MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Asticcacaulis excentricus CB 48 chromosome 1

Total Repeats: 1601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014816	GGCTG	2	10	2384226	2384235	0 %	20 %	60 %	20 %	315499200
1502	NC_014816	ATTAT	2	10	2385116	2385125	40 %	60 %	0 %	0 %	315499203
1503	NC_014816	CGGCG	2	10	2387773	2387782	0 %	0 %	60 %	40 %	315499206
1504	NC_014816	AAAAG	2	10	2389059	2389068	80 %	0 %	20 %	0 %	315499207
1505	NC_014816	TAAGA	2	10	2389748	2389757	60 %	20 %	20 %	0 %	315499208
1506	NC_014816	ATCCA	2	10	2392543	2392552	40 %	20 %	0 %	40 %	315499210
1507	NC_014816	AAGGC	2	10	2396486	2396495	40 %	0 %	40 %	20 %	315499216
1508	NC_014816	TTGCC	2	10	2399084	2399093	0 %	40 %	20 %	40 %	315499218
1509	NC_014816	CGAGC	2	10	2402740	2402749	20 %	0 %	40 %	40 %	315499222
1510	NC_014816	GGTCG	2	10	2407034	2407043	0 %	20 %	60 %	20 %	315499225
1511	NC_014816	CAACG	2	10	2407217	2407226	40 %	0 %	20 %	40 %	315499225
1512	NC_014816	CGGCG	2	10	2409165	2409174	0 %	0 %	60 %	40 %	315499227
1513	NC_014816	CCCCG	2	10	2410830	2410839	0 %	0 %	20 %	80 %	315499228
1514	NC_014816	ATTGG	2	10	2411946	2411955	20 %	40 %	40 %	0 %	315499228
1515	NC_014816	GCGAG	2	10	2417130	2417139	20 %	0 %	60 %	20 %	315499234
1516	NC_014816	CAATC	2	10	2418706	2418715	40 %	20 %	0 %	40 %	315499234
1517	NC_014816	TGCGG	2	10	2421025	2421034	0 %	20 %	60 %	20 %	315499235
1518	NC_014816	GATCC	2	10	2426974	2426983	20 %	20 %	20 %	40 %	315499240
1519	NC_014816	TCACC	2	10	2427002	2427011	20 %	20 %	0 %	60 %	315499240
1520	NC_014816	GCGCC	2	10	2427836	2427845	0 %	0 %	40 %	60 %	315499240
1521	NC_014816	AGGAG	2	10	2428827	2428836	40 %	0 %	60 %	0 %	315499241
1522	NC_014816	GTCGT	2	10	2429218	2429227	0 %	40 %	40 %	20 %	315499242
1523	NC_014816	CGGTG	2	10	2431907	2431916	0 %	20 %	60 %	20 %	315499245
1524	NC_014816	GCCTT	2	10	2432608	2432617	0 %	40 %	20 %	40 %	315499245
1525	NC_014816	GCGAA	2	10	2434001	2434010	40 %	0 %	40 %	20 %	315499246
1526	NC_014816	ATCGC	2	10	2439144	2439153	20 %	20 %	20 %	40 %	315499252
1527	NC_014816	TTGGG	2	10	2446694	2446703	0 %	40 %	60 %	0 %	315499259
1528	NC_014816	ATAGC	2	10	2449893	2449902	40 %	20 %	20 %	20 %	315499262
1529	NC_014816	GTGCG	2	10	2449949	2449958	0 %	20 %	60 %	20 %	315499262
1530	NC_014816	GCCTC	2	10	2455637	2455646	0 %	20 %	20 %	60 %	315499266
1531	NC_014816	GCATT	2	10	2456479	2456488	20 %	40 %	20 %	20 %	315499267
1532	NC_014816	GATGA	2	10	2456562	2456571	40 %	20 %	40 %	0 %	315499267
1533	NC_014816	GGGCG	2	10	2460374	2460383	0 %	0 %	80 %	20 %	315499270
1534	NC_014816	GTGAT	2	10	2461198	2461207	20 %	40 %	40 %	0 %	315499271
1535	NC_014816	TCGCG	2	10	2463130	2463139	0 %	20 %	40 %	40 %	315499273
1536	NC_014816	CTGTT	2	10	2463582	2463591	0 %	60 %	20 %	20 %	315499274
1537	NC_014816	ACGGA	2	10	2466964	2466973	40 %	0 %	40 %	20 %	315499275
1538	NC_014816	CCAAA	2	10	2470043	2470052	60 %	0 %	0 %	40 %	315499277
1539	NC_014816	GCCAG	2	10	2473445	2473454	20 %	0 %	40 %	40 %	315499280
1540	NC_014816	AAACT	2	10	2473516	2473525	60 %	20 %	0 %	20 %	315499280
1541	NC_014816	TCGGC	2	10	2473673	2473682	0 %	20 %	40 %	40 %	315499280
1542	NC_014816	TCGAC	2	10	2477099	2477108	20 %	20 %	20 %	40 %	315499282
1543	NC_014816	CATTT	2	10	2478691	2478700	20 %	60 %	0 %	20 %	315499282
1544	NC_014816	GGCAT	2	10	2481720	2481729	20 %	20 %	40 %	20 %	315499285
1545	NC_014816	CTTTG	2	10	2482222	2482231	0 %	60 %	20 %	20 %	315499285
1546	NC_014816	GCCCA	2	10	2483347	2483356	20 %	0 %	20 %	60 %	315499287
1547	NC_014816	CACTG	2	10	2485280	2485289	20 %	20 %	20 %	40 %	315499288
1548	NC_014816	AACGG	2	10	2485293	2485302	40 %	0 %	40 %	20 %	315499288
1549	NC_014816	GACGC	2	10	2486684	2486693	20 %	0 %	40 %	40 %	315499289
1550	NC_014816	GAAAT	2	10	2486705	2486714	60 %	20 %	20 %	0 %	315499289
1551	NC_014816	TCATC	2	10	2487926	2487935	20 %	40 %	0 %	40 %	315499291
1552	NC_014816	ATGAT	2	10	2487946	2487955	40 %	40 %	20 %	0 %	315499291
1553	NC_014816	CGCGC	2	10	2493532	2493541	0 %	0 %	40 %	60 %	315499296
1554	NC_014816	CCTTA	2	10	2494575	2494584	20 %	40 %	0 %	40 %	315499298
1555	NC_014816	AGCCA	2	10	2494894	2494903	40 %	0 %	20 %	40 %	315499298
1556	NC_014816	CTGGG	2	10	2495598	2495607	0 %	20 %	60 %	20 %	315499300
1557	NC_014816	TCAAA	2	10	2496731	2496740	60 %	20 %	0 %	20 %	315499302
1558	NC_014816	GAGAC	2	10	2497132	2497141	40 %	0 %	40 %	20 %	315499302
1559	NC_014816	TGGAT	2	10	2498013	2498022	20 %	40 %	40 %	0 %	315499304
1560	NC_014816	CACGC	2	10	2502858	2502867	20 %	0 %	20 %	60 %	315499307
1561	NC_014816	CTCAT	2	10	2505232	2505241	20 %	40 %	0 %	40 %	315499310
1562	NC_014816	CCAGC	2	10	2509014	2509023	20 %	0 %	20 %	60 %	315499313
1563	NC_014816	CGGGA	2	10	2509587	2509596	20 %	0 %	60 %	20 %	315499313
1564	NC_014816	GAAGC	2	10	2509908	2509917	40 %	0 %	40 %	20 %	315499313
1565	NC_014816	GTCTG	2	10	2511054	2511063	0 %	40 %	40 %	20 %	315499314
1566	NC_014816	TAAGG	2	10	2512280	2512289	40 %	20 %	40 %	0 %	315499315
1567	NC_014816	CCAGC	2	10	2515259	2515268	20 %	0 %	20 %	60 %	315499318
1568	NC_014816	GCGCC	2	10	2515475	2515484	0 %	0 %	40 %	60 %	315499318
1569	NC_014816	CCGGT	2	10	2518146	2518155	0 %	20 %	40 %	40 %	315499322
1570	NC_014816	TCACG	2	10	2518674	2518683	20 %	20 %	20 %	40 %	315499322
1571	NC_014816	AGACG	2	10	2519134	2519143	40 %	0 %	40 %	20 %	315499322
1572	NC_014816	GCCGA	2	10	2522536	2522545	20 %	0 %	40 %	40 %	315499325
1573	NC_014816	GGTCA	2	10	2523883	2523892	20 %	20 %	40 %	20 %	315499326
1574	NC_014816	TCCAG	2	10	2526857	2526866	20 %	20 %	20 %	40 %	315499328
1575	NC_014816	ATCAA	2	10	2528562	2528571	60 %	20 %	0 %	20 %	315499329
1576	NC_014816	CGGCC	2	10	2531710	2531719	0 %	0 %	40 %	60 %	315499331
1577	NC_014816	GGCTC	2	10	2532545	2532554	0 %	20 %	40 %	40 %	315499332
1578	NC_014816	GAAGT	2	10	2534669	2534678	40 %	20 %	40 %	0 %	315499335
1579	NC_014816	GCCGT	2	10	2537904	2537913	0 %	20 %	40 %	40 %	315499338
1580	NC_014816	TCGGG	2	10	2540578	2540587	0 %	20 %	60 %	20 %	315499340
1581	NC_014816	CCGAA	2	10	2540864	2540873	40 %	0 %	20 %	40 %	315499340
1582	NC_014816	CCGAC	2	10	2541652	2541661	20 %	0 %	20 %	60 %	315499341
1583	NC_014816	GGCCC	2	10	2541768	2541777	0 %	0 %	40 %	60 %	315499341
1584	NC_014816	ATTGA	2	10	2545497	2545506	40 %	40 %	20 %	0 %	315499344
1585	NC_014816	GGGAT	2	10	2547970	2547979	20 %	20 %	60 %	0 %	315499346
1586	NC_014816	CGAAG	2	10	2548409	2548418	40 %	0 %	40 %	20 %	315499347
1587	NC_014816	TCGGT	2	10	2549056	2549065	0 %	40 %	40 %	20 %	315499348
1588	NC_014816	GCCGT	2	10	2549896	2549905	0 %	20 %	40 %	40 %	315499348
1589	NC_014816	CCAGC	2	10	2561103	2561112	20 %	0 %	20 %	60 %	315499356
1590	NC_014816	GCGCG	2	10	2561282	2561291	0 %	0 %	60 %	40 %	315499356
1591	NC_014816	GACTT	2	10	2562546	2562555	20 %	40 %	20 %	20 %	315499357
1592	NC_014816	CCCGA	2	10	2564866	2564875	20 %	0 %	20 %	60 %	315499360
1593	NC_014816	AAAAG	2	10	2567783	2567792	80 %	0 %	20 %	0 %	315499362
1594	NC_014816	CGACC	2	10	2568410	2568419	20 %	0 %	20 %	60 %	315499364
1595	NC_014816	GCGAC	2	10	2570016	2570025	20 %	0 %	40 %	40 %	315499365
1596	NC_014816	GACCT	2	10	2570454	2570463	20 %	20 %	20 %	40 %	315499365
1597	NC_014816	GCCCG	2	10	2575796	2575805	0 %	0 %	40 %	60 %	315499372
1598	NC_014816	CGCGC	2	10	2576921	2576930	0 %	0 %	40 %	60 %	315499372
1599	NC_014816	GCCCC	2	10	2579634	2579643	0 %	0 %	20 %	80 %	315499375
1600	NC_014816	CAGGA	2	10	2580298	2580307	40 %	0 %	40 %	20 %	315499376
1601	NC_014816	ACGCG	2	10	2583690	2583699	20 %	0 %	40 %	40 %	315499378

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.