MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX02

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014819	CGCCA	2	10	829	838	20 %	0 %	20 %	60 %	315500678
2	NC_014819	TGCGC	2	10	3189	3198	0 %	20 %	40 %	40 %	315500679
3	NC_014819	GCCCC	2	10	4395	4404	0 %	0 %	20 %	80 %	315500679
4	NC_014819	TCCCC	2	10	5160	5169	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_014819	GATCA	2	10	6059	6068	40 %	20 %	20 %	20 %	315500681
6	NC_014819	TACAA	2	10	6351	6360	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014819	GCGCT	2	10	6435	6444	0 %	20 %	40 %	40 %	315500682
8	NC_014819	TCCCA	2	10	7014	7023	20 %	20 %	0 %	60 %	315500682
9	NC_014819	GGCTG	2	10	10424	10433	0 %	20 %	60 %	20 %	315500684
10	NC_014819	GTCCT	2	10	10724	10733	0 %	40 %	20 %	40 %	315500684
11	NC_014819	ATCGA	2	10	11867	11876	40 %	20 %	20 %	20 %	315500684
12	NC_014819	CCGAT	2	10	13149	13158	20 %	20 %	20 %	40 %	315500684
13	NC_014819	CGATC	2	10	13201	13210	20 %	20 %	20 %	40 %	315500684
14	NC_014819	GAGGC	2	10	13512	13521	20 %	0 %	60 %	20 %	315500684
15	NC_014819	CAGAT	2	10	16511	16520	40 %	20 %	20 %	20 %	315500687
16	NC_014819	GGATC	2	10	18686	18695	20 %	20 %	40 %	20 %	315500688
17	NC_014819	CTTGG	2	10	18926	18935	0 %	40 %	40 %	20 %	315500688
18	NC_014819	CGGTC	2	10	20137	20146	0 %	20 %	40 %	40 %	315500691
19	NC_014819	TGCCG	2	10	21359	21368	0 %	20 %	40 %	40 %	315500691
20	NC_014819	TGAGG	2	10	22845	22854	20 %	20 %	60 %	0 %	315500693
21	NC_014819	TTCTT	2	10	25515	25524	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014819	AAAAG	2	10	25664	25673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014819	AGCCA	2	10	25678	25687	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014819	ATCCT	2	10	28022	28031	20 %	40 %	0 %	40 %	315500698
25	NC_014819	AATGT	2	10	28186	28195	40 %	40 %	20 %	0 %	315500698
26	NC_014819	TCCCC	2	10	30215	30224	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
27	NC_014819	ACCCA	2	10	30318	30327	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014819	TCGCC	2	10	32636	32645	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_014819	GATTT	2	10	34504	34513	20 %	60 %	20 %	0 %	315500702
30	NC_014819	GGGTC	2	10	36547	36556	0 %	20 %	60 %	20 %	315500703
31	NC_014819	GCAGG	2	10	37930	37939	20 %	0 %	60 %	20 %	315500703
32	NC_014819	CGGAT	2	10	40958	40967	20 %	20 %	40 %	20 %	315500705
33	NC_014819	TGAGC	2	10	41070	41079	20 %	20 %	40 %	20 %	315500705
34	NC_014819	CTTTT	2	10	43234	43243	0 %	80 %	0 %	20 %	315500708
35	NC_014819	GGCCG	2	10	45484	45493	0 %	0 %	60 %	40 %	315500708
36	NC_014819	CGTCC	2	10	45679	45688	0 %	20 %	20 %	60 %	315500708
37	NC_014819	CCCCA	2	10	46149	46158	20 %	0 %	0 %	80 %	315500708
38	NC_014819	CCGCT	2	10	46520	46529	0 %	20 %	20 %	60 %	315500709
39	NC_014819	TCGGG	2	10	46688	46697	0 %	20 %	60 %	20 %	315500709
40	NC_014819	GACCC	2	10	50352	50361	20 %	0 %	20 %	60 %	315500711
41	NC_014819	ACGGC	2	10	50518	50527	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014819	GCCCG	2	10	51228	51237	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014819	GAGTC	2	10	51519	51528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014819	GCTGG	2	10	52178	52187	0 %	20 %	60 %	20 %	315500715
45	NC_014819	GGATC	2	10	52735	52744	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014819	CCCTT	2	10	53329	53338	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_014819	CGCTG	2	10	53895	53904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014819	CCAGT	2	10	55715	55724	20 %	20 %	20 %	40 %	315500720
49	NC_014819	CTGAA	2	10	56290	56299	40 %	20 %	20 %	20 %	315500721
50	NC_014819	TTTTC	2	10	56973	56982	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014819	GAATG	2	10	57602	57611	40 %	20 %	40 %	0 %	315500724
52	NC_014819	CCGCT	2	10	57654	57663	0 %	20 %	20 %	60 %	315500724
53	NC_014819	AGACC	2	10	57802	57811	40 %	0 %	20 %	40 %	315500724
54	NC_014819	AAGCG	2	10	62244	62253	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014819	GCATG	2	10	62841	62850	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014819	CCCTA	2	10	63349	63358	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_014819	GCATG	2	10	66862	66871	20 %	20 %	40 %	20 %	315500732
58	NC_014819	GCGCG	2	10	68434	68443	0 %	0 %	60 %	40 %	315500732
59	NC_014819	TCCCT	2	10	69399	69408	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_014819	CCCCT	2	10	71451	71460	0 %	20 %	0 %	80 %	315500733
61	NC_014819	GCATG	2	10	71880	71889	20 %	20 %	40 %	20 %	315500734
62	NC_014819	TCACC	2	10	72619	72628	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_014819	AGGGG	2	10	73758	73767	20 %	0 %	80 %	0 %	315500736
64	NC_014819	TGAGC	2	10	76471	76480	20 %	20 %	40 %	20 %	315500738
65	NC_014819	GATGC	2	10	78394	78403	20 %	20 %	40 %	20 %	315500739
66	NC_014819	AATCA	2	10	79131	79140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014819	ATCGA	2	10	82850	82859	40 %	20 %	20 %	20 %	315500746
68	NC_014819	ACGGT	2	10	84280	84289	20 %	20 %	40 %	20 %	315500747
69	NC_014819	GGGGC	2	10	85975	85984	0 %	0 %	80 %	20 %	315500749
70	NC_014819	GGCCA	2	10	86739	86748	20 %	0 %	40 %	40 %	315500749
71	NC_014819	TGGCT	2	10	89843	89852	0 %	40 %	40 %	20 %	315500754
72	NC_014819	TGAGC	2	10	89940	89949	20 %	20 %	40 %	20 %	315500754
73	NC_014819	GCCGT	2	10	93769	93778	0 %	20 %	40 %	40 %	315500757
74	NC_014819	CGGGC	2	10	97664	97673	0 %	0 %	60 %	40 %	315500759
75	NC_014819	AAGGC	2	10	100922	100931	40 %	0 %	40 %	20 %	315500765
76	NC_014819	AGGCC	2	10	102587	102596	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014819	TGAGC	2	10	106449	106458	20 %	20 %	40 %	20 %	315500769
78	NC_014819	ATTCG	2	10	106820	106829	20 %	40 %	20 %	20 %	315500770
79	NC_014819	TGGGG	2	10	106961	106970	0 %	20 %	80 %	0 %	315500770
80	NC_014819	AATGG	2	10	107181	107190	40 %	20 %	40 %	0 %	315500770
81	NC_014819	AAAAC	2	10	112933	112942	80 %	0 %	0 %	20 %	315500774
82	NC_014819	CGATA	2	10	113880	113889	40 %	20 %	20 %	20 %	315500775
83	NC_014819	CGATC	2	10	114786	114795	20 %	20 %	20 %	40 %	315500776
84	NC_014819	CGGCC	2	10	115490	115499	0 %	0 %	40 %	60 %	315500777
85	NC_014819	CATTG	2	10	115740	115749	20 %	40 %	20 %	20 %	315500777
86	NC_014819	AAACA	2	10	118514	118523	80 %	0 %	0 %	20 %	315500778
87	NC_014819	ACCCG	2	10	119056	119065	20 %	0 %	20 %	60 %	315500779
88	NC_014819	GACGG	2	10	120616	120625	20 %	0 %	60 %	20 %	315500781
89	NC_014819	CGCGC	2	10	120741	120750	0 %	0 %	40 %	60 %	315500781
90	NC_014819	AAATT	2	10	123695	123704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014819	CCGGC	2	10	125557	125566	0 %	0 %	40 %	60 %	315500786
92	NC_014819	CTGGT	2	10	128914	128923	0 %	40 %	40 %	20 %	315500788
93	NC_014819	TCGTA	2	10	129019	129028	20 %	40 %	20 %	20 %	315500788
94	NC_014819	GCCAA	2	10	133617	133626	40 %	0 %	20 %	40 %	315500791
95	NC_014819	GGGGC	2	10	134842	134851	0 %	0 %	80 %	20 %	315500794
96	NC_014819	GGGAT	2	10	138032	138041	20 %	20 %	60 %	0 %	315500798
97	NC_014819	TGCCC	2	10	140070	140079	0 %	20 %	20 %	60 %	315500800
98	NC_014819	CGTGC	2	10	144940	144949	0 %	20 %	40 %	40 %	315500805
99	NC_014819	GCTTG	2	10	146412	146421	0 %	40 %	40 %	20 %	315500806
100	NC_014819	GGATC	2	10	153256	153265	20 %	20 %	40 %	20 %	315500812
101	NC_014819	TGGCC	2	10	156368	156377	0 %	20 %	40 %	40 %	315500813
102	NC_014819	TTCGC	2	10	158663	158672	0 %	40 %	20 %	40 %	315500816
103	NC_014819	TCGGC	2	10	158990	158999	0 %	20 %	40 %	40 %	315500816
104	NC_014819	CAACC	2	10	160054	160063	40 %	0 %	0 %	60 %	315500817
105	NC_014819	ATTAT	2	10	160308	160317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.