTAC	2	12	35801	35812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315500702
16	NC_014819	GCGTCC	2	12	40281	40292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014819	CCTTTG	2	12	43251	43262	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	315500708
18	NC_014819	CCAGGC	2	12	51087	51098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500713
19	NC_014819	CTCGAC	2	12	56265	56276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500721
20	NC_014819	TCGGTC	2	12	57717	57728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500724
21	NC_014819	CAACGG	2	12	61779	61790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315500729
22	NC_014819	CCCCTC	2	12	65429	65440	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	315500732
23	NC_014819	CAGCGA	2	12	79330	79341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315500741
24	NC_014819	GCGCGT	2	12	84383	84394	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315500748
25	NC_014819	GCGCGG	2	12	86324	86335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315500749
26	NC_014819	CCTCTT	2	12	87741	87752	0 %	50 %	0 %	50 %	315500750
27	NC_014819	CTGAAG	2	12	87828	87839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500750
28	NC_014819	TTGCCA	2	12	92985	92996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315500757
29	NC_014819	TATGGG	2	12	106635	106646	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315500769
30	NC_014819	ACTACC	2	12	107157	107168	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	315500770
31	NC_014819	GGGCGC	2	12	109122	109133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315500771
32	NC_014819	CGCGAC	2	12	110711	110722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500771
33	NC_014819	GCGCTC	2	12	110813	110824	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500771
34	NC_014819	GACTTC	2	12	111232	111243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315500772
35	NC_014819	CCTCGG	2	12	114945	114956	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500776
36	NC_014819	ATATTG	2	12	115088	115099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014819	CGCTGG	2	12	121016	121027	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315500781
38	NC_014819	TTCTCT	2	12	121386	121397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315500782
39	NC_014819	CCGATA	2	12	123392	123403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014819	CCTTGT	2	12	123818	123829	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	315500783
41	NC_014819	CGTTCT	2	12	129203	129214	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	315500788
42	NC_014819	CATCAG	2	12	132498	132509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315500790
43	NC_014819	ATTTTC	2	12	137203	137214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014819	GGCAAG	2	12	138605	138616	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315500799
45	NC_014819	GCTTCG	2	12	139893	139904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500799
46	NC_014819	ATCGCC	2	12	141145	141156	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500800
47	NC_014819	GTCGAT	2	12	142129	142140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500800
48	NC_014819	CCGCGA	2	12	142443	142454	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500800
49	NC_014819	CCATGA	2	12	143357	143368	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315500801
50	NC_014819	AAATTG	2	12	143606	143617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014819	CAAGGT	2	12	144249	144260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500803
52	NC_014819	TTCGCC	2	12	147298	147309	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315500806
53	NC_014819	TGGTCA	2	12	150341	150352	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500809
54	NC_014819	GGCCCG	2	12	151722	151733	0 %	0 %	50 %	50 %	315500809
55	NC_014819	TTTCCT	2	12	155555	155566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315500813
56	NC_014819	GATGAC	2	12	156030	156041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500813
57	NC_014819	GGACCG	2	12	157243	157254	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315500814
58	NC_014819	CTTCGG	2	12	158175	158186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500815
59	NC_014819	GCTTCA	2	12	158761	158772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315500816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.