MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX02

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014819	CTTT	2	8	886	893	0 %	75 %	0 %	25 %	315500679
2	NC_014819	AGGG	2	8	906	913	25 %	0 %	75 %	0 %	315500679
3	NC_014819	GTTT	2	8	1396	1403	0 %	75 %	25 %	0 %	315500679
4	NC_014819	GTAT	2	8	3268	3275	25 %	50 %	25 %	0 %	315500679
5	NC_014819	ACCC	2	8	3349	3356	25 %	0 %	0 %	75 %	315500679
6	NC_014819	AGGC	2	8	4608	4615	25 %	0 %	50 %	25 %	315500679
7	NC_014819	TCGA	2	8	5033	5040	25 %	25 %	25 %	25 %	315500679
8	NC_014819	CGCT	2	8	5091	5098	0 %	25 %	25 %	50 %	315500679
9	NC_014819	CGGA	2	8	5695	5702	25 %	0 %	50 %	25 %	315500680
10	NC_014819	CCGG	2	8	6643	6650	0 %	0 %	50 %	50 %	315500682
11	NC_014819	ACTG	2	8	6718	6725	25 %	25 %	25 %	25 %	315500682
12	NC_014819	AGCG	2	8	6728	6735	25 %	0 %	50 %	25 %	315500682
13	NC_014819	CGGC	2	8	9497	9504	0 %	0 %	50 %	50 %	315500683
14	NC_014819	GCCA	2	8	9838	9845	25 %	0 %	25 %	50 %	315500684
15	NC_014819	AACC	2	8	10498	10505	50 %	0 %	0 %	50 %	315500684
16	NC_014819	ACCG	2	8	11023	11030	25 %	0 %	25 %	50 %	315500684
17	NC_014819	CGCT	2	8	11584	11591	0 %	25 %	25 %	50 %	315500684
18	NC_014819	CGGC	2	8	11727	11734	0 %	0 %	50 %	50 %	315500684
19	NC_014819	GCAG	2	8	11950	11957	25 %	0 %	50 %	25 %	315500684
20	NC_014819	GGCT	2	8	12191	12198	0 %	25 %	50 %	25 %	315500684
21	NC_014819	CGCC	2	8	12480	12487	0 %	0 %	25 %	75 %	315500684
22	NC_014819	TCCG	2	8	13758	13765	0 %	25 %	25 %	50 %	315500684
23	NC_014819	ACCT	2	8	14003	14010	25 %	25 %	0 %	50 %	315500684
24	NC_014819	ATTC	2	8	14296	14303	25 %	50 %	0 %	25 %	315500684
25	NC_014819	GGAG	2	8	14417	14424	25 %	0 %	75 %	0 %	315500685
26	NC_014819	TCCT	2	8	14569	14576	0 %	50 %	0 %	50 %	315500685
27	NC_014819	CTCA	2	8	15522	15529	25 %	25 %	0 %	50 %	315500686
28	NC_014819	GCTG	2	8	15602	15609	0 %	25 %	50 %	25 %	315500686
29	NC_014819	CCCG	2	8	15636	15643	0 %	0 %	25 %	75 %	315500686
30	NC_014819	CGTC	2	8	16530	16537	0 %	25 %	25 %	50 %	315500687
31	NC_014819	CCGG	2	8	16692	16699	0 %	0 %	50 %	50 %	315500687
32	NC_014819	TGCA	2	8	16897	16904	25 %	25 %	25 %	25 %	315500687
33	NC_014819	GCAA	2	8	17019	17026	50 %	0 %	25 %	25 %	315500687
34	NC_014819	TTTC	2	8	17116	17123	0 %	75 %	0 %	25 %	315500687
35	NC_014819	CGTC	2	8	17387	17394	0 %	25 %	25 %	50 %	315500687
36	NC_014819	GTTG	2	8	17991	17998	0 %	50 %	50 %	0 %	315500687
37	NC_014819	TCAT	2	8	18152	18159	25 %	50 %	0 %	25 %	315500687
38	NC_014819	CAGA	2	8	18793	18800	50 %	0 %	25 %	25 %	315500688
39	NC_014819	TCAG	2	8	19347	19354	25 %	25 %	25 %	25 %	315500689
40	NC_014819	CCGC	2	8	19503	19510	0 %	0 %	25 %	75 %	315500690
41	NC_014819	TGTC	2	8	19575	19582	0 %	50 %	25 %	25 %	315500690
42	NC_014819	ATCG	2	8	19741	19748	25 %	25 %	25 %	25 %	315500690
43	NC_014819	GTCG	2	8	20678	20685	0 %	25 %	50 %	25 %	315500691
44	NC_014819	GGTC	2	8	21091	21098	0 %	25 %	50 %	25 %	315500691
45	NC_014819	CGCC	2	8	21244	21251	0 %	0 %	25 %	75 %	315500691
46	NC_014819	CAGA	2	8	21851	21858	50 %	0 %	25 %	25 %	315500691
47	NC_014819	GAGC	2	8	22155	22162	25 %	0 %	50 %	25 %	315500692
48	NC_014819	CAAT	2	8	22337	22344	50 %	25 %	0 %	25 %	315500692
49	NC_014819	CGGA	2	8	22428	22435	25 %	0 %	50 %	25 %	315500693
50	NC_014819	GGCT	2	8	22899	22906	0 %	25 %	50 %	25 %	315500694
51	NC_014819	GACA	2	8	23836	23843	50 %	0 %	25 %	25 %	315500695
52	NC_014819	GCAG	2	8	23934	23941	25 %	0 %	50 %	25 %	315500695
53	NC_014819	TACG	2	8	26008	26015	25 %	25 %	25 %	25 %	315500698
54	NC_014819	TATC	2	8	26421	26428	25 %	50 %	0 %	25 %	315500698
55	NC_014819	TGGT	2	8	27116	27123	0 %	50 %	50 %	0 %	315500698
56	NC_014819	CTGA	2	8	27592	27599	25 %	25 %	25 %	25 %	315500698
57	NC_014819	AGCC	2	8	28207	28214	25 %	0 %	25 %	50 %	315500698
58	NC_014819	GTAG	2	8	28315	28322	25 %	25 %	50 %	0 %	315500698
59	NC_014819	TGGC	2	8	29321	29328	0 %	25 %	50 %	25 %	315500698
60	NC_014819	GCGA	2	8	29422	29429	25 %	0 %	50 %	25 %	315500698
61	NC_014819	GTAG	2	8	29512	29519	25 %	25 %	50 %	0 %	315500698
62	NC_014819	GCGG	2	8	30414	30421	0 %	0 %	75 %	25 %	315500699
63	NC_014819	GAAG	2	8	30558	30565	50 %	0 %	50 %	0 %	315500699
64	NC_014819	CGGA	2	8	30575	30582	25 %	0 %	50 %	25 %	315500699
65	NC_014819	GCCC	2	8	30752	30759	0 %	0 %	25 %	75 %	315500699
66	NC_014819	CAGC	2	8	30902	30909	25 %	0 %	25 %	50 %	315500699
67	NC_014819	ACTG	2	8	33238	33245	25 %	25 %	25 %	25 %	315500700
68	NC_014819	CATT	2	8	33708	33715	25 %	50 %	0 %	25 %	315500701
69	NC_014819	CAAT	2	8	33985	33992	50 %	25 %	0 %	25 %	315500701
70	NC_014819	CATC	2	8	34088	34095	25 %	25 %	0 %	50 %	315500701
71	NC_014819	ATCC	3	12	34430	34441	25 %	25 %	0 %	50 %	315500702
72	NC_014819	CCTG	2	8	35721	35728	0 %	25 %	25 %	50 %	315500702
73	NC_014819	GTAA	2	8	37433	37440	50 %	25 %	25 %	0 %	315500703
74	NC_014819	GATC	2	8	37688	37695	25 %	25 %	25 %	25 %	315500703
75	NC_014819	TTCA	2	8	37755	37762	25 %	50 %	0 %	25 %	315500703
76	NC_014819	ACTT	2	8	37917	37924	25 %	50 %	0 %	25 %	315500703
77	NC_014819	ATCC	2	8	38318	38325	25 %	25 %	0 %	50 %	315500703
78	NC_014819	AAAT	2	8	38462	38469	75 %	25 %	0 %	0 %	315500703
79	NC_014819	TTAC	2	8	38503	38510	25 %	50 %	0 %	25 %	315500703
80	NC_014819	TGCG	2	8	38906	38913	0 %	25 %	50 %	25 %	315500704
81	NC_014819	GCGG	2	8	39020	39027	0 %	0 %	75 %	25 %	315500704
82	NC_014819	ATAG	2	8	39057	39064	50 %	25 %	25 %	0 %	315500704
83	NC_014819	ACGA	2	8	41053	41060	50 %	0 %	25 %	25 %	315500705
84	NC_014819	GGCC	2	8	41299	41306	0 %	0 %	50 %	50 %	315500705
85	NC_014819	GCCC	2	8	44608	44615	0 %	0 %	25 %	75 %	315500708
86	NC_014819	TGGG	2	8	44642	44649	0 %	25 %	75 %	0 %	315500708
87	NC_014819	CCAG	2	8	45197	45204	25 %	0 %	25 %	50 %	315500708
88	NC_014819	GTCA	2	8	45337	45344	25 %	25 %	25 %	25 %	315500708
89	NC_014819	ACCG	2	8	45872	45879	25 %	0 %	25 %	50 %	315500708
90	NC_014819	GCCC	2	8	46470	46477	0 %	0 %	25 %	75 %	315500709
91	NC_014819	ATGG	2	8	47838	47845	25 %	25 %	50 %	0 %	315500709
92	NC_014819	CGCC	2	8	48548	48555	0 %	0 %	25 %	75 %	315500709
93	NC_014819	CGAA	2	8	50735	50742	50 %	0 %	25 %	25 %	315500712
94	NC_014819	GGCC	2	8	51103	51110	0 %	0 %	50 %	50 %	315500713
95	NC_014819	GACA	2	8	52427	52434	50 %	0 %	25 %	25 %	315500715
96	NC_014819	GCCG	2	8	52767	52774	0 %	0 %	50 %	50 %	315500716
97	NC_014819	GCGA	2	8	52943	52950	25 %	0 %	50 %	25 %	315500716
98	NC_014819	TCAC	2	8	53038	53045	25 %	25 %	0 %	50 %	315500716
99	NC_014819	GATT	2	8	53151	53158	25 %	50 %	25 %	0 %	315500716
100	NC_014819	CAGA	2	8	53633	53640	50 %	0 %	25 %	25 %	315500717
101	NC_014819	CAGT	2	8	54449	54456	25 %	25 %	25 %	25 %	315500718
102	NC_014819	CCGG	2	8	54965	54972	0 %	0 %	50 %	50 %	315500719
103	NC_014819	TCGA	2	8	55172	55179	25 %	25 %	25 %	25 %	315500719
104	NC_014819	CCTG	2	8	55610	55617	0 %	25 %	25 %	50 %	315500720
105	NC_014819	ACGA	2	8	57273	57280	50 %	0 %	25 %	25 %	315500723
106	NC_014819	GGCC	2	8	57299	57306	0 %	0 %	50 %	50 %	315500723
107	NC_014819	CGCT	2	8	57483	57490	0 %	25 %	25 %	50 %	315500724
108	NC_014819	GGCA	2	8	58195	58202	25 %	0 %	50 %	25 %	315500725
109	NC_014819	GCTT	2	8	58430	58437	0 %	50 %	25 %	25 %	315500725
110	NC_014819	ACGA	2	8	59500	59507	50 %	0 %	25 %	25 %	315500727
111	NC_014819	ACAA	2	8	59738	59745	75 %	0 %	0 %	25 %	315500727
112	NC_014819	GATG	2	8	59964	59971	25 %	25 %	50 %	0 %	315500728
113	NC_014819	CAAG	2	8	60026	60033	50 %	0 %	25 %	25 %	315500728
114	NC_014819	GGAT	2	8	60127	60134	25 %	25 %	50 %	0 %	315500728
115	NC_014819	ACGA	2	8	60204	60211	50 %	0 %	25 %	25 %	315500728
116	NC_014819	TTGG	2	8	61307	61314	0 %	50 %	50 %	0 %	315500729
117	NC_014819	AACG	2	8	61378	61385	50 %	0 %	25 %	25 %	315500729
118	NC_014819	GCCA	2	8	63598	63605	25 %	0 %	25 %	50 %	315500730
119	NC_014819	GCTT	2	8	63607	63614	0 %	50 %	25 %	25 %	315500730
120	NC_014819	CTCA	2	8	63618	63625	25 %	25 %	0 %	50 %	315500730
121	NC_014819	CATG	2	8	64836	64843	25 %	25 %	25 %	25 %	315500731
122	NC_014819	TTCA	2	8	65029	65036	25 %	50 %	0 %	25 %	315500731
123	NC_014819	CGGA	2	8	65295	65302	25 %	0 %	50 %	25 %	315500732
124	NC_014819	GATA	2	8	65692	65699	50 %	25 %	25 %	0 %	315500732
125	NC_014819	GCCG	2	8	65978	65985	0 %	0 %	50 %	50 %	315500732
126	NC_014819	GTCG	2	8	66368	66375	0 %	25 %	50 %	25 %	315500732
127	NC_014819	TGGT	2	8	66405	66412	0 %	50 %	50 %	0 %	315500732
128	NC_014819	GCTG	2	8	67099	67106	0 %	25 %	50 %	25 %	315500732
129	NC_014819	TTCG	2	8	67875	67882	0 %	50 %	25 %	25 %	315500732
130	NC_014819	TGGC	2	8	68109	68116	0 %	25 %	50 %	25 %	315500732
131	NC_014819	CGAT	2	8	68505	68512	25 %	25 %	25 %	25 %	315500732
132	NC_014819	CCCG	2	8	68867	68874	0 %	0 %	25 %	75 %	315500732
133	NC_014819	GCCG	2	8	68906	68913	0 %	0 %	50 %	50 %	315500732
134	NC_014819	CCGG	2	8	68935	68942	0 %	0 %	50 %	50 %	315500732
135	NC_014819	CCTC	2	8	69474	69481	0 %	25 %	0 %	75 %	315500733
136	NC_014819	AGGT	2	8	70849	70856	25 %	25 %	50 %	0 %	315500733
137	NC_014819	GGAC	2	8	71078	71085	25 %	0 %	50 %	25 %	315500733
138	NC_014819	CGAC	2	8	71118	71125	25 %	0 %	25 %	50 %	315500733
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140	NC_014819	GGAC	2	8	71971	71978	25 %	0 %	50 %	25 %	315500734
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.