MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 chromosome 1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014816	TTCGCC	2	12	81766	81777	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014816	ATTAGT	2	12	81990	82001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014816	CTGCAC	2	12	103418	103429	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014816	CAAGTT	2	12	123640	123651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014816	GGCCGG	2	12	142024	142035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014816	CAAAAG	2	12	158994	159005	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014816	CACCAA	2	12	166746	166757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014816	GCTTCT	2	12	277919	277930	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014816	GGTTTC	2	12	308797	308808	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014816	ACCTAC	2	12	364248	364259	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014816	CGTGAT	2	12	389565	389576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014816	GAGGGG	2	12	489075	489086	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014816	GTGGGG	2	12	495482	495493	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014816	CCCGCG	2	12	533965	533976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014816	CGCAAA	2	12	540873	540884	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014816	GAAAAA	2	12	552811	552822	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014816	TCCGGG	2	12	557411	557422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014816	GGTGGC	2	12	561421	561432	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014816	CGGCAT	2	12	568601	568612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014816	GGTTTT	2	12	589744	589755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014816	ATCACT	2	12	622089	622100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014816	GCCCGC	2	12	635651	635662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014816	GGTGTT	2	12	705610	705621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014816	ATAAAA	2	12	739014	739025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014816	GATGGT	2	12	765228	765239	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014816	GAGCGT	2	12	765602	765613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014816	GGCGCC	2	12	796050	796061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014816	TGGGGG	2	12	859542	859553	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014816	CTTTTT	2	12	880088	880099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014816	GCGTGT	2	12	889200	889211	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014816	TTGCCG	2	12	907406	907417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014816	CTGACC	2	12	915444	915455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014816	CGCCCG	2	12	923467	923478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014816	ACGGGG	2	12	987385	987396	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014816	GCGTCA	2	12	987689	987700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014816	GCTCTT	2	12	1027415	1027426	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014816	GCAAAT	2	12	1113164	1113175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014816	GATCCA	2	12	1119296	1119307	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014816	AGACGC	2	12	1141490	1141501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014816	GGCTTA	2	12	1147215	1147226	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014816	CTCCCT	2	12	1253919	1253930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014816	GCCTTC	2	12	1254751	1254762	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014816	CCGCAC	2	12	1345420	1345431	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014816	CCTCCA	2	12	1432685	1432696	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014816	CTGCCG	2	12	1438658	1438669	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014816	CCCCCT	2	12	1592787	1592798	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
47	NC_014816	CATTAA	2	12	1753041	1753052	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014816	TCCTGA	2	12	1784294	1784305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014816	CAAACG	2	12	1805462	1805473	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014816	CTTTGA	2	12	1834073	1834084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014816	GCTAAC	2	12	1846880	1846891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014816	CCCTCC	2	12	1914962	1914973	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
53	NC_014816	AAAGCC	2	12	2028774	2028785	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014816	CGTCAT	2	12	2142480	2142491	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014816	AAACGC	2	12	2150697	2150708	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014816	CGAAAG	2	12	2235569	2235580	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014816	AATAAA	2	12	2241604	2241615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014816	GATATA	2	12	2243042	2243053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014816	CCGGTT	2	12	2261648	2261659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014816	CATAGC	2	12	2263191	2263202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014816	ACGCTT	2	12	2284858	2284869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014816	GATCAG	2	12	2365693	2365704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014816	ATTTTT	2	12	2368207	2368218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014816	AGCGTA	2	12	2382192	2382203	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014816	ACGTAC	2	12	2480118	2480129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014816	AAGCTT	2	12	2512998	2513009	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014816	GAACGC	2	12	2562815	2562826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014816	TTTCTG	2	12	2572355	2572366	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.