MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 chromosome 2

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014817	GGACG	2	10	6640	6649	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014817	TTGCC	2	10	10289	10298	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014817	CCGAT	2	10	22902	22911	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014817	GTTAT	2	10	29776	29785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014817	ATTTT	2	10	44325	44334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014817	TATAA	2	10	45897	45906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014817	GAGGC	2	10	50422	50431	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014817	CAGCT	2	10	53270	53279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014817	TCAGG	2	10	64959	64968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014817	TCGGC	2	10	71521	71530	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014817	CGGCG	2	10	71841	71850	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014817	CCTTT	2	10	91485	91494	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014817	TGGGG	2	10	102784	102793	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014817	AGGGA	2	10	149697	149706	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014817	TCGTG	2	10	150909	150918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014817	AGAGG	2	10	165904	165913	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014817	AGGAG	2	10	177419	177428	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014817	CAACG	2	10	185091	185100	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014817	GCGGG	2	10	185632	185641	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014817	TTGCA	2	10	185721	185730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014817	TCGCG	2	10	187189	187198	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014817	CGATC	2	10	191792	191801	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014817	TTGCA	2	10	191850	191859	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014817	GGCGA	2	10	195369	195378	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014817	TCTCC	2	10	211814	211823	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_014817	TTTTC	2	10	218873	218882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014817	CGGGA	2	10	243025	243034	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014817	GCGAT	2	10	243251	243260	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014817	TTGCG	2	10	249102	249111	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014817	CTTGC	2	10	275466	275475	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014817	CTTTT	2	10	286274	286283	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014817	TCCGA	2	10	293924	293933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014817	TCGTT	2	10	297421	297430	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014817	TGTGT	2	10	297715	297724	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014817	CGCGG	2	10	308516	308525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014817	TCTGA	2	10	313859	313868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014817	TGATC	2	10	318332	318341	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014817	GCGCA	2	10	319499	319508	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014817	GTAAA	2	10	329934	329943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014817	AGCGA	2	10	359635	359644	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014817	TAATT	2	10	365943	365952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014817	TAAAA	2	10	366002	366011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014817	TTTTC	2	10	370572	370581	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014817	AATCA	2	10	372988	372997	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014817	TGCGG	2	10	374340	374349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014817	TGAAC	2	10	375913	375922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014817	TAAAA	2	10	382700	382709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014817	AAGGG	2	10	409226	409235	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014817	GTGCT	2	10	414805	414814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014817	AATCG	2	10	422472	422481	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014817	AAAGG	2	10	427498	427507	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014817	GCGCA	2	10	451177	451186	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014817	AAGCG	2	10	455597	455606	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014817	CCGGC	2	10	459151	459160	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_014817	GCCCG	2	10	469886	469895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_014817	CGCGT	2	10	478438	478447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014817	GCGCG	2	10	479157	479166	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014817	TTTAA	2	10	494694	494703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014817	GAGGT	2	10	504875	504884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014817	AGCGA	2	10	506484	506493	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014817	GAAAG	2	10	509653	509662	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014817	TCAAA	2	10	509706	509715	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014817	CTGAT	2	10	541983	541992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014817	CCTTG	2	10	562763	562772	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014817	CTTTT	2	10	596197	596206	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014817	TTTTG	2	10	613998	614007	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014817	CGCCT	2	10	649963	649972	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_014817	CTTTT	2	10	686287	686296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014817	GTTCC	2	10	686465	686474	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014817	AAGCG	2	10	702848	702857	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014817	GACCG	2	10	704125	704134	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014817	AAAAG	2	10	704858	704867	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014817	CTTTT	2	10	704888	704897	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014817	TAAGT	2	10	706968	706977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014817	GCTTC	2	10	719706	719715	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014817	CACTG	2	10	722349	722358	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014817	CCATC	2	10	724906	724915	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014817	CTGCG	2	10	739448	739457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014817	GCCCT	2	10	740904	740913	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014817	CTGTT	2	10	746286	746295	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014817	ACCGT	2	10	749915	749924	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014817	ACAAA	2	10	779878	779887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014817	AATGA	2	10	786784	786793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014817	TCAGA	2	10	803800	803809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014817	GGCCC	2	10	811465	811474	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_014817	CCCCT	2	10	817598	817607	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
87	NC_014817	AGGGG	2	10	817614	817623	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014817	TCTTT	2	10	837256	837265	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014817	TCTCA	2	10	848635	848644	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014817	GCAGC	2	10	854377	854386	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014817	GCTGC	2	10	859833	859842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014817	CCCAC	2	10	865158	865167	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
93	NC_014817	ATGCT	2	10	881270	881279	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014817	CCCCG	2	10	884289	884298	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
95	NC_014817	ATTTC	2	10	893785	893794	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014817	TGAAA	2	10	893844	893853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014817	ATTCA	2	10	894362	894371	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014817	ATCCG	2	10	896064	896073	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014817	GCATG	2	10	901567	901576	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014817	TCCGA	2	10	962960	962969	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014817	TCAGC	2	10	977537	977546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014817	CTGTC	2	10	999924	999933	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014817	GCGCC	2	10	1063140	1063149	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_014817	TCTGA	2	10	1070108	1070117	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014817	CACGA	2	10	1074507	1074516	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014817	TCCCT	2	10	1075719	1075728	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014817	CGAAG	2	10	1080190	1080199	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014817	AATAA	2	10	1099030	1099039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014817	GCGCG	2	10	1106577	1106586	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014817	GACTT	2	10	1110840	1110849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014817	GAGTC	2	10	1111841	1111850	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014817	CGTCA	2	10	1113108	1113117	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014817	TAGCC	2	10	1116153	1116162	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014817	CGACT	2	10	1116481	1116490	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014817	GATCT	2	10	1139737	1139746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014817	TTTGA	2	10	1139769	1139778	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014817	TTAGA	2	10	1160424	1160433	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014817	GATGG	2	10	1174537	1174546	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014817	GGGAG	2	10	1174702	1174711	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014817	GGTCT	2	10	1179725	1179734	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014817	ATGCA	2	10	1197234	1197243	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014817	GGCGC	2	10	1259648	1259657	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014817	GGCGG	2	10	1277654	1277663	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014817	CAAAA	2	10	1277667	1277676	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014817	GCATT	2	10	1288736	1288745	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014817	CCTGT	2	10	1306277	1306286	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.