MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Micromonospora sp. L5 chromosome

Total Repeats: 8819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014815	GCCCG	2	10	670	679	0 %	0 %	40 %	60 %	315500819
2	NC_014815	GCGCC	2	10	773	782	0 %	0 %	40 %	60 %	315500819
3	NC_014815	GCGCC	2	10	892	901	0 %	0 %	40 %	60 %	315500819
4	NC_014815	GGGCG	2	10	2403	2412	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014815	GGGGT	2	10	2428	2437	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014815	GCAAC	2	10	5739	5748	40 %	0 %	20 %	40 %	315500822
7	NC_014815	CGCGG	2	10	5935	5944	0 %	0 %	60 %	40 %	315500822
8	NC_014815	GACGC	2	10	6432	6441	20 %	0 %	40 %	40 %	315500823
9	NC_014815	GGCCG	2	10	6499	6508	0 %	0 %	60 %	40 %	315500823
10	NC_014815	CGGCG	2	10	6569	6578	0 %	0 %	60 %	40 %	315500823
11	NC_014815	ACCGG	2	10	11721	11730	20 %	0 %	40 %	40 %	315500828
12	NC_014815	GGGTC	2	10	12709	12718	0 %	20 %	60 %	20 %	315500828
13	NC_014815	GGGCC	2	10	13069	13078	0 %	0 %	60 %	40 %	315500828
14	NC_014815	GGGCC	2	10	13582	13591	0 %	0 %	60 %	40 %	315500829
15	NC_014815	GGCCC	2	10	13912	13921	0 %	0 %	40 %	60 %	315500829
16	NC_014815	CGCGC	2	10	13997	14006	0 %	0 %	40 %	60 %	315500829
17	NC_014815	TGATC	2	10	14983	14992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014815	CCGGC	2	10	15807	15816	0 %	0 %	40 %	60 %	315500831
19	NC_014815	TCGGC	2	10	16645	16654	0 %	20 %	40 %	40 %	315500832
20	NC_014815	CTGGC	2	10	17733	17742	0 %	20 %	40 %	40 %	315500835
21	NC_014815	CGGGA	2	10	18316	18325	20 %	0 %	60 %	20 %	315500836
22	NC_014815	GACGC	2	10	18511	18520	20 %	0 %	40 %	40 %	315500836
23	NC_014815	AGCCG	2	10	18890	18899	20 %	0 %	40 %	40 %	315500837
24	NC_014815	ACCGG	2	10	19398	19407	20 %	0 %	40 %	40 %	315500837
25	NC_014815	CGCGG	2	10	20340	20349	0 %	0 %	60 %	40 %	315500839
26	NC_014815	GGCCC	2	10	20474	20483	0 %	0 %	40 %	60 %	315500839
27	NC_014815	GCGAG	2	10	21443	21452	20 %	0 %	60 %	20 %	315500840
28	NC_014815	GATGC	2	10	22338	22347	20 %	20 %	40 %	20 %	315500840
29	NC_014815	CGACG	2	10	22929	22938	20 %	0 %	40 %	40 %	315500840
30	NC_014815	GTGCC	2	10	23155	23164	0 %	20 %	40 %	40 %	315500840
31	NC_014815	GCACC	2	10	23555	23564	20 %	0 %	20 %	60 %	315500840
32	NC_014815	CCGGT	2	10	23770	23779	0 %	20 %	40 %	40 %	315500840
33	NC_014815	CGGCA	2	10	25554	25563	20 %	0 %	40 %	40 %	315500840
34	NC_014815	CGGCG	2	10	25754	25763	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014815	GCGGG	2	10	26534	26543	0 %	0 %	80 %	20 %	315500841
36	NC_014815	CGGGC	2	10	26887	26896	0 %	0 %	60 %	40 %	315500841
37	NC_014815	CGGCC	2	10	27156	27165	0 %	0 %	40 %	60 %	315500841
38	NC_014815	CGGCA	2	10	28396	28405	20 %	0 %	40 %	40 %	315500843
39	NC_014815	GTCGA	2	10	28917	28926	20 %	20 %	40 %	20 %	315500844
40	NC_014815	CCGGC	2	10	31418	31427	0 %	0 %	40 %	60 %	315500848
41	NC_014815	CCGGG	2	10	33307	33316	0 %	0 %	60 %	40 %	315500850
42	NC_014815	CGAGC	2	10	34579	34588	20 %	0 %	40 %	40 %	315500851
43	NC_014815	GCACT	2	10	35624	35633	20 %	20 %	20 %	40 %	315500854
44	NC_014815	GCGCG	2	10	36297	36306	0 %	0 %	60 %	40 %	315500854
45	NC_014815	CCGCC	2	10	39644	39653	0 %	0 %	20 %	80 %	315500861
46	NC_014815	CGGAG	2	10	41088	41097	20 %	0 %	60 %	20 %	315500862
47	NC_014815	CCGGG	2	10	43808	43817	0 %	0 %	60 %	40 %	315500864
48	NC_014815	GCACC	2	10	46120	46129	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_014815	ACCGG	2	10	47588	47597	20 %	0 %	40 %	40 %	315500868
50	NC_014815	AGTGG	2	10	47847	47856	20 %	20 %	60 %	0 %	315500868
51	NC_014815	CGGAC	2	10	47937	47946	20 %	0 %	40 %	40 %	315500868
52	NC_014815	GCGCG	2	10	48540	48549	0 %	0 %	60 %	40 %	315500869
53	NC_014815	CCGGT	2	10	48589	48598	0 %	20 %	40 %	40 %	315500869
54	NC_014815	CAGCG	2	10	48707	48716	20 %	0 %	40 %	40 %	315500869
55	NC_014815	CGGGG	2	10	51431	51440	0 %	0 %	80 %	20 %	315500872
56	NC_014815	CGTGG	2	10	52149	52158	0 %	20 %	60 %	20 %	315500873
57	NC_014815	CCCGG	2	10	52268	52277	0 %	0 %	40 %	60 %	315500873
58	NC_014815	GGCGT	2	10	52860	52869	0 %	20 %	60 %	20 %	315500873
59	NC_014815	CGGGC	2	10	52902	52911	0 %	0 %	60 %	40 %	315500873
60	NC_014815	CGGCT	2	10	53532	53541	0 %	20 %	40 %	40 %	315500873
61	NC_014815	GGCCG	2	10	53883	53892	0 %	0 %	60 %	40 %	315500873
62	NC_014815	CGACC	2	10	54414	54423	20 %	0 %	20 %	60 %	315500874
63	NC_014815	CGCGG	2	10	54576	54585	0 %	0 %	60 %	40 %	315500874
64	NC_014815	GGTCG	2	10	55579	55588	0 %	20 %	60 %	20 %	315500874
65	NC_014815	TCCCG	2	10	56641	56650	0 %	20 %	20 %	60 %	315500874
66	NC_014815	CGGCG	2	10	56954	56963	0 %	0 %	60 %	40 %	315500875
67	NC_014815	GCCGC	2	10	57203	57212	0 %	0 %	40 %	60 %	315500875
68	NC_014815	CCGAC	2	10	57424	57433	20 %	0 %	20 %	60 %	315500875
69	NC_014815	GCCCG	2	10	58561	58570	0 %	0 %	40 %	60 %	315500876
70	NC_014815	CGGGC	2	10	62962	62971	0 %	0 %	60 %	40 %	315500880
71	NC_014815	GCCCG	2	10	63102	63111	0 %	0 %	40 %	60 %	315500880
72	NC_014815	CACCG	2	10	64227	64236	20 %	0 %	20 %	60 %	315500880
73	NC_014815	ACCTG	2	10	64729	64738	20 %	20 %	20 %	40 %	315500880
74	NC_014815	CGCGT	2	10	65729	65738	0 %	20 %	40 %	40 %	315500881
75	NC_014815	GGCGG	2	10	67011	67020	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014815	ACGGT	2	10	67066	67075	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014815	CGACG	2	10	67462	67471	20 %	0 %	40 %	40 %	315500883
78	NC_014815	GGCCT	2	10	68831	68840	0 %	20 %	40 %	40 %	315500884
79	NC_014815	GCCCG	2	10	69083	69092	0 %	0 %	40 %	60 %	315500884
80	NC_014815	CGGCA	2	10	69419	69428	20 %	0 %	40 %	40 %	315500884
81	NC_014815	CGGCG	2	10	70200	70209	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014815	CGGGG	2	10	70265	70274	0 %	0 %	80 %	20 %	315500885
83	NC_014815	GCGCG	2	10	70953	70962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014815	CGGGG	2	10	71523	71532	0 %	0 %	80 %	20 %	315500886
85	NC_014815	CGGCC	2	10	73839	73848	0 %	0 %	40 %	60 %	315500889
86	NC_014815	CCGAG	2	10	74115	74124	20 %	0 %	40 %	40 %	315500889
87	NC_014815	CCGGC	2	10	74432	74441	0 %	0 %	40 %	60 %	315500890
88	NC_014815	GCGGG	2	10	75296	75305	0 %	0 %	80 %	20 %	315500892
89	NC_014815	CAGCC	2	10	76014	76023	20 %	0 %	20 %	60 %	315500893
90	NC_014815	GCCGG	2	10	76949	76958	0 %	0 %	60 %	40 %	315500894
91	NC_014815	CCGGC	2	10	78437	78446	0 %	0 %	40 %	60 %	315500895
92	NC_014815	GCCGC	2	10	78919	78928	0 %	0 %	40 %	60 %	315500896
93	NC_014815	GGCCG	2	10	78982	78991	0 %	0 %	60 %	40 %	315500896
94	NC_014815	CGCTC	2	10	79480	79489	0 %	20 %	20 %	60 %	315500897
95	NC_014815	GCCGG	2	10	81778	81787	0 %	0 %	60 %	40 %	315500898
96	NC_014815	CTCGG	2	10	83100	83109	0 %	20 %	40 %	40 %	315500899
97	NC_014815	CGCCT	2	10	84594	84603	0 %	20 %	20 %	60 %	315500900
98	NC_014815	CCCCG	2	10	84747	84756	0 %	0 %	20 %	80 %	315500900
99	NC_014815	GCCCG	2	10	87612	87621	0 %	0 %	40 %	60 %	315500902
100	NC_014815	GGGCG	2	10	88824	88833	0 %	0 %	80 %	20 %	315500904
101	NC_014815	GCCGG	2	10	89385	89394	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014815	GGCGG	2	10	89538	89547	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014815	GGGCC	2	10	89617	89626	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014815	CACGC	2	10	91081	91090	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_014815	CCGGC	2	10	91640	91649	0 %	0 %	40 %	60 %	315500907
106	NC_014815	TCGAG	2	10	92497	92506	20 %	20 %	40 %	20 %	315500907
107	NC_014815	GGCCG	2	10	94376	94385	0 %	0 %	60 %	40 %	315500909
108	NC_014815	GCCGG	2	10	95934	95943	0 %	0 %	60 %	40 %	315500910
109	NC_014815	CGGCC	2	10	95963	95972	0 %	0 %	40 %	60 %	315500910
110	NC_014815	TGAAT	2	10	96561	96570	40 %	40 %	20 %	0 %	315500910
111	NC_014815	GCGCG	2	10	97818	97827	0 %	0 %	60 %	40 %	315500912
112	NC_014815	CGGTC	2	10	97925	97934	0 %	20 %	40 %	40 %	315500912
113	NC_014815	CGGCG	2	10	99465	99474	0 %	0 %	60 %	40 %	315500912
114	NC_014815	CGGCG	2	10	99747	99756	0 %	0 %	60 %	40 %	315500912
115	NC_014815	GGCCG	2	10	100987	100996	0 %	0 %	60 %	40 %	315500913
116	NC_014815	CGTGA	2	10	101529	101538	20 %	20 %	40 %	20 %	315500914
117	NC_014815	AGGTC	2	10	101726	101735	20 %	20 %	40 %	20 %	315500914
118	NC_014815	CGGGC	2	10	102062	102071	0 %	0 %	60 %	40 %	315500915
119	NC_014815	GCCCA	2	10	102967	102976	20 %	0 %	20 %	60 %	315500916
120	NC_014815	AGGGC	2	10	106421	106430	20 %	0 %	60 %	20 %	315500921
121	NC_014815	TCTGC	2	10	107589	107598	0 %	40 %	20 %	40 %	315500922
122	NC_014815	GCCGG	2	10	107837	107846	0 %	0 %	60 %	40 %	315500923
123	NC_014815	GGTCG	2	10	109512	109521	0 %	20 %	60 %	20 %	315500926
124	NC_014815	CTGGC	2	10	110808	110817	0 %	20 %	40 %	40 %	315500928
125	NC_014815	GCCGG	2	10	111545	111554	0 %	0 %	60 %	40 %	315500929
126	NC_014815	GGCCG	2	10	111661	111670	0 %	0 %	60 %	40 %	315500929
127	NC_014815	CTGCT	2	10	112258	112267	0 %	40 %	20 %	40 %	315500929
128	NC_014815	CCGGG	2	10	112437	112446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014815	GCCGG	2	10	113345	113354	0 %	0 %	60 %	40 %	315500930
130	NC_014815	CGGCC	2	10	114073	114082	0 %	0 %	40 %	60 %	315500932
131	NC_014815	CCGGG	2	10	114297	114306	0 %	0 %	60 %	40 %	315500932
132	NC_014815	CGGAC	2	10	116524	116533	20 %	0 %	40 %	40 %	315500935
133	NC_014815	GCCAG	2	10	118917	118926	20 %	0 %	40 %	40 %	315500937
134	NC_014815	ACCGC	2	10	120475	120484	20 %	0 %	20 %	60 %	315500939
135	NC_014815	GAGCA	2	10	120576	120585	40 %	0 %	40 %	20 %	315500939
136	NC_014815	GCGCG	2	10	121488	121497	0 %	0 %	60 %	40 %	315500941
137	NC_014815	CCGGC	2	10	122544	122553	0 %	0 %	40 %	60 %	315500942
138	NC_014815	CCGGC	2	10	122641	122650	0 %	0 %	40 %	60 %	315500943
139	NC_014815	CGGTG	2	10	122899	122908	0 %	20 %	60 %	20 %	315500943
140	NC_014815	GTCGA	2	10	124086	124095	20 %	20 %	40 %	20 %	315500944
141	NC_014815	GCGGT	2	10	124122	124131	0 %	20 %	60 %	20 %	315500944
142	NC_014815	GCTCG	2	10	124743	124752	0 %	20 %	40 %	40 %	315500945
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150	NC_014815	CGAGC	2	10	133378	133387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_014815	CGAGC	2	10	134370	134379	20 %	0 %	40 %	40 %	315500951
152	NC_014815	GCGGT	2	10	134641	134650	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
153	NC_014815	GACAG	2	10	136082	136091	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_014815	GCCGG	2	10	137046	137055	0 %	0 %	60 %	40 %	315500952
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171	NC_014815	GCCGG	2	10	146705	146714	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
172	NC_014815	CCGGC	2	10	146733	146742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
173	NC_014815	CCCGG	2	10	147014	147023	0 %	0 %	40 %	60 %	315500961
174	NC_014815	CCGGA	2	10	149537	149546	20 %	0 %	40 %	40 %	315500965
175	NC_014815	GCCGA	2	10	149878	149887	20 %	0 %	40 %	40 %	315500966
176	NC_014815	GGCCC	2	10	152251	152260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
177	NC_014815	GGGCC	2	10	152769	152778	0 %	0 %	60 %	40 %	315500967
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179	NC_014815	CCCCG	2	10	158413	158422	0 %	0 %	20 %	80 %	315500975
180	NC_014815	GTCGT	2	10	159243	159252	0 %	40 %	40 %	20 %	315500976
181	NC_014815	ACCGC	2	10	159813	159822	20 %	0 %	20 %	60 %	315500976
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184	NC_014815	GCGTC	2	10	161039	161048	0 %	20 %	40 %	40 %	315500978
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189	NC_014815	CCGGC	2	10	165677	165686	0 %	0 %	40 %	60 %	315500982
190	NC_014815	CCAGC	2	10	166523	166532	20 %	0 %	20 %	60 %	315500982
191	NC_014815	GCAGC	2	10	166571	166580	20 %	0 %	40 %	40 %	315500982
192	NC_014815	GCGGA	2	10	166653	166662	20 %	0 %	60 %	20 %	315500982
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196	NC_014815	GGTCA	2	10	168584	168593	20 %	20 %	40 %	20 %	315500984
197	NC_014815	CCCAG	2	10	171291	171300	20 %	0 %	20 %	60 %	315500988
198	NC_014815	CCGAG	2	10	175608	175617	20 %	0 %	40 %	40 %	315500991
199	NC_014815	ACCCC	3	15	177052	177066	20 %	0 %	0 %	80 %	315500992
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201	NC_014815	GTCCG	2	10	177384	177393	0 %	20 %	40 %	40 %	315500993
202	NC_014815	GCCGG	2	10	177670	177679	0 %	0 %	60 %	40 %	315500993
203	NC_014815	CGGGG	2	10	178255	178264	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
204	NC_014815	CGCCT	2	10	179788	179797	0 %	20 %	20 %	60 %	315500995
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212	NC_014815	CGGGC	2	10	186173	186182	0 %	0 %	60 %	40 %	315501001
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230	NC_014815	CGGGC	2	10	199609	199618	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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236	NC_014815	GCCAG	2	10	207226	207235	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
237	NC_014815	GCGCG	2	10	207797	207806	0 %	0 %	60 %	40 %	315501018
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239	NC_014815	CCGTC	2	10	210137	210146	0 %	20 %	20 %	60 %	315501020
240	NC_014815	GCCCC	2	10	212041	212050	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
241	NC_014815	GCCGT	2	10	213318	213327	0 %	20 %	40 %	40 %	315501024
242	NC_014815	GCGCT	2	10	213822	213831	0 %	20 %	40 %	40 %	315501024
243	NC_014815	TCCGC	2	10	216307	216316	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
244	NC_014815	CCGGG	2	10	216644	216653	0 %	0 %	60 %	40 %	315501029
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248	NC_014815	GACCG	2	10	220203	220212	20 %	0 %	40 %	40 %	315501033
249	NC_014815	CGGCG	2	10	220706	220715	0 %	0 %	60 %	40 %	315501033
250	NC_014815	GTGCC	2	10	220850	220859	0 %	20 %	40 %	40 %	315501034
251	NC_014815	TTCCG	2	10	221313	221322	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
252	NC_014815	CCAGG	2	10	223179	223188	20 %	0 %	40 %	40 %	315501037
253	NC_014815	CAGGA	2	10	223275	223284	40 %	0 %	40 %	20 %	315501037
254	NC_014815	CGACG	2	10	224321	224330	20 %	0 %	40 %	40 %	315501039
255	NC_014815	TCGGA	2	10	226707	226716	20 %	20 %	40 %	20 %	315501041
256	NC_014815	CCGGT	2	10	227473	227482	0 %	20 %	40 %	40 %	315501042
257	NC_014815	GCCCG	2	10	227873	227882	0 %	0 %	40 %	60 %	315501042
258	NC_014815	CAGCG	2	10	228581	228590	20 %	0 %	40 %	40 %	315501043
259	NC_014815	CGGTG	2	10	230348	230357	0 %	20 %	60 %	20 %	315501045
260	NC_014815	GCCCG	2	10	232391	232400	0 %	0 %	40 %	60 %	315501046
261	NC_014815	CGGTT	2	10	233120	233129	0 %	40 %	40 %	20 %	315501047
262	NC_014815	CGGCG	2	10	233258	233267	0 %	0 %	60 %	40 %	315501047
263	NC_014815	GTCCA	2	10	234286	234295	20 %	20 %	20 %	40 %	315501048
264	NC_014815	GTCCG	2	10	234315	234324	0 %	20 %	40 %	40 %	315501048
265	NC_014815	CGGTG	2	10	235267	235276	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
266	NC_014815	ACCTC	2	10	236547	236556	20 %	20 %	0 %	60 %	315501049
267	NC_014815	ACGCG	2	10	237748	237757	20 %	0 %	40 %	40 %	315501051
268	NC_014815	GCGCC	2	10	237859	237868	0 %	0 %	40 %	60 %	315501051
269	NC_014815	CGGCC	2	10	238423	238432	0 %	0 %	40 %	60 %	315501051
270	NC_014815	GCGTC	2	10	238712	238721	0 %	20 %	40 %	40 %	315501052
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371	NC_014815	GGCCC	2	10	299219	299228	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
372	NC_014815	GCCCG	2	10	299246	299255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
373	NC_014815	CGGGG	3	15	299631	299645	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
374	NC_014815	CGGCG	2	10	300850	300859	0 %	0 %	60 %	40 %	315501119
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377	NC_014815	TGACC	2	10	303288	303297	20 %	20 %	20 %	40 %	315501120
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382	NC_014815	CAGCG	2	10	308585	308594	20 %	0 %	40 %	40 %	315501124
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396	NC_014815	GGGCC	2	10	319562	319571	0 %	0 %	60 %	40 %	315501134
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