MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 plasmid pASTEX01

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014818	CACG	2	8	52	59	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014818	CATC	2	8	5513	5520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014818	TTTG	2	8	10691	10698	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014818	CACG	2	8	10729	10736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014818	CTTT	2	8	12886	12893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014818	CAAG	2	8	20060	20067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014818	GAAA	3	12	21454	21465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014818	TAAG	2	8	21522	21529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014818	ACAA	2	8	32237	32244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014818	CGCA	2	8	36525	36532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014818	GAGG	2	8	42455	42462	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014818	GCAC	2	8	42625	42632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014818	ACGA	2	8	44438	44445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014818	ATCT	2	8	44672	44679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014818	TCAC	2	8	44739	44746	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014818	CCAT	2	8	44816	44823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014818	CGTT	2	8	44944	44951	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014818	GCCG	2	8	46325	46332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014818	CGGA	2	8	46530	46537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014818	AATG	2	8	46602	46609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014818	CGTC	2	8	46837	46844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014818	CCGA	2	8	47600	47607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014818	ATTC	2	8	53960	53967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014818	CATT	2	8	56804	56811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014818	TCAT	2	8	57072	57079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014818	GTGG	2	8	60919	60926	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014818	AATA	2	8	69485	69492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014818	AAGT	2	8	82376	82383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014818	ATAA	2	8	82562	82569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014818	TTTA	2	8	84145	84152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014818	CGGC	2	8	84231	84238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014818	CGGG	2	8	84251	84258	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014818	CCGG	2	8	102502	102509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014818	TCAC	2	8	102582	102589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014818	TCAA	2	8	113118	113125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014818	CTGA	2	8	113369	113376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014818	CTTT	2	8	122934	122941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014818	AATA	2	8	125642	125649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014818	CACC	2	8	125953	125960	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_014818	ACTG	2	8	129194	129201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014818	AAAC	2	8	129328	129335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014818	TTGG	2	8	134081	134088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014818	CAGA	2	8	144278	144285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014818	CGAG	2	8	151680	151687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014818	TTGG	2	8	152654	152661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014818	GGCG	2	8	152687	152694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014818	TGAC	2	8	153693	153700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014818	GCTG	2	8	156780	156787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014818	TCCG	2	8	157118	157125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014818	GTCA	2	8	157135	157142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014818	GCGA	2	8	160740	160747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014818	CCTT	2	8	161957	161964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014818	TTCA	2	8	162222	162229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014818	TAGA	2	8	163899	163906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014818	CCGG	2	8	164065	164072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014818	TCGA	2	8	164080	164087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014818	CGAA	2	8	169276	169283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014818	AGCA	2	8	170568	170575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014818	CACC	2	8	177833	177840	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_014818	GTCG	2	8	178009	178016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014818	ATTG	2	8	178821	178828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014818	TCGC	2	8	178897	178904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014818	AAGA	2	8	179008	179015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014818	GAAA	2	8	186855	186862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014818	AGAT	2	8	192969	192976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014818	AAAT	2	8	193121	193128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014818	ATTT	3	12	193693	193704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014818	CAGG	2	8	195428	195435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014818	GCTA	2	8	204026	204033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014818	TGCC	2	8	204274	204281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014818	CCGT	2	8	204793	204800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014818	CATC	2	8	204858	204865	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014818	TCTG	2	8	206086	206093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014818	CCTG	2	8	210919	210926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014818	AGCG	2	8	214032	214039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014818	ATCC	2	8	218141	218148	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014818	TTAT	2	8	226114	226121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014818	GGAC	2	8	226828	226835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.