MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX01

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014818	GGCCCC	2	12	323	334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315500505
2	NC_014818	CGCCGA	2	12	5304	5315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500509
3	NC_014818	CGCAGG	2	12	7704	7715	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315500511
4	NC_014818	AGGCTG	2	12	20783	20794	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315500520
5	NC_014818	GCCAGA	2	12	22087	22098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315500521
6	NC_014818	GCTGGC	2	12	22411	22422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315500522
7	NC_014818	GCGCGA	2	12	23873	23884	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315500523
8	NC_014818	AGCCGA	2	12	24337	24348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315500524
9	NC_014818	CGGCCC	2	12	29020	29031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315500527
10	NC_014818	ACCCCG	2	12	29629	29640	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315500528
11	NC_014818	GAAATA	2	12	31488	31499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315500529
12	NC_014818	CTGCGC	2	12	36216	36227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500532
13	NC_014818	TGCCGG	2	12	38604	38615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315500533
14	NC_014818	GCTTTA	2	12	38963	38974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315500534
15	NC_014818	CTTTTC	2	12	48786	48797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315500538
16	NC_014818	CCGAAG	3	18	49582	49599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315500539
17	NC_014818	CAAGGG	2	12	49676	49687	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315500539
18	NC_014818	GGCCTC	2	12	55964	55975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500545
19	NC_014818	GCCGAA	2	12	57145	57156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315500546
20	NC_014818	CCGCAT	2	12	57297	57308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500546
21	NC_014818	CCCGCA	2	12	58458	58469	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315500547
22	NC_014818	CGTCTG	2	12	58953	58964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500547
23	NC_014818	AAACCC	2	12	60530	60541	50 %	0 %	0 %	50 %	315500548
24	NC_014818	GGTGCA	2	12	61868	61879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315500549
25	NC_014818	TGACGA	2	12	63568	63579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500550
26	NC_014818	TGGTAG	2	12	64175	64186	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315500551
27	NC_014818	TCGGCT	2	12	64394	64405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500551
28	NC_014818	ATCAGC	2	12	66761	66772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315500553
29	NC_014818	TCCAGC	2	12	70565	70576	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500556
30	NC_014818	TGAAGC	2	12	72546	72557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500556
31	NC_014818	GATGAC	2	12	73993	74004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500558
32	NC_014818	TGGTGA	2	12	79142	79153	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315500562
33	NC_014818	ACCGGC	2	12	81174	81185	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500563
34	NC_014818	GCCAGC	2	12	86395	86406	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500568
35	NC_014818	CTTGGC	2	12	90022	90033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500570
36	NC_014818	GTCGAA	2	12	94395	94406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500572
37	NC_014818	TGCGGC	2	12	97652	97663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315500573
38	NC_014818	AGATCG	2	12	99881	99892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500575
39	NC_014818	CAACCC	2	12	100433	100444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315500575
40	NC_014818	CCAGCG	2	12	103293	103304	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500577
41	NC_014818	GTTGAC	2	12	107538	107549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500578
42	NC_014818	AGGTCA	2	12	108331	108342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500578
43	NC_014818	GGCCAC	2	12	108384	108395	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500578
44	NC_014818	TCGGCC	2	12	110941	110952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500579
45	NC_014818	TGTGCC	2	12	116181	116192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500581
46	NC_014818	CGCTGA	2	12	118229	118240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315500581
47	NC_014818	TTCGAT	2	12	118792	118803	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315500581
48	NC_014818	AGGCGC	2	12	120874	120885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315500582
49	NC_014818	CCTGAC	2	12	122757	122768	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500583
50	NC_014818	CCTACT	2	12	128340	128351	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	315500586
51	NC_014818	ACCTGC	2	12	130433	130444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500587
52	NC_014818	TCATAG	2	12	131219	131230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315500588
53	NC_014818	ACCTCG	2	12	132659	132670	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500588
54	NC_014818	GGCCGC	2	12	133870	133881	0 %	0 %	50 %	50 %	315500588
55	NC_014818	TTGCCG	2	12	136794	136805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500591
56	NC_014818	TCCAGT	2	12	137176	137187	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315500591
57	NC_014818	GCTGGC	2	12	148524	148535	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315500596
58	NC_014818	ATCAAT	2	12	150373	150384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315500597
59	NC_014818	CCTGAC	2	12	150849	150860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500597
60	NC_014818	ATAGGC	2	12	155246	155257	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500600
61	NC_014818	CGGAGG	2	12	157815	157826	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	315500602
62	NC_014818	GACCCT	2	12	160530	160541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500603
63	NC_014818	CCCTGT	2	12	161655	161666	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315500604
64	NC_014818	GGATCG	2	12	162732	162743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315500605
65	NC_014818	CCCGAC	2	12	165008	165019	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315500606
66	NC_014818	AGGCCC	2	12	166826	166837	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500608
67	NC_014818	CCAGCG	2	12	169858	169869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315500610
68	NC_014818	TAACGC	2	12	170122	170133	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315500610
69	NC_014818	CGGGCG	2	12	171906	171917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315500611
70	NC_014818	GGCAAA	2	12	173932	173943	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	315500612
71	NC_014818	CTTCGG	2	12	175933	175944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315500613
72	NC_014818	GATGTC	2	12	180134	180145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500614
73	NC_014818	AGGCGA	2	12	180721	180732	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315500614
74	NC_014818	GGCTGC	2	12	180823	180834	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315500614
75	NC_014818	GGCATA	2	12	180932	180943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500614
76	NC_014818	CGCGGG	2	12	181057	181068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315500614
77	NC_014818	TCGGCC	2	12	181080	181091	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500614
78	NC_014818	TGGATC	2	12	182282	182293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500615
79	NC_014818	GGTCAT	2	12	185436	185447	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500616
80	NC_014818	CAAAGG	2	12	190055	190066	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	315500623
81	NC_014818	GCAATG	2	12	194812	194823	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315500631
82	NC_014818	CGATCT	2	12	200781	200792	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315500635
83	NC_014818	GCCGAT	2	12	201559	201570	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315500635
84	NC_014818	TAAGCT	2	12	211215	211226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315500646
85	NC_014818	GAAGGT	2	12	216850	216861	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	315500650
86	NC_014818	ACCGAC	2	12	216893	216904	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315500650
87	NC_014818	CGCTCT	2	12	219737	219748	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315500652
88	NC_014818	GCTTGA	2	12	226567	226578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315500658
89	NC_014818	CCACCG	2	12	229456	229467	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315500662
90	NC_014818	CCTGAC	2	12	232034	232045	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315500664
91	NC_014818	AGGCTC	2	12	236722	236733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315500665
92	NC_014818	GGCCTC	2	12	239747	239758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315500671
93	NC_014818	CTGTGG	2	12	241921	241932	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315500674

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.