MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX02

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014819	AGCG	2	8	583	590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014819	CTTT	2	8	886	893	0 %	75 %	0 %	25 %	315500679
3	NC_014819	AGGG	2	8	906	913	25 %	0 %	75 %	0 %	315500679
4	NC_014819	GTTT	2	8	1396	1403	0 %	75 %	25 %	0 %	315500679
5	NC_014819	GTAT	2	8	3268	3275	25 %	50 %	25 %	0 %	315500679
6	NC_014819	ACCC	2	8	3349	3356	25 %	0 %	0 %	75 %	315500679
7	NC_014819	AGGC	2	8	4608	4615	25 %	0 %	50 %	25 %	315500679
8	NC_014819	TCGA	2	8	5033	5040	25 %	25 %	25 %	25 %	315500679
9	NC_014819	CGCT	2	8	5091	5098	0 %	25 %	25 %	50 %	315500679
10	NC_014819	AATT	2	8	5202	5209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014819	CGGA	2	8	5695	5702	25 %	0 %	50 %	25 %	315500680
12	NC_014819	CGGC	2	8	6263	6270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014819	CCGG	2	8	6643	6650	0 %	0 %	50 %	50 %	315500682
14	NC_014819	ACTG	2	8	6718	6725	25 %	25 %	25 %	25 %	315500682
15	NC_014819	AGCG	2	8	6728	6735	25 %	0 %	50 %	25 %	315500682
16	NC_014819	TCGA	2	8	7287	7294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014819	ATAA	2	8	7704	7711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014819	AGAT	2	8	8362	8369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014819	GACA	2	8	8623	8630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014819	CGGC	2	8	9497	9504	0 %	0 %	50 %	50 %	315500683
21	NC_014819	GCCA	2	8	9838	9845	25 %	0 %	25 %	50 %	315500684
22	NC_014819	AACC	2	8	10498	10505	50 %	0 %	0 %	50 %	315500684
23	NC_014819	ACCG	2	8	11023	11030	25 %	0 %	25 %	50 %	315500684
24	NC_014819	CGCT	2	8	11584	11591	0 %	25 %	25 %	50 %	315500684
25	NC_014819	CGGC	2	8	11727	11734	0 %	0 %	50 %	50 %	315500684
26	NC_014819	GCAG	2	8	11950	11957	25 %	0 %	50 %	25 %	315500684
27	NC_014819	GGCT	2	8	12191	12198	0 %	25 %	50 %	25 %	315500684
28	NC_014819	CGCC	2	8	12480	12487	0 %	0 %	25 %	75 %	315500684
29	NC_014819	TCCG	2	8	13758	13765	0 %	25 %	25 %	50 %	315500684
30	NC_014819	ACCT	2	8	14003	14010	25 %	25 %	0 %	50 %	315500684
31	NC_014819	ATTC	2	8	14296	14303	25 %	50 %	0 %	25 %	315500684
32	NC_014819	GGAG	2	8	14417	14424	25 %	0 %	75 %	0 %	315500685
33	NC_014819	TCCT	2	8	14569	14576	0 %	50 %	0 %	50 %	315500685
34	NC_014819	GGCC	2	8	14806	14813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014819	CGCA	2	8	15169	15176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014819	CTCA	2	8	15522	15529	25 %	25 %	0 %	50 %	315500686
37	NC_014819	GCTG	2	8	15602	15609	0 %	25 %	50 %	25 %	315500686
38	NC_014819	CCCG	2	8	15636	15643	0 %	0 %	25 %	75 %	315500686
39	NC_014819	CGTC	2	8	16530	16537	0 %	25 %	25 %	50 %	315500687
40	NC_014819	CCGG	2	8	16692	16699	0 %	0 %	50 %	50 %	315500687
41	NC_014819	TGCA	2	8	16897	16904	25 %	25 %	25 %	25 %	315500687
42	NC_014819	GCAA	2	8	17019	17026	50 %	0 %	25 %	25 %	315500687
43	NC_014819	TTTC	2	8	17116	17123	0 %	75 %	0 %	25 %	315500687
44	NC_014819	CGTC	2	8	17387	17394	0 %	25 %	25 %	50 %	315500687
45	NC_014819	GTTG	2	8	17991	17998	0 %	50 %	50 %	0 %	315500687
46	NC_014819	TCAT	2	8	18152	18159	25 %	50 %	0 %	25 %	315500687
47	NC_014819	CAGA	2	8	18793	18800	50 %	0 %	25 %	25 %	315500688
48	NC_014819	TCAG	2	8	19347	19354	25 %	25 %	25 %	25 %	315500689
49	NC_014819	CCGC	2	8	19503	19510	0 %	0 %	25 %	75 %	315500690
50	NC_014819	TGTC	2	8	19575	19582	0 %	50 %	25 %	25 %	315500690
51	NC_014819	ATCG	2	8	19741	19748	25 %	25 %	25 %	25 %	315500690
52	NC_014819	GTCG	2	8	20678	20685	0 %	25 %	50 %	25 %	315500691
53	NC_014819	GGTC	2	8	21091	21098	0 %	25 %	50 %	25 %	315500691
54	NC_014819	CGCC	2	8	21244	21251	0 %	0 %	25 %	75 %	315500691
55	NC_014819	CAGA	2	8	21851	21858	50 %	0 %	25 %	25 %	315500691
56	NC_014819	GAGC	2	8	22155	22162	25 %	0 %	50 %	25 %	315500692
57	NC_014819	CAAT	2	8	22337	22344	50 %	25 %	0 %	25 %	315500692
58	NC_014819	CGGA	2	8	22428	22435	25 %	0 %	50 %	25 %	315500693
59	NC_014819	GGCT	2	8	22899	22906	0 %	25 %	50 %	25 %	315500694
60	NC_014819	GACA	2	8	23836	23843	50 %	0 %	25 %	25 %	315500695
61	NC_014819	GCAG	2	8	23934	23941	25 %	0 %	50 %	25 %	315500695
62	NC_014819	TACG	2	8	26008	26015	25 %	25 %	25 %	25 %	315500698
63	NC_014819	TATC	2	8	26421	26428	25 %	50 %	0 %	25 %	315500698
64	NC_014819	TGGT	2	8	27116	27123	0 %	50 %	50 %	0 %	315500698
65	NC_014819	CTGA	2	8	27592	27599	25 %	25 %	25 %	25 %	315500698
66	NC_014819	AGCC	2	8	28207	28214	25 %	0 %	25 %	50 %	315500698
67	NC_014819	GTAG	2	8	28315	28322	25 %	25 %	50 %	0 %	315500698
68	NC_014819	TGGC	2	8	29321	29328	0 %	25 %	50 %	25 %	315500698
69	NC_014819	GCGA	2	8	29422	29429	25 %	0 %	50 %	25 %	315500698
70	NC_014819	GTAG	2	8	29512	29519	25 %	25 %	50 %	0 %	315500698
71	NC_014819	GCGG	2	8	30414	30421	0 %	0 %	75 %	25 %	315500699
72	NC_014819	GAAG	2	8	30558	30565	50 %	0 %	50 %	0 %	315500699
73	NC_014819	CGGA	2	8	30575	30582	25 %	0 %	50 %	25 %	315500699
74	NC_014819	GCCC	2	8	30752	30759	0 %	0 %	25 %	75 %	315500699
75	NC_014819	CAGC	2	8	30902	30909	25 %	0 %	25 %	50 %	315500699
76	NC_014819	CGGA	2	8	31212	31219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014819	GAAG	2	8	31361	31368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014819	TCCC	2	8	31678	31685	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_014819	TGGG	2	8	31921	31928	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014819	ACTG	2	8	33238	33245	25 %	25 %	25 %	25 %	315500700
81	NC_014819	CATT	2	8	33708	33715	25 %	50 %	0 %	25 %	315500701
82	NC_014819	CAAT	2	8	33985	33992	50 %	25 %	0 %	25 %	315500701
83	NC_014819	CATC	2	8	34088	34095	25 %	25 %	0 %	50 %	315500701
84	NC_014819	ATCC	3	12	34430	34441	25 %	25 %	0 %	50 %	315500702
85	NC_014819	CCTG	2	8	35721	35728	0 %	25 %	25 %	50 %	315500702
86	NC_014819	GTAA	2	8	37433	37440	50 %	25 %	25 %	0 %	315500703
87	NC_014819	GATC	2	8	37688	37695	25 %	25 %	25 %	25 %	315500703
88	NC_014819	TTCA	2	8	37755	37762	25 %	50 %	0 %	25 %	315500703
89	NC_014819	ACTT	2	8	37917	37924	25 %	50 %	0 %	25 %	315500703
90	NC_014819	ATCC	2	8	38318	38325	25 %	25 %	0 %	50 %	315500703
91	NC_014819	AAAT	2	8	38462	38469	75 %	25 %	0 %	0 %	315500703
92	NC_014819	TTAC	2	8	38503	38510	25 %	50 %	0 %	25 %	315500703
93	NC_014819	TGCG	2	8	38906	38913	0 %	25 %	50 %	25 %	315500704
94	NC_014819	GCGG	2	8	39020	39027	0 %	0 %	75 %	25 %	315500704
95	NC_014819	ATAG	2	8	39057	39064	50 %	25 %	25 %	0 %	315500704
96	NC_014819	GGGT	2	8	39274	39281	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014819	GAAC	2	8	39475	39482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014819	ACGT	2	8	40528	40535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014819	ACGA	2	8	41053	41060	50 %	0 %	25 %	25 %	315500705
100	NC_014819	GGCC	2	8	41299	41306	0 %	0 %	50 %	50 %	315500705
101	NC_014819	GCCG	2	8	42150	42157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014819	GATC	2	8	42228	42235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014819	CCGA	2	8	42746	42753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014819	GCCC	2	8	44608	44615	0 %	0 %	25 %	75 %	315500708
105	NC_014819	TGGG	2	8	44642	44649	0 %	25 %	75 %	0 %	315500708
106	NC_014819	CCAG	2	8	45197	45204	25 %	0 %	25 %	50 %	315500708
107	NC_014819	GTCA	2	8	45337	45344	25 %	25 %	25 %	25 %	315500708
108	NC_014819	ACCG	2	8	45872	45879	25 %	0 %	25 %	50 %	315500708
109	NC_014819	GCCC	2	8	46470	46477	0 %	0 %	25 %	75 %	315500709
110	NC_014819	ATGG	2	8	47838	47845	25 %	25 %	50 %	0 %	315500709
111	NC_014819	CGCC	2	8	48548	48555	0 %	0 %	25 %	75 %	315500709
112	NC_014819	TCCC	2	8	48883	48890	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_014819	ATCG	2	8	49847	49854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014819	CGAG	2	8	49958	49965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014819	AGTC	2	8	50429	50436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014819	CACT	2	8	50643	50650	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014819	AAGA	2	8	50690	50697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014819	CGAA	2	8	50735	50742	50 %	0 %	25 %	25 %	315500712
119	NC_014819	GGCC	2	8	51103	51110	0 %	0 %	50 %	50 %	315500713
120	NC_014819	GACA	2	8	52427	52434	50 %	0 %	25 %	25 %	315500715
121	NC_014819	TGAT	2	8	52691	52698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014819	GCCG	2	8	52767	52774	0 %	0 %	50 %	50 %	315500716
123	NC_014819	GCGA	2	8	52943	52950	25 %	0 %	50 %	25 %	315500716
124	NC_014819	TCAC	2	8	53038	53045	25 %	25 %	0 %	50 %	315500716
125	NC_014819	GATT	2	8	53151	53158	25 %	50 %	25 %	0 %	315500716
126	NC_014819	CAGA	2	8	53633	53640	50 %	0 %	25 %	25 %	315500717
127	NC_014819	TGGA	2	8	54135	54142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014819	CAGT	2	8	54449	54456	25 %	25 %	25 %	25 %	315500718
129	NC_014819	CCGG	2	8	54965	54972	0 %	0 %	50 %	50 %	315500719
130	NC_014819	TCGA	2	8	55172	55179	25 %	25 %	25 %	25 %	315500719
131	NC_014819	CGAA	2	8	55433	55440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014819	CCTG	2	8	55610	55617	0 %	25 %	25 %	50 %	315500720
133	NC_014819	TGTC	2	8	57001	57008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014819	GGCT	2	8	57014	57021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014819	CCGT	2	8	57124	57131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014819	ACGA	2	8	57273	57280	50 %	0 %	25 %	25 %	315500723
137	NC_014819	GGCC	2	8	57299	57306	0 %	0 %	50 %	50 %	315500723
138	NC_014819	CGCT	2	8	57483	57490	0 %	25 %	25 %	50 %	315500724
139	NC_014819	CTTC	2	8	58070	58077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014819	GGCA	2	8	58195	58202	25 %	0 %	50 %	25 %	315500725
141	NC_014819	GCTT	2	8	58430	58437	0 %	50 %	25 %	25 %	315500725
142	NC_014819	CCGG	2	8	59076	59083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014819	ACGA	2	8	59500	59507	50 %	0 %	25 %	25 %	315500727
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.