MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX02

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014819	AGCG	2	8	583	590	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014819	AATT	2	8	5202	5209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014819	CGGC	2	8	6263	6270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014819	TCGA	2	8	7287	7294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014819	ATAA	2	8	7704	7711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014819	AGAT	2	8	8362	8369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014819	GACA	2	8	8623	8630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014819	GGCC	2	8	14806	14813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014819	CGCA	2	8	15169	15176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014819	CGGA	2	8	31212	31219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014819	GAAG	2	8	31361	31368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014819	TCCC	2	8	31678	31685	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_014819	TGGG	2	8	31921	31928	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014819	GGGT	2	8	39274	39281	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014819	GAAC	2	8	39475	39482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014819	ACGT	2	8	40528	40535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014819	GCCG	2	8	42150	42157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014819	GATC	2	8	42228	42235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014819	CCGA	2	8	42746	42753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014819	TCCC	2	8	48883	48890	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_014819	ATCG	2	8	49847	49854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014819	CGAG	2	8	49958	49965	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014819	AGTC	2	8	50429	50436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014819	CACT	2	8	50643	50650	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014819	AAGA	2	8	50690	50697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014819	TGAT	2	8	52691	52698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014819	TGGA	2	8	54135	54142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014819	CGAA	2	8	55433	55440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014819	TGTC	2	8	57001	57008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014819	GGCT	2	8	57014	57021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014819	CCGT	2	8	57124	57131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014819	CTTC	2	8	58070	58077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014819	CCGG	2	8	59076	59083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014819	CGAC	2	8	63133	63140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014819	GGGT	2	8	63151	63158	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014819	GCCG	2	8	63388	63395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014819	AGCG	2	8	63408	63415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014819	CGAC	2	8	63553	63560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014819	CGGA	2	8	63991	63998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014819	TCCT	2	8	65070	65077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014819	GTTA	2	8	72926	72933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014819	GGGT	2	8	74227	74234	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014819	GGTG	2	8	74299	74306	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014819	GGTG	2	8	74381	74388	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014819	GGGT	2	8	74522	74529	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014819	GGGT	2	8	74650	74657	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014819	GGTG	2	8	74694	74701	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014819	GGTG	2	8	74748	74755	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014819	GAAA	2	8	74763	74770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014819	GTCG	2	8	76120	76127	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014819	ATAA	2	8	80029	80036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014819	TTCA	2	8	80122	80129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014819	TGTT	2	8	99971	99978	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014819	GAGT	2	8	102578	102585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014819	CTAT	2	8	102937	102944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014819	AGGA	2	8	103199	103206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014819	TCCG	2	8	114250	114257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014819	GGCG	2	8	122393	122400	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014819	CGGG	2	8	122848	122855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014819	CGAC	2	8	123209	123216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014819	CGCC	2	8	123296	123303	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_014819	GTTC	2	8	123446	123453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014819	CGGT	2	8	123545	123552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014819	TAGA	2	8	123976	123983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014819	TATC	2	8	124001	124008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014819	TCCG	2	8	124847	124854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014819	AGCC	2	8	133866	133873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014819	GGAT	2	8	136064	136071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014819	GGGT	2	8	137183	137190	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014819	CAAC	2	8	143549	143556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014819	AACG	2	8	143587	143594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014819	GACA	2	8	147761	147768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014819	CATC	2	8	148910	148917	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014819	CGTT	2	8	149548	149555	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014819	AGAC	2	8	159766	159773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014819	AATG	2	8	160253	160260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014819	AAGG	2	8	160330	160337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.