MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Micromonospora sp. L5 chromosome

Total Repeats: 6190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014815	CGGGCG	2	12	6730825	6730836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315506762
6002	NC_014815	CCGCAG	2	12	6730866	6730877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506762
6003	NC_014815	AGCACC	2	12	6733164	6733175	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315506764
6004	NC_014815	CGCCAG	2	12	6733373	6733384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506764
6005	NC_014815	ACGCCG	2	12	6734124	6734135	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506765
6006	NC_014815	TCCGGC	2	12	6734605	6734616	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506765
6007	NC_014815	AGGCCG	2	12	6736381	6736392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506766
6008	NC_014815	CCGGGG	2	12	6737566	6737577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_014815	GGCCGG	2	12	6738950	6738961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315506768
6010	NC_014815	AACTCG	2	12	6739053	6739064	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315506768
6011	NC_014815	CACCGT	2	12	6739640	6739651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506768
6012	NC_014815	AGCCGG	2	12	6740407	6740418	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506768
6013	NC_014815	GCCGTG	2	12	6740525	6740536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506768
6014	NC_014815	CAGGTC	2	12	6742556	6742567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506769
6015	NC_014815	ACCCGC	2	12	6743138	6743149	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315506770
6016	NC_014815	TCGACC	2	12	6744559	6744570	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506773
6017	NC_014815	CCGGCT	2	12	6745251	6745262	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506774
6018	NC_014815	CCTCGC	2	12	6745910	6745921	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	315506775
6019	NC_014815	GTCCCG	2	12	6746109	6746120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506775
6020	NC_014815	ATCGTC	3	18	6746232	6746249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315506775
6021	NC_014815	TCCTCG	2	12	6746311	6746322	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315506775
6022	NC_014815	TCGTCC	3	18	6746323	6746340	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315506775
6023	NC_014815	TCCAGC	2	12	6746443	6746454	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506775
6024	NC_014815	CGCGTA	2	12	6746556	6746567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506775
6025	NC_014815	GCGCCA	2	12	6746939	6746950	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506775
6026	NC_014815	CACGGT	2	12	6747269	6747280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_014815	TGCACT	2	12	6749496	6749507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_014815	GAGCAA	2	12	6756341	6756352	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	315506778
6029	NC_014815	CGCCGA	2	12	6759283	6759294	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506780
6030	NC_014815	CGGCGC	2	12	6761441	6761452	0 %	0 %	50 %	50 %	315506782
6031	NC_014815	TTCGCC	2	12	6764919	6764930	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315506784
6032	NC_014815	CGGCTC	2	12	6766941	6766952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506786
6033	NC_014815	TCGCCG	2	12	6768073	6768084	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506786
6034	NC_014815	GGCCGA	2	12	6770102	6770113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506788
6035	NC_014815	ACTACG	2	12	6771537	6771548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315506789
6036	NC_014815	GACCGG	2	12	6771824	6771835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506789
6037	NC_014815	CGGGGC	2	12	6773408	6773419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315506789
6038	NC_014815	GGCATG	2	12	6773948	6773959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506789
6039	NC_014815	CGGTTG	2	12	6777585	6777596	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315506791
6040	NC_014815	CGCCAC	2	12	6782471	6782482	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315506796
6041	NC_014815	CGGCAT	2	12	6782571	6782582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506796
6042	NC_014815	GCCGTC	2	12	6782706	6782717	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506796
6043	NC_014815	TCTGGC	2	12	6784796	6784807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506799
6044	NC_014815	GACGTC	2	12	6787358	6787369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506801
6045	NC_014815	CTGATC	2	12	6788027	6788038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315506802
6046	NC_014815	CCAGGG	2	12	6788479	6788490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_014815	CCCTGG	2	12	6788531	6788542	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_014815	CTGGGC	2	12	6788723	6788734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_014815	CCTGGC	2	12	6788831	6788842	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_014815	GCAGCT	2	12	6790233	6790244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506804
6051	NC_014815	ATGGAC	2	12	6791792	6791803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315506806
6052	NC_014815	TGCCCG	2	12	6793185	6793196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506808
6053	NC_014815	AGCCCG	2	12	6793971	6793982	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506808
6054	NC_014815	CCCCGA	2	12	6794556	6794567	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315506810
6055	NC_014815	CACCCC	2	12	6795283	6795294	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	315506812
6056	NC_014815	CCCCGG	2	12	6795345	6795356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315506812
6057	NC_014815	CTCCGA	2	12	6795426	6795437	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506812
6058	NC_014815	CCGGCC	2	12	6795440	6795451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315506812
6059	NC_014815	GGTCAC	2	12	6795929	6795940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506814
6060	NC_014815	TGGTCC	2	12	6796120	6796131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506814
6061	NC_014815	GCAAAG	2	12	6798022	6798033	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	315506815
6062	NC_014815	CGGACG	2	12	6801267	6801278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506818
6063	NC_014815	GCACCG	2	12	6802091	6802102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506819
6064	NC_014815	CGAGCA	2	12	6802484	6802495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315506819
6065	NC_014815	GCCCCC	2	12	6803826	6803837	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
6066	NC_014815	GCAGCG	2	12	6806881	6806892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506823
6067	NC_014815	GTCCAC	2	12	6809359	6809370	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506825
6068	NC_014815	CCGATC	2	12	6809946	6809957	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506826
6069	NC_014815	GCAGCC	2	12	6812432	6812443	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506828
6070	NC_014815	GGACCG	2	12	6812984	6812995	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506829
6071	NC_014815	CGGTTC	2	12	6813149	6813160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506829
6072	NC_014815	CGGGCT	2	12	6813170	6813181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506829
6073	NC_014815	CCGGCA	2	12	6816286	6816297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506833
6074	NC_014815	GCCAGC	2	12	6816432	6816443	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506833
6075	NC_014815	TCGCCA	2	12	6821612	6821623	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506839
6076	NC_014815	GCCGGT	2	12	6821694	6821705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506839
6077	NC_014815	GGGCGC	2	12	6824140	6824151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_014815	AGCCGC	2	12	6826223	6826234	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506843
6079	NC_014815	TGGCCG	2	12	6827333	6827344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506844
6080	NC_014815	CGCCAG	2	12	6828476	6828487	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506845
6081	NC_014815	CGACCA	2	12	6830834	6830845	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315506847
6082	NC_014815	CTCGGT	2	12	6831979	6831990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506849
6083	NC_014815	GAGCGG	2	12	6832441	6832452	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	315506849
6084	NC_014815	AGGCCC	2	12	6833225	6833236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506849
6085	NC_014815	GACGGC	2	12	6833668	6833679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506849
6086	NC_014815	CGAGCC	2	12	6833786	6833797	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506850
6087	NC_014815	TCACCG	2	12	6834361	6834372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506850
6088	NC_014815	CTTCGT	2	12	6834910	6834921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	315506851
6089	NC_014815	GCGGGA	2	12	6835156	6835167	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	315506851
6090	NC_014815	CGTGGT	2	12	6835210	6835221	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315506851
6091	NC_014815	CCATCG	2	12	6835830	6835841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506851
6092	NC_014815	CTCATC	2	12	6836015	6836026	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	315506851
6093	NC_014815	GACGGC	2	12	6836224	6836235	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506852
6094	NC_014815	CTGGGA	2	12	6837093	6837104	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506852
6095	NC_014815	CGCCGG	2	12	6837213	6837224	0 %	0 %	50 %	50 %	315506852
6096	NC_014815	AGGCGG	2	12	6837323	6837334	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	315506852
6097	NC_014815	GAGCGG	2	12	6837933	6837944	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	315506853
6098	NC_014815	GGTCGG	2	12	6838387	6838398	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315506854
6099	NC_014815	CTGGCG	2	12	6839776	6839787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506854
6100	NC_014815	CACCGG	2	12	6840413	6840424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506855
6101	NC_014815	GACGGC	2	12	6841049	6841060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506856
6102	NC_014815	GCGCCC	2	12	6842312	6842323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315506857
6103	NC_014815	TCCCGG	2	12	6844380	6844391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506857
6104	NC_014815	CACCGC	2	12	6844441	6844452	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315506857
6105	NC_014815	ACATCG	2	12	6844578	6844589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315506857
6106	NC_014815	GGTCGA	2	12	6847089	6847100	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506860
6107	NC_014815	TGGCGA	2	12	6847831	6847842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506861
6108	NC_014815	GACCTC	2	12	6848712	6848723	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506862
6109	NC_014815	AGGTGG	2	12	6849345	6849356	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	315506863
6110	NC_014815	CCGGTG	2	12	6852210	6852221	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506865
6111	NC_014815	GCCCGC	2	12	6852823	6852834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315506865
6112	NC_014815	CGCCAC	2	12	6853190	6853201	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315506866
6113	NC_014815	CACCGG	2	12	6854317	6854328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506867
6114	NC_014815	GGTGCC	2	12	6855356	6855367	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506868
6115	NC_014815	GCCGGC	2	12	6856035	6856046	0 %	0 %	50 %	50 %	315506869
6116	NC_014815	CGGCGC	2	12	6862973	6862984	0 %	0 %	50 %	50 %	315506877
6117	NC_014815	GGTGCT	2	12	6865598	6865609	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315506879
6118	NC_014815	GCGTTC	2	12	6865944	6865955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506879
6119	NC_014815	CGGCAA	2	12	6867859	6867870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315506880
6120	NC_014815	GTCCTG	2	12	6868154	6868165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_014815	GGCGAT	2	12	6873344	6873355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506887
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6139	NC_014815	CGTACG	2	12	6899510	6899521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506915
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6143	NC_014815	CGCCAC	2	12	6902964	6902975	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315506918
6144	NC_014815	CTGGAC	2	12	6904078	6904089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6145	NC_014815	CGTGGT	2	12	6905847	6905858	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315506921
6146	NC_014815	GAGGTC	2	12	6907992	6908003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506924
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6149	NC_014815	ACGGCC	2	12	6916953	6916964	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506929
6150	NC_014815	ACCTGG	2	12	6917590	6917601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506930
6151	NC_014815	TCCGCG	2	12	6919177	6919188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506931
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6153	NC_014815	CGGCGT	2	12	6921699	6921710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506932
6154	NC_014815	GTCGGA	2	12	6921775	6921786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506932
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6163	NC_014815	CTCCAG	2	12	6935082	6935093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315506944
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6165	NC_014815	CCGCCA	2	12	6935387	6935398	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315506944
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6169	NC_014815	GTCGAA	2	12	6938179	6938190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315506947
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6172	NC_014815	GCCTCG	2	12	6940000	6940011	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506948
6173	NC_014815	GGAGGC	2	12	6941397	6941408	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	315506948
6174	NC_014815	AGTACC	2	12	6945219	6945230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315506950
6175	NC_014815	CACGAC	2	12	6945744	6945755	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315506951
6176	NC_014815	CTGGTC	2	12	6945813	6945824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506951
6177	NC_014815	CGCCGG	2	12	6946309	6946320	0 %	0 %	50 %	50 %	315506952
6178	NC_014815	GCTGGG	2	12	6946926	6946937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315506952
6179	NC_014815	GGCGCC	2	12	6947101	6947112	0 %	0 %	50 %	50 %	315506953
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6181	NC_014815	CGTGCT	2	12	6952156	6952167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506958
6182	NC_014815	CTCGTC	2	12	6953155	6953166	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315506959
6183	NC_014815	CAGGTG	2	12	6953560	6953571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315506959
6184	NC_014815	GGCGAC	2	12	6954355	6954366	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315506960
6185	NC_014815	CCGAGC	2	12	6954574	6954585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315506960
6186	NC_014815	GGGCTC	2	12	6956692	6956703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315506961
6187	NC_014815	TCGGGT	2	12	6958350	6958361	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6188	NC_014815	CGTCGC	2	12	6959221	6959232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315506963
6189	NC_014815	CTCGGT	2	12	6960105	6960116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315506964
6190	NC_014815	TGCGCA	2	12	6962198	6962209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315506968

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